Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2519
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2519, 555 aa
1>>>pF1KE2519 555 - 555 aa - 555 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5517+/-0.000334; mu= 13.8014+/- 0.021
mean_var=106.9923+/-21.869, 0's: 0 Z-trim(117.3): 29 B-trim: 1633 in 1/54
Lambda= 0.123993
statistics sampled from 29167 (29197) to 29167 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.342), width: 16
Scan time: 8.350
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011540171 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grai ( 556) 3749 681.4 2e-195
NP_001181939 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like ( 556) 3749 681.4 2e-195
NP_937816 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pr ( 602) 3749 681.4 2.2e-195
NP_067003 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pr ( 607) 3749 681.4 2.2e-195
NP_937817 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pr ( 626) 3513 639.2 1.1e-182
XP_011540172 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grai ( 509) 3436 625.4 1.3e-178
XP_016859389 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 479) 1423 265.3 3.2e-70
XP_011508645 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 583) 1423 265.3 3.8e-70
XP_006711945 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 630) 1423 265.3 4e-70
XP_016859390 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 467) 1386 258.6 3.1e-68
NP_937825 (OMIM: 609786) grainyhead-like protein 1 ( 618) 1386 258.7 3.9e-68
XP_006711947 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 441) 1377 257.0 9e-68
NP_001317522 (OMIM: 608576,608641,616029) grainyhe ( 609) 1369 255.7 3.2e-67
XP_011515608 (OMIM: 608576,608641,616029) PREDICTE ( 609) 1369 255.7 3.2e-67
NP_079191 (OMIM: 608576,608641,616029) grainyhead- ( 625) 1369 255.7 3.2e-67
XP_005246216 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead- ( 429) 1340 250.4 8.7e-66
XP_011515609 (OMIM: 608576,608641,616029) PREDICTE ( 591) 1255 235.3 4.2e-61
XP_016859394 (OMIM: 609785) PREDICTED: transcripti ( 273) 352 73.5 9.6e-13
XP_016859393 (OMIM: 609785) PREDICTED: transcripti ( 273) 352 73.5 9.6e-13
XP_016859391 (OMIM: 609785) PREDICTED: transcripti ( 406) 352 73.6 1.3e-12
NP_055368 (OMIM: 609785) transcription factor CP2- ( 479) 352 73.7 1.5e-12
NP_001121632 (OMIM: 609784) upstream-binding prote ( 504) 351 73.5 1.8e-12
NP_055332 (OMIM: 609784) upstream-binding protein ( 540) 347 72.8 3.1e-12
NP_001121633 (OMIM: 609784) upstream-binding prote ( 540) 347 72.8 3.1e-12
NP_001166923 (OMIM: 189889) alpha-globin transcrip ( 501) 339 71.4 7.9e-12
NP_005644 (OMIM: 189889) alpha-globin transcriptio ( 502) 339 71.4 7.9e-12
>>XP_011540171 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grainyhe (556 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3629.4 bits: 681.4 E(85289): 2e-195
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:2-556)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL
490 500 510 520 530 540
540 550
pF1KE2 DMGELDGKIQIILKEL
::::::::::::::::
XP_011 DMGELDGKIQIILKEL
550
>>NP_001181939 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like pro (556 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3629.4 bits: 681.4 E(85289): 2e-195
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:2-556)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAER
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEV
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLL
490 500 510 520 530 540
540 550
pF1KE2 DMGELDGKIQIILKEL
::::::::::::::::
NP_001 DMGELDGKIQIILKEL
550
>>NP_937816 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like protei (602 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3628.9 bits: 681.4 E(85289): 2.2e-195
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:48-602)
10 20 30
pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 VNLQKFSYTSEDEAWKTYLENPLTAATKAMMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550
pF1KE2 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
560 570 580 590 600
>>NP_067003 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like protei (607 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3749 Z-score: 3628.9 bits: 681.4 E(85289): 2.2e-195
Smith-Waterman score: 3749; 100.0% identity (100.0% similar) in 555 aa overlap (1-555:53-607)
10 20 30
pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 VNLQKFSYTSEDEAWKTYLENPLTAATKAMMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550
pF1KE2 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
570 580 590 600
>>NP_937817 (OMIM: 606713,608317) grainyhead-like protei (626 aa)
initn: 3513 init1: 3513 opt: 3513 Z-score: 3400.5 bits: 639.2 E(85289): 1.1e-182
Smith-Waterman score: 3513; 100.0% identity (100.0% similar) in 518 aa overlap (1-518:48-565)
10 20 30
pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 VNLQKFSYTSEDEAWKTYLENPLTAATKAMMRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 SSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEYPDLLKKNNLMSLEG
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 ALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDST
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 FKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQ
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 FYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 ADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQID
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 TYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGCLLSG
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 FRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLPLKRTCSPFTE
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 EFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYK
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550
pF1KE2 VYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
::::::::
NP_937 VYKKCKRGETSLLHPRLSRHPPPDCLECSHPVTQVRNMGFGDGFWRQRDLDSNPSPTTVN
560 570 580 590 600 610
>>XP_011540172 (OMIM: 606713,608317) PREDICTED: grainyhe (509 aa)
initn: 3436 init1: 3436 opt: 3436 Z-score: 3327.4 bits: 625.4 E(85289): 1.3e-178
Smith-Waterman score: 3436; 100.0% identity (100.0% similar) in 509 aa overlap (47-555:1-509)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 YDYYMGPKEKRILSSSTGGRNDQGKRYYHGMEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEY
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEYETDLTPLESPTHLMKFLTENVSGTPEY
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80 90 100 110 120 130
pF1KE2 PDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESI
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pF1KE2 HGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESMLFPDILKTSPEPPCPEDYPSLKSDFEYTLGSPKAIHI
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pF1KE2 KSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHW
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pF1KE2 HSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSS
220 230 240 250 260 270
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pF1KE2 QKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCP
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pF1KE2 DSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSSNSGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSS
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pF1KE2 NRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NRLPLKRTCSPFTEEFEPLPSKQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNA
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pF1KE2 ISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
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>>XP_016859389 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (479 aa)
initn: 1394 init1: 878 opt: 1423 Z-score: 1381.6 bits: 265.3 E(85289): 3.2e-70
Smith-Waterman score: 1423; 51.8% identity (75.1% similar) in 446 aa overlap (123-555:34-479)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 PTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFK
..: . .. : : .: .:: :::::.
XP_016 HSIKTETQPHGFAVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSSGAQAPNAQRRTPDSTFS
10 20 30 40 50 60
160 170 180 190 200
pF1KE2 DDPQESM---LFPDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYL
. .:.. .::. :. ::: :.. ..::::: . :... : :.: :.::
XP_016 ETFKEGVQEVFFPSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLEASKSLRQKPGDSTMTYL
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pF1KE2 NKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQR
:::::::.::. ....:. .::.::.:::: ..: .::: ::.::::: :::::
XP_016 NKGQFYPITLKEVSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQLRHWKYWHSRQHTAKQR
130 140 150 160 170 180
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pF1KE2 VIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLN
::.:: ::.:::. .:::.::::.::.:..:.::::::.::::::::::::::::.:::
XP_016 CIDIADYKESFNTISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNCLSTDFSSQKGVKGLPLN
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 LQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSN-----S
.:.:::. . ... :::: ::::.:::::::::.::.:::: .:: :::: :. :
XP_016 IQVDTYSYNNRSNKPVHRAYCQIKVFCDKGAERKIRDEERKQSKRKGKCPDPSSQVNAFS
250 260 270 280 290 300
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pF1KE2 GVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLP-
:: :: . . . : ..: ::.: ::::::.:::..:::. . : :. ..
XP_016 DVKVPLLPSHKRMDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRGTHVLPIASEELEGEGSV
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 LKRTCSPFTEEFEPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISE
::: ..: :: : :. . .:::::::.:.::::::::::::.:::: .:::.
XP_016 LKRGPYGTEDDFAVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDALMLKTPSLKGLMEAISD
370 380 390 400 410 420
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pF1KE2 KYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
:: :...: :..::::.:::::::.::..::::. .: :.. : :. .. : :.
XP_016 KYDVPHDKIGKIFKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIEEAGGSYKLTLTEI
430 440 450 460 470
>>XP_011508645 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (583 aa)
initn: 1504 init1: 878 opt: 1423 Z-score: 1380.4 bits: 265.3 E(85289): 3.8e-70
Smith-Waterman score: 1509; 45.1% identity (69.0% similar) in 583 aa overlap (1-555:2-583)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILSSSTGGRN---DQGKRYYHGMEYETDL-TP
: .:::.::.:::..::::: :.:.: ... .. :..:: . : : .
XP_011 MMSINGDEDSAAALGLLYDYYKVPRERRSSTAKPEVEHPEPDHSKRNSIPIVTEQPLISA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE2 LESPTHLMKFLTENVS-------GTPEYPDLLKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKL
:. ....: . :. : . : .. ... : : .. . : .
XP_011 GENRVQVLKNVPFNIVLPHGNQLGIDKRGHLTAPDTTVTVSIAT-MPTHSIKTETQPHGF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 EAGSVDSYLLPTTD----MYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESM---LF
.: . : ..: . .. : : .: .:: :::::.. .:.. .:
XP_011 AVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSSGAQAPNAQRRTPDSTFSETFKEGVQEVFF
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KE2 PDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRT
:. :. ::: :.. ..::::: . :... : :.: :.:::::::::.::.
XP_011 PSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLEASKSLRQKPGDSTMTYLNKGQFYPITLKE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 PAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFN
....:. .::.::.:::: ..: .::: ::.::::: ::::: ::.:: ::.::
XP_011 VSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQLRHWKYWHSRQHTAKQRCIDIADYKESFN
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 TVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGT
:. .:::.::::.::.:..:.::::::.::::::::::::::::.:::.:.:::. . .
XP_011 TISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNCLSTDFSSQKGVKGLPLNIQVDTYSYNNRS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 ERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSN-----SGVKGCLLSGFRG
.. :::: ::::.:::::::::.::.:::: .:: :::: :. : :: :: . .
XP_011 NKPVHRAYCQIKVFCDKGAERKIRDEERKQSKRKGKCPDPSSQVNAFSDVKVPLLPSHKR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 NETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLP-LKRTCSPFTEEF
. : ..: ::.: ::::::.:::..:::. . : :. .. ::: ..:
XP_011 MDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRGTHVLPIASEELEGEGSVLKRGPYGTEDDF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 EPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKV
:: : :. . .:::::::.:.::::::::::::.:::: .:::.:: :...: :.
XP_011 AVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDALMLKTPSLKGLMEAISDKYDVPHDKIGKI
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550
pF1KE2 YKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
.::::.:::::::.::..::::. .: :.. : :. .. : :.
XP_011 FKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIEEAGGSYKLTLTEI
540 550 560 570 580
>>XP_006711945 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (630 aa)
initn: 1504 init1: 878 opt: 1423 Z-score: 1379.9 bits: 265.3 E(85289): 4e-70
Smith-Waterman score: 1509; 45.1% identity (69.0% similar) in 583 aa overlap (1-555:49-630)
10 20 30
pF1KE2 MRVNGDDDSVAALSFLYDYYMGPKEKRILS
: .:::.::.:::..::::: :.:.: .
XP_006 LYPQRRSYTSEDEAWKSFLENPLTAATKAMMSINGDEDSAAALGLLYDYYKVPRERRSST
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70
pF1KE2 SSTGGRN---DQGKRYYHGMEYETDL-TPLESPTHLMKFLTENVS-------GTPEYPDL
.. .. :..:: . : : . :. ....: . :. : . :
XP_006 AKPEVEHPEPDHSKRNSIPIVTEQPLISAGENRVQVLKNVPFNIVLPHGNQLGIDKRGHL
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 LKKNNLMSLEGALPTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTD----MYDNGSLNSLFES
.. ... : : .. . : . .: . : ..: . .. : :
XP_006 TAPDTTVTVSIAT-MPTHSIKTETQPHGFAVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSS
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180
pF1KE2 IHGVPPTQRWQPDSTFKDDPQESM---LFPDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLG
.: .:: :::::.. .:.. .::. :. ::: :.. ..:::::
XP_006 GAQAPNAQRRTPDSTFSETFKEGVQEVFFPSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLE
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SPKAIHIKSGESPMAYLNKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQ
. :... : :.: :.:::::::::.::. ....:. .::.::.:::: ..: .:
XP_006 ASKSLRQKPGDSTMTYLNKGQFYPITLKEVSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQ
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250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LRFWKHWHSRQPTAKQRVIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNC
:: ::.::::: ::::: ::.:: ::.:::. .:::.::::.::.:..:.::::::.:::
XP_006 LRHWKYWHSRQHTAKQRCIDIADYKESFNTISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNC
320 330 340 350 360 370
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pF1KE2 LSTDFSSQKGVKGVPLNLQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQF
:::::::::::::.:::.:.:::. . ... :::: ::::.:::::::::.::.::::
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370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RRKVKCPDSSN-----SGVKGCLLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRS
.:: :::: :. : :: :: . . . : ..: ::.: ::::::.:::..:::.
XP_006 KRKGKCPDPSSQVNAFSDVKVPLLPSHKRMDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRG
440 450 460 470 480 490
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pF1KE2 GGAAPSAGPSSSNRLP-LKRTCSPFTEEFEPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDA
. : :. .. ::: ..: :: : :. . .:::::::.:.::::::
XP_006 THVLPIASEELEGEGSVLKRGPYGTEDDFAVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDA
500 510 520 530 540 550
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pF1KE2 LMLKTPDLKGLRNAISEKYGFPEENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMG
::::::.:::: .:::.:: :...: :..::::.:::::::.::..::::. .: :..
XP_006 LMLKTPSLKGLMEAISDKYDVPHDKIGKIFKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIE
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pF1KE2 ELDGKIQIILKEL
: :. .. : :.
XP_006 EAGGSYKLTLTEI
620 630
>>XP_016859390 (OMIM: 609786) PREDICTED: grainyhead-like (467 aa)
initn: 1236 init1: 848 opt: 1386 Z-score: 1346.0 bits: 258.6 E(85289): 3.1e-68
Smith-Waterman score: 1386; 51.5% identity (74.8% similar) in 441 aa overlap (123-555:34-467)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 PTPGKAAPLPAGPSKLEAGSVDSYLLPTTDMYDNGSLNSLFESIHGVPPTQRWQPDSTFK
..: . .. : : .: .:: :::::.
XP_016 HSIKTETQPHGFAVGIPPAVYHPEPTERVVVFDRNLNTDQFSSGAQAPNAQRRTPDSTFS
10 20 30 40 50 60
160 170 180 190 200
pF1KE2 DDPQESM---LFPDILKTSPEPPCPEDY--PSLK-SDFEYTLGSPKAIHIKSGESPMAYL
. .:.. .::. :. ::: :.. ..::::: . :... : :.: :.::
XP_016 ETFKEGVQEVFFPSDLSLRMPGMNSEDYVFDSVSGNNFEYTLEASKSLRQKPGDSTMTYL
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 NKGQFYPVTLRTPAGGKGLALSSNKVKSVVMVVFDNEKVPVEQLRFWKHWHSRQPTAKQR
:::::::.::. ....:. .::.::.:::: ..: .::: ::.::::: :::::
XP_016 NKGQFYPITLKEVSSSEGIHHPISKVRSVIMVVFAEDKSREDQLRHWKYWHSRQHTAKQR
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 VIDVADCKENFNTVEHIEEVAYNALSFVWNVNEEAKVFIGVNCLSTDFSSQKGVKGVPLN
::.:: ::.:::. .:::.::::.::.:..:.::::::.::::::::::::::::.:::
XP_016 CIDIADYKESFNTISNIEEIAYNAISFTWDINDEAKVFISVNCLSTDFSSQKGVKGLPLN
190 200 210 220 230 240
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pF1KE2 LQIDTYDCGLGTERLVHRAVCQIKIFCDKGAERKMRDDERKQFRRKVKCPDSSNSGVKGC
.:.:::. . ... :::: ::::.:::::::::.::.:::: .::: : ::
XP_016 IQVDTYSYNNRSNKPVHRAYCQIKVFCDKGAERKIRDEERKQSKRKV-------SDVKVP
250 260 270 280 290
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pF1KE2 LLSGFRGNETTYLRPETDLETPPVLFIPNVHFSSLQRSGGAAPSAGPSSSNRLP-LKRTC
:: . . . : ..: ::.: ::::::.:::..:::. . : :. .. :::
XP_016 LLPSHKRMDITVFKPFIDLDTQPVLFIPDVHFANLQRGTHVLPIASEELEGEGSVLKRGP
300 310 320 330 340 350
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pF1KE2 SPFTEEFEPLPS-KQAKEGDLQRVLLYVRRETEEVFDALMLKTPDLKGLRNAISEKYGFP
..: :: : :. . .:::::::.:.::::::::::::.:::: .:::.:: :
XP_016 YGTEDDFAVPPSTKLARIEEPKRVLLYVRKESEEVFDALMLKTPSLKGLMEAISDKYDVP
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 EENIYKVYKKCKRGILVNMDNNIIQHYSNHVAFLLDMGELDGKIQIILKEL
...: :..::::.:::::::.::..::::. .: :.. : :. .. : :.
XP_016 HDKIGKIFKKCKKGILVNMDDNIVKHYSNEDTFQLQIEEAGGSYKLTLTEI
420 430 440 450 460
555 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:15:20 2016 done: Tue Nov 8 03:15:22 2016
Total Scan time: 8.350 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]