Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2441, 1836 aa
1>>>pF1KE2441 1836 - 1836 aa - 1836 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2448+/-0.000957; mu= 16.0513+/- 0.058
mean_var=115.4663+/-23.451, 0's: 0 Z-trim(108.8): 112 B-trim: 528 in 1/52
Lambda= 0.119357
statistics sampled from 10338 (10453) to 10338 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.321), width: 16
Scan time: 4.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836) 12368 2141.7 0
CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 6257 1089.5 0
CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 6257 1089.5 0
CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 6177 1075.7 0
CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 6177 1075.7 0
CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009) 6177 1075.7 0
CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977) 6044 1052.8 0
CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 6012 1047.3 0
CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 6012 1047.3 0
CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951) 4360 762.8 0
CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (2000) 4360 762.8 0
CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962) 4339 759.2 3.4e-218
CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 4289 750.6 1.4e-215
CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 4289 750.6 1.4e-215
CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015) 4284 749.7 2.5e-215
CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3 (1956) 3888 681.5 8.1e-195
CCDS53794.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1939) 3243 570.5 2.2e-161
CCDS33737.1 SCN11A gene_id:11280|Hs108|chr3 (1791) 3018 531.7 9.4e-150
CCDS46442.1 SCN7A gene_id:6332|Hs108|chr2 (1682) 2881 508.1 1.1e-142
CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1998) 2818 497.3 2.4e-139
CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1983) 1356 245.5 1.5e-63
CCDS44801.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1187 216.4 9e-55
CCDS44795.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2146) 1183 215.8 1.4e-54
CCDS59166.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1912) 1169 213.3 6.9e-54
CCDS59167.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1966) 1169 213.3 7.1e-54
CCDS35253.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX (1977) 1169 213.3 7.2e-54
CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2237) 948 175.3 2.3e-42
CCDS59522.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9 (2339) 948 175.3 2.4e-42
CCDS53734.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 854 159.1 1.6e-37
CCDS44791.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2138) 854 159.1 1.6e-37
CCDS53735.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2157) 854 159.1 1.6e-37
CCDS53733.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2173) 854 159.1 1.7e-37
CCDS44790.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2166) 798 149.5 1.3e-34
CCDS1407.1 CACNA1S gene_id:779|Hs108|chr1 (1873) 790 148.1 3e-34
CCDS44792.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2179) 785 147.2 6.3e-34
CCDS9498.1 NALCN gene_id:259232|Hs108|chr13 (1738) 661 125.8 1.4e-27
CCDS46711.1 CACNA1I gene_id:8911|Hs108|chr22 (2188) 537 104.5 4.5e-21
CCDS46710.1 CACNA1I gene_id:8911|Hs108|chr22 (2223) 537 104.5 4.6e-21
CCDS44797.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12 (2155) 497 97.6 5.3e-19
CCDS58571.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2194) 497 97.6 5.3e-19
CCDS58566.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2205) 497 97.6 5.4e-19
CCDS58573.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2232) 497 97.6 5.4e-19
CCDS58575.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2239) 497 97.6 5.4e-19
CCDS58572.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2250) 497 97.6 5.5e-19
CCDS58567.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2259) 497 97.6 5.5e-19
CCDS45733.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2266) 497 97.6 5.5e-19
CCDS54143.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2273) 497 97.6 5.5e-19
CCDS58565.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2277) 497 97.6 5.5e-19
CCDS45732.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2284) 497 97.6 5.5e-19
CCDS58574.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17 (2287) 497 97.6 5.5e-19
>>CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17 (1836 aa)
initn: 12368 init1: 12368 opt: 12368 Z-score: 11503.2 bits: 2141.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12368; 100.0% identity (100.0% similar) in 1836 aa overlap (1-1836:1-1836)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKTIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKTIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSNDTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSNDTW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDALLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDALLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRAAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEEEFQQMLEKFKKHQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEEEFQQMLEKFKKHQE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ELEKAKAAQALEGGEADGDPAHGKDCNGSLDTSQGEKGAPRQSSSGDSGISDAMEELEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELEKAKAAQALEGGEADGDPAHGKDCNGSLDTSQGEKGAPRQSSSGDSGISDAMEELEEA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 HQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PMTEHFDNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PMTEHFDNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 NVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 LFGKSYKECVCKIALDCNLPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LFGKSYKECVCKIALDCNLPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 VFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDEDGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDEDGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAPEDEKKEPPEEDLKKDNHILNHMGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAPEDEKKEPPEEDLKKDNHILNHMGLA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 DGPPSSLELDHLNFINNPYLTIQVPIASEESDLEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DGPPSSLELDHLNFINNPYLTIQVPIASEESDLEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 NSSVCSTADYKPPEEDPEEQAEENPEGEQPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NSSVCSTADYKPPEEDPEEQAEENPEGEQPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 RRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEM
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRAL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 SRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 SEVNNKSECESLMHTGQVRWLNVKVNYDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEVNNKSECESLMHTGQVRWLNVKVNYDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKE
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 EQPQYEVNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQPQYEVNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYY
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 NAMKKLGSKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NAMKKLGSKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 KVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLALRQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLALRQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKY
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 FVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 MSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSIICLFEITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSIICLFEITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 GTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFLIVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFLIVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMF
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 YETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDIL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 FALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRR
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 HLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGD
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830
pF1KE2 AGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPGVKESLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPGVKESLV
1810 1820 1830
>>CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005 aa)
initn: 8504 init1: 3051 opt: 6257 Z-score: 5815.5 bits: 1089.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7572; 65.6% identity (78.5% similar) in 1857 aa overlap (149-1792:147-1972)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
:::.:: :.:::::::::::::::::::::
CCDS33 PIRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RGFCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKT
::::..::::::::::::::.:: .::.::::.:::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS33 RGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 IVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSND
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::..::: :... :
CCDS33 IVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPD----NSSFEINI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDAL
: . :.. :: . :.: .: :.:: :: :...::::::.::::
CCDS33 TSFFNNSLDGN-----------GTTFNRTVS-----IFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDAL
300 310 320 330
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pF1KE2 LCGNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRA
:::::::::.::::: :.:.::::::::::.::::::::.::::::::.::::.::::::
CCDS33 LCGNSSDAGQCPEGYICVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AGKTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEEEFQQMLEKFKKH
::::::::::..:::::::::::::::::::: :::.::: : ..:: :::::::..::.
CCDS33 AGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQ
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480 490
pF1KE2 QEELEKAKAAQA------------------------------------------------
::: . : :: .
CCDS33 QEEAQAAAAAASAESRDFSGAGGIGVFSESSSVASKLSSKSEKELKNRRKKKKQKEQSGE
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ------------------------LEG---------------------------------
:::
CCDS33 EEKNDRVRKSESEDSIRRKGFRFSLEGSRLTYEKRFSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRAS
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 -----GEA------------------DGD-------------------------------
:.: :.:
CCDS33 LFSFRGRAKDIGSENDFADDEHSTFEDNDSRRDSLFVPHRHGERRHSNVSQASRASRVLP
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500 510 520
pF1KE2 --PAHGK-----DCNG--------SLDTSQGE---KGAP-------RQSSSGD-------
: .:: :::: : :: :. .:. :.:::
CCDS33 ILPMNGKMHSAVDCNGVVSLVGGPSTLTSAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLE
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530 540 550 560 570
pF1KE2 ------------SGISDAMEELEEAHQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIV
: ....::::::..::::: ::: :. :::.:: :::: :....:.:
CCDS33 DPTSRQRAMSIASILTNTMEELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVV
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:::::::.:::::::::::::::::::::.:..::.:::::::::::::: ::.::::::
CCDS33 MDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTEQFSSVLSVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPY
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pF1KE2 EYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
:::.::::::..::.:::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::.:::::::::::::::::
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:.::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::.:.:::.:.
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:.::::::::.::.. :: :.: . ... .. . .: : . .. ..
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.. .:: :.. . : ..: ::.: :...::::: ::. ::::
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:::.: . :: .. :. :.:: . : .:: ::.: : : :: : .:: .
CCDS33 ESDFENLNTEEFSSESDMEESK---EKLNATSSSEGSTVDIGAPAEG--EQPEVEPEESL
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.:: :::: ::... : ..: .:.:: ::.::..:.:::::::::::::::::::::::
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::::::::::..:.:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::::::
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..::.:: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::.::: ::.: ::.: ::: :::..:....:. :: :::::.
CCDS33 IFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINYTTGEMFDVSVVNNYSECKALIESNQTARWKNVKVNF
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::::::::::::::::::::::::::::::. : ::.:: ::::::::::::::::::::
CCDS33 DNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEDNLYMYLYFVIFIIFGSFFTL
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:::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.
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pF1KE2 DLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLAL
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CCDS33 DFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEMTNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISL
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pF1KE2 RQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKG
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CCDS33 RYYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKG
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:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ::::::::::::::.:
CCDS33 IRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMI
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:::.::::::::::: ::::::::::::. ..::.::::::::::.:: :: ::::::::
CCDS33 CLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKDHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFL
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pF1KE2 IVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTL
.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::: ...::::.:.:
CCDS33 VVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADAL
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pF1KE2 QEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMA
. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::
CCDS33 DPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMA
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pF1KE2 ANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPE
.:::::::::::::::::.::: :: :::::::.::....:..: .:.... : .:
CCDS33 SNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPI
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pF1KE2 KEGLLANTMSKMYGHENGN--SSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQ
:: : . ... :. . :. ::
CCDS33 KEDTLIDKLNENSTPEKTDMTPSTTSPPSYDSVTKPEKEKFEKDKSEKEDKGKDIRESKK
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>--
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::: ::. .: :::::::::::: .::.: : ..... : .: :: ::::
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.:. :::.:.:.::.:.:: :::::::::
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::::..::::::::::::::.:: .::.::::::::.:::::::::::::::.:::::::
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: . :.. :: . :.: .: :.:: :: :...::::::.::::
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:::
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:.::::.:::.:::::::::::::::::.::: ..::: ::..::..::::::::...:
CCDS33 DFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEMTNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISL
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE2 RQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKG
: ::::.::::::::::::::::. :..::.:::::::::::::::::::.::::.::::
CCDS33 RYYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKG
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KE2 IRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSII
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ::::::::::::::.:
CCDS33 IRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMI
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KE2 CLFEITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENPGTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFL
:::.::::::::::: ::::::::::::. ..::.::::::::::.:: :: ::::::::
CCDS33 CLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKDHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFL
1710 1720 1730 1740 1750 1760
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KE2 IVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTL
.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::: ...::::.:.:
CCDS33 VVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADAL
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KE2 QEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMA
. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::
CCDS33 DPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMA
1830 1840 1850 1860 1870 1880
1710 1720 1730 1740 1750 1760
pF1KE2 ANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPE
.:::::::::::::::::.::: :: :::::::.::....:..: .:.... : .:
CCDS33 SNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRAYRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPI
1890 1900 1910 1920 1930 1940
1770 1780 1790 1800 1810 1820
pF1KE2 KEGLLANTMSKMYGHENGN--SSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQ
:: : . ... :. . :. ::
CCDS33 KEDTLIDKLNENSTPEKTDMTPSTTSPPSYDSVTKPEKEKFEKDKSEKEDKGKDIRESKK
1950 1960 1970 1980 1990 2000
>--
initn: 623 init1: 506 opt: 630 Z-score: 578.9 bits: 120.5 E(32554): 6.3e-26
Smith-Waterman score: 630; 68.8% identity (87.2% similar) in 141 aa overlap (9-148:6-146)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEA-RLQRNKQMEIEEPERKPRSDLE
::: ::. .: :::::::::::: .::.: : ..... : .: :: ::::
CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQERKDEDDENGPKPNSDLE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 AGKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSV
:::.::.:::: :::....::::::::: :::::::::::::: :::::::::.:.::.
CCDS33 AGKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
.:. :::.:.:.::.:.:: :::::::::
CCDS33 IRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR
120 130 140 150 160 170
>>CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981 aa)
initn: 8387 init1: 2995 opt: 6177 Z-score: 5741.2 bits: 1075.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7564; 65.3% identity (79.1% similar) in 1838 aa overlap (132-1778:129-1938)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 IFRFSATPALYLLSPFSVVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVE
::::.:: ::::::::::::.:: :.::::
CCDS54 IFRFSATSALYILTPFNPLRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 YTFTGIYTFESLIKILARGFCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTF
:::::::::::::::.:::::..::::::::::::::.:: .::.::::::::.::::::
CCDS54 YTFTGIYTFESLIKIIARGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTF
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RVLRALKTITVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCV
:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::.
CCDS54 RVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCI
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RWPPPFNDTNTTWYSNDTWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAY
.::: ::.. .. . . :.. . :.. . ::: .:
CCDS54 QWPP----TNASLEEHSIEKNITVNYNGTLI--NETVFE---------------FDWKSY
280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ISDEGNFYFLEGSNDALLCGNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFR
:.: ::::: ::::::::::::.::::: :.:.::::::::::.::::::::.:::
CCDS54 IQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFR
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 LMTQDYWENLFQLTLRAAGKTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAED
:::::.::::.::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: :::.::: :
CCDS54 LMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQATLEEA
380 390 400 410 420 430
470 480 490
pF1KE2 KEKEEEFQQMLEKFKKHQEELEKAKAAQALE-----------------------------
..:: :::::.:..::.:: ..: .: : :
CCDS54 EQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATATASEHSREPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKER
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 -------------GGE--------------------------------------------
:::
CCDS54 RNRRKKRKQKEQSGGEEKDEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLL
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 ---------------------------------ADGD-----------------------
:: .
CCDS54 SIRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGER
560 570 580 590 600 610
500 510 520
pF1KE2 ------------------PAHGK-----DCNG--SLDTSQGEKGAPRQSSSGD-------
::.:: :::: :: :. . :.:::
CCDS54 RNSNLSQTSRSSRMLAVFPANGKMHSTVDCNGVVSLGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLE
620 630 640 650 660 670
530 540 550 560 570
pF1KE2 ------------SGISDAMEELEEAHQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIV
: .....:::::..::::: ::: .. :::.: ::: :....:.:
CCDS54 DPSQRQRAMSIASILTNTVEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVV
680 690 700 710 720 730
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 MDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHYPMTEHFDNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPY
:::::::.::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::.::::::
CCDS54 MDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPY
740 750 760 770 780 790
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 EYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
:::.::::::..::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YYFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
800 810 820 830 840 850
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIALDCNLPRWHMHDFFHSFLIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::.::::::.::::::::::
CCDS54 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVF
860 870 880 890 900 910
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 RILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDE
:.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::.:.
CCDS54 RVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDD
920 930 940 950 960 970
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 DGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFLLGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAP
:.::::::::. :.. :....: . ... ... . :. . : .. .. .
CCDS54 DNEMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNH
980 990 1000 1010 1020 1030
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 EDEKKEPPEEDLKKD-NHILNHMGLADGPPSSL--ELDHLNFINNPYLTIQVPIASEESD
: . . : :: : . .: ... . . : :...::::: ::. :::: :::
CCDS54 TAEIGK--DLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESD
1040 1050 1060 1070 1080 1090
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 LEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDGNSSVCSTADYKPP-EEDPEEQAEENPEGEQPE
.: . :. .. :. :.::. . ...:: ::.: : ::.: . ::. : ::
CCDS54 FENLNTEDFSSESDLEESKEKLNE--SSSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLE---PE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 ECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFE
::::.::::. : ... .::::.::.:::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 DIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIIS
::::.::..:.:.:::::::::::::.::::::::::...:::::::::::::::::..:
CCDS54 DIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVS
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 LVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFW
:.:: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFW
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 LIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSECESLMHTGQV-RWLNVKVNYDNV
::::::::::::::::.::::::..:::: .:::...: .:.. ... :: :::::.:::
CCDS54 LIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNV
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE2 GLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKEEQPQYEVNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLF
:.:::::::::::::::::::::::::. : ::.:: .::::::::::::::::::::::
CCDS54 GFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLF
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE2 IGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLV
::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.:.:
CCDS54 IGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFV
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE2 TKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLALRQY
:.:.:::.:::::::::::::::::.::. . :: ::..::..::::::::...::.:
CCDS54 TRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHY
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE2 YFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRT
:::.::::::::::::::::. :..::.:::::::::::::::::::.::::.:::::::
CCDS54 YFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRT
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE2 LLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSNFAYVKKESGIDDMFNFETFGNSIICLF
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ::::::::::::::.::::
CCDS54 LLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLF
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KE2 EITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENPGTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFLIVV
.::::::::::: ::::: ::::::: :::.::::::::::.:: :: ::::::::.::
CCDS54 QITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVV
1700 1710 1720 1730 1740 1750
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KE2 NMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEP
:::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::. . .::.:. .:. :
CCDS54 NMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPP
1760 1770 1780 1790 1800 1810
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KE2 LRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANP
: . .:::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::.::
CCDS54 LNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNP
1820 1830 1840 1850 1860 1870
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KE2 SKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEG
:::::.:::::::::.::: :. ::::::::::.:..::::. : ... .: . ::
CCDS54 SKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKED
1880 1890 1900 1910 1920 1930
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE2 LLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPG
.. . ...
CCDS54 MIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHEQEGKDEKAKGK
1940 1950 1960 1970 1980
>--
initn: 518 init1: 518 opt: 518 Z-score: 474.8 bits: 101.2 E(32554): 4e-20
Smith-Waterman score: 518; 65.0% identity (82.9% similar) in 123 aa overlap (9-131:6-128)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
::: ::. . ::::::::::.: .::.:. . . . .: :: :::::
CCDS54 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVV
:::::.:::: :::... ::::::::: :::::::::::::::::::: :::.:.::. .
CCDS54 GKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
:. :::.:.:.
CCDS54 RKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARG
120 130 140 150 160 170
>>CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998 aa)
initn: 8387 init1: 2995 opt: 6177 Z-score: 5741.1 bits: 1075.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7431; 64.6% identity (78.2% similar) in 1838 aa overlap (149-1778:146-1955)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILA
:::.:: :.:::::::::::::::::::.:
CCDS33 PLRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 RGFCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKT
::::..::::::::::::::.:: .::.::::::::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS33 RGFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 IVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSND
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::..::: ::.. ..
CCDS33 IVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPP----TNASLEEHS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 TWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDAL
. . :.. . :.. . ::: .::.: ::::: :::
CCDS33 IEKNITVNYNGTLI--NETVFE---------------FDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDAL
300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LCGNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRA
:::::::::.::::: :.:.::::::::::.::::::::.::::::::.::::.::::::
CCDS33 LCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 AGKTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEEEFQQMLEKFKKH
::::::::::..:::::::::::::::::::: :::.::: : ..:: :::::.:..::.
CCDS33 AGKTYMIFFVLVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQ
400 410 420 430 440 450
480 490
pF1KE2 QEELEKAKAAQALE------------------------------------------GGE-
:: ..: .: : : :::
CCDS33 QEAAQQAATATASEHSREPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEE
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 ------------------------------------------------------------
CCDS33 KDEDEFQKSESEDSIRRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSL
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 ----------------ADGD----------------------------------------
:: .
CCDS33 FSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNSNLSQTSRSSRMLAV
580 590 600 610 620 630
500 510 520
pF1KE2 -PAHGK-----DCNG--------SLDTSQGEKGAP-----------RQSSSGD-------
::.:: :::: :. :: . : :.:::
CCDS33 FPANGKMHSTVDCNGVVSLVGGPSVPTSPVGQLLPEGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLE
640 650 660 670 680 690
530 540 550 560 570
pF1KE2 ------------SGISDAMEELEEAHQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIV
: .....:::::..::::: ::: .. :::.: ::: :....:.:
CCDS33 DPSQRQRAMSIASILTNTVEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVV
700 710 720 730 740 750
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 MDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHYPMTEHFDNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPY
:::::::.::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::.::::::
CCDS33 MDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPY
760 770 780 790 800 810
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 EYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
:::.::::::..::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YYFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
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700 710 720 730 740 750
pF1KE2 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIALDCNLPRWHMHDFFHSFLIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::.::::::.::::::::::
CCDS33 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVF
880 890 900 910 920 930
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 RILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDE
:.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::.:.
CCDS33 RVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDD
940 950 960 970 980 990
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 DGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFLLGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAP
:.::::::::. :.. :....: . ... ... . :. . : .. .. .
CCDS33 DNEMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNH
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pF1KE2 EDEKKEPPEEDLKKD-NHILNHMGLADGPPSSL--ELDHLNFINNPYLTIQVPIASEESD
: . . : :: : . .: ... . . : :...::::: ::. :::: :::
CCDS33 TAEIGK--DLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESD
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pF1KE2 LEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDGNSSVCSTADYKPP-EEDPEEQAEENPEGEQPE
.: . :. .. :. :.::. . ...:: ::.: : ::.: . ::. : ::
CCDS33 FENLNTEDFSSESDLEESKEKLNE--SSSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLE---PE
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pF1KE2 ECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFE
::::.::::. : ... .::::.::.:::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFE
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pF1KE2 DIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIIS
::::.::..:.:.:::::::::::::.::::::::::...:::::::::::::::::..:
CCDS33 DIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVS
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pF1KE2 LVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFW
:.:: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFW
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pF1KE2 LIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSECESLMHTGQV-RWLNVKVNYDNV
::::::::::::::::.::::::..:::: .:::...: .:.. ... :: :::::.:::
CCDS33 LIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNV
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:.:::::::::::::::::::::::::. : ::.:: .::::::::::::::::::::::
CCDS33 GFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLF
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pF1KE2 IGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLV
::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.:.:
CCDS33 IGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFV
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE2 TKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYNINMIFIIIFTGECVLKMLALRQY
:.:.:::.:::::::::::::::::.::. . :: ::..::..::::::::...::.:
CCDS33 TRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHY
1530 1540 1550 1560 1570 1580
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pF1KE2 YFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLFRVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRT
:::.::::::::::::::::. :..::.:::::::::::::::::::.::::.:::::::
CCDS33 YFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRT
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::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.: ::::::::::::::.::::
CCDS33 LLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLF
1650 1660 1670 1680 1690 1700
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pF1KE2 EITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENPGTSVKGDCGNPSIGICFFCSYIIISFLIVV
.::::::::::: ::::: ::::::: :::.::::::::::.:: :: ::::::::.::
CCDS33 QITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPNKVNPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVV
1710 1720 1730 1740 1750 1760
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pF1KE2 NMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEP
:::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::. . .::.:. .:. :
CCDS33 NMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPP
1770 1780 1790 1800 1810 1820
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KE2 LRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANP
: . .:::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::.::
CCDS33 LNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNP
1830 1840 1850 1860 1870 1880
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pF1KE2 SKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEG
:::::.:::::::::.::: :. ::::::::::.:..::::. : ... .: . ::
CCDS33 SKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKED
1890 1900 1910 1920 1930 1940
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE2 LLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPG
.. . ...
CCDS33 MIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHEQEGKDEKAKGK
1950 1960 1970 1980 1990
>--
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pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
::: ::. . ::::::::::.: .::.:. . . . .: :: :::::
CCDS33 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEA
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:::::.:::: :::... ::::::::: :::::::::::::::::::: :::.:.::. .
CCDS33 GKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPL
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:. :::.:.:.::::.:: :::::::::
CCDS33 RKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARG
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Smith-Waterman score: 7342; 64.0% identity (77.7% similar) in 1838 aa overlap (160-1778:157-1966)
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARGFCVDDFTFL
:::::::::::::::::.:::::..:::::
CCDS54 HSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARGFCLEDFTFL
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pF1KE2 RDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKTIVGALIQSVKK
:::::::::.:: .::.::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS54 RDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKK
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:::::::::::::::::.::::::::::.::..::: ::.. .. . . :..
CCDS54 LSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPP----TNASLEEHSIEKNITVNYNG
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. :.. . ::: .::.: ::::: ::::::::::::.:
CCDS54 TLI--NETVFE---------------FDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQC
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pF1KE2 PEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRAAGKTYMIFFVV
:::: :.:.::::::::::.::::::::.::::::::.::::.::::::::::::::::.
CCDS54 PEGYMCVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVL
350 360 370 380 390 400
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.:::::::::::::::::::: :::.::: : ..:: :::::.:..::.:: ..: .:
CCDS54 VIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMIEQLKKQQEAAQQAATAT
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pF1KE2 ALE------------------------------------------GGE------------
: : :::
CCDS54 ASEHSREPSAAGRLSDSSSEASKLSSKSAKERRNRRKKRKQKEQSGGEEKDEDEFQKSES
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CCDS54 EDSIRRKGFRFSIEGNRLTYEKRYSSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSRTSLFSFRGRAKDVG
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pF1KE2 -----ADGD-----------------------------------------PAHGK-----
:: . ::.::
CCDS54 SENDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNSNLSQTSRSSRMLAVFPANGKMHSTV
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CCDS54 DCNGVVSLVGGPSVPTSPVGQLLPEVIIDKPATDDNGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLE
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pF1KE2 --------------ISDAMEELEEAHQKCPPWWYKCAHKVLIWNCCAPWLKFKNIIHLIV
.....:::::..::::: ::: .. :::.: ::: :....:.:
CCDS54 DPSQRQRAMSIASILTNTVEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVV
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pF1KE2 MDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHYPMTEHFDNVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKLIAMDPY
:::::::.::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::.::::::
CCDS54 MDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPY
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pF1KE2 EYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
:::.::::::..::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YYFQEGWNIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGN
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pF1KE2 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIALDCNLPRWHMHDFFHSFLIVF
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::.::::::.::::::::::
CCDS54 SVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVF
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pF1KE2 RILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFLMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADSLAASDE
:.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::.:.
CCDS54 RVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDD
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pF1KE2 DGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFLLGLLHGKILSPKDIMLSLGEADGAGEAGEAGETAP
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CCDS54 DNEMNNLQIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNH
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CCDS54 TAEIGK--DLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESD
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.: . :. .. :. :.::. . ...:: ::.: : ::.: . ::. : ::
CCDS54 FENLNTEDFSSESDLEESKEKLNE--SSSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLE---PE
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pF1KE2 ECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFE
::::.::::. : ... .::::.::.:::.::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ACFTEGCVQRFKCCQINVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFE
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pF1KE2 DIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYGFKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIIS
::::.::..:.:.:::::::::::::.::::::::::...:::::::::::::::::..:
CCDS54 DIYIDQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVS
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CCDS54 LTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFW
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CCDS54 LIFSIMGVNLFAGKFYHCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETARWKNVKVNFDNV
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CCDS54 GFGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLF
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CCDS54 IGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFV
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1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KE2 NMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKFDPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEP
:::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.:::::::::::. . .::.:. .:. :
CCDS54 NMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPP
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1660 1670 1680 1690 1700 1710
pF1KE2 LRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEVLGDSGEMDALKQTMEEKFMAANP
: . .:::..::..::::: ::.:::::::::.::.:::.:::::::. :::.:::.::
CCDS54 LNLPQPNKLQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNP
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1720 1730 1740 1750 1760 1770
pF1KE2 SKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSMKQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEG
:::::.:::::::::.::: :. ::::::::::.:..::::. : ... .: . ::
CCDS54 SKVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKED
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1780 1790 1800 1810 1820 1830
pF1KE2 LLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGDAGPTMGLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPG
.. . ...
CCDS54 MIIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHEQEGKDEKAKGK
1960 1970 1980 1990 2000
>--
initn: 682 init1: 682 opt: 682 Z-score: 627.3 bits: 129.5 E(32554): 1.3e-28
Smith-Waterman score: 682; 68.2% identity (84.8% similar) in 151 aa overlap (9-159:6-156)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
::: ::. . ::::::::::.: .::.:. . . . .: :: :::::
CCDS54 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNPKPDKKDDDENGPKPNSDLEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVV
:::::.:::: :::... ::::::::: :::::::::::::::::::: :::.:.::. .
CCDS54 GKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNPL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
:. :::.:.:.::::.:: ::::::::::::.:: :.::
CCDS54 RKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIARG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRALKTITVIPGLKTIV
CCDS54 FCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
180 190 200 210 220 230
>>CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977 aa)
initn: 8142 init1: 2925 opt: 6044 Z-score: 5617.4 bits: 1052.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7306; 63.2% identity (76.7% similar) in 1877 aa overlap (125-1792:120-1944)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 VLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPP
::.:.:.::::.:: ::::::.::::..::
CCDS46 VLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRRISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPP
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 PWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARGFCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGN
:.::::::::::::::::.::::::::: .::::::::::::: ::..:::::::.:::
CCDS46 DWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFCVGEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGN
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 ISALRTFRVLRALKTITVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMG
.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS46 VSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMG
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 NLRQKCVRWPPPFNDTNTTWYSNDTWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATND
::..:: : .: :.: .: . ..
CCDS46 NLKHKCFR---------------------------------NSLENNETLESIMNTLESE
270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 TFDWDAYISDEGNFYFLEGSNDALLCGNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSW
:. : ::.::::.:::::: :.:.:.::::: :.: ::::.:::::.:::::
CCDS46 E-DFRKY------FYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDYGYTSFDTFSW
300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 AFLALFRLMTQDYWENLFQLTLRAAGKTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQN
:::::::::::::::::.: :::::::::::::::.:::::::::::::::::::: :::
CCDS46 AFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQN
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490
pF1KE2 EATLAEDKEKEEEFQQMLEKFKKHQEELEKAKAAQA------------------------
.:.. : :.:: ::::::...::.::: : :: :
CCDS46 QANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIMGLSESSSETSKLS
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 ------------------LEGGEADGD---------------------------------
: .:: ::
CCDS46 SKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRAHEKRL
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ------------------------------------------------------------
CCDS46 STPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFGDNESRRGSLF
530 540 550 560 570 580
500 510
pF1KE2 -----------------------PAHGK-----DCNGSLDTSQGE------------KGA
:..:: :::: .. .:. .:.
CCDS46 VPHRPQERRSSNISQASRSPPMLPVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSALMLPNGQLLPEGT
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550
pF1KE2 PRQ-------SS---SGD---------------SGISDAMEELEEAHQKCPPWWYKCAHK
: :: : : : .....:::::..::::::::. :::
CCDS46 TNQIHKKRRCSSYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNTVEELEESRQKCPPWWYRFAHK
650 660 670 680 690 700
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 VLIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHYPMTEHFDNVLTVGN
::::: :.:::. :..:::::::::.::::::::::::::::.::::.: :::..::
CCDS46 FLIWNCSPYWIKFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTEEFKNVLAIGN
710 720 730 740 750 760
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 LVFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLL
:::::::.::::::::::::::::: :::::::.::::::::: ::.:.:::::::::::
CCDS46 LVFTGIFAAEMVLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELFLADVEGLSVLRSFRLL
770 780 790 800 810 820
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 RVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIN
830 840 850 860 870 880
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 LDCNLPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFLMVMVIGNLVVL
::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: :..:::::::::::
CCDS46 DDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVYMMVMVIGNLVVL
890 900 910 920 930 940
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 NLFLALLLSSFSADSLAASDEDGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFLLGLLHGKILSPKDI
::::::::::::.:.:.: .:: . ::::::. ::: ::...: : .. : .: :
CCDS46 NLFLALLLSSFSSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINYVKQTLREFIL-KAFSKKP-
950 960 970 980 990 1000
860 870 880 890 900
pF1KE2 MLSLGEADGAGEAGEAGETAPEDEKKEPPEEDLKKDNHILNHMGLADGPPSSLEL-----
. . . .: .: :. .. ...: ...:.. .: ::..
CCDS46 -----KISREIRQAEDLNTKKENYISNHTLAEMSKGHNFLKEKDKISGFGSSVDKHLMED
1010 1020 1030 1040 1050 1060
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 -DHLNFINNPYLTIQVPIASEESDLEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDGNSSVCSTA
: .::.:: ::. :::: ::::: . :: .. :. : :: : ..:: :::.
CCDS46 SDGQSFIHNPSLTVTVPIAPGESDLENMNAEELSSDSDSEYSK---VRLNRSSSSECSTV
1070 1080 1090 1100 1110
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 DYKPPEEDPEEQAEENPEGEQPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIV
: : : : .:: ....:: :::..:: :. : :.: .:.:: ::..:..:.:::
CCDS46 DNPLPGEGEEAEAEPM-NSDEPEACFTDGCVWRFSCCQVNIESGKGKIWWNIRKTCYKIV
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 EHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYG
::.:::.:::.:::::::::::::::::....:. :::::::.::::::.::::::.:::
CCDS46 EHSWFESFIVLMILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEMLLKWIAYG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 FKVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRV
.:.:::::::::::::::::...:::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRV
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 VVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: . :: :.: :.::
CCDS46 VVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFPASQVPNRSE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 CESLMHTGQ-VRWLNVKVNYDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKEEQPQYEV
: .::...: ::: :.:::.::::::::::::::::::: :::::::: . ..::.::
CCDS46 CFALMNVSQNVRWKNLKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSVNVDKQPKYEY
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 NLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYYNAMKKLG
.::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS46 SLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLG
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 SKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYN
::::::::::: ::::: ..::::.:::::.::.:::::::::::: ..::: ...::
CCDS46 SKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQHMTEVLYW
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 INMIFIIIFTGECVLKMLALRQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLF
::..:::.::::::::...::.::::::::::::::::.::::. :.:::. ::::::::
CCDS46 INVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIETYFVSPTLF
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 RVIRLARIGRVLRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSNFAYV
::::::::::.:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS46 RVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYV
1600 1610 1620 1630 1640 1650
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 KKESGIDDMFNFETFGNSIICLFEITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENPGTSVKGD
:::.::.:::::::::::.::::.::::::::::: ::::: ::::::. .::.::.::
CCDS46 KKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVHPGSSVEGD
1660 1670 1680 1690 1700 1710
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 CGNPSIGICFFCSYIIISFLIVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKF
:::::.:: .: ::::::::.:::::::.:::::.::::::.:::.:::::::::.::::
CCDS46 CGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEMFYEVWEKF
1720 1730 1740 1750 1760 1770
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 DPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEV
:::::::: .:.::::. .:. :: ::::::..::..::::: ::.:::::::::.::.:
CCDS46 DPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRV
1780 1790 1800 1810 1820 1830
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 LGDSGEMDALKQTMEEKFMAANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSM
::.:::::.:.. :::.::.::::::::::::::::::.:.: : :::::::. :....
CCDS46 LGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYRRYRLRQNV
1840 1850 1860 1870 1880 1890
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 KQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHE--NGNSSSPSPEEKGEAGDAGPTM
:. : .: .. : :: .:. . ..... . : ...::. ::
CCDS46 KNISSIYIKDGD-RDDDLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYDSVTKPDKEK
1900 1910 1920 1930 1940 1950
1810 1820 1830
pF1KE2 GLMPISPSDTAWPPAPPPGQTVRPGVKESLV
CCDS46 YEQDRTEKEDKGKDSKESKK
1960 1970
>--
initn: 461 init1: 461 opt: 461 Z-score: 421.8 bits: 91.4 E(32554): 3.6e-17
Smith-Waterman score: 461; 59.0% identity (82.1% similar) in 117 aa overlap (6-122:1-117)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEEARLQRNKQMEIEEPERKPRSDLEA
. : : ::. . ::..::: :::: .:.... .... . .: :: :::::
CCDS46 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKDDDEEAPKPSSDLEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GKNLPMIYGDPPPEVIGIPLEDLDPYYSNKKTFIVLNKGKAIFRFSATPALYLLSPFSVV
::.::.:::: :: ... :::::::::..:::::::::::.::::.::::::.::::: .
CCDS46 GKQLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
::
CCDS46 RRISIKILVHSLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARG
120 130 140 150 160 170
>>CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980 aa)
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Smith-Waterman score: 7287; 64.5% identity (76.6% similar) in 1828 aa overlap (137-1745:138-1913)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ATPALYLLSPFSVVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTG
:: ::::::::::.:.:: :::::::::::
CCDS44 ATPALYILSPFNLIRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 IYTFESLIKILARGFCVDDFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYLTEFVDLGNISALRTFRVLRA
:::::::.::.:::::.: ::::::::::::::::::::.::::.:::.:::::::::::
CCDS44 IYTFESLVKIIARGFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRA
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LKTITVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPP
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::: ::
CCDS44 LKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPIN
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 FNDTNTTWYSNDTWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEG
::. :. : : . :::. ::...
CCDS44 FNE---------------------------SYLENGTKG----------FDWEEYINNKT
290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 NFYFLEGSNDALLCGNSSDAGHCPEGYECIKTGRNPNYGYTSYDTFSWAFLALFRLMTQD
::: . : . ::::::::::.:::::.:.:.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS44 NFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQD
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 YWENLFQLTLRAAGKTYMIFFVVIIFLGSFYLINLILAVVAMAYAEQNEATLAEDKEKEE
:::::.::::::::::::::::..::.:::::.::::::::::: :::.::: : ..::
CCDS44 YWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEA
380 390 400 410 420 430
470 480 490
pF1KE2 EFQQMLEKFKKHQEELEKAKAA-------------QALEGG-------------------
::. :::..::.::: . : : .. :::
CCDS44 EFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEISKLSSKSAKE
440 450 460 470 480 490
500
pF1KE2 ----------------EADGDPAH----------------------GK------------
: ::: . :.
CCDS44 RRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRLPDNRIGRKFSIMNQSLLSI
500 510 520 530 540 550
510 520
pF1KE2 -----------------------------------DCNGSLDTSQGEKGA---P------
: ..... :.:.. . :
CCDS44 PGSPFLSRHNSKSSIFSFRGPGRFRDPGSENEFADDEHSTVEESEGRRDSLFIPIRARER
560 570 580 590 600 610
530
pF1KE2 RQSSSGDSGISDA-----------------------------------------------
:.: :: :: :..
CCDS44 RSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGPGSHIGGRLLPEATTE
620 630 640 650 660 670
540 550
pF1KE2 --------------------------------------MEELEEAHQKCPPWWYKCAHKV
.:::::...:::: ::: :.
CCDS44 VEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCPPCWYKFANTF
680 690 700 710 720 730
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHYPMTEHFDNVLTVGNL
:::.: :.:.:.:..::::::::::.::::::::::::::::.::: .:..::.::::
CCDS44 LIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQFEHVLAVGNL
740 750 760 770 780 790
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 VFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLLR
:::::::::: ::::::::: :::.::::::..::.:::.::.::.:.::::::::::::
CCDS44 VFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRSFRLLR
800 810 820 830 840 850
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 VFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQ
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740 750 760 770 780 790
pF1KE2 DCNLPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFLMVMVIGNLVVLN
::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS44 DCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLN
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800 810 820 830 840 850
pF1KE2 LFLALLLSSFSADSLAASDEDGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFLLGLLHGKILSPKDIM
:::::::::::::.:::.:.:::::::::.. ::: :....: :. . .
CCDS44 LFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKL--------KVHAFMQAH
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860 870 880 890 900 910
pF1KE2 LSLGEADGAGEAGEAGETAPEDEKKEPPEEDLKKDNHILNHMGLADGPPSSLEL-----D
.. ::: . : : . .. . .. . : : ..: ::.: :
CCDS44 FKQREADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHRNGDFQKNGNGTTSGIGSSVEKYIIDED
1030 1040 1050 1060 1070 1080
920 930 940 950 960 970
pF1KE2 HLNFINNPYLTIQVPIASEESDLEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDGNSSVCSTADY
:..::::: ::..:::: :::.: . :.... :.:: :: . : : .:: :: :
CCDS44 HMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSK---DKLDDTSSSEGSTIDI
1090 1100 1110 1120 1130
980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 KPP-EEDPEEQAEENPEGEQPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVE
:: :: : :: :: . :. ::::.::::. : :.: .: ::.:: ::..:: :::
CCDS44 KPEVEEVPVEQPEEYLD---PDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVE
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pF1KE2 HNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYGF
::::::::.::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::.::::::.::::
CCDS44 HNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGF
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 KVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVV
.::::::::::::: ::..::.:: ::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVV
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 VNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSEC
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::..::.: :. ::.: .::::.::
CCDS44 VNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTEC
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pF1KE2 ESLM--HTGQVRWLNVKVNYDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSREKEEQPQYEV
:.:: .. ..:: :::.:.:::: :::.:::::::::::::::::::::. .:::.::
CCDS44 EKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYED
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 NLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGKDIFMTEEQKKYYNAMKKLG
:.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS44 NIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLG
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 SKKPQKPIPRPQNKIQGMVYDLVTKQAFDITIMILICLNMVTMMVETDNQSQLKVDILYN
::::::::::: :::::.:.:.::.:::::.::.::::::::::::::.::. .:::
CCDS44 SKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYW
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 INMIFIIIFTGECVLKMLALRQYYFTVGWNIFDFVVVILSIVGLALSDLIQKYFVSPTLF
::..:.:.:: ::::::.:::.::::.::::::::::::::::. :.:.:.:::::::::
CCDS44 INLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLF
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::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS44 RVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYV
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pF1KE2 KKESGIDDMFNFETFGNSIICLFEITTSAGWDGLLNPILNSGPPDCDPNLENPGTSVKGD
:.:.::::::::::::::.::::.::::::::::: :::: ::::. . :.::.. :::
CCDS44 KHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNR-PPDCSLDKEHPGSGFKGD
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pF1KE2 CGNPSIGICFFCSYIIISFLIVVNMYIAIILENFNVATEESSEPLGEDDFEMFYETWEKF
:::::.:: :: ::::::::::::::::::::::.::::::..::.::::: ::: ::::
CCDS44 CGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKF
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 DPDATQFIAYSRLSDFVDTLQEPLRIAKPNKIKLITLDLPMVPGDKIHCLDILFALTKEV
:::::::: : .:.::.:.:..:::. ::: :.::..::::: ::.:::::::::.::.:
CCDS44 DPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRV
1800 1810 1820 1830 1840 1850
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pF1KE2 LGDSGEMDALKQTMEEKFMAANPSKVSYEPITTTLKRKHEEVCAIKIQRAYRRHLLQRSM
::::::.: :.: :::.:.:.::::::::::::::.::.::: :. .::::: :: .:
CCDS44 LGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGF
1860 1870 1880 1890 1900 1910
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pF1KE2 KQASYMYRHSHDGSGDDAPEKEGLLANTMSKMYGHENGNSSSPSPEEKGEAGDAGPTMGL
CCDS44 ICKKTTSNKLENGGTHREKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEV
1920 1930 1940 1950 1960 1970
>--
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pF1KE2 MARPSLCTLVPLGPECLRPFTRESLAAIEQRAVEEE----ARLQRNKQMEIEEPERKPRS
:.: ::. ..::: :::: ::.: .: . . . ... . :. . :: :
CCDS44 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNS
10 20 30 40 50
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::::::.::.:::: : ....::::.:::: ..:::.:::.::..::::::::::.:::
CCDS44 DLEAGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSP
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:...:: :::.:::..:::
CCDS44 FNLIRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKI
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Smith-Waterman score: 7292; 64.6% identity (76.6% similar) in 1828 aa overlap (137-1745:138-1913)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 ATPALYLLSPFSVVRRGAIKVLIHALFSMFIMITILTNCVFMTMSDPPPWSKNVEYTFTG
:: ::::::::::.:.:: :::::::::::
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:::::::.::.:::::.: ::::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS81 IYTFESLVKIIARGFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRA
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pF1KE2 LKTITVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALVGLQLFMGNLRQKCVRWPPP
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::: ::
CCDS81 LKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWPIN
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pF1KE2 FNDTNTTWYSNDTWYGNDTWYGNEMWYGNDSWYANDTWNSHASWATNDTFDWDAYISDEG
::. :. : : . :::. ::...
CCDS81 FNE---------------------------SYLENGTKG----------FDWEEYINNKT
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::: . : . ::::::::::.:::::.:.:.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS81 NFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQD
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:::::.::::::::::::::::..::.:::::.::::::::::: :::.::: : ..::
CCDS81 YWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEA
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pF1KE2 EFQQMLEKFKKHQEELEKAKAA-------------QALEGG-------------------
::. :::..::.::: . : : .. :::
CCDS81 EFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIEEEGEEGGGSPRSSSEISKLSSKSAKE
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pF1KE2 ----------------EADGDPAH----------------------GK------------
: ::: . :.
CCDS81 RRNRRKKRKQKELSEGEEKGDPEKVFKSESEDGMRRKAFRLPDNRIGRKFSIMNQSLLSI
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510 520
pF1KE2 -----------------------------------DCNGSLDTSQGEKGA---P------
: ..... :.:.. . :
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530
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:.: :: :: :..
CCDS81 RSSYSGYSGYSQGSRSSRIFPSLRRSVKRNSTVDCNGVVSLIGGPGSHIGGRLLPEATTE
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pF1KE2 --------------------------------------MEELEEAHQKCPPWWYKCAHKV
.:::::...:::: ::: :.
CCDS81 VEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRINSIMSVVTNTLVEELEESQRKCPPCWYKFANTF
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pF1KE2 LIWNCCAPWLKFKNIIHLIVMDPFVDLGITICIVLNTLFMAMEHYPMTEHFDNVLTVGNL
:::.: :.:.:.:..::::::::::.::::::::::::::::.::: .:..::.::::
CCDS81 LIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQFEHVLAVGNL
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pF1KE2 VFTGIFTAEMVLKLIAMDPYEYFQQGWNIFDSIIVTLSLVELGLANVQGLSVLRSFRLLR
:::::::::: ::::::::: :::.::::::..::.:::.::.::.:.::::::::::::
CCDS81 VFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRSFRLLR
800 810 820 830 840 850
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pF1KE2 VFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQ
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pF1KE2 DCNLPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLTVFLMVMVIGNLVVLN
::.::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::.::::::::::::
CCDS81 DCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLN
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pF1KE2 LFLALLLSSFSADSLAASDEDGEMNNLQIAIGRIKLGIGFAKAFLLGLLHGKILSPKDIM
:::::::::::::.:::.:.:::::::::.. ::: :....: :. . .
CCDS81 LFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNLQISVIRIKKGVAWTKL--------KVHAFMQAH
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.. ::: . : : . .. . .. . : : ..: ::.: :
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pF1KE2 HLNFINNPYLTIQVPIASEESDLEMPTEEETDTFSEPEDSKKPPQPLYDGNSSVCSTADY
:..::::: ::..:::: :::.: . :.... :.:: :: . : : .:: :: :
CCDS81 HMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTEDVSSESDPEGSK---DKLDDTSSSEGSTIDI
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pF1KE2 KPP-EEDPEEQAEENPEGEQPEECFTEACVQRWPCLYVDISQGRGKKWWTLRRACFKIVE
:: :: : :: :: . :. ::::.::::. : :.: .: ::.:: ::..:: :::
CCDS81 KPEVEEVPVEQPEEYLD---PDACFTEGCVQRFKCCQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVE
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pF1KE2 HNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRRVIRTILEYADKVFTYIFIMEMLLKWVAYGF
::::::::.::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::.::::::.::::
CCDS81 HNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTILEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGF
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pF1KE2 KVYFTNAWCWLDFLIVDVSIISLVANWLGYSELGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVV
.::::::::::::: ::..::.:: ::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVV
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pF1KE2 VNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYYCINTTTSERFDISEVNNKSEC
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CCDS81 VNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTEC
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CCDS81 LGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGF
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