FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2498, 4388 aa
1>>>pF1KE2498 4388 - 4388 aa - 4388 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6034+/-0.00106; mu= 22.2533+/- 0.065
mean_var=81.8482+/-16.434, 0's: 0 Z-trim(103.5): 33 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.141765
statistics sampled from 7402 (7422) to 7402 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 11.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30588.1 VPS13D gene_id:55187|Hs108|chr1 (4388) 28934 5929.0 0
CCDS30589.1 VPS13D gene_id:55187|Hs108|chr1 (4363) 18744 3844.9 0
CCDS58367.1 VPS13C gene_id:54832|Hs108|chr15 (3585) 427 98.6 1.1e-18
CCDS10180.1 VPS13C gene_id:54832|Hs108|chr15 (3710) 427 98.6 1.1e-18
CCDS47983.1 VPS13A gene_id:23230|Hs108|chr9 (3069) 417 96.5 3.8e-18
CCDS6656.1 VPS13A gene_id:23230|Hs108|chr9 (3095) 417 96.5 3.8e-18
CCDS55321.1 VPS13A gene_id:23230|Hs108|chr9 (3135) 417 96.5 3.9e-18
CCDS6655.1 VPS13A gene_id:23230|Hs108|chr9 (3174) 417 96.5 3.9e-18
>>CCDS30588.1 VPS13D gene_id:55187|Hs108|chr1 (4388 aa)
initn: 28934 init1: 28934 opt: 28934 Z-score: 31957.6 bits: 5929.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 28934; 100.0% identity (100.0% similar) in 4388 aa overlap (1-4388:1-4388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MLEGLVAWVLNTYLGKYVNNLNTDQLSVALLKGAVELENLPLKKDALKELELPFEVKAGF
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CCDS30 MLEGLVAWVLNTYLGKYVNNLNTDQLSVALLKGAVELENLPLKKDALKELELPFEVKAGF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IGKVTLQIPFYRPHVDPWVISISSLHLIGAPEKIQDFNDEKEKLLERERKKALLQALEEK
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CCDS30 IGKVTLQIPFYRPHVDPWVISISSLHLIGAPEKIQDFNDEKEKLLERERKKALLQALEEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 WKNDRQQKGESYWYSVTASVVTRIVENIELKIQDVHLRFEDGVTNPSHPFAFGICIKNVS
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CCDS30 WKNDRQQKGESYWYSVTASVVTRIVENIELKIQDVHLRFEDGVTNPSHPFAFGICIKNVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MQNAVNEPVQKLMRKKQLDVAEFSIYWDVDCTLLGDLPQMELQEAMARSMESRSHHYVLE
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CCDS30 MQNAVNEPVQKLMRKKQLDVAEFSIYWDVDCTLLGDLPQMELQEAMARSMESRSHHYVLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PVFASALLKRNCSKKPLRSRHSPRIDCDIQLETIPLKLSQLQYRQIMEFLKELERKERQV
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CCDS30 PVFASALLKRNCSKKPLRSRHSPRIDCDIQLETIPLKLSQLQYRQIMEFLKELERKERQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KFRRWKPKVAISKNCREWWYFALNANLYEIREQRKRCTWDFMLHRARDAVSYTDKYFNKL
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CCDS30 KFRRWKPKVAISKNCREWWYFALNANLYEIREQRKRCTWDFMLHRARDAVSYTDKYFNKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KGGLLSTDDKEEMCRIEEEQSFEELKILRELVHDRFHKQEELAESLREPQFDSPGACPGA
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CCDS30 KGGLLSTDDKEEMCRIEEEQSFEELKILRELVHDRFHKQEELAESLREPQFDSPGACPGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PEPGGGSGMLQYLQSWFPGWGGWYGQQTPEGNVVEGLSAEQQEQWIPEEILGTEEFFDPT
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CCDS30 PEPGGGSGMLQYLQSWFPGWGGWYGQQTPEGNVVEGLSAEQQEQWIPEEILGTEEFFDPT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ADASCMNTYTKRDHVFAKLNLQLQRGTVTLLHKEQGTPQMNESAFMQLEFSDVKLLAESL
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CCDS30 ADASCMNTYTKRDHVFAKLNLQLQRGTVTLLHKEQGTPQMNESAFMQLEFSDVKLLAESL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 PRRNSSLLSVRLGGLFLRDLATEGTMFPLLVFPNPQKEVGRVSQSFGLQTTSADRSDHYP
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CCDS30 PRRNSSLLSVRLGGLFLRDLATEGTMFPLLVFPNPQKEVGRVSQSFGLQTTSADRSDHYP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AADPDGPVFEMLYERNPAHSHFERRLNVSTRPLNIIYNPQAIKKVADFFYKGKVHTSGFG
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CCDS30 AADPDGPVFEMLYERNPAHSHFERRLNVSTRPLNIIYNPQAIKKVADFFYKGKVHTSGFG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 YQSELELRVAEAARRQYNKLKMQTKAEIRQTLDRLLVGDFIEESKRWTVRLDISAPQVIF
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CCDS30 YQSELELRVAEAARRQYNKLKMQTKAEIRQTLDRLLVGDFIEESKRWTVRLDISAPQVIF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PDDFKFKNPVLVVVDLGRMLLTNTQDNSRRKSRDGSASEETQFSDDEYKTPLATPPNTPP
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CCDS30 PDDFKFKNPVLVVVDLGRMLLTNTQDNSRRKSRDGSASEETQFSDDEYKTPLATPPNTPP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 PESSSSNGEKTPPFSGVEFSEEQLQAHLMSTKMYERYSLSFMDLQIMVGRVKDNWKHVQD
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CCDS30 PESSSSNGEKTPPFSGVEFSEEQLQAHLMSTKMYERYSLSFMDLQIMVGRVKDNWKHVQD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 IDVGPTHVVEKFNVHLQLERRLIYTSDPKYPGAVLSGNLPDLKIHINEDKISALKNCFAL
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CCDS30 IDVGPTHVVEKFNVHLQLERRLIYTSDPKYPGAVLSGNLPDLKIHINEDKISALKNCFAL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 LTTPEMKTSDTQIKEKIFPQEEQRGSLQDSVMNLTQSIVLLEQHTREVLVESQLLLAEFK
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CCDS30 LTTPEMKTSDTQIKEKIFPQEEQRGSLQDSVMNLTQSIVLLEQHTREVLVESQLLLAEFK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 VNCMQLGVESNGRYISVLKVFGTNAHFVKRPYDAEVSLTVHGLLLVDTMQTYGADFDLLM
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CCDS30 VNCMQLGVESNGRYISVLKVFGTNAHFVKRPYDAEVSLTVHGLLLVDTMQTYGADFDLLM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 ASHKNLSFDIPTGSLRDSRAQSPVSGPNVAHLTDGATLNDRSATSVSLDKILTKEQESLI
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CCDS30 ASHKNLSFDIPTGSLRDSRAQSPVSGPNVAHLTDGATLNDRSATSVSLDKILTKEQESLI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 KLEYQFVSSECPSMNLDSTLQVISLQVNNLDIILNPETIVELIGFLQKSFPKEKDDLSPQ
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CCDS30 KLEYQFVSSECPSMNLDSTLQVISLQVNNLDIILNPETIVELIGFLQKSFPKEKDDLSPQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 PLMTDFERSFREQGTYQSTYEQNTEVAVEIHRLNLLLLRTVGMANREKYGRKIATASIGG
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CCDS30 PLMTDFERSFREQGTYQSTYEQNTEVAVEIHRLNLLLLRTVGMANREKYGRKIATASIGG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 TKVNVSMGSTFDMNGSLGCLQLMDLTQDNVKNQYVVSIGNSVGYENIISDIGYFESVFVR
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CCDS30 TKVNVSMGSTFDMNGSLGCLQLMDLTQDNVKNQYVVSIGNSVGYENIISDIGYFESVFVR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 MEDAALTEALSFTFVERSKQECFLNLKMASLHYNHSAKFLKELTLSMDELEENFRGMLKS
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CCDS30 MEDAALTEALSFTFVERSKQECFLNLKMASLHYNHSAKFLKELTLSMDELEENFRGMLKS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 AATKVTTVLATKTAEYSEMVSLFETPRKTREPFILEENEIYGFDLASSHLDTVKLILNIN
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CCDS30 AATKVTTVLATKTAEYSEMVSLFETPRKTREPFILEENEIYGFDLASSHLDTVKLILNIN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 IESPVVSIPRKPGSPELLVGHLGQIFIQNFVAGDDESRSDRLQVEIKDIKLYSLNCTQLA
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CCDS30 IESPVVSIPRKPGSPELLVGHLGQIFIQNFVAGDDESRSDRLQVEIKDIKLYSLNCTQLA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 GREAVGSEGSRMFCPPSGSGSANSQEEAHFTRHDFFESLHRGQAFHILNNTTIQFKLEKI
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CCDS30 GREAVGSEGSRMFCPPSGSGSANSQEEAHFTRHDFFESLHRGQAFHILNNTTIQFKLEKI
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 PIERESELTFSLSPDDLGTSSIMKIEGKFVNPVQVVLAKHVYEQVLQTLDNLVYSEDLNK
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CCDS30 PIERESELTFSLSPDDLGTSSIMKIEGKFVNPVQVVLAKHVYEQVLQTLDNLVYSEDLNK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 YPASATSSPCPDSPLPPLSTCGESSVERKENGLFSHSSLSNTSQKSLSVKEVKSFTQIQA
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CCDS30 YPASATSSPCPDSPLPPLSTCGESSVERKENGLFSHSSLSNTSQKSLSVKEVKSFTQIQA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 TFCISELQVQLSGDLTLGAQGLVSLKFQDFEVEFSKDHPQTLSIQIALHSLLMEDLLEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TFCISELQVQLSGDLTLGAQGLVSLKFQDFEVEFSKDHPQTLSIQIALHSLLMEDLLEKN
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 PDSKYKNLMVSRGAPKPSSLAQKEYLSQSCPSVSNVEYPDMPRSLPSHMEEAPNVFQLYQ
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CCDS30 PDSKYKNLMVSRGAPKPSSLAQKEYLSQSCPSVSNVEYPDMPRSLPSHMEEAPNVFQLYQ
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 RPTSASRKKQKEVQDKDYPLTPPPSPTVDEPKILVGKSKFDDSLVHINIFLVDKKHPEFS
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CCDS30 RPTSASRKKQKEVQDKDYPLTPPPSPTVDEPKILVGKSKFDDSLVHINIFLVDKKHPEFS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 SSYNRVNRSIDVDFNCLDVLITLQTWVVILDFFGIGSTADNHAMRLPPEGILHNVKLEPH
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CCDS30 SSYNRVNRSIDVDFNCLDVLITLQTWVVILDFFGIGSTADNHAMRLPPEGILHNVKLEPH
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 ASMESGLQDPVNTKLDLKVHSLSLVLNKTTSELAKANVSKLVAHLEMIEGDLALQGSIGS
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CCDS30 ASMESGLQDPVNTKLDLKVHSLSLVLNKTTSELAKANVSKLVAHLEMIEGDLALQGSIGS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 LSLSDLTCHGEFYRERFTTSGEEALIFQTFKYGRPDPLLRREHDIRVSLRMASVQYVHTQ
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CCDS30 LSLSDLTCHGEFYRERFTTSGEEALIFQTFKYGRPDPLLRREHDIRVSLRMASVQYVHTQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 RFQAEVVAFIQHFTQLQDVLGRQRAAIEGQTVRDQAQRCSRVLLDIEAGAPVLLIPESSR
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CCDS30 RFQAEVVAFIQHFTQLQDVLGRQRAAIEGQTVRDQAQRCSRVLLDIEAGAPVLLIPESSR
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE2 SNNLIVANLGKLKVKNKFLFAGFPGTFSLQDKESVPSASPTGIPKHSLRKTTSTEEPRGT
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CCDS30 SNNLIVANLGKLKVKNKFLFAGFPGTFSLQDKESVPSASPTGIPKHSLRKTTSTEEPRGT
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE2 HSQGQFTMPLAGMSLGSLKSEFVPSTSTKQQGPQPTLSVGQESSSPEDHVCLLDCVVVDL
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CCDS30 HSQGQFTMPLAGMSLGSLKSEFVPSTSTKQQGPQPTLSVGQESSSPEDHVCLLDCVVVDL
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE2 QDMDIFAAERHPREYSKAPEDSSGDLIFPSYFVRQTGGSLLTEPCRLKLQVERNLDKEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QDMDIFAAERHPREYSKAPEDSSGDLIFPSYFVRQTGGSLLTEPCRLKLQVERNLDKEIS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE2 HTVPDISIHGNLSSVHCSLDLYKYKLIRGLLENNLGEPIEEFMRPYDLQDPRIHTVLSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HTVPDISIHGNLSSVHCSLDLYKYKLIRGLLENNLGEPIEEFMRPYDLQDPRIHTVLSGE
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE2 VYTCMCFLIDMVNVSLELKDPKRKEGAGSLARFDFKKCKLLYESFSNQTKSINLVSHSMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VYTCMCFLIDMVNVSLELKDPKRKEGAGSLARFDFKKCKLLYESFSNQTKSINLVSHSMM
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE2 AFDTRYAGQKTSPGMTNVFSCIFQPAKNSSTTQGSIQIELHFRSTKDSSCFTVVLNNLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AFDTRYAGQKTSPGMTNVFSCIFQPAKNSSTTQGSIQIELHFRSTKDSSCFTVVLNNLRV
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE2 FLIFDWLLLVHDFLHTPSDIKKQNHVTPSRHRNSSSESAIVPKTVKSGVVTKRSSLPVSN
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CCDS30 FLIFDWLLLVHDFLHTPSDIKKQNHVTPSRHRNSSSESAIVPKTVKSGVVTKRSSLPVSN
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE2 ERHLEVKVNVTGTEFVVIEDVSCFDTNAIILKGTTVLTYKPRFVDRPFSGSLFGIEVFSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ERHLEVKVNVTGTEFVVIEDVSCFDTNAIILKGTTVLTYKPRFVDRPFSGSLFGIEVFSC
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KE2 RLGNEHDTALSIVDPVQIQMELVGNSSYQNSSGLMDAFNSEDFPPVLEIQLQALDIRLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RLGNEHDTALSIVDPVQIQMELVGNSSYQNSSGLMDAFNSEDFPPVLEIQLQALDIRLSY
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KE2 NDVQLFLAIAKSIPEQANAAVPDSVALESDSVGTYLPGASRVGEEIREGTRHTLDPVLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NDVQLFLAIAKSIPEQANAAVPDSVALESDSVGTYLPGASRVGEEIREGTRHTLDPVLEL
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KE2 QLARLQELGFSMDDCRKALLACQGQLKKAASWLFKNAEPLKSLSLASTSRDSPGAVAAPL
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CCDS30 QLARLQELGFSMDDCRKALLACQGQLKKAASWLFKNAEPLKSLSLASTSRDSPGAVAAPL
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KE2 ISGVEIKAESVCICFIDDCMDCDVPLAELTFSRLNFLQRVRTSPEGYAHFTLSGDYYNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ISGVEIKAESVCICFIDDCMDCDVPLAELTFSRLNFLQRVRTSPEGYAHFTLSGDYYNRA
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KE2 LSGWEPFIEPWPCSVSWQQQAASRLHPPRLKLEAKAKPRLDINITSVLIDQYVSTKESWM
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CCDS30 LSGWEPFIEPWPCSVSWQQQAASRLHPPRLKLEAKAKPRLDINITSVLIDQYVSTKESWM
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830 2840 2850 2860 2870 2880
pF1KE2 ADYCKDDKDIESAKSEDWMGSSVDPPCFGQSLPLVYLRTRSTASLTNLEHQIYARAEVKT
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CCDS30 ADYCKDDKDIESAKSEDWMGSSVDPPCFGQSLPLVYLRTRSTASLTNLEHQIYARAEVKT
2830 2840 2850 2860 2870 2880
2890 2900 2910 2920 2930 2940
pF1KE2 PKRRQPFVPFALRNHTGCTLWFATLTTTPTRAALSHSGSPGVVPEGNGTFLDDTHNVSEW
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CCDS30 PKRRQPFVPFALRNHTGCTLWFATLTTTPTRAALSHSGSPGVVPEGNGTFLDDTHNVSEW
2890 2900 2910 2920 2930 2940
2950 2960 2970 2980 2990 3000
pF1KE2 REVLTGEEIPFEFEARGKLRHRHTHDLRIHQLQVRVNGWEQVSPVSVDKVGTFFRYAAPD
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CCDS30 REVLTGEEIPFEFEARGKLRHRHTHDLRIHQLQVRVNGWEQVSPVSVDKVGTFFRYAAPD
2950 2960 2970 2980 2990 3000
3010 3020 3030 3040 3050 3060
pF1KE2 KNSSSSTIGSPSSRTNIIHPQVYFSSLPPVRVVFAVTMEGSARKVITVRSALIVRNRLET
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CCDS30 KNSSSSTIGSPSSRTNIIHPQVYFSSLPPVRVVFAVTMEGSARKVITVRSALIVRNRLET
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CCDS30 PMELRLDSPSAPDKPVVLPAIMPGDSFAVPLHLTSWRLQARPKGLGVFFCKAPIHWTNVV
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CCDS30 AATKVTTVLATKTAEYSEMVSLFETPRKTREPFILEENEIYGFDLASSHLDTVKLILNIN
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CCDS30 IESPVVSIPRKPGSPELLVGHLGQIFIQNFVAGDDESRSDRLQVEIKDIKLYSLNCTQLA
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CCDS30 GREAVGSEGSRMFCPPSGSGSANSQEEAHFTRHDFFESLHRGQAFHILNNTTIQFKLEKI
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CCDS30 PIERESELTFSLSPDDLGTSSIMKIEGKFVNPVQVVLAKHVYEQVLQTLDNLVYSEDLNK
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CCDS30 YPASATSSPCPDSPLPPLSTCGESSVERKENGLFSHSSLSNTSQKSLSVKEVKSFTQIQA
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CCDS30 TFCISELQVQLSGDLTLGAQGLVSLKFQDFEVEFSKDHPQTLSIQIALHSLLMEDLLEKN
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CCDS30 PDSKYKNLMVSRGAPKPSSLAQKEYLSQSCPSVSNVEYPDMPRSLPSHMEEAPNVFQLYQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RPTSASRKKQKEVQDKDYPLTPPPSPTVDEPKILVGKSKFDDSLVHINIFLVDKKHPEFS
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pF1KE2 QSIVLLEQHTREVLVESQLLLAE--FKVNCMQL-GVE-------SNGRYISVLKVFGTNA
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CCDS58 GTSLLLD--TVESESDDEYFDAEDGEPQTCKSMKGSELKKAAEVPNEELINLLLKFEIKE
820 830 840 850 860 870
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE2 ---HFVKRPYDAEVSLTVHGLLLVDTMQTYGADFDLLMASH-KNLSFDIPTGSLRDSRAQ
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CCDS58 VILEFTKQQKE-EDTILVFNVTQLGTEATMRT-FDLTVVSYLKKISLDYH--EIEGSK-R
880 890 900 910 920 930
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE2 SPVSGPNVAHLTDGATLNDRSATSVSLDKILTKEQESLIKLEYQFVSSECPSMN--LDST
.:. :: . :. . .:: :.:.:: .... ::.. . .:
CCDS58 KPL------HLIS-------SSDKPGLD---------LLKVEYIKADKNGPSFQTAFGKT
940 950 960
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pF1KE2 LQVISLQVNNLDIILNPETIVELIGFLQKSFPKEKDDLS-PQPLMTDFERSFREQGTYQS
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CCDS58 EQTVKVAFSSLNLLLQTQALVASINYLTTIIPSDDQSISVAKEVQISTEKQ-QKNSTLPK
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KE2 TYEQNTEVAVEIHRLNLLLLRTVGMANREKYGRKIATASIGGTKVNVSMGSTFD-MNGSL
. .. . . :: : .. :: .:: .: : ..:. : . . . :
CCDS58 AIVSSRDSDIIDFRLFAKLNAFCVIVCNEK--NNIAEIKIQGLDSSLSLQSRKQSLFARL
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pF1KE2 GCLQLMDLTQDNVKNQYVVSIGNSVGYENIISDIGYFESVFVRMEDAALTEALSFTFVER
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CCDS58 ENIIVTDVDPKTVHKKAVSIMGNEVFRFNL--DL---------YPDA--TEGDLYT--DM
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CCDS58 SKVDGVLSLNVGCIQIVYLHKFL----MSLLNFLNNFQTAKES--------LSAATAQAA
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: .. : : :::. . .. .::....::. ::.. : .
CCDS58 ERAA---TSVK---------------DLAQR---SFRVSINIDLKAPVIVIPQSSISTNA
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.. :: . ..: . .:.:.
CCDS58 -------------------IQLLHPINLEFLVNRNLAASWYHKVPV--------------
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pF1KE2 LGTSSIMKIEGKFVNPVQVVLAKHVYEQVLQTL-DNLVY-SEDLNKYPASATSSPCPDSP
..:.:.. . ..: : .. . ... : .:: .:::.:
CCDS58 ------VEIKGHL-DSMNVSLNQEDLNLLFRILTENLCEGTEDLDKVK------------
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pF1KE2 LPPLSTCGESSVERKENGLFSHSSLSNTSQKSLS--VKEVKSFTQIQA--TFCISELQVQ
: .. :: :: .: :. . :...:. :.:..: :. .: :.:. :
CCDS58 -PRVQETGEI----KEPLEISISQDVHDSKNTLTTGVEEIRSVDIINMLLNFEIKEVVVT
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pF1KE2 LSGDLTLGAQGLVSLKFQDFEVEFSKDHPQTLSIQIALHSLLMEDLLEKNPDSKYKNLMV
: .: .. .: .: :: : ..:. . ..: :.
CCDS58 L-------------MKKSE-----KKGRP--------LHEL---NVLQLGMEAKVKTY--
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... : ::.. :.. .. : .. : :. .. ::
CCDS58 --------DMTAKAYLKK--ISMQCFDFTD-SKGEPLHIINSSNV---------------
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pF1KE2 KEVQDKDYPLTPPPSPTVDEPKILVGKSKFDDSLVHINIFLVDKKHPEFSSSYNRVNRSI
: :: :.:. :. :. :::.. .. ... .
CCDS58 -----TDEPLL----------KMLLTKA--------------DSDGPEFKTIHDSTKQRL
1460 1470 1480
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pF1KE2 DVDFNCLDVLITLQTWVVILDF------FGIGSTADNHAMRLPPEGILHNVKLEPHASME
:.: ::... :.. . ..:: :. :...... : : ... .. .:
CCDS58 KVSFASLDLVLHLEALLSFMDFLSSAAPFSEPSSSEKESELKPLVGESRSIAVKAVSSNI
1490 1500 1510 1520 1530 1540
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pF1KE2 SGLQDPVNTKLDLKVHSLSLVLNKTTSELAKANVSKLVAHLEMIEGDLALQGSIGSLSLS
: .: . :. ....... . ..: .. . : . . . . . . .. .
CCDS58 SQ-KDVFDLKITAELNAFNVFVCDQKCNIADIKIHGMDASISVKPKQTDVFARLKDIIVM
1550 1560 1570 1580 1590 1600
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pF1KE2 DLTCHGEFYRERFTTSGEEALIFQTFKYGRPDPLLRREH------DIRVSLRMASVQYVH
.. .. .... . :.:.. :: : :: . . : ..:.... .: :.
CCDS58 NVDLQS-IHKKAVSILGDEVFRFQLTLY--PDATEGEAYADMSKVDGKLSFKVGCIQIVY
1610 1620 1630 1640 1650 1660
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pF1KE2 TQRFQAEVVAFIQHFTQLQDVLGR---QRAAIEGQTVRDQAQRCSRVLLDIEAGAPVLLI
...: .. :...: ...:. : : .....: ::. :.:.::. :::..:
CCDS58 VHKFFMSLLNFLNNFQTAKEALSTATVQAAERAASSMKDLAQKSFRLLMDINLKAPVIII
1670 1680 1690 1700 1710 1720
2040 2050 2060 2070 2080 2090
pF1KE2 PESSRSNNLIVANLGKLKVKNKFLFAGFPGTFSLQDKESVPSASPTGIPKHSLRKTTSTE
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CCDS58 PQSSVSPNAVIADLGLIRVENKFSLVPMEH-YSLP-----PVIDKMNIELTQLKLSRTIL
1730 1740 1750 1760 1770
2100 2110 2120 2130 2140 2150
pF1KE2 EPRGTHSQGQFTMPLAGMSLGSLKSEFVPSTSTKQQGPQ--PTLSVGQESSSPEDHVCLL
. ... .. :. .: : :.. ... . .. : . :. : . : .: . :.
CCDS58 QASLPQNDIEILKPV-NMLL-SIQRNLAAAWYVQIPGMEIKGKLKPMQVALSEDDLTVLM
1780 1790 1800 1810 1820 1830
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pF1KE2 DCVVVDLQDMDIFAAERHPREYSKAPEDSSGDLIFPSYFVRQTGGSLLTEPCRLKLQVER
.. .: . : .: .: .: . . ::.. : . : .:: : :
CCDS58 KILLENLGE-----ASSQP-----SPTQSVQETVR----VRKVDVS--SVPDHLKEQ-ED
1840 1850 1860 1870
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pF1KE2 NLDKEISHTVPDISIHGNLSSVHCSLDLYKYKLIRGLLENNLGEPIEEFMRPYDLQDPRI
:...: . .:.. .. :. ::. . : . ..: . :.
CCDS58 WTDSKLSMN-QIVSLQFDFHFESLSIILYNNDI-------NQESGVAFHNDSFQLGELRL
1880 1890 1900 1910 1920 1930
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pF1KE2 HTVLS-GEVYTCMCFLIDMVNVSLELKDPKRKEGAGSLARFDFKKCKLLYESFSNQTKSI
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CCDS58 HLMASSGKM-----FKDGSMNVSVKLKT-----------------CTLD-----------
1940 1950
2340 2350 2360 2370 2380 2390
pF1KE2 NLVSHSMMAFDTRYAGQKTSPGMTNVFSCIFQPAKNSSTTQGSIQIELHFRSTKDSSCFT
: : . .... : . ::.. ...:. :.. ... :..: .
CCDS58 ----------DLREGIERATSRMID--------RKNDQDNNSSM-IDISYKQDKNGSQID
1960 1970 1980 1990
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pF1KE2 VVLNNLRVFLIFDWLLLVHDFLHTPSDIKKQNHVTPSRHRNSSSESAIVPKTVKSGVVTK
.::..: : ..:. : ::. :: ..:. .: ..:. :.:. . .: :
CCDS58 AVLDKLYVCASVEFLMTVADFF-----IK----AVPQSPENVAKETQILPRQTATGKVKI
2000 2010 2020 2030 2040 2050
2460 2470 2480 2490 2500 2510
pF1KE2 RSSLPVSNERHLEVKVNVTGTEFVVIEDVSCFDTNAIILKGTTVLTYKPRFVDRPFSGSL
... : .. .:. .: : : . ... :. :. . :. . ... . .:.
CCDS58 EKDDSVRP--NMTLKAMITDPEVVFVASLTKADAPALTASFQCNLSLSTSKLEQMMEASV
2060 2070 2080 2090 2100
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pF1KE2 FGIEVFSCRLGNEH--DTALSIVDPVQIQME-LVGNSSYQNSSGLMDAFNSEDFPPVLEI
..:..: . :. . ....: .. :: . :. :: . .. : . : .:
CCDS58 RDLKVLACPFLREKRGKNITTVLQPCSLFMEKCTWASGKQNINIMVKEFIIKISPIIL--
2110 2120 2130 2140 2150 2160
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pF1KE2 QLQALDIRLSYNDVQLFLAIAKSIPEQANAAVPDSVALESDSVGTYLPGASRVGEEIREG
: : ..: : : . .: .:
CCDS58 -----------NTVLTIMA----------ALSPKT-------------------KE--DG
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.. : . .: . :..: .:. . . . : ::. : :
CCDS58 SKDTSKEMENLWGIK------SINDYNTWFLGVDTATEITES--FKGIEH-------SLI
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pF1KE2 RDSPGAVAAPLISGVEIKAESVCICFIDDCMDCDVPL--AELTFSRLNFLQRVRTSPEGY
... :.: . .... : : . ::: :: :: . .. . .
CCDS58 EENCGVV----VESIQVTLE----CGLGHRT---VPLLLAESKFS--GNIKNWTSLMAAV
2230 2240 2250 2260 2270
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pF1KE2 AHFTLSGDYYNRALSGWEPFIEPWPCSVSWQQQAASRLHPPRLKLEAKAKPRLDINITSV
: ::. :::. . :::.:: . .:. :.:..: .: : ..
CCDS58 ADVTLQVHYYNEIHAVWEPLIERVEGKRQWN-----------LRLDVKKNPVQDKSLLPG
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pF1KE2 LIDQYVSTKESWMADYCKDDKDIESAKSEDWMGSSVDPPCFGQSLPLVYLRTRSTASLTN
:... : :: . : :... :. ... :.. :. ...::: .
CCDS58 --DDFI--PEPQMAIH------ISSGNT---MNITISKSCLNVFNNLAKGFSEGTAS--T
2330 2340 2350 2360 2370
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pF1KE2 LEHQIYARAEVKTPKRRQPFVPFALRNHTGCTLWFATLTTTPTRAALSHSGSPGVVPEGN
..... :: ::...: .: . . . :. : : :: .
CCDS58 FDYSLKDRA------------PFTVKNAVG-----VPIKVKPN-CNLRVMG----FPEKS
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pF1KE2 GTF-LDDTHNVSEWREVLTGEEIPFEFEARGKLRHRHTHDLRIHQLQVRVNGWEQVSPVS
: .: .:. :. . .: ..:.: .. . : . .:. .:. .
CCDS58 DIFDVDAGQNL----ELEYASMVP---SSQGNLSILSRQESSFFTLTIVPHGYTEVANIP
2410 2420 2430 2440 2450 2460
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pF1KE2 VDKVGTFFRYAAPDKNSSSSTIGSPSSRTNIIHPQVYFSSLPPVRVVFAVTMEGSARKVI
: . : . : . . :.: : : : . .: ::. :::
CCDS58 VARPGRRL-YNVRNPNASHSD---------------------SVLVQIDAT-EGN--KVI
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pF1KE2 TVRSALIVRNRLETPMELRLDSPSAPDKPVVLPAIMPGDSFAVPLHLTSWRLQARPKGLG
:.:: : ..:.. . . .. . : : . : ::: :.: : . :
CCDS58 TLRSPLQIKNHFSIAFIIYKFVKNVKLLERIGIA-RPEEEFHVPLD--SYRCQLFIQPAG
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pF1KE2 VFFCKAPIHWTNVVKTAEISSSKRECHSMDTEKSRFFRFC-VAIKKENYPDYMPSNIFSD
.. . : . :. : :: . : : : . .. :: . : : .
CCDS58 ILEHQYKESTTYISWKEELHRS-REVRCMLQCPSVEVSFLPLIVNTVALPDEL-SYICTH
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pF1KE2 SAKQIFRQPGHTIYLLPTVVICNLLPCELDFYVKGMPINGTLKPGKEA-ALHTADTSQNI
. . .. :.: :.... :::: : . ..: . : :. : .::. ... .
CCDS58 GEDW---DVAYIIHLYPSLTLRNLLPYSLRYLLEGTAETHELAEGSTADVLHSRISGEIM
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pF1KE2 ELG-VSLENFPLCKELLIPPGTQNYM-VRMRLYDVNRRQLNLTIRIVCRAEGSLKIF-IS
:: :. .. .. : ... : . ... ..:.... : :: .. .
CCDS58 ELVLVKYQGKNWNGHFRIRDTLPEFFPVCFSSDSTEVTTVDLSVHV--RRIGSRMVLSVF
2670 2680 2690 2700 2710 2720
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pF1KE2 APYWLINKTGLPLIFRQDNAKTDAAGQFEEHELARSLSPLLFCYADKE--QPNLCTMRIG
.:::::::: : .:... .. ..:.. .:: . :. : ..:.
CCDS58 SPYWLINKTTRVLQYRSEDIHVKHPADFRD--------IILFSFKKKNIFTKNKVQLKIS
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pF1KE2 RGIHPEGMPGWCQGFSLDGGSGVRALKVIQQGNRPGLIYNIGIDVKKGRGRYIDTCMVIF
. .: ..:::: .. .: .: .. : .:...: . . . .: .
CCDS58 TS-------AWSSSFSLDTVGSYGCVKC--PAN--NMEYLVGVSIKMS--SFNLSRIVTL
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pF1KE2 APRYLLDNKSSHKLAFAQREFAR-GQGTANPEGYISTLPGSSVVFHWPRNDYDQLLCVRL
.: . :::: .: . :.: :. .: .::.. : . ::.. .: :::.
CCDS58 TPFCTIANKSSLELEVG--EIASDGSMPTNKWNYIAS---SECLPFWPESLSGKL-CVRV
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. . : : :. .:. ....: : . :... . :.::: . :
CCDS58 VGCEGS--SKPFFYNRQDNGTLLSLEDLNGGIL---VDVNTAEHSTVITFSDYHEGSAPA
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: : . .. . : : : . . : . .:: .:: :.
CCDS58 LIMNHTPWDILTYKQSGSPEEMV---LLPRQARLFAWADPT------------GT-----
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pF1KE2 NMNDFQDNRQLYYENFIYIAATYTFSGLQEGTGR-PVASNKAITCAELVLDVSPKTQRVI
:.: .. : : . . :..: :. : .: : . . :: :::.
CCDS58 --------RKL---TWTYAANVGEHDLLKDGCGQFPYDANIQIHWVSF-LD---GRQRVL
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pF1KE2 LKKKEPGKRSQLWRMTGTGMLAHEGSSVPHNPNKPSAARSTEGSAILDIAGLAAVTDNRY
: . . ... .. :.:
CCDS58 LFTDDVA-------LVSKALQAEE------------------------------------
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pF1KE2 EPLMLRKPDRRRSTTQTWSFREGKLTCGLHGLVVQAKGGLSGLFDGA--EVVLGPDTSME
... : ..: .::.: ::: . . . :: ::
CCDS58 ----MEQADY-------------EITLSLHSL------GLSLVNNESKQEVSYIGITSSG
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.. : :.: : .: : . ..: : .. ... ::.. .: ..
CCDS58 VVWEVKPKQ-----KWKPFS---QKQII-------LLEQSYQKHQISRDHGWIKLD-NNF
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pF1KE2 ELQKLKNPDTEQELEVLVRLEGGIGLSLINKVPEELVFASLTGINVHYTQLATSHMLELS
:.. :.: .:... .: : . : :.::.... : . .. :.
CCDS58 EVNFDKDP---MEMRLPIR------------SPIKRDF--LSGIQIEFKQSSHQRSLRAR
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pF1KE2 IQDVQVDNQLIGTTQPFMLY-VTPLSNENEVIETGPAVQVNAV-KFPSKSALTNIYKHLM
. .:::::: :. : ... :.: .. : : ..:... .: : . . .:..:
CCDS58 LYWLQVDNQLPGAMFPVVFHPVAPPKSIALDSEPKPFIDVSVITRFNEYSKVLQ-FKYFM
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pF1KE2 ITAQRFTVQIEEKLLLKLLSFFG-YDQAESE------VEKYDENLHEKTAEQGGTPIRY-
. :.....:.. .: ....: . :.: ... . :. . : . : .
CCDS58 VLIQEMALKIDQGFLGAIIALFTPTTDPEAERRRTKLIQQDIDALNAELMETSMTDMSIL
3220 3230 3240 3250 3260 3270
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pF1KE2 -YFENLKISIPQIKLSVFT------SNKLPLDLKALKS------TLGFPLIRFEDAVINL
.::...:: ...::. :.: .. :..: ..: : .: ...:
CCDS58 SFFEHFHISPVKLHLSLSLGSGGEESDKEKQEMFAVHSVNLLLKSIGATLTDVDDLIFKL
3280 3290 3300 3310 3320 3330
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pF1KE2 DPFTRVHPYETKEFIINDILKHFQEELLSQAARILGSVDFLGNPMGLLNDVSEGVTGLIK
. . . .. .: ....:..:..:.: .. ..: ::::.::. .:::: .:.
CCDS58 AYYEIRYQFYKRDQLIWSVVRHYSEQFLKQMYVLVLGLDVLGNPFGLIRGLSEGVEALFY
3340 3350 3360 3370 3380 3390
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pF1KE2 ---YGNVGG-------LIRNVT----HGVSNSA---AKFAGTLSDGLGK-TMDNRHQSER
: : : :. .: : :...: ....:... ::. :::...:..:
CCDS58 EPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRSLFGHTVGGAAGVVSRITGSVGKGLAAITMDKEYQQKR
3400 3410 3420 3430 3440 3450
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