Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2411
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2411, 570 aa
1>>>pF1KE2411 570 - 570 aa - 570 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6122+/-0.000924; mu= 17.5575+/- 0.055
mean_var=74.4044+/-15.401, 0's: 0 Z-trim(105.9): 24 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.148688
statistics sampled from 8670 (8676) to 8670 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 2.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11209.1 SLC47A1 gene_id:55244|Hs108|chr17 ( 570) 3719 807.4 0
CCDS58530.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 ( 580) 1269 281.9 1.5e-75
CCDS11211.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 ( 602) 1116 249.1 1.2e-65
>>CCDS11209.1 SLC47A1 gene_id:55244|Hs108|chr17 (570 aa)
initn: 3719 init1: 3719 opt: 3719 Z-score: 4310.2 bits: 807.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3719; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLSAFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLISFISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLSAFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLISFISS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVILQRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVILQRSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQVKYLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQVKYLLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LAIIVYMVPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAIIVYMVPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 PRSGNSALPQDPLHPGCPENLEGILTNDVGKTGEPQSDQQMRQEEPLPEHPQDGAKLSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PRSGNSALPQDPLHPGCPENLEGILTNDVGKTGEPQSDQQMRQEEPLPEHPQDGAKLSRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE2 QLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ
550 560 570
>>CCDS58530.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 (580 aa)
initn: 1319 init1: 1266 opt: 1269 Z-score: 1469.7 bits: 281.9 E(32554): 1.5e-75
Smith-Waterman score: 1808; 50.0% identity (76.1% similar) in 570 aa overlap (22-564:13-574)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI
:. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.:
CCDS58 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI
..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : ::::::
CCDS58 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV
:::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : .
CCDS58 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 KYLLNQGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYI
::: :: :. ::...::..: ::..::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::
CCDS58 KYLQNQKITWPQVLSGVVGNCVNGVANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LGKKLHQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQ
. :::: ::.::: .:::::. :. ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::
CCDS58 VLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPFFSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE2 SIVYELAIIVYM--------------VPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLL
...::.: ..:: .: :.:... :::: ::::.: ::..:.. ..:
CCDS58 AVIYEVATVTYMRHSHRLAYAAHVTRIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAKRSAVSGVL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 ITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRG
: .......:. :...:.:::.:.:.: ::.::.:.:.: :.:::. :. ::::::
CCDS58 SIVGISLVLGTLISILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVLPVYSVFHVFEAICCVYGGVLRG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 SGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLN
.:.: :: ::.: ::..:::.:: : :.. . .:::: :.. :. . .. :... .:.
CCDS58 TGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLWLGMLACVFLATAAFVAYTARLD
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 WKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPEN--LEGILTNDV-GKTGEPQSD
:: : ..:. :.. . .. :. ..: .:: ::. : .. :.. : : :
CCDS58 WKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAESTAT-----RPG-PEKAVLSSVATGSSPGITLTTYSR
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 QQMRQE---EPLPEHPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ
.. . . : : .. ..:: ::::.::: : .. :.::. ::
CCDS58 SECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALGAASATLMVGLTVRILATRH
530 540 550 560 570 580
>>CCDS11211.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 (602 aa)
initn: 1085 init1: 1085 opt: 1116 Z-score: 1292.1 bits: 249.1 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 1774; 48.3% identity (73.5% similar) in 592 aa overlap (22-564:13-596)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI
:. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.:
CCDS11 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI
..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : ::::::
CCDS11 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV
:::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : .
CCDS11 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA
120 130 140 150 160 170
180 190
pF1KE2 KYLLNQG------------------------------------IVLPQIVTGVAANLVNA
::: ::: :. ::...::..: ::.
CCDS11 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF
.::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. :
CCDS11 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYMVPAGFSVAASVR
. ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..::.: :.:... ::
CCDS11 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMIPLGLSIGVCVR
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 VGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVV
:: ::::.: ::..:.. ..: : .......:. :...:.:::.:.:.: ::.::.
CCDS11 VGMALGAADTVQAKRSAVSGVLSIVGISLVLGTLISILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVL
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 PIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLW
:.:.: :.:::. :. ::::::.:.: :: ::.: ::..:::.:: : :.. . .::::
CCDS11 PVYSVFHVFEAICCVYGGVLRGTGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLW
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPE
:.. :. . .. :... .:.:: : ..:. :.. . .. :. ..: .:: ::
CCDS11 LGMLACVFLATAAFVAYTARLDWKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAESTAT-----RPG-PE
480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 N--LEGILTNDV-GKTGEPQSDQQMRQE---EPLPEHPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLL
. : .. :.. : : : .. . . : : .. ..:: ::::.::: :
CCDS11 KAVLSSVATGSSPGITLTTYSRSECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALG
530 540 550 560 570 580
560 570
pF1KE2 GVFLILLVGILVRFYVRIQ
.. :.::. ::
CCDS11 AASATLMVGLTVRILATRH
590 600
570 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 19:44:42 2016 done: Sat Nov 5 19:44:42 2016
Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]