Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2440
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2440, 3075 aa
1>>>pF1KE2440 3075 - 3075 aa - 3075 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5042+/-0.00162; mu= 25.0999+/- 0.098
mean_var=302.8791+/-58.951, 0's: 0 Z-trim(104.7): 154 B-trim: 34 in 1/52
Lambda= 0.073695
statistics sampled from 7895 (8021) to 7895 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 6.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075) 21241 2276.1 0
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122) 7174 780.6 0
CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277) 1460 173.1 2.6e-41
CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333) 1460 173.1 2.6e-41
CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695) 1432 170.2 2.2e-40
CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391) 1129 138.1 1.2e-30
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786) 1004 124.1 7.6e-27
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798) 986 122.2 2.9e-26
CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609) 929 116.1 1.8e-24
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761) 872 110.1 1.3e-22
CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1724) 798 102.2 2.9e-20
CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1111) 773 99.2 1.5e-19
CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1193) 773 99.3 1.6e-19
CCDS48010.2 MEGF9 gene_id:1955|Hs108|chr9 ( 602) 618 82.3 1e-14
CCDS1516.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1 (1546) 594 80.4 9.4e-14
CCDS44180.1 NTNG1 gene_id:22854|Hs108|chr1 ( 539) 586 78.8 1e-13
CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1 (5202) 594 81.4 1.7e-13
CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1668) 585 79.5 1.9e-13
CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1 (1172) 580 78.7 2.3e-13
CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1816) 554 76.3 1.9e-12
CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1823) 546 75.5 3.5e-12
CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140) 519 72.2 2e-11
CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 ( 604) 495 69.2 8.9e-11
>>CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075 aa)
initn: 21241 init1: 21241 opt: 21241 Z-score: 12221.6 bits: 2276.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 21241; 99.9% identity (100.0% similar) in 3075 aa overlap (1-3075:1-3075)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPGRP
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CCDS32 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPGRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 YVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMT
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CCDS32 ICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGES
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHN
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CCDS32 CINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 GKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGK
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CCDS32 GKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIP
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CCDS32 ACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV
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CCDS32 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 DSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLM
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CCDS32 DSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSC
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CCDS32 TVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 ESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEP
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CCDS32 ESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 SRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCR
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CCDS32 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS
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CCDS32 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG
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CCDS32 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 YRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALR
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CCDS32 YRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD
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CCDS32 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI
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CCDS32 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ
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CCDS32 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC
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CCDS32 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 LVEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ
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CCDS32 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS
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CCDS32 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 ENAVEITRQTNESLLILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE2 ASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLS
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE2 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE2 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE2 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE2 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE2 LLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGV
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE2 LAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKN
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KE2 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSS
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KE2 GIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSD
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KE2 GQAHSISLVRNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GQAHSISLVRNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMR
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KE2 RSFHGCIKNLIFNLELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKLAPDAEDSKLLPEPRAFPEQ
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CCDS32 RSFHGCIKNLIFNLELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKLAPDAEDSKLLPEPRAFPEQ
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CCDS51 VDANAMLFVGGLTGKLKKADAVRVITFTGCMGETYFDNKPIGLWNFREKEGDCKGCTVSP
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CCDS51 PAPPRRKRRQTGQAYYAILLNRGRLEVHLSTGART-MRKIVIRPEPNLFHDGREHSVHVE
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CCDS42 CNSNGQL-GSCHPLTGDCINQ-----------EPKDSSPAEECDDCDS-CVMTLLNDLAT
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CCDS42 MGEQLRLVKSQLQGL-SASAGLLEQMRHMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERE
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CCDS42 LTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLNNNVNRATQSAKELDVKIKNVIRNVHILLKQ--IS
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CCDS42 GTDGEGNNVPSGDFSREWAEAQRMMRELRNRNFGKHLREAEADKRESQLLLNRIR-TWQK
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..: .:. :...:. . .. ...... ... :: :: .:.: ::.
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.:. .: :. .:. :. :: ...... ::.::: :...:: .. .
CCDS33 SVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNG
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:. .. :. . . :..: . .. :: : ...:.:: :. :...: .:
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.: ....:: .. . : : . .. .. . : ..: .:: . . . .
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::. ..:.. . ..: ::: . . : .. ..::. :: . ..:.:. ::
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. : : :... :: . ..::.:.. . : .:. .. . . : .:.:
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..: . . .:: . . .: . .. :.:.: . : .... .. . . ..
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::. .. .. . : ..::. : :.::.: ... .:: : . :
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::.:... . :: : :. :: :: . . :...: :...:
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CCDS33 YSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFY
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::. .::.. :.::::..
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: : :..:: : : :.:: :: :::: :... :. .
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.:::.. ::::::.:... :. :. .:.: : :. : .. . :: .. :.
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. . . .:. : .:.: :::: .:.::::::::: : : .. : :
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CCDS57 LIM-TFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAY---DCEASFPGIS--TGP--MKKVDD
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CCDS57 T-NRTHRFLEKAKALKISGVI-GPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLK-NIGNLF
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240 250 260 270 280 290
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: :. : . : : . .. .. .: :..: . :: . :
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: .:. .. .. :: :. :: : . : ... .. .
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:.: : :. . ..:. . . :. .. . .. : :.: :
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..::.: . . ..:. :: : :: .:: : .:: : ....: ..:
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CCDS34 DLEALFRFSHLIL-TFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFA---KDCATSFPNITS--
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CCDS34 GQAQGVGD--IVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLD--PSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRI
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CCDS34 NFTKLHTLGDAL--LGRRQNDSLD-----KYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMR
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CCDS34 GDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRC
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CCDS34 CIPCECDPDGTISGGICVS---HSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATD
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CCDS34 PLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGN-HLHGCSPCD
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CCDS34 CDIGGAYSNVCSPKN---GQCECRPH--VTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQ
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CCDS34 GLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTI
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pF1KE2 TVDSNLMSHAD----VIIKGNG-------LTLSTQAEGLSL---------------QPYE
.. . .: :: .... : ::... ....: .:
CCDS34 AIHYETQSAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDV
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pF1KE2 EY---------------------LNVVRLVPE--NFQDFHSKRQIDRDQLMT--------
.: .. . :.:. ....: ::...:. :: .
CCDS34 QYSIDVYFSQPLQGESHAHSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEIASAM
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:: .. . :: :. ... .: . :. . : . :::
CCDS34 GPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRC
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