Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2542
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2542, 901 aa
1>>>pF1KE2542 901 - 901 aa - 901 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9728+/-0.00104; mu= 17.2377+/- 0.062
mean_var=75.8940+/-15.463, 0's: 0 Z-trim(104.5): 191 B-trim: 167 in 1/49
Lambda= 0.147221
statistics sampled from 7710 (7914) to 7710 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 3.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 901) 6001 1284.8 0
CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 847) 5549 1188.8 0
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CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 894) 3204 690.7 3.1e-198
CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 840) 2830 611.3 2.4e-174
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CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 916) 1246 274.9 4.9e-73
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 ( 814) 1230 271.4 4.6e-72
CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 882) 1213 267.8 6.1e-71
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 784) 1201 265.3 3.2e-70
CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 829) 1201 265.3 3.4e-70
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20 ( 832) 1145 253.4 1.3e-66
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 713) 1136 251.5 4.2e-66
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 760) 1132 250.6 8.1e-66
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 674) 1092 242.1 2.6e-63
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1040) 1081 239.8 1.9e-62
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059) 1081 239.8 2e-62
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118) 1074 238.4 5.8e-62
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 ( 999) 1000 222.6 2.8e-57
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 785) 936 209.0 2.8e-53
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 630) 909 203.2 1.2e-51
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 790) 897 200.7 8.8e-51
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18 ( 801) 856 192.0 3.7e-48
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5 ( 788) 852 191.1 6.6e-48
CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049) 839 188.4 5.8e-47
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 ( 799) 821 184.6 6.4e-46
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5 ( 790) 819 184.1 8.6e-46
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 574) 800 180.0 1.1e-44
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 575) 800 180.0 1.1e-44
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 798 179.7 1.7e-44
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 798 179.7 1.9e-44
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 794) 796 179.3 2.5e-44
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5 ( 789) 788 177.6 8.2e-44
CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs108|chr20 ( 828) 776 175.0 5e-43
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 741 167.6 8.2e-41
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 670) 660 150.3 1.1e-35
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 772) 650 148.2 5.4e-35
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 819) 634 144.9 6e-34
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 490) 562 129.5 1.5e-29
CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 821) 563 129.8 2.1e-29
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 754) 534 123.6 1.4e-27
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 732) 514 119.3 2.5e-26
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 441 104.1 4.1e-21
CCDS53548.1 CDHR1 gene_id:92211|Hs108|chr10 ( 745) 391 93.2 1.9e-18
CCDS7372.1 CDHR1 gene_id:92211|Hs108|chr10 ( 859) 391 93.3 2.1e-18
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 386 92.4 1.5e-17
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16 ( 784) 363 87.3 1.2e-16
CCDS58471.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 790) 354 85.4 4.6e-16
>>CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 (901 aa)
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Smith-Waterman score: 6001; 100.0% identity (100.0% similar) in 901 aa overlap (1-901:1-901)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
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310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVV
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430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
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550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
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670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
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790 800 810 820 830 840
pF1KE2 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKVYL
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850 860 870 880 890 900
pF1KE2 CNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACMK
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pF1KE2 R
:
CCDS11 R
>>CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 (847 aa)
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Smith-Waterman score: 5549; 99.9% identity (100.0% similar) in 837 aa overlap (1-837:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
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310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
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370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTSVEENTVDVEILRVTVEDKDLVNTANWRANYTILKGNENGNFKIVTDAKTNEGVLCVV
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pF1KE2 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPLNYEEKQQMILQIGVVNEAPFSREASPRSAMSTATVTVNVEDQDEGPECNPPIQTVRM
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pF1KE2 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KENAEVGTTSNGYKAYDPETRSSSGIRYKKLTDPTGWVTIDENTGSIKVFRSLDREAETI
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pF1KE2 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KNGIYNITVLASDQGGRTCTGTLGIILQDVNDNSPFIPKKTVIICKPTMSSAEIVAVDPD
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610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTSLDVTLCDCITENDCTHRVDPRIGGGGVQLGKWAILAILLGIALLFCILFTLVCGASG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSKQPKVIPDDLAQQNLIVSNTEAPGDDKVYSANGFTTQTVGASAQGVCGTVGSGIKNGG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS11 QETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEESIR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 CNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFRTLAEACMK
CCDS11 GHTLIKN
>>CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 (896 aa)
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Smith-Waterman score: 4123; 67.1% identity (85.6% similar) in 902 aa overlap (1-901:1-896)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAARPSGSWNGALCRLLLLTLAILIFASDACKNVTLHVPSKLDAEKLVGRVNLKECFTA
: :: : : ::.: :::::.:. :..:::.: :.:::::.:.:..:::::.::: .
CCDS32 MAAAGPRRSVRGAVCLHLLLTLVIFSRAGEACKKVILNVPSKLEADKIIGRVNLEECFRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ANLIHSSDPDFQILEDGSVYTTNTILLSSEKRSFTILLSNTENQEKKKIFVFLEHQTKVL
:.::.::::::..:.::::::. .. ::..:::::: ::. ..: .:.. :.:::: ::
CCDS32 ADLIRSSDPDFRVLNDGSVYTARAVALSDKKRSFTIWLSDKRKQTQKEVTVLLEHQKKVS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KKRHTKEKVLRRAKRRWAPIPCSMLENSLGPFPLFLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQ
: :::.: :::::::::::::::: ::::::::::::::.::.:::::..::: : :::.
CCDS32 KTRHTRETVLRRAKRRWAPIPCSMQENSLGPFPLFLQQVESDAAQNYTVFYSISGRGVDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAFATTPDGYTPELPLPLIIKIEDENDNY
:: ::::.:::::::.::::::::.:. :..::.:.: :::. .::::: :..::::::.
CCDS32 EPLNLFYIERDTGNLFCTRPVDREEYDVFDLIAYASTADGYSADLPLPLPIRVEDENDNH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHPT
:.::: :.: ..:. : ::::: :::::.::::::::::::::. :.: :: :::.::.
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pF1KE2 TGVITTTSSQLDRELIDKYQLKIKVQDMDGQYFGLQTTSTCIINIDDVNDHLPTFTRTSY
::::::.: ::::..:::.: .::::::::.::: ::::::.. : ::. ::: ...:
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CCDS32 EAFVEENAFNVEILRIPIEDKDLINTANWRVNFTILKGNENGHFKISTDKETNEGVLSVV
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CCDS32 KPLNYEENRQVNLEIGVNNEAPFARDI-PRVTALNRALVTVHVRDLDEGPECTPAAQYVR
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:: .::::::: :. :.:::::.. ..::::: : : .. :.:::: :. ..:.::::
CCDS32 PKNELYNITVLAIDKDDRSCTGTLAVNIEDVNDNPPEILQEYVVICKPKMGYTDILAVDP
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pF1KE2 DEPIHGPPFDFSLESSTSEVQRMWRLKAINDTAARLSYQNDPPFGSYVVPITVRDRLGMS
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CCDS32 DEPVHGAPFYFSLPNTSPEISRLWSLTKVNDTAARLSYQKNAGFQEYTIPITVKDRAGQA
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.. : :.::.: ..: :. : . :: ::::::::::::::::: .:.:::::.
CCDS32 ATKLLRVNLCECTHPTQC--RATSR--STGVILGKWAILAILLGIALLFSVLLTLVCGVF
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:..: : .:.::::::::.:::::::::.: ::::: :::.. :.:: :::.:::.:::
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CCDS32 GQETIEMMKGGNQTLESCRGAGHHHTLDSCRGGHTEVDNCRYTYSEWHSFTQPRLGEKLH
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CCDS32 KR
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CCDS11 TLAKTCIKK
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CCDS11 KEPFNLFYIEKDTGDIFCTRSIDREKYEQFALYGYATTADGYAPEYPLPLIIKIEDDNDN
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pF1KE2 YPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYSIIGQVPPSPTLFSMHP
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CCDS11 QSQDGFPAGQELLGYKALDPEISSGEGLRYQKLGDEDNWFEINQHTGDLRTLKVLDRESK
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CCDS11 PDGPENGPPFQFFLDNSAS---KNWNIEEKDGKTAILRQRQNLDYNYYSVPIQIKDRHGL
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CCDS11 VATHMLTVRVCDCSTPSECRMKDKSTRDVRPNVILGRWAILAMVLGSVLLLCILFTCFC-
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pF1KE2 -GIKNGGQETIEMVKGGHQTSESCRGAGHHHTLDSCRG-GHTEVDNCRYTYSEWHSFTQP
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pF1KE2 RLGEKVYLCNQDENHKHAQDYVLTYNYEGRGSVAGSVGCCSERQEEDGLEFLDNLEPKFR
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CCDS11 RLGEESIRGHTLIKN
830 840
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CCDS77 LIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWV
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CCDS77 GTYVMTVTAIDADDPNALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKV
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CCDS77 LTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTV
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.: ...::: :: :: :.: :: ::.:::: : .:. ... .: . .: : :
CCDS77 QCDSNGDCTD-VD-RIVGAG--LGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQ
680 690 700 710 720
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pF1KE2 --VIPDDLAQQNLIVSNTEAPGD-DKVYSANGFTT-QTVGASAQGVCGTVGSGIKNGGQE
. :.: ...:.. . :. :. :. :. . . .:: .: :: : .
CCDS77 LLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDA----------IKPVGIR
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.. . . :.:. : : : .:: . : :
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: .:...::: ::.:::.. : :. ..:.. :.:. ::.
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900
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.::: .. : : :...: :. .. .:.. :.: :: :. : .. :
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:: :::: : ...:: .: .. ::. :::.:: : ..: .. .:.: :.:.::::
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210 220 230 240 250 260
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:.. : :. .: : :. ..:.. : ::: : : ..... :. :. . :: : :
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: : :.:.... :.: :..:.: :::..:... :: : :... :::: ...: : :.
CCDS11 AIDADDPNALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQ
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330 340 350 360 370 380
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.. . . .:::::.:.: : .:.: : . .:..:. ..:: . . : ::. .
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:: : : :.:::.: . . . :. : .: .:.:.: : .. :: :.: : ..
CCDS11 TLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINITALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIK
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CCDS11 TD-VD-RIVGAG--LGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDD
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CCDS11 VRDNILKYDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDA----------IKPVGIRRMDERPIH
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CCDS58 RAFMLTVMVSNQAPLAS-GIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGT
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. . ..: ::. ....::.::.::..:. :. ..:.: . ::::. ::..:. :
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900
pF1KE2 RTLAEACMKR
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CCDS58 KKLADMYGGGEED
830 840
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CCDS13 KVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINVPENSRGPFPQQLVRIRSDK
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CCDS13 DNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDREEHASYHLRAHAVDMNGNKV
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pF1KE2 ELPLPLIIKIEDENDNYPIFTEETYTFTIFENCRVGTTVGQVCATDKDEPDTMHTRLKYS
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CCDS13 ENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMTVTANDADDSTTANGMVRYR
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CCDS13 IVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAAGLDREKVQQYTVIVQATDMEGNLNYGLSNTAT
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CCDS13 SGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVSNQAPLASGIQ-MSFQSTAGVTI
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CCDS13 SIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPASWLHI
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CCDS13 GTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGGE
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CCDS13 EDQDYD----LSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDERPV-----GAEPQYPIRPMVPHPGD
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CCDS13 IGDFINEGLRAADN---------DPTAP-----------------PYDSLLVFDYEGSGS
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pF1KE2 VAGSVGCCSERQEED-GLEFLDNLEPKFRTLAEACMKR
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CCDS13 TAGSVSSLNSSSSGDQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED
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CCDS10 LLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENHKRLPYPL
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pF1KE2 FLQQVQSDTAQNYTIYYSIRGPGVDQEPRNLFYVERDTGNLYCTRPVDREQYESFEIIAF
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CCDS10 V--QIKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRLRAF
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