Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2424
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2424, 829 aa
1>>>pF1KE2424 829 - 829 aa - 829 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3667+/-0.000506; mu= 19.8794+/- 0.031
mean_var=65.6517+/-13.790, 0's: 0 Z-trim(107.2): 35 B-trim: 650 in 1/51
Lambda= 0.158289
statistics sampled from 15248 (15265) to 15248 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.513), E-opt: 0.2 (0.179), width: 16
Scan time: 10.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001309228 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 580) 2314 538.3 3.7e-152
XP_016862153 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 804) 2314 538.4 4.9e-152
NP_060169 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family ( 827) 2314 538.4 5.1e-152
XP_011511241 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 828) 2302 535.6 3.4e-151
XP_016862156 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 585) 2295 533.9 7.6e-151
XP_016862155 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 625) 2295 534.0 8.1e-151
NP_001309227 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 651) 2295 534.0 8.4e-151
XP_016862154 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 653) 2295 534.0 8.4e-151
NP_001309226 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 681) 2295 534.0 8.7e-151
NP_001309225 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 770) 2295 534.0 9.6e-151
NP_001309224 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 804) 2295 534.0 1e-150
NP_001295279 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 832) 2295 534.0 1e-150
NP_001309223 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 833) 2293 533.6 1.4e-150
NP_001309229 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane fam ( 405) 2041 475.9 1.6e-133
XP_016862157 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 405) 2041 475.9 1.6e-133
XP_011511243 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transm ( 794) 1973 460.5 1.4e-128
>>NP_001309228 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (580 aa)
initn: 2510 init1: 2283 opt: 2314 Z-score: 2852.6 bits: 538.3 E(85289): 3.7e-152
Smith-Waterman score: 2509; 63.5% identity (83.1% similar) in 597 aa overlap (233-829:1-580)
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPF
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NP_001 MQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-F
10 20
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 YPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQ
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NP_001 IQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRF
30 40 50 60 70 80
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 KKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGT
..:.. .. . . .:: .: : : :: :::.... :.:. : :..
NP_001 QRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSD
90 100 110 120 130 140
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 GDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKK
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NP_001 G-------GPPGQSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKK
150 160 170 180 190
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 YQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILS
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NP_001 YKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILS
200 210 220 230 240 250
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 NLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSA
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NP_001 NLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSA
260 270 280 290 300 310
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 CYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVV
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NP_001 CYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVV
320 330 340 350 360 370
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 FGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLDSGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLY
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NP_001 FGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKIDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLY
380 390 400 410 420 430
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 VDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIK
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NP_001 MDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVL
440 450 460 470 480 490
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 LIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSI
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NP_001 PVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSAT
500 510 520 530 540 550
810 820
pF1KE2 AMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
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NP_001 ALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
560 570 580
>>XP_016862153 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (804 aa)
initn: 2737 init1: 2283 opt: 2314 Z-score: 2850.5 bits: 538.4 E(85289): 4.9e-152
Smith-Waterman score: 2776; 55.4% identity (77.4% similar) in 801 aa overlap (31-829:44-804)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
. :.:...: :: :::.::.: .
XP_016 PWLLLAASPGHPAKSPRQPPAPRRDPFDAARGADFDHVYSGVVNLSTENIYSFNYTSQPD
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
.. .::: :: ... . :.: ::::.. :.:.::::...:..::.: ::.: ::::
XP_016 QVTAVRVYVNSSSENLNYPVLVVVRQQKEVLSWQVPLLFQGLYQRSYNYQEVSRTLCPSE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE2 TKNESEI--QFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEL
. ::. :...:::....:... :.: :... : :: :: : .: .:. :
XP_016 ATNETGPLQQLIFVDVASMAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRI-FYTSFPKTWTQ-LSLKWCL
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDF
. ...: .. : :: .:. ...:. . .:.:::
XP_016 -----KWLIHVLLSQ----SRIS--------WDFLPSTSFLPPIIRLL----CLMQKKDF
200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGML
:...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . .. .::.. :
XP_016 PGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPY
: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: .: : :
XP_016 FSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKN
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XP_016 EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKN
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQ
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XP_016 IIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQ
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALEC
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XP_016 DICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEY
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 GIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPD
::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::
XP_016 GIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPD
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 INASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLD
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XP_016 INASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKID
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAI
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XP_016 LGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGI
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 GICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESR
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XP_016 FICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESR
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820
pF1KE2 EHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
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XP_016 EKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
760 770 780 790 800
>>NP_060169 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family mem (827 aa)
initn: 3071 init1: 2283 opt: 2314 Z-score: 2850.3 bits: 538.4 E(85289): 5.1e-152
Smith-Waterman score: 3174; 59.7% identity (82.1% similar) in 801 aa overlap (31-829:44-827)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
. :.:...: :: :::.::.: .
NP_060 PWLLLAASPGHPAKSPRQPPAPRRDPFDAARGADFDHVYSGVVNLSTENIYSFNYTSQPD
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
.. .::: :: ... . :.: ::::.. :.:.::::...:..::.: ::.: ::::
NP_060 QVTAVRVYVNSSSENLNYPVLVVVRQQKEVLSWQVPLLFQGLYQRSYNYQEVSRTLCPSE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE2 TKNESEI--QFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEL
. ::. :...:::....:... :.: :... : :::. : :... .::::: :..
NP_060 ATNETGPLQQLIFVDVASMAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQYFLYKF
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDF
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NP_060 PKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMTKKAAITLQKKDF
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGML
:...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . .. .::.. :
NP_060 PGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPY
: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: .: : :
NP_060 FSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----
320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKN
:: :::.... :.:. : :.. : : : . :. :::::.:.::. ::.::::
NP_060 EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKN
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQ
.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.::::::::::::::::
NP_060 IIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALEC
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NP_060 DICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 GIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPD
::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::
NP_060 GIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 INASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLD
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NP_060 INASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKID
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 SGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAI
::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: :::::.:.:
NP_060 LGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGI
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 GICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESR
:::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. ::::::
NP_060 FICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESR
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KE2 EHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
:.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.:.::.: ::
NP_060 EKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
780 790 800 810 820
>>XP_011511241 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (828 aa)
initn: 3069 init1: 1402 opt: 2302 Z-score: 2835.4 bits: 535.6 E(85289): 3.4e-151
Smith-Waterman score: 3162; 59.6% identity (82.0% similar) in 802 aa overlap (31-829:44-828)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
. :.:...: :: :::.::.: .
XP_011 PWLLLAASPGHPAKSPRQPPAPRRDPFDAARGADFDHVYSGVVNLSTENIYSFNYTSQPD
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
.. .::: :: ... . :.: ::::.. :.:.::::...:..::.: ::.: ::::
XP_011 QVTAVRVYVNSSSENLNYPVLVVVRQQKEVLSWQVPLLFQGLYQRSYNYQEVSRTLCPSE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE2 TKNESEI--QFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEL
. ::. :...:::....:... :.: :... : :::. : :... .::::: :..
XP_011 ATNETGPLQQLIFVDVASMAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQYFLYKF
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDF
:. :::::.::.:. :.::::.:.:...:::::::.:: : :.::.::::::::.:.:::
XP_011 PKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMTKKAAITLQKKDF
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGML
:...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . .. .::.. :
XP_011 PGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSL
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPY
: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: .: : :
XP_011 FSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----
320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 EGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKN
:: :::.... :.:. : :.. : : : . :. :::::.:.::. ::.::::
XP_011 EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKN
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 VIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQ
.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.::::::::::::::::
XP_011 IIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 DICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALEC
:::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.:
XP_011 DICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEY
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 GIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPD
::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::
XP_011 GIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 INASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKL-
:::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:.
XP_011 INASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKIA
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 DSGIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLA
: ::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: :::::.:.
XP_011 DLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 IGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAES
: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. :::::
XP_011 IFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAES
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KE2 REHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.:.::.: ::
XP_011 REKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
780 790 800 810 820
>>XP_016862156 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (585 aa)
initn: 2498 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2829.1 bits: 533.9 E(85289): 7.6e-151
Smith-Waterman score: 2490; 63.0% identity (82.4% similar) in 602 aa overlap (233-829:1-585)
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPF
.:.::::...:.:: :.: :: :::::. :
XP_016 MQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-F
10 20
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 YPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQ
:.. . .:.:.: : . .. .::.. :: . ::::::: .:.. . :
XP_016 IQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRF
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pF1KE2 KKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGT
..:.. .. . . .:: .: : : :: :::.... :.:. : :..
XP_016 QRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSD
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: : . :. :::::.:.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. ::
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:.:::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
XP_016 YKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILS
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pF1KE2 NLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSA
:::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.:::
XP_016 NLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSA
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pF1KE2 CYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVV
::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::: .:.::. .:::::
XP_016 CYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVV
320 330 340 350 360 370
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pF1KE2 FGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQC
:::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:.: ::::: :.:::::.::
XP_016 FGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQC
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pF1KE2 SGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRS
: :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: :::::.:.: :::::::.::::::::::
XP_016 SRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRS
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pF1KE2 GERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWH
.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. :::::::.::.::::::::::::::
XP_016 SEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWH
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pF1KE2 FLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
:::. :.: :::::::::::::.:.::.: ::
XP_016 FLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
560 570 580
>>XP_016862155 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (625 aa)
initn: 2724 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.7 bits: 534.0 E(85289): 8.1e-151
Smith-Waterman score: 2705; 63.7% identity (83.3% similar) in 641 aa overlap (194-829:2-625)
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 FNTTAAQPQYFKYELPEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQ
:.::::.:.:...:::::::.:: : :.::
XP_016 MAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQ
10 20 30
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pF1KE2 TMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVL
.::::::::.:.::::...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: :
XP_016 SMTKKAAITLQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVT
40 50 60 70 80
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pF1KE2 VSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLG
. .. .::.. :: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .
XP_016 IVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVAS
90 100 110 120 130 140
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pF1KE2 HPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVE
:: .: : : :: :::.... :.:. : :.. : : : . :. ::::
XP_016 HP--IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVE
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:.:.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.:
XP_016 ESDFDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQ
200 210 220 230 240 250
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pF1KE2 LVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREIN
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.:
XP_016 LVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDIL
260 270 280 290 300 310
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pF1KE2 HNRALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMI
: ::: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.:::::::::::.::::::::::::
XP_016 HRRALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMI
320 330 340 350 360 370
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pF1KE2 AGLCMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATL
:::::::::: :::::::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.:
XP_016 AGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASL
380 390 400 410 420 430
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::::.:::::.:.: ::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::
XP_016 ALSTQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWS
440 450 460 470 480 490
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pF1KE2 LAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGF
.: .:::.:: :::::.:.: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:.
XP_016 FALFGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAA
500 510 520 530 540 550
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pF1KE2 ALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDL
::.::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::::::. :.: ::::::::::::
XP_016 ALYFFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDL
560 570 580 590 600 610
820
pF1KE2 DTVQRDKIYVF
:.:.::.: ::
XP_016 DVVRRDQIPVF
620
>>NP_001309227 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (651 aa)
initn: 2498 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.4 bits: 534.0 E(85289): 8.4e-151
Smith-Waterman score: 2490; 63.0% identity (82.4% similar) in 602 aa overlap (233-829:67-651)
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPF
.:.::::...:.:: :.: :: :::::. :
NP_001 IHVLLSQSRISWDFLPSTSFLPPIIRLLCLMQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-F
40 50 60 70 80 90
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pF1KE2 YPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQ
:.. . .:.:.: : . .. .::.. :: . ::::::: .:.. . :
NP_001 IQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRF
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pF1KE2 KKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGT
..:.. .. . . .:: .: : : :: :::.... :.:. : :..
NP_001 QRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSD
160 170 180 190 200
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pF1KE2 GDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKK
: : . :. :::::.:.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. ::
NP_001 G-------GPPGQSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKK
210 220 230 240 250
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pF1KE2 YQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILS
:.:::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_001 YKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILS
260 270 280 290 300 310
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pF1KE2 NLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSA
:::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.:::
NP_001 NLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSA
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::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::: .:.::. .:::::
NP_001 CYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVV
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pF1KE2 FGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQC
:::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:.: ::::: :.:::::.::
NP_001 FGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQC
440 450 460 470 480 490
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pF1KE2 SGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRS
: :::.:::::::.::..:::.: .:::.:: :::::.:.: :::::::.::::::::::
NP_001 SRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRS
500 510 520 530 540 550
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pF1KE2 GERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWH
.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. :::::::.::.::::::::::::::
NP_001 SEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWH
560 570 580 590 600 610
800 810 820
pF1KE2 FLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
:::. :.: :::::::::::::.:.::.: ::
NP_001 FLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
620 630 640 650
>>XP_016862154 (OMIM: 606816) PREDICTED: SID1 transmembr (653 aa)
initn: 2730 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.4 bits: 534.0 E(85289): 8.4e-151
Smith-Waterman score: 2662; 58.7% identity (79.1% similar) in 698 aa overlap (137-829:1-653)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 YLYQKVERTLCQPPTKNESEIQFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNT
..:... :.: :... : :::. : :..
XP_016 MAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTA
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 TAAQPQYFKYELPEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMT
. .::::: :..:. :::::.::.:. :.::::.:.:...
XP_016 SPSQPQYFLYKFPKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIM--------------------
40 50 60 70
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 KKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQ
.::::...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : .
XP_016 --------KKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVP
80 90 100 110 120
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 AVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPR
.. .::.. :: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .::
XP_016 SIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP-
130 140 150 160 170
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pF1KE2 VLADSFPGSSPYEGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDD
.: : : :: :::.... :.:. : :.. : : . :. :::::.:
XP_016 -IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG-------GPPGQSDTDSSVEESD
180 190 200 210 220
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pF1KE2 YDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVI
.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.::::
XP_016 FDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVI
230 240 250 260 270 280
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 TYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNR
:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: : :
XP_016 TYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRR
290 300 310 320 330 340
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 ALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGL
:: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::
XP_016 ALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGL
350 360 370 380 390 400
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 CMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLS
::::::: :::::::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: ::
XP_016 CMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALS
410 420 430 440 450 460
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 TQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAA
::.:::::.:.: ::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::.:
XP_016 TQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFAL
470 480 490 500 510 520
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 YGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALF
.:::.:: :::::.:.: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.
XP_016 FGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALY
530 540 550 560 570 580
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 FFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTV
::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.:
XP_016 FFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVV
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 QRDKIYVF
.::.: ::
XP_016 RRDQIPVF
650
>>NP_001309226 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (681 aa)
initn: 2899 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2828.1 bits: 534.0 E(85289): 8.7e-151
Smith-Waterman score: 2880; 61.9% identity (82.8% similar) in 698 aa overlap (137-829:1-681)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 YLYQKVERTLCQPPTKNESEIQFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNT
..:... :.: :... : :::. : :..
NP_001 MAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTA
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170 180 190 200 210 220
pF1KE2 TAAQPQYFKYELPEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMT
. .::::: :..:. :::::.::.:. :.::::.:.:...:::::::.:: : :.::.::
NP_001 SPSQPQYFLYKFPKDVDSVIIKVVSEMAYPCSVVSVQNIMCPVYDLDHNVEFNGVYQSMT
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pF1KE2 KKAAITVQRKDFPSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQ
::::::.:.::::...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : .
NP_001 KKAAITLQKKDFPGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVP
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pF1KE2 AVTSEAYVSGMLFCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPR
.. .::.. :: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .::
NP_001 SIKESVYVKSSLFSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP-
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.: : : :: :::.... :.:. : :.. : : . :. :::::.:
NP_001 -IAASTP-----EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG-------GPPGQSDTDSSVEESD
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pF1KE2 YDTLTDIDSDKNVIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVI
.::. ::.::::.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.::::
NP_001 FDTMPDIESDKNIIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVI
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pF1KE2 TYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNR
:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: : :
NP_001 TYQTVVNVTGNQDICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRR
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pF1KE2 ALLRNDLCALECGIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGL
:: .:. :.: ::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::
NP_001 ALEAKDIFAVEYGIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGL
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pF1KE2 CMLKLYQKRHPDINASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLS
::::::: :::::::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: ::
NP_001 CMLKLYQTRHPDINASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALS
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pF1KE2 TQLYYMGRWKLDS-----GIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAA
::.:::::.:.: ::::: :.:::::.::: :::.:::::::.::..:::.:
NP_001 TQIYYMGRFKIDVSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFAL
500 510 520 530 540 550
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 YGLIMRPNDFASYLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALF
.:::.:: :::::.:.: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.
NP_001 FGLIYRPRDFASYMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALY
560 570 580 590 600 610
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 FFFQGLSTWQKTPAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTV
::::.::.:. :::::::.::.:::::::::::::::::. :.: :::::::::::::.:
NP_001 FFFQNLSSWEGTPAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVV
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 QRDKIYVF
.::.: ::
NP_001 RRDQIPVF
680
>>NP_001309225 (OMIM: 606816) SID1 transmembrane family (770 aa)
initn: 2840 init1: 1404 opt: 2295 Z-score: 2827.3 bits: 534.0 E(85289): 9.6e-151
Smith-Waterman score: 2719; 54.2% identity (74.6% similar) in 806 aa overlap (31-829:44-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MFALGLPFLVLLVASVESHLGVLGPKNVSQKDAEFERTYVDEVNSELVNIYTFNHTVTRN
. :.:...: :: :::.::.: .
NP_001 PWLLLAASPGHPAKSPRQPPAPRRDPFDAARGADFDHVYSGVVNLSTENIYSFNYTSQPD
20 30 40 50 60 70
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pF1KE2 RTEGVRVSVNVLNKQKGAPLLFVVRQKEAVVSFQVPLILRGMFQRKYLYQKVERTLCQPP
.. .::: :: ... . :.: ::::.. :.:.::::...:..::.: ::.: ::::
NP_001 QVTAVRVYVNSSSENLNYPVLVVVRQQKEVLSWQVPLLFQGLYQRSYNYQEVSRTLCPSE
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE2 TKNESEI--QFFYVDVSTLSPVNTTYQLRVSRMDDFVLRTGEQFSFNTTAAQPQYFKYEL
. ::. :...:::....:... :.: :... : :::. : :... .:::
NP_001 ATNETGPLQQLIFVDVASMAPLGAQYKLLVTKLKHFQLRTNVAFHFTASPSQPQ------
140 150 160 170 180
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pF1KE2 PEGVDSVIVKVTSNKAFPCSVISIQDVLCPVYDLDNNVAFIGMYQTMTKKAAITVQRKDF
.:::
NP_001 --------------------------------------------------------KKDF
190
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSNSFYVVVVVKTEDQACGGSLPFYPFAEDEPVDQGHRQKTLSVLVSQAVTSEAYVSGML
:...:.:: :.: :: :::::. : :.. . .:.:.: : . .. .::.. :
NP_001 PGEQFFVVFVIKPEDYACGGSF-FIQEKENQTWNL-QRKKNLEVTIVPSIKESVYVKSSL
200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 FCLGIFLSFYLLTVLLACWENWRQKKKTLLVAIDRACPESASLLGHPRVLADSFPGSSPY
: . ::::::: .:.. . : ..:.. .. . . .:: .: : :
NP_001 FSVFIFLSFYLGCLLVGFVHYLRFQRKSIDGSFGSNDGSGNMVASHP--IAASTP-----
250 260 270 280 290 300
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pF1KE2 EGYNYGSFENVSGSTDGLVDSAGTGDLSYGYQGTRPRVDSMSSVEEDDYDTLTDIDSDKN
:: :::.... :.:. : :.. : : : . :. :::::.:.::. ::.::::
NP_001 EGSNYGTIDE-SSSSPGRQMSSSDG----GPPG---QSDTDSSVEESDFDTMPDIESDKN
310 320 330 340 350
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pF1KE2 VIRTKQYLYVADLARKDKRVLRKKYQIYFWNIATIAVFYALPVVQLVITYQTVVNVTGNQ
.::::..::..::.:::.:.. :::.:::::: ::::::::::.::::::::::::::::
NP_001 IIRTKMFLYLSDLSRKDRRIVSKKYKIYFWNIITIAVFYALPVIQLVITYQTVVNVTGNQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 DICYYNFLCAHPLGNLSAFNNILSNLGYILLGLLFLLIILQREINHNRALLRNDLCALEC
:::::::::::::: ::::::::::::..:::.:::::.:.:.: : ::: .:. :.:
NP_001 DICYYNFLCAHPLGVLSAFNNILSNLGHVLLGFLFLLIVLRRDILHRRALEAKDIFAVEY
420 430 440 450 460 470
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pF1KE2 GIPKHFGLFYAMGTALMMEGLLSACYHVCPNYTNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQKRHPD
::::::::::::: ::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::::: ::::
NP_001 GIPKHFGLFYAMGIALMMEGVLSACYHVCPNYSNFQFDTSFMYMIAGLCMLKLYQTRHPD
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pF1KE2 INASAYSAYACLAIVIFFSVLGVVFGKGNTAFWIVFSIIHIIATLLLSTQLYYMGRWKLD
:::::::::: .:.::. .::::::::... ::..:: ::..:.: ::::.:::::.:.:
NP_001 INASAYSAYASFAVVIMVTVLGVVFGKNDVWFWVIFSAIHVLASLALSTQIYYMGRFKID
540 550 560 570 580 590
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pF1KE2 S-----GIFRRILHVLYTDCIRQCSGPLYVDRMVLLVMGNVINWSLAAYGLIMRPNDFAS
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NP_001 VSDTDLGIFRRAAMVFYTDCIQQCSRPLYMDRMVLLVVGNLVNWSFALFGLIYRPRDFAS
600 610 620 630 640 650
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 YLLAIGICNLLLYFAFYIIMKLRSGERIKLIPLLCIVCTSVVWGFALFFFFQGLSTWQKT
:.:.: :::::::.::::::::::.:.. .::.::: :.:.:. ::.::::.::.:. :
NP_001 YMLGIFICNLLLYLAFYIIMKLRSSEKVLPVPLFCIVATAVMWAAALYFFFQNLSSWEGT
660 670 680 690 700 710
780 790 800 810 820
pF1KE2 PAESREHNRDCILLDFFDDHDIWHFLSSIAMFGSFLVLLTLDDDLDTVQRDKIYVF
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NP_001 PAESREKNRECILLDFFDDHDIWHFLSATALFFSFLVLLTLDDDLDVVRRDQIPVF
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]