Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2449
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2449, 940 aa
1>>>pF1KE2449 940 - 940 aa - 940 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5561+/-0.000467; mu= 15.5601+/- 0.029
mean_var=122.3595+/-24.570, 0's: 0 Z-trim(111.8): 116 B-trim: 123 in 1/56
Lambda= 0.115946
statistics sampled from 20358 (20474) to 20358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 9.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055383 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalac ( 940) 6312 1068.4 0
XP_016858726 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide ( 956) 6000 1016.2 0
NP_001316797 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylga ( 470) 3167 542.1 2.5e-153
XP_016858727 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide ( 501) 3153 539.7 1.3e-152
XP_016881181 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 1397 246.0 3.9e-64
NP_065207 (OMIM: 602273) polypeptide N-acetylgalac ( 559) 1397 246.0 3.9e-64
XP_005258296 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 1397 246.0 3.9e-64
XP_016858747 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1383 243.7 2e-63
XP_011508839 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1383 243.7 2e-63
XP_016858748 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1383 243.7 2e-63
NP_443149 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylgalac ( 556) 1372 241.9 7e-63
XP_016858750 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 556) 1372 241.9 7e-63
XP_016858749 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 561) 1371 241.7 7.9e-63
NP_001288556 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylga ( 561) 1371 241.7 7.9e-63
XP_011530295 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 522) 1263 223.6 2.1e-57
NP_001030017 (OMIM: 615138) polypeptide N-acetylga ( 601) 1263 223.6 2.3e-57
XP_016863733 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 609) 1263 223.7 2.3e-57
NP_938080 (OMIM: 608043) polypeptide N-acetylgalac ( 603) 1253 222.0 7.3e-57
NP_003765 (OMIM: 603565) polypeptide N-acetylgalac ( 578) 1246 220.8 1.6e-56
XP_011509231 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1232 218.5 8.6e-56
XP_005246506 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1232 218.5 8.6e-56
NP_004473 (OMIM: 601756) polypeptide N-acetylgalac ( 633) 1232 218.5 8.6e-56
XP_016859259 (OMIM: 601756) PREDICTED: polypeptide ( 633) 1232 218.5 8.6e-56
XP_011536124 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53
XP_016874234 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53
XP_005268664 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53
XP_006719277 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53
XP_016874233 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53
XP_011536121 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1186 210.8 1.8e-53
NP_009141 (OMIM: 605148) polypeptide N-acetylgalac ( 622) 1186 210.8 1.8e-53
NP_001278795 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylga ( 533) 1182 210.1 2.5e-53
NP_004472 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylgalac ( 571) 1182 210.1 2.6e-53
NP_078918 (OMIM: 608812,610290) polypeptide N-acet ( 581) 1169 207.9 1.2e-52
NP_001291443 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylga ( 527) 1165 207.2 1.8e-52
XP_006716146 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1165 207.3 2e-52
XP_006716147 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1165 207.3 2e-52
NP_071370 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylgalac ( 608) 1165 207.3 2e-52
XP_006716145 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1165 207.3 2e-52
XP_016860395 (OMIM: 608225) PREDICTED: polypeptide ( 563) 1149 204.6 1.2e-51
NP_001316024 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 517) 1145 203.9 1.8e-51
NP_001316025 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1145 203.9 1.8e-51
NP_001240756 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylga ( 532) 1145 203.9 1.8e-51
NP_078848 (OMIM: 608225) polypeptide N-acetylgalac ( 552) 1145 203.9 1.9e-51
XP_011535309 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 514) 1136 202.3 5e-51
XP_016876987 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 558) 1136 202.4 5.4e-51
XP_011535308 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 558) 1136 202.4 5.4e-51
XP_011535307 (OMIM: 615132) PREDICTED: polypeptide ( 558) 1136 202.4 5.4e-51
NP_065743 (OMIM: 615132) polypeptide N-acetylgalac ( 558) 1136 202.4 5.4e-51
NP_001161840 (OMIM: 615132) polypeptide N-acetylga ( 558) 1136 202.4 5.4e-51
XP_016856454 (OMIM: 602274) PREDICTED: polypeptide ( 598) 1134 202.1 7.1e-51
>>NP_055383 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalactosa (940 aa)
initn: 6312 init1: 6312 opt: 6312 Z-score: 5712.7 bits: 1068.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6312; 100.0% identity (100.0% similar) in 940 aa overlap (1-940:1-940)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNRIRKFFRGSGRVLAFIFVASVIWLLFDMAALRLSFSEINTRVIKEDIVRRERIGFRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MNRIRKFFRGSGRVLAFIFVASVIWLLFDMAALRLSFSEINTRVIKEDIVRRERIGFRVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PDQGKIFYSSIKEMKPPLRGHGKGAWGKENVRKTEESVLKVEVDLDQTQRERKMQNALGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PDQGKIFYSSIKEMKPPLRGHGKGAWGKENVRKTEESVLKVEVDLDQTQRERKMQNALGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GKVVPLWHPAHLQTLPVTPNKQKTDGRGTKPEASSHQGTPKQTTAQGAPKTSFIAAKGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GKVVPLWHPAHLQTLPVTPNKQKTDGRGTKPEASSHQGTPKQTTAQGAPKTSFIAAKGTQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VVKISVHMGRVSLKQEPRKSHSPSSDTSKLAAERDLNVTISLSTDRPKQRSQAVANERAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VVKISVHMGRVSLKQEPRKSHSPSSDTSKLAAERDLNVTISLSTDRPKQRSQAVANERAH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PASTAVPKSGEAMALNKTKTQSKEVNANKHKANTSLPFPKFTVNSNRLRKQSINETPLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PASTAVPKSGEAMALNKTKTQSKEVNANKHKANTSLPFPKFTVNSNRLRKQSINETPLGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LSKDDGARGAHGKKLNFSESHLVIITKEEEQKADPKEVSNSKTKTIFPKVLGKSQSKHIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LSKDDGARGAHGKKLNFSESHLVIITKEEEQKADPKEVSNSKTKTIFPKVLGKSQSKHIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RNRSEMSSSSLAPHRVPLSQTNHALTGGLEPAKINITAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RNRSEMSSSSLAPHRVPLSQTNHALTGGLEPAKINITAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 HQVLRIDVTLSPRDPKAPGQFGRPVVVPHGKEKEAERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HQVLRIDVTLSPRDPKAPGQFGRPVVVPHGKEKEAERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIED
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRSVHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRSVHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DYLKDNLDKYMSQFPKVRILRLKERHGLIRARLAGAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DYLKDNLDKYMSQFPKVRILRLKERHGLIRARLAGAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQRGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQRGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDVWGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDVWGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 VGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLDEYKELFYGHGDHLIDQGLDVGNLTQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLDEYKELFYGHGDHLIDQGLDVGNLTQQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 RELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRASGVLINVALGKCISIENTTVILEDCDGSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRASGVLINVALGKCISIENTTVILEDCDGSKE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKGAVRLHPCDNRNKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKGAVRLHPCDNRNKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KE2 ENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPVKPYQKWKFEKYYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPVKPYQKWKFEKYYEA
910 920 930 940
>>XP_016858726 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide N-a (956 aa)
initn: 5994 init1: 5994 opt: 6000 Z-score: 5430.5 bits: 1016.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6270; 98.3% identity (98.3% similar) in 956 aa overlap (1-940:1-956)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MNRIRKFFRGSGRVLAFIFVASVIWLLFDMAALRLSFSEINTRVIKEDIVRRERIGFRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MNRIRKFFRGSGRVLAFIFVASVIWLLFDMAALRLSFSEINTRVIKEDIVRRERIGFRVQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PDQGKIFYSSIKEMKPPLRGHGKGAWGKENVRKTEESVLKVEVDLDQTQRERKMQNALGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDQGKIFYSSIKEMKPPLRGHGKGAWGKENVRKTEESVLKVEVDLDQTQRERKMQNALGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GKVVPLWHPAHLQTLPVTPNKQKTDGRGTKPEASSHQGTPKQTTAQGAPKTSFIAAKGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKVVPLWHPAHLQTLPVTPNKQKTDGRGTKPEASSHQGTPKQTTAQGAPKTSFIAAKGTQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VVKISVHMGRVSLKQEPRKSHSPSSDTSKLAAERDLNVTISLSTDRPKQRSQAVANERAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVKISVHMGRVSLKQEPRKSHSPSSDTSKLAAERDLNVTISLSTDRPKQRSQAVANERAH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PASTAVPKSGEAMALNKTKTQSKEVNANKHKANTSLPFPKFTVNSNRLRKQSINETPLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PASTAVPKSGEAMALNKTKTQSKEVNANKHKANTSLPFPKFTVNSNRLRKQSINETPLGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LSKDDGARGAHGKKLNFSESHLVIITKEEEQKADPKEVSNSKTKTIFPKVLGKSQSKHIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSKDDGARGAHGKKLNFSESHLVIITKEEEQKADPKEVSNSKTKTIFPKVLGKSQSKHIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RNRSEMSSSSLAPHRVPLSQTNHALTGGLEPAKINITAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RNRSEMSSSSLAPHRVPLSQTNHALTGGLEPAKINITAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 HQVLRIDVTLSPRDPKAPGQFGRPVVVPHGKEKEAERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HQVLRIDVTLSPRDPKAPGQFGRPVVVPHGKEKEAERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIED
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRSVHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRSVHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 DYLKDNLDKYMSQFPKVRILRLKERHGLIRARLAGAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DYLKDNLDKYMSQFPKVRILRLKERHGLIRARLAGAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQRGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQRGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDVWGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDVWGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 VGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLDEYKELFYGHGDHLIDQGLDVGNLTQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLDEYKELFYGHGDHLIDQGLDVGNLTQQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 RELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRASGVLINVALGKCISIENTTVILEDCDGSKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRASGVLINVALGKCISIENTTVILEDCDGSKE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KE2 LQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKGAVRLHPCDNRNKGLKWLHKSTSVFHPEL------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKGAVRLHPCDNRNKGLKWLHKSTSVFHPELLSNSAC
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
pF1KE2 ----------VNHIVFENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPVKPYQKWKFEKYYEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSFPALLSLQVNHIVFENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPVKPYQKWKFEKYYEA
910 920 930 940 950
>>NP_001316797 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalact (470 aa)
initn: 3167 init1: 3167 opt: 3167 Z-score: 2873.6 bits: 542.1 E(85289): 2.5e-153
Smith-Waterman score: 3167; 100.0% identity (100.0% similar) in 456 aa overlap (485-940:15-470)
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 AERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIEDTRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLR
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTLAEIKTPLFLIHGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLR
10 20 30 40
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 SVHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTKDYLKDNLDKYMSQFPKVRILRLKERHGLIRARLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTKDYLKDNLDKYMSQFPKVRILRLKERHGLIRARLA
50 60 70 80 90 100
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 GAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEPLLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEPLLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQ
110 120 130 140 150 160
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 RGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIKETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIKETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDV
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700 710 720 730 740 750
pF1KE2 WGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSRVGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSRVGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLD
230 240 250 260 270 280
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 EYKELFYGHGDHLIDQGLDVGNLTQQRELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRASGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYKELFYGHGDHLIDQGLDVGNLTQQRELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRASGVL
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820 830 840 850 860 870
pF1KE2 INVALGKCISIENTTVILEDCDGSKELQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKGAVRLHPCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INVALGKCISIENTTVILEDCDGSKELQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKGAVRLHPCD
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pF1KE2 NRNKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVFENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPVKPYQKWKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRNKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVFENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPVKPYQKWKF
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940
pF1KE2 EKYYEA
::::::
NP_001 EKYYEA
470
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MNRIRKFFRGSGRVLAFIFVASVIWLLFDMAALRLSFSEINTRVIKEDIVRRERIGFRVQ
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pF1KE2 PDQGKIFYSSIKEMKPPLRGHGKGAWGKENVRKTEESVLKVEVDLDQTQRERKMQNALGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PDQGKIFYSSIKEMKPPLRGHGKGAWGKENVRKTEESVLKVEVDLDQTQRERKMQNALGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKVVPLWHPAHLQTLPVTPNKQKTDGRGTKPEASSHQGTPKQTTAQGAPKTSFIAAKGTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVKISVHMGRVSLKQEPRKSHSPSSDTSKLAAERDLNVTISLSTDRPKQRSQAVANERAH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PASTAVPKSGEAMALNKTKTQSKEVNANKHKANTSLPFPKFTVNSNRLRKQSINETPLGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSKDDGARGAHGKKLNFSESHLVIITKEEEQKADPKEVSNSKTKTIFPKVLGKSQSKHIS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RNRSEMSSSSLAPHRVPLSQTNHALTGGLEPAKINITAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HQVLRIDVTLSPRDPKAPGQFGRPVVVPHGKEKEAERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIED
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:::::
XP_016 TRPAGTSLVLCLYSGPDVQSS
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pF1KE2 TAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGTHQVLRIDVTLSPRDP-KAPGQFGRPVVVPHGKEKEA
:: . : ..::..:.:::.:. ...
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pF1KE2 ERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIEDTRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRS
.. .: ..::.. :..: ..:.. :.: :: .. .:::::::.. : .:.::::::.
XP_016 KEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRT
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pF1KE2 VHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTKDYLKDNLDKYMSQFP-KVRILRLKERHGLIRARLA
::::::::: :.:.::.:::: : .:.:: :..:.... :...:...: :::::::
XP_016 VHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLK
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pF1KE2 GAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEPLLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQ
:: . :.:.::::.: ::.:::::::: :. .:. :.::.:.::.: . ::. ...
XP_016 GAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMT
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pF1KE2 RGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIKETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDV
: : : .:: : .: . . . .: .: :.:::::::::..:: :.:::: :.:.
XP_016 YGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDI
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pF1KE2 WGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSRVGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLD
:::::.:.::..:.::: .::. ::.:::.::. .::.:: . ...: :.::::.:
XP_016 WGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMD
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pF1KE2 EYKELFYGHGDHLIDQGL---DVGNLTQQRELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRAS
:.:..:: .:. :. : :..... ::.::.:: :.:::::..:: . : :
XP_016 EFKNFFY-----IISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFS
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pF1KE2 -GVLINVALGKCISI----ENTTVILEDCDGSKELQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKG
: . :: ..:.. :: : . .: : : :.:: . :. . :. .:
XP_016 LGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDDLCLDVSKLNG
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pF1KE2 AVRLHPCDNRNKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVFENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPV
: . : . . . : . ... ..:. :..: : . .... .. :.
XP_016 PVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKL----TLQHV---NSNQCLDKATEEDSQVPSIRDCNGS
500 510 520 530 540
930 940
pF1KE2 KPYQKWKFEKYYEA
. :.:
XP_016 RS-QQWLLRNVTLPEIF
550
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400 410 420 430 440 450
pF1KE2 TAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGTHQVLRIDVTLSPRDP-KAPGQFGRPVVVPHGKEKEA
:: . : ..::..:.:::.:. ...
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pF1KE2 ERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIEDTRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRS
.. .: ..::.. :..: ..:.. :.: :: .. .:::::::.. : .:.::::::.
NP_065 KEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRT
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pF1KE2 VHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTKDYLKDNLDKYMSQFP-KVRILRLKERHGLIRARLA
::::::::: :.:.::.:::: : .:.:: :..:.... :...:...: :::::::
NP_065 VHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLK
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pF1KE2 GAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEPLLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQ
:: . :.:.::::.: ::.:::::::: :. .:. :.::.:.::.: . ::. ...
NP_065 GAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMT
200 210 220 230 240 250
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pF1KE2 RGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIKETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDV
: : : .:: : .: . . . .: .: :.:::::::::..:: :.:::: :.:.
NP_065 YGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDI
260 270 280 290 300 310
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 WGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSRVGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLD
:::::.:.::..:.::: .::. ::.:::.::. .::.:: . ...: :.::::.:
NP_065 WGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMD
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pF1KE2 EYKELFYGHGDHLIDQGL---DVGNLTQQRELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRAS
:.:..:: .:. :. : :..... ::.::.:: :.:::::..:: . : :
NP_065 EFKNFFY-----IISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFS
380 390 400 410 420 430
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pF1KE2 -GVLINVALGKCISI----ENTTVILEDCDGSKELQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKG
: . :: ..:.. :: : . .: : : :.:: . :. . :. .:
NP_065 LGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDDLCLDVSKLNG
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pF1KE2 AVRLHPCDNRNKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVFENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPV
: . : . . . : . ... ..:. :..: : . .... .. :.
NP_065 PVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKL----TLQHV---NSNQCLDKATEEDSQVPSIRDCNGS
500 510 520 530 540
930 940
pF1KE2 KPYQKWKFEKYYEA
. :.:
NP_065 RS-QQWLLRNVTLPEIF
550
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Smith-Waterman score: 1397; 40.3% identity (69.6% similar) in 516 aa overlap (427-932:46-548)
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pF1KE2 TAKAPSTEYNQSHIKALLPEDSGTHQVLRIDVTLSPRDP-KAPGQFGRPVVVPHGKEKEA
:: . : ..::..:.:::.:. ...
XP_005 IWVLLDMFLLLYFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEMGKPVVIPKEDQEKM
20 30 40 50 60 70
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ERRWKEGNFNVYLSDLIPVDRAIEDTRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRS
.. .: ..::.. :..: ..:.. :.: :: .. .:::::::.. : .:.::::::.
XP_005 KEMFKINQFNLMASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRT
80 90 100 110 120 130
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 VHSVINRSPPHLIKEILLVDDFSTKDYLKDNLDKYMSQFP-KVRILRLKERHGLIRARLA
::::::::: :.:.::.:::: : .:.:: :..:.... :...:...: :::::::
XP_005 VHSVINRSPRHMIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVPVHVIRMEQRSGLIRARLK
140 150 160 170 180 190
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 GAQNATGDVLTFLDSHVECNVGWLEPLLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQ
:: . :.:.::::.: ::.:::::::: :. .:. :.::.:.::.: . ::. ...
XP_005 GAAVSKGQVITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMT
200 210 220 230 240 250
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 RGIFVWPMNFGWRTIPPDVIAKNRIKETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDV
: : : .:: : .: . . . .: .: :.:::::::::..:: :.:::: :.:.
XP_005 YGGFNWKLNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDI
260 270 280 290 300 310
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 WGGENMELSFKVWMCGGEIEIIPCSRVGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLD
:::::.:.::..:.::: .::. ::.:::.::. .::.:: . ...: :.::::.:
XP_005 WGGENLEISFRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMD
320 330 340 350 360 370
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 EYKELFYGHGDHLIDQGL---DVGNLTQQRELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRAS
:.:..:: .:. :. : :..... ::.::.:: :.:::::..:: . : :
XP_005 EFKNFFY-----IISPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFS
380 390 400 410 420 430
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pF1KE2 -GVLINVALGKCISI----ENTTVILEDCDGSKELQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKG
: . :: ..:.. :: : . .: : : :.:: . :. . :. .:
XP_005 LGEIRNVETNQCLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTANKEIRTDDLCLDVSKLNG
440 450 460 470 480 490
870 880 890 900 910 920
pF1KE2 AVRLHPCDNRNKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVFENNQQLLCLEGNFSQKILKVAACDPV
: . : . . . : . ... ..:. :..: : . .... .. :.
XP_005 PVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKL----TLQHV---NSNQCLDKATEEDSQVPSIRDCNGS
500 510 520 530 540
930 940
pF1KE2 KPYQKWKFEKYYEA
. :.:
XP_005 RS-QQWLLRNVTLPEIF
550
>>XP_016858747 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide N-a (571 aa)
initn: 1311 init1: 827 opt: 1383 Z-score: 1259.7 bits: 243.7 E(85289): 2e-63
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pF1KE2 TEYNQSHIKALLPEDSGTHQVLRIDVTLSPRDPKAPGQFGRPVVVPHGKEKEAERRWKEG
:. ..::..:. :..:. ... .. .: .
XP_016 VFLLLYFSECNKCDDKKERSLLPALRAVISRNQEGPGEMGKAVLIPKDDQEKMKELFKIN
30 40 50 60 70 80
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pF1KE2 NFNVYLSDLIPVDRAIEDTRPAGCAEQLVHNNLPTTSVIMCFVDEVWSTLLRSVHSVINR
.::.. :::: ..:.. :.: :: .. ..::.:::.. : .:.::::::.:.:::::
XP_016 QFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTSVVIVFHNEAWSTLLRTVYSVINR
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pF1KE2 SPPHLIKEILLVDDFSTKDYLKDNLDKYMSQFP-KVRILRLKERHGLIRARLAGAQNATG
:: .:..:..:::: : .:.:: .:..:.... :.:.:..:: ::::::: :: . :
XP_016 SPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYVKNLEVPVKIIRMEERSGLIRARLRGAAASKG
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pF1KE2 DVLTFLDSHVECNVGWLEPLLERVYLSRKKVACPVIEVINDKDMSYMTVDNFQRGIFVWP
.:.::::.: ::..::::::: :. .:: :.::.:.::.: . ::. ... : : :
XP_016 QVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWK
210 220 230 240 250 260
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pF1KE2 MNFGWRTIPPDVIAKNRIKETDTIRCPVMAGGLFSIDKSYFFELGTYDPGLDVWGGENME
.:: : .: . . . .: .: :.:::::::::..:: :.:::: :.:.:::::.:
XP_016 LNFRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRNYFEEIGTYDAGMDIWGGENLE
270 280 290 300 310 320
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 LSFKVWMCGGEIEIIPCSRVGHIFRNDNPYSFPKDRMKTVERNLVRVAEVWLDEYKELFY
.::..:.::: .::. ::.:::.::. .::.:: .....: :.::::.::.:..::
XP_016 MSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGHVINKNNRRLAEVWMDEFKDFFY
330 340 350 360 370 380
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 GHGDHLIDQGLDVGNLTQQRELRKKLKCKSFKWYLENVFPDLRAPIVRAS-GVLINVALG
. .. .: :... .. ::..:::: :.:::::..:: . : : : . :: .
XP_016 IISPGVVK--VDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIYPDSQIPRRYYSLGEIRNVETN
390 400 410 420 430
830 840 850 860 870
pF1KE2 KCISI----ENTTVILEDCDGSKELQQFNYTWLRLIKCGEWCIAPIPDKGAVRLHPCDNR
.:.. :: : . .: : : :.:: . :. . :. .: : . : .
XP_016 QCLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRTDDLCLDVSRLNGPVIMLKCHHM
440 450 460 470 480 490
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 NKGLKWLHKSTSVFHPELVNHIVFENNQQLLCLEGNF----SQKILKVAACDPVKPYQKW
. : . . . : : ::. .. :: : ::. : .:. . :::
XP_016 RGNQLWEYDAET--HTLL--HIITQS-----CLSVNKVADGSQHPT-VETCND-STLQKW
500 510 520 530 540
940
pF1KE2 KFEKYYEA
...:
XP_016 LLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
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