FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2442, 1956 aa
1>>>pF1KE2442 1956 - 1956 aa - 1956 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7190+/-0.00111; mu= 13.2276+/- 0.066
mean_var=129.3274+/-26.576, 0's: 0 Z-trim(107.4): 107 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.112779
statistics sampled from 9467 (9574) to 9467 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 5.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3 (1956) 13035 2133.7 0
CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 6011 990.8 0
CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 6011 990.8 0
CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015) 6003 989.5 0
CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962) 5399 891.2 0
CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951) 4732 782.7 0
CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1983) 3990 662.0 6.6e-189
CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 3986 661.3 1e-188
CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 3986 661.3 1e-188
CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (2000) 3922 650.9 1.4e-185
CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 3902 647.7 1.4e-184
CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 3902 647.7 1.4e-184
CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009) 3902 647.7 1.4e-184
CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836) 3892 646.0 3.9e-184
CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977) 3847 638.7 6.7e-182
CCDS53794.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1939) 3818 634.0 1.7e-180
CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 3789 629.3 4.6e-179
CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 3789 629.3 4.6e-179
CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1998) 2858 477.8 1.9e-133
CCDS33737.1 SCN11A gene_id:11280|Hs108|chr3 (1791) 2754 460.9 2.1e-128
CCDS46442.1 SCN7A gene_id:6332|Hs108|chr2 (1682) 2613 437.9 1.6e-121
CCDS46849.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2137) 1154 200.6 5.7e-50
CCDS44795.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1148 199.6 1.1e-49
CCDS44801.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1147 199.4 1.3e-49
CCDS44796.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2144) 1142 198.6 2.2e-49
CCDS53735.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1129 196.5 9.6e-49
CCDS59166.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1912) 1120 195.0 2.4e-48
CCDS59167.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1966) 1120 195.0 2.4e-48
CCDS35253.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1977) 1120 195.0 2.5e-48
CCDS53734.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1119 194.9 2.9e-48
CCDS44791.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1119 194.9 2.9e-48
CCDS53733.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1119 194.9 3e-48
CCDS44798.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1118 194.7 3.3e-48
CCDS44793.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1115 194.2 4.7e-48
CCDS44799.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 1114 194.1 5.2e-48
CCDS55665.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2251) 1114 194.1 5.4e-48
CCDS53443.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2270) 1114 194.1 5.5e-48
CCDS55664.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1 (2313) 1114 194.1 5.5e-48
CCDS44794.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1105 192.6 1.4e-47
CCDS44787.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1104 192.4 1.6e-47
CCDS44800.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 1104 192.4 1.6e-47
CCDS53736.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 1104 192.4 1.6e-47
CCDS44789.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2158) 1028 180.1 8.5e-44
CCDS45733.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2266) 875 155.2 2.8e-36
CCDS58568.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2314) 875 155.2 2.8e-36
CCDS46848.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2161) 849 151.0 5e-35
CCDS2872.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3 (2181) 849 151.0 5e-35
CCDS1407.1 CACNA1S gene_id:779|Hs108|chr1 (1873) 822 146.5 9.2e-34
CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2237) 817 145.8 1.9e-33
CCDS59522.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2339) 817 145.8 2e-33
>>CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3 (1956 aa)
initn: 13035 init1: 13035 opt: 13035 Z-score: 11458.6 bits: 2133.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 13035; 99.9% identity (100.0% similar) in 1956 aa overlap (1-1956:1-1956)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKAC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 NQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPEKIEYVFTVIYTFEALIKILARGFCLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPEKIEYVFTVIYTFEALIKILARGFCLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIVGALI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIVGALI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSHRKPDIYIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSHRKPDIYIN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRIKPRVSEGSTEDNKSPRSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRIKPRVSEGSTEDNKSPRSD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDDGVFPGDHESHRGSLLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDDGVFPGDHESHRGSLLLG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GGAGQQGPLPRSPLPQPSNPDSRHGEDEHQPPPTSELAPGAVDVSAFDAGQKKTFLSAEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GGAGQQGPLPRSPLPQPSNPDSRHGEDEHQPPPTSELAPGAVDVSAFDAGQKKTFLSAEY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LDEPFRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDEPFRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 LVTDPFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LVTDPFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKII
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GNSVGALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GNSVGALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 IVFRILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVFRILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTA
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pF1KE2 PEDDGEVNNLQVALARIQVFGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKAEPELVVKLPLSSSKAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PEDDGEVNNLQVALARIQVFGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKAEPELVVKLPLSSSKAEN
910 920 930 940 950 960
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pF1KE2 HIAANTARGSSGGLQAPRGPRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HIAANTARGSSGGLQAPRGPRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSF
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 QQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDD
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 TSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE2 VRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
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pF1KE2 MLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRA
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pF1KE2 LSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSL
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pF1KE2 VPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSR
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pF1KE2 EVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQK
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 KYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQ
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pF1KE2 SEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAIL
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1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 KSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
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pF1KE2 YSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDP
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 NLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDD
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIMVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDD
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1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 FDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHC
1750 1760 1770 1780 1790 1800
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pF1KE2 LDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQK
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 AYRSYVLHRSMALSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AYRSYVLHRSMALSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950
pF1KE2 YESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
1930 1940 1950
>>CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016 aa)
initn: 6972 init1: 1963 opt: 6011 Z-score: 5282.0 bits: 990.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7967; 62.8% identity (80.6% similar) in 2008 aa overlap (21-1946:21-2002)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQ--GTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLK
:. :::..: :: :. .:. :: .:: :::::::.
CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL
: ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::.
CCDS46 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
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CCDS46 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI
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CCDS46 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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:::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.: :.: :: : .
CCDS46 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
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pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
:. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS46 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
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:::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
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. :.: :. : ... :.:: . : :. :.:. : : :.:.::.: :: ::
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.. .:: . :. :::. ::: : ..: : : . : . :. :
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:::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...: . .: :
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::..::::.:::.::.:::.::..:. :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
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.:::.. ..: :.. . .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
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CCDS46 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL
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CCDS46 ATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLIN
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CCDS46 MDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLR
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1960 1970 1980 1990 2000 2010
CCDS46 IV
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1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE2 YTDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIK
:.:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::
CCDS46 YADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIK
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE2 ALRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF
.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE2 WRCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFK
:::: :.:.. : .::::::.:. : :: ..:..::::::::. ::::::::::::
CCDS46 GRCINQTEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFK
1370 1380 1390 1400 1410
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE2 GWMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKK
::::::::::::: . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS46 GWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKK
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KE2 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLIC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: :::
CCDS46 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLIC
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1490 1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE2 LNMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVV
:::.:::::::::: :: .::.::: .:::.:::::..:. :::.:::::.::.:::.::
CCDS46 LNMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVV
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1550 1560 1570 1580 1590 1600
pF1KE2 VLSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPAL
.:::.. ..: :.. . .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS46 ILSIVGTVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPAL
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1610 1620 1630 1640 1650 1660
pF1KE2 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL
:::::::::::::::::::..: .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1670 1680 1690 1700 1710 1720
pF1KE2 SPILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNV
:::::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:
CCDS46 SPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSV
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KE2 ATEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQ
::::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::. ::.
CCDS46 ATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLIN
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KE2 MDLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLR
::::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.::::
CCDS46 MDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLR
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KE2 WKQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANE
:.:..:: :::.:.: ..:.::. .. .: ::.: :. ::..:.. .:
CCDS46 RKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSE
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1910 1920 1930 1940 1950
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: . : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :. ..:: :
CCDS46 NFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRES
1960 1970 1980 1990 2000 2010
CCDS46 IV
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: ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::.
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CCDS46 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
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CCDS46 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTI
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CCDS46 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
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pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
:. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS46 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
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:::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE
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pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI
::::: : : :::.::::.:::.::.:.:. :.::.: : . :::. :. ::: .
CCDS46 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR
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. :.: :. : ... :.:: . : :. :.:. : : :.:.::.: :: ::
CCDS46 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD
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.. .:: . :. :::. ::: : ..: : : . : . :. :
CCDS46 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD
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CCDS46 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP
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pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
:::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...: . .: :
CCDS46 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD
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::..::::.:::.::.:::.::..:. :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
CCDS46 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY
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CCDS46 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED
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CCDS46 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP
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CCDS46 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE
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1020 1030 1040 1050 1060
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CCDS46 ENSLGTEEESSKQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE-
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::.:. : . . : :::::.: . :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: .
CCDS46 -PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAV
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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CCDS46 DTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEY
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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CCDS46 ADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKS
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CCDS46 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFG
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CCDS46 RCINQTEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKG
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CCDS46 NMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVI
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CCDS46 LSIVGTVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALF
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CCDS46 NIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS
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pF1KE2 PILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVA
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CCDS46 PILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVA
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1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KE2 TEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQM
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CCDS46 TEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINM
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KE2 DLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRW
:::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.::::
CCDS46 DLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRR
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KE2 KQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANEN
:.:..:: :::.:.: ..:.::. .. .: ::.: :. ::..:.. .::
CCDS46 KHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSEN
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1910 1920 1930 1940 1950
pF1KE2 C---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
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CCDS46 FSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESI
1960 1970 1980 1990 2000 2010
CCDS46 V
>>CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS54 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ
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pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL
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CCDS54 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
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CCDS54 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI
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CCDS54 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
180 190 200 210 220 230
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CCDS54 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
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pF1KE2 LNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFV
::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:
CCDS46 LNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMV
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KE2 FDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFA
::.::::.:::.::.::::::.:::::::::.. : .:..:: :...:::: :.:. .
CCDS46 FDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQGKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVS
1480 1490 1500 1510 1520 1530
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pF1KE2 LRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAILKSLQSYF-SPTLFRVIRLARIGRILRLIR
::.:::: :::.:::.::.:::...... . ...:: ::::::::::::::::::::.
CCDS46 LRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAEM---IEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIK
1540 1550 1560 1570 1580
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KE2 AAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFA
.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.: .:. ::::::::::.::.
CCDS46 GAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFG
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KE2 NSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNL--PNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYI
:::.:::::::::::::::.::::..:: :::. :.:. ..::::.:.:::.::..::
CCDS46 NSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSAPPDCDPDTIHPGSS-VKGDCGNPSVGIFFFVSYI
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KE2 IISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSD
:::::.:::::::::::::.::::::.::::::::.::::.::::::.::::: :: :::
CCDS46 IISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSD
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KE2 FADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANME
:: .:. :: : :::. :: ::::.: ::.:::::::::::: :::::::.:.:. .::
CCDS46 FAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQME
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1830 1840 1850 1860 1870 1880
pF1KE2 EKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRAEEEA
..:::.: :: :::::.:::. :::..::..::. .: :.:.. . .. .: .
CCDS46 DRFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAAIIQRNFRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGR
1830 1840 1850 1860 1870 1880
1890 1900 1910 1920 1930 1940
pF1KE2 ASLP-DEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDE
.:: . .. : : . :.:.. .:.:. ::::.:::.
CCDS46 IDLPIKQDMIIDKLNGNST-PEKTDGSSSTTSPPSYDSVTKPDKEKFEKDKPEKESKGKE
1890 1900 1910 1920 1930 1940
1950
pF1KE2 ATSMELIAPGP
CCDS46 VRENQK
1950
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: ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::.
CCDS54 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
:::.:.:. ::: :...: :::.::: :.. : : . .::.::.:::::.:.:::::
CCDS54 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
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::::. ::.::::::::::::: .:::. : : ..:.::::::::::::.:::::::.:
CCDS54 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
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pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH---
:::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.: :.: :: : .
CCDS54 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
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pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
:. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS54 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
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:::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS54 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE
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::::: : : :::.::::.:::.::.:.:. :.::.: : . :::. :. ::: .
CCDS54 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR
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. :.: :. : ... :.:: . : :. :.:. : : :.:.::.: :: ::
CCDS54 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD
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.. .:: . :. :::. ::: : ..: : : . : . :. :
CCDS54 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD
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pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
:::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...: . .: :
CCDS54 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD
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::..::::.:::.::.:::.::..:. :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
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CCDS54 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
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CCDS54 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED
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CCDS54 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP
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:.. . : . . : : .: : : . : : :::: .::: :: :.:
CCDS54 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE
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: . .: .:: : . . : .... . . . .: . : . . :: :
CCDS54 ENSLGTEEESSKQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE-
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::.:. : . . : :::::.: . :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: .
CCDS54 -PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAV
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
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:::..: : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.::::
CCDS54 DTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEY
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.:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::.
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CCDS54 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFG
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CCDS54 NMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGT--------------------------
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CCDS54 ------VLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALF
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::::::::::::::::::..: .:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS
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pF1KE2 PILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVA
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CCDS54 PILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVA
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pF1KE2 TEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQM
:::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::. ::.:
CCDS54 TEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINM
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KE2 DLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRW
:::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.::::
CCDS54 DLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRR
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pF1KE2 KQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANEN
:.:..:: :::.:.: ..:.::. .. .: ::.: :. ::..:.. .::
CCDS54 KHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSEN
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pF1KE2 C---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
. : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :. ..:: :
CCDS54 FSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESI
1930 1940 1950 1960 1970 1980
CCDS54 V
>>CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKA
::..:: ... . .: :...:.:. :.:. ::.:
CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQE--RKDEDDENGPKPNSDLEA
10 20 30 40 50
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pF1KE2 CNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLI
..:: .::..: :... :::::::.: ...::.:::::..::::::: ::....::: :
CCDS33 GKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNPI
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 RRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPE---KIEYVFTVIYTFEALIKILARG
:. :::. ::: :...: :::.::: :: .. :. ..::.:: :::::.::::::::
CCDS33 RKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
120 130 140 150 160 170
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pF1KE2 FCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIV
:::..::.::::::::::.:::.::: ..: ..:.::::::::::::.:::::::.::
CCDS33 FCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 GALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVK-----NDMAVNETT----
::::.:::::.:: :::.::::::::.::::: :::.:::.. ... .: :.
CCDS33 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE2 ----NYSSHRKP------DIYINKR-------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD
: .. . : ::. . : .: :::::.::.:.::.::::.:..
CCDS33 SLDGNGTTFNRTVSIFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAGR
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 NPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVN
::...:::::.:.::::::::::::: :: ::: :::..:: ::::::::::::::::.:
CCDS33 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KE2 LILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAAL---------------
::::::.:::::::::: .: : :: .::. ::.:.:.:: :
CCDS33 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAAAAAASAESRDFSGAG
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470
pF1KE2 GIDTTSLHSHNGSPLTSKNASE-RRHRIKPRVSEGSTEDNKSPR----------------
:: . : : .: :.::. .: . .: : . .: : :..:. :
CCDS33 GIGVFSESSSVASKLSSKSEKELKNRRKKKKQKEQSGEEEKNDRVRKSESEDSIRRKGFR
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520
pF1KE2 --------------SDPYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDD-
:.:. : .:. : . :: :..:.: ::. ..::. . .::
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..: :..:.: ::.. :. :. :: : : . . : .
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