FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2440, 3075 aa
1>>>pF1KE2440 3075 - 3075 aa - 3075 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8376+/-0.000713; mu= 5.8702+/- 0.044
mean_var=388.5710+/-82.083, 0's: 0 Z-trim(112.1): 360 B-trim: 52 in 1/56
Lambda= 0.065064
statistics sampled from 20528 (20888) to 20528 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 23.000
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005550 (OMIM: 150320,615960) laminin subunit al (3075) 21241 2011.9 0
XP_011523957 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (3085) 18747 1777.8 0
XP_011523959 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2489) 17330 1644.7 0
XP_011523958 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: lami (2561) 14900 1416.6 0
NP_001073291 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit (3118) 7174 691.5 5.7e-197
NP_000417 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit al (3122) 7174 691.5 5.7e-197
XP_016866342 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (1916) 4602 449.8 2e-124
XP_016866340 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3212) 4604 450.3 2.4e-124
XP_005267039 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3206) 4602 450.1 2.8e-124
XP_011534122 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3208) 4602 450.1 2.8e-124
XP_005267038 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3210) 4602 450.1 2.8e-124
XP_016866341 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (2587) 2958 295.6 6.9e-78
XP_011524284 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3243) 1460 155.1 1.7e-35
NP_001121189 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l (3277) 1460 155.1 1.7e-35
NP_937762 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) lami (3333) 1460 155.2 1.7e-35
XP_011524282 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3336) 1460 155.2 1.7e-35
XP_011524281 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3339) 1460 155.2 1.7e-35
XP_011524280 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3342) 1460 155.2 1.7e-35
XP_011524283 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3298) 1444 153.6 4.8e-35
XP_006723861 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (2300) 1432 152.3 8.4e-35
NP_005551 (OMIM: 601033) laminin subunit alpha-5 p (3695) 1432 152.6 1.1e-34
XP_006723859 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3700) 1432 152.6 1.1e-34
NP_001289925 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l ( 488) 1359 144.7 3.6e-33
XP_011527121 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3609) 1364 146.2 9.3e-33
XP_011527120 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3654) 1364 146.2 9.4e-33
NP_005520 (OMIM: 142461,224410,255800) basement me (4391) 1129 124.2 4.6e-26
NP_001278789 (OMIM: 142461,224410,255800) basement (4392) 1129 124.2 4.6e-26
XP_016856611 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4438) 1129 124.2 4.7e-26
XP_016856610 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4439) 1129 124.2 4.7e-26
XP_016856609 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4456) 1129 124.2 4.7e-26
NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit be (1786) 1004 112.0 8.8e-23
XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1810) 1004 112.0 8.9e-23
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798) 986 110.3 2.9e-22
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798) 986 110.3 2.9e-22
XP_016881232 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (2626) 966 108.7 1.3e-21
XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1212) 951 106.9 2.2e-21
NP_002284 (OMIM: 150290) laminin subunit gamma-1 p (1609) 929 104.9 1.1e-20
XP_011539620 (OMIM: 142461,224410,255800) PREDICTE (4574) 918 104.4 4.3e-20
XP_016881233 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (1856) 883 100.7 2.4e-19
XP_011514282 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1564) 872 99.6 4.4e-19
XP_016867369 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1567) 872 99.6 4.4e-19
XP_011514281 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1703) 872 99.6 4.6e-19
XP_011514280 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1723) 872 99.6 4.6e-19
XP_016867368 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1753) 872 99.6 4.7e-19
NP_031382 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 is (1761) 872 99.6 4.7e-19
NP_001304975 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1761) 872 99.6 4.7e-19
XP_011514277 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1772) 872 99.6 4.7e-19
NP_001304976 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1101) 830 95.4 5.4e-18
NP_000218 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) lami (1724) 798 92.7 5.7e-17
XP_016856762 (OMIM: 150292,226650,226700) PREDICTE ( 742) 773 89.9 1.7e-16
>>NP_005550 (OMIM: 150320,615960) laminin subunit alpha- (3075 aa)
initn: 21241 init1: 21241 opt: 21241 Z-score: 10793.5 bits: 2011.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 21241; 99.9% identity (100.0% similar) in 3075 aa overlap (1-3075:1-3075)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPGRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 ESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPT
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850 860 870 880 890 900
pF1KE2 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCR
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910 920 930 940 950 960
pF1KE2 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS
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pF1KE2 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 YRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ
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NP_005 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ
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pF1KE2 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC
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NP_005 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KE2 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 LVEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LDEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
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NP_005 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ
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pF1KE2 ENAVEITRQTNESLLILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
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NP_005 ENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
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NP_005 CVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIYYMAHQNQ
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NP_005 ADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDGRESPM
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NP_005 VTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAF
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NP_005 ELHGVFLHSCPGTES
3070
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI
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pF1KE2 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG
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XP_011 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT
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XP_011 LDEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS
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pF1KE2 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KE2 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
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pF1KE2 ENAVEITRQTNESLLILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
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XP_011 ENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
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XP_011 ASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLS
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pF1KE2 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS
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XP_011 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE2 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE2 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK
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pF1KE2 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKN
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pF1KE2 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQAHSISLVRNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AASFTISQEQCVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIYYMAHQNQADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITVDGRESPMVTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQ
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pF1KE2 LDKDSPVSAFTVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDKDSPVSAFTVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GISTAKVDAIGLELVDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRIT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIVDGNAVGAESPHTQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIKSPQ
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:::::::::::::::::::::::::
XP_011 VQSFDFSRAFELHGVFLHSCPGTES
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Smith-Waterman score: 17330; 99.9% identity (100.0% similar) in 2484 aa overlap (1-2484:1-2484)
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XP_011 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPGRP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIP
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pF1KE2 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCR
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pF1KE2 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS
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pF1KE2 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT
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pF1KE2 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALR
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pF1KE2 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD
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pF1KE2 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI
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pF1KE2 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
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pF1KE2 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY
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pF1KE2 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG
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pF1KE2 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ
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pF1KE2 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC
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pF1KE2 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE
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pF1KE2 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT
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pF1KE2 LVEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL
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pF1KE2 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS
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pF1KE2 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KE2 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 ENAVEITRQTNESLLILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE2 ASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLS
2050 2060 2070 2080 2090 2100
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pF1KE2 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS
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pF1KE2 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE2 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK
2230 2240 2250 2260 2270 2280
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pF1KE2 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE2 LLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGV
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE2 LAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKN
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE2 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSS
::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLENQNGW
2470 2480
>>XP_011523958 (OMIM: 150320,615960) PREDICTED: laminin (2561 aa)
initn: 17380 init1: 14900 opt: 14900 Z-score: 7577.6 bits: 1416.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 17364; 99.5% identity (99.6% similar) in 2561 aa overlap (525-3075:1-2561)
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 KNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSI
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSI
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560 570 580 590 600 610
pF1KE2 NNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKG
40 50 60 70 80 90
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 NGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRAN
100 110 120 130 140 150
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pF1KE2 YNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSCESCLSGYYRVDGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSCESCLSGYYRVDGIL
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pF1KE2 FGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACP
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pF1KE2 LTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGN
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pF1KE2 VDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAVC
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pF1KE2 HLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEGQCHCVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEGQCHCVPG
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pF1KE2 VAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWG
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pF1KE2 YDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDL
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pF1KE2 RGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSG
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pF1KE2 LSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRA
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pF1KE2 EPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLIKGGRIRKQVIYMDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLIKGGRIRKQVIYMDA
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pF1KE2 PAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSR
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pF1KE2 ISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPR
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pF1KE2 PLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCAC
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pF1KE2 PHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPH
940 950 960 970 980 990
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pF1KE2 GSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDECVGVLLNDLDEIGDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDECVGVLLNDLDEIGDA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KE2 VLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLEGVAEETDNLQKKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLEGVAEETDNLQKKLT
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KE2 RMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQTLVEDFLLPNSTLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
XP_011 RMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQTLDEDFLLPNSTLQN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1700 1710 1720 1730 1740 1750
pF1KE2 MQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLKEAASHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLKEAASHVL
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KE2 SKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQGR
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KE2 GLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVDLVYRAEDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVDLVYRAEDH
1300 1310 1320 1330 1340 1350
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pF1KE2 AAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTETSLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTETSLLS
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KE2 ESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESL
1420 1430 1440 1450 1460 1470
2000 2010 2020 2030 2040 2050
pF1KE2 LILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETH
:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LILRAIPKGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETH
1480 1490 1500 1510 1520 1530
2060 2070 2080 2090 2100 2110
pF1KE2 QLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLSEIKLLISQARKQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLSEIKLLISQARKQAA
1540 1550 1560 1570 1580 1590
2120 2130 2140 2150 2160 2170
pF1KE2 SIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGSSTASDFLAVEMRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGSSTASDFLAVEMRRG
1600 1610 1620 1630 1640 1650
2180 2190 2200 2210 2220 2230
pF1KE2 RVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKSPTKTSKSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKSPTKTSKSP
1660 1670 1680 1690 1700 1710
2240 2250 2260 2270 2280 2290
pF1KE2 GTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREGKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREGKC
1720 1730 1740 1750 1760 1770
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pF1KE2 RGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNGLLLYLGSYGTKDFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNGLLLYLGSYGTKDFL
1780 1790 1800 1810 1820 1830
2360 2370 2380 2390 2400 2410
pF1KE2 SIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGVLAVIDAYNTSNKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGVLAVIDAYNTSNKET
1840 1850 1860 1870 1880 1890
2420 2430 2440 2450 2460 2470
pF1KE2 KQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKNLEISRSTFDLLRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKNLEISRSTFDLLRNS
1900 1910 1920 1930 1940 1950
2480 2490 2500 2510 2520 2530
pF1KE2 YGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSSGIILAALGGDVEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSSGIILAALGGDVEKR
1960 1970 1980 1990 2000 2010
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pF1KE2 GDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSISLVRNRRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSISLVRNRRI
2020 2030 2040 2050 2060 2070
2600 2610 2620 2630 2640 2650
pF1KE2 ITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMRRSFHGCIKNLIFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMRRSFHGCIKNLIFNL
2080 2090 2100 2110 2120 2130
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pF1KE2 ELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKLAPDAEDSKLLPEPRAFP----------EQCVVD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
XP_011 ELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKLAPDAEDSKLLPEPRAFPVGAASFTISQEQCVVD
2140 2150 2160 2170 2180 2190
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pF1KE2 AALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIYYMAHQNQADYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIYYMAHQNQADYA
2200 2210 2220 2230 2240 2250
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pF1KE2 VLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDGRESPMVTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDGRESPMVTVV
2260 2270 2280 2290 2300 2310
2830 2840 2850 2860 2870 2880
pF1KE2 GDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAFTVNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAFTVNR
2320 2330 2340 2350 2360 2370
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pF1KE2 CYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGISTAKVDAIGLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGISTAKVDAIGLEL
2380 2390 2400 2410 2420 2430
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pF1KE2 VDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIVDGNAVGAESPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIVDGNAVGAESPH
2440 2450 2460 2470 2480 2490
3010 3020 3030 3040 3050 3060
pF1KE2 TQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIKSPQVQSFDFSRAFELHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIKSPQVQSFDFSRAFELHG
2500 2510 2520 2530 2540 2550
3070
pF1KE2 VFLHSCPGTES
:::::::::::
XP_011 VFLHSCPGTES
2560
>>NP_001073291 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit alp (3118 aa)
initn: 6677 init1: 2247 opt: 7174 Z-score: 3657.2 bits: 691.5 E(85289): 5.7e-197
Smith-Waterman score: 9943; 46.0% identity (72.2% similar) in 3128 aa overlap (4-3071:6-3116)
10 20 30 40
pF1KE2 MRGGVLLVLLLC-----VAAQ----------CRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGE
::::.::: : :: .:::::::.::::::: :.:::::::
NP_001 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLASNALITTNATCGE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 KGPEMFCKLVEHVPGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGRE
:::::.:::::::::.::::::::::. ::.:: .::::..:::: :.:::::::.:: :
NP_001 KGPEMYCKLVEHVPGQPVRNPQCRICNQNSSNPNQRHPITNAIDGKNTWWQSPSIKNGIE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 YHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRY
::.:::::::.::::.::::.::::.::::::::::::: . ..::::.::.:.:::. :
NP_001 YHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWILERSLDDVEYKPWQYHAVTDTECLTLY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 NITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARY
:: :: :::.: ::::::::.::.. :::.:::: ::::::::::: ::.:::::::::
NP_001 NIYPRTGPPSYAKDDEVICTSFYSKIHPLENGEIHISLINGRPSADDPSPELLEFTSARY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 IRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDE
::::.::::::::::: ..:..:.:.:::::::::::.::::::::::::::: .:: :
NP_001 IRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDPIVTRRYYYSVKDISVGGMCICYGHARACPLDP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 TTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVA
.:.: .:.:::::::.::..::::.::.::: :: . . :::::::.::..:::::.::
NP_001 ATNKSRCECEHNTCGDSCDQCCPGFHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHGKAEECYYDENVA
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 KQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVG
... ::: :.. :::::::: ::: ::::::: ::..::. ::: .::.::.:::.:
NP_001 RRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQNTAGINCETCTDGFFRPKGVSPNYPRPCQPCHCDPIG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 SLSSVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSAS
::. ::.::. :. . : ::.: :: :. : .:::: :: :: : .:.:. .:: .
NP_001 SLNEVCVKDEKHA--RRGLAPGSCHCKTGFGGVSCDRCARGYTGYPDCKACNCSGLGSKN
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 DEPCTGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVN
..:: :::.::::::: :.::: ::.::.: : .::.:::: :::. :.: : :...
NP_001 EDPCFGPCICKENVEGGDCSRCKSGFFNLQEDNWKGCDECFCSGVSNRCQSSYWTYGKIQ
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
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