Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2377
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2377, 1390 aa
1>>>pF1KE2377 1390 - 1390 aa - 1390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5580+/-0.00129; mu= 10.1906+/- 0.078
mean_var=312.9352+/-62.635, 0's: 0 Z-trim(109.3): 101 B-trim: 115 in 1/52
Lambda= 0.072502
statistics sampled from 10725 (10810) to 10725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.656), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 5.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 9142 972.0 0
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 3622 394.6 1e-108
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 759 94.9 1e-18
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 703 89.1 6.3e-17
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 647 82.8 2.3e-15
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 642 82.2 3e-15
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 642 82.3 3.4e-15
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 610 78.9 3.2e-14
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 610 78.9 3.3e-14
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 602 78.1 5.8e-14
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 584 76.2 2.3e-13
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 586 76.7 2.5e-13
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 586 76.7 2.7e-13
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 586 76.7 2.8e-13
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 586 76.8 3e-13
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 551 72.8 2.7e-12
CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 547 72.5 4.1e-12
CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 547 72.6 4.6e-12
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 545 72.6 6.3e-12
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 539 71.6 6.3e-12
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 527 70.2 1.3e-11
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 527 70.2 1.4e-11
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 513 68.8 3.9e-11
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 508 68.2 5e-11
>>CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390 aa)
initn: 9142 init1: 9142 opt: 9142 Z-score: 5185.7 bits: 972.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9142; 100.0% identity (100.0% similar) in 1390 aa overlap (1-1390:1-1390)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVVLRSSLELHNHSAASATGSLDLSSDFLSLEHIGRRRLRSAGAAQKKPAATTAKAGDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MVVLRSSLELHNHSAASATGSLDLSSDFLSLEHIGRRRLRSAGAAQKKPAATTAKAGDGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SVKEVETYHRTRALRSLRKDAQNSSDSSFEKNVEITEQLANGRHFTRQLARQQADKKKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SVKEVETYHRTRALRSLRKDAQNSSDSSFEKNVEITEQLANGRHFTRQLARQQADKKKEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HREDKVIPVTRSLRARNIVQSTEHLHEDNGDVEVRRSCRIRSRYSGVNQSMLFDKLITNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HREDKVIPVTRSLRARNIVQSTEHLHEDNGDVEVRRSCRIRSRYSGVNQSMLFDKLITNT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 AEAVLQKMDDMKKMRRQRMRELEDLGVFNETEESNLNMYTRGKQKDIQRTDEETTDNQEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AEAVLQKMDDMKKMRRQRMRELEDLGVFNETEESNLNMYTRGKQKDIQRTDEETTDNQEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SVESSEEGEDQEHEDDGEDEDDEDDDDDDDDDDDDDDEDDEDEEDGEEENQKRYYLRQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SVESSEEGEDQEHEDDGEDEDDEDDDDDDDDDDDDDDEDDEDEEDGEEENQKRYYLRQRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 ATVYYQAPLEKPRHQRKPNIFYSGPASPARPRYRLSSAGPRSPYCKRMNRRRHAIHSSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ATVYYQAPLEKPRHQRKPNIFYSGPASPARPRYRLSSAGPRSPYCKRMNRRRHAIHSSDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TSSSSSEDEQHFERRRKRSRNRAINRCLPLNFRKDELKGIYKDRMKIGASLADVDPMQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TSSSSSEDEQHFERRRKRSRNRAINRCLPLNFRKDELKGIYKDRMKIGASLADVDPMQLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 SSVRFDSVGGLSNHIAALKEMVVFPLLYPEVFEKFKIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SSVRFDSVGGLSNHIAALKEMVVFPLLYPEVFEKFKIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ANECSQGDKRVAFFMRKGADCLSKWVGESERQLRLLFDQAYQMRPSIIFFDEIDGLAPVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 ANECSQGDKRVAFFMRKGADCLSKWVGESERQLRLLFDQAYQMRPSIIFFDEIDGLAPVR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDSRGEIVVIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFSLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDSRGEIVVIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFSLPD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 KEARKEILKIHTRDWNPKPLDTFLEELAENCVGYCGADIKSICAEAALCALRRRYPQIYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KEARKEILKIHTRDWNPKPLDTFLEELAENCVGYCGADIKSICAEAALCALRRRYPQIYT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 TSEKLQLDLSSINISAKDFEVAMQKMIPASQRAVTSPGQALSTVVKPLLQNTVDKILEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TSEKLQLDLSSINISAKDFEVAMQKMIPASQRAVTSPGQALSTVVKPLLQNTVDKILEAL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 QRVFPHAEFRTNKTLDSDISCPLLESDLAYSDDDVPSVYENGLSQKSSHKAKDNFNFLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QRVFPHAEFRTNKTLDSDISCPLLESDLAYSDDDVPSVYENGLSQKSSHKAKDNFNFLHL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 NRNACYQPMSFRPRILIVGEPGFGQGSHLAPAVIHALEKFTVYTLDIPVLFGVSTTSPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 NRNACYQPMSFRPRILIVGEPGFGQGSHLAPAVIHALEKFTVYTLDIPVLFGVSTTSPEE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 TCAQVIREAKRTAPSIVYVPHIHVWWEIVGPTLKATFTTLLQNIPSFAPVLLLATSDKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TCAQVIREAKRTAPSIVYVPHIHVWWEIVGPTLKATFTTLLQNIPSFAPVLLLATSDKPH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 SALPEEVQELFIRDYGEIFNVQLPDKEERTKFFEDLILKQAAKPPISKKKAVLQALEVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SALPEEVQELFIRDYGEIFNVQLPDKEERTKFFEDLILKQAAKPPISKKKAVLQALEVLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 VAPPPEPRSLTAEEVKRLEEQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VAPPPEPRSLTAEEVKRLEEQEEDTFRELRIFLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 YVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLRDIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESRKKRGCSSSKYAPSYYHVMPKQNSTLVGDKRSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESRKKRGCSSSKYAPSYYHVMPKQNSTLVGDKRSD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 PEQNEKLKTPSTPVACSTPAQLKRKIRKKSNWYLGTIKKRRKISQAKDDSQNAIDHKIES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 PEQNEKLKTPSTPVACSTPAQLKRKIRKKSNWYLGTIKKRRKISQAKDDSQNAIDHKIES
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 DTEETQDTSVDHNETGNTGESSVEENEKQQNASESKLELRNNSNTCNIENELEDSRKTTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DTEETQDTSVDHNETGNTGESSVEENEKQQNASESKLELRNNSNTCNIENELEDSRKTTA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 CTELRDKIACNGDASSSQIIHISDENEGKEMCVLRMTRARRSQVEQQQLITVEKALAILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 CTELRDKIACNGDASSSQIIHISDENEGKEMCVLRMTRARRSQVEQQQLITVEKALAILS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 QPTPSLVVDHERLKNLLKTVVKKSQNYNIFQLENLYAVISQCIYRHRKDHDKTSLIQKME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QPTPSLVVDHERLKNLLKTVVKKSQNYNIFQLENLYAVISQCIYRHRKDHDKTSLIQKME
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390
pF1KE2 QEVENFSCSR
::::::::::
CCDS63 QEVENFSCSR
1390
>>CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458 aa)
initn: 4109 init1: 3304 opt: 3622 Z-score: 2065.1 bits: 394.6 E(32554): 1e-108
Smith-Waterman score: 3964; 51.0% identity (74.7% similar) in 1289 aa overlap (15-1283:25-1246)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MVVLRSSLELHNHSAASATGSLDLSSDFLSLEHIGRRRLRSAGAAQKKPA
:.. :. :: :.: .: : .. ::. :
CCDS46 MVNTRKSSLRLLGSKSPGPGPGPGAGAEPGATGGSSHFIS----SRTRSSKTRAASCPAA
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KE2 ATTAKAGDGSSVKEV----------ETYHRTRALRSLRKDAQNSSDSSFEKNVEITEQ--
. ...: : .. :. ... : :.:.. . .:.: ... :.
CCDS46 KAGGSGGAGVTLDEARKVEVDGSLSDSHVSPPAKRTLKQPDSVCKDKSKSRSTGQREEWN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 LANGRHFTRQLARQQADKKKEEHREDKVIPVTRSLRARNIVQSTEHLHEDNGDVEVRRSC
:..:. .:. : . . : .. :: :. .. : :::.:::.::
CCDS46 LSTGQA---RLTSQPGATLPNGHSGLSL----RSHPLRGEKKGDGDLSCINGDMEVRKSC
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 RIR-SRYSGVNQSMLFDKLITNTAEAVLQKMDDMKKMRRQRMRELEDLGVFNETEESNLN
: : .:. .::::.:::.:...:::::::.::... : .: :.: : ....:: :..
CCDS46 RSRKNRFESVNQSLLFDQLVNSTAEAVLQEMDNINIRRNRRSGEVERLRMWTDTEFENMD
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 MYTRGKQKDIQRTDEETTDNQEGSVESSEEGEDQEHEDDGEDEDDEDDDDDDDDDDDDDD
::.: :.. . :.. . : ...:: . : :..:....: :
CCDS46 MYSRVKRR-------------RKSLRRNSYGIQNHHEVSTEGEEEESQEEDGDI------
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 EDDEDEEDGEEENQKRYYLRQRKATVYYQAPLEKPRHQRK-PNIFYSGPASPARPRYRLS
: :: :::.. : :::::.. :::: : ::.: : ... ::::
CCDS46 ---EVEEAEGEENDRPYNLRQRKTVDRYQAPPIVPAHQKKRENTLFDIHRSPAR------
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SAGPRSPYCKRMNRRRHAIHSSDSTSSSSSEDEQHFERRRKRSRNRAINRCLPLNFRKDE
:: .. :..:::::::.::: ::..::::...: :: :::::.::: ..
CCDS46 ----RS----HIRRKKHAIHSSDTTSS----DEERFERRKSKSMARARNRCLPMNFRAED
330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 L-KGIYKDRMKIGASLADVDPMQLDSSVRFDSVGGLSNHIAALKEMVVFPLLYPEVFEKF
: .:: ..:.:.::::::::::..:.::::::.::::.:: ::::::::::::::.::::
CCDS46 LASGILRERVKVGASLADVDPMNIDKSVRFDSIGGLSHHIHALKEMVVFPLLYPEIFEKF
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 KIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARALANECSQGDKRVAFFMRKGADCLSKWVGESERQLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KIQPPRGCLFYGPPGTGKTLVARALANECSQGDKKVAFFMRKGADCLSKWVGESERQLRL
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 LFDQAYQMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDSRGEIVVIGATN
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS46 LFDQAYLMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALMDGLDNRGEIVVIGATN
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 RLDSIDPALRRPGRFDREFLFSLPDKEARKEILKIHTRDWNPKPLDTFLEELAENCVGYC
:::::::::::::::::::::.:::..:::.::.::::::::: :.:: ::::.:::::
CCDS46 RLDSIDPALRRPGRFDREFLFNLPDQKARKHILQIHTRDWNPKLSDAFLGELAEKCVGYC
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 GADIKSICAEAALCALRRRYPQIYTTSEKLQLDLSSINISAKDFEVAMQKMIPASQRAVT
:::::..:.:::: ::::::::::..:.:::::.::: .::.:: :::...:::::::
CCDS46 GADIKALCTEAALIALRRRYPQIYASSHKLQLDVSSIVLSAQDFYHAMQNIVPASQRAVM
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 SPGQALSTVVKPLLQNTVDKILEALQRVFPHAEFRTNKTLDSDISCPLLESDLAYSDDDV
: :.::: ...:::. . ..:: .::.::::::. . . :: .::.. :...
CCDS46 SSGHALSPIIRPLLERSFNNILAVLQKVFPHAEISQSDKKE-DIETLILEDS---EDENA
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 PSVYE----NGLSQKSSHKAKDNFNFLHLNRNACYQPMSFRPRILIVGEPGFGQGSHLAP
:..: .: .:.: .: . .::.. . .:: :.:::.:. :: : :: :::::
CCDS46 LSIFETNCHSGSPKKQSSSAAIHKPYLHFTMSPYHQPTSYRPRLLLSGERGSGQTSHLAP
730 740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 AVIHALEKFTVYTLDIPVLFGVSTTSPEETCAQVIREAKRTAPSIVYVPHIHVWWEIVGP
:..:.::.:.:. ::.:.:..::. .:::.:::..:::.::.:::::.::: ::: :.
CCDS46 ALLHTLERFSVHRLDLPALYSVSAKTPEESCAQIFREARRTVPSIVYMPHIGDWWEAVSE
790 800 810 820 830 840
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 TLKATFTTLLQNIPSFAPVLLLATSDKPHSALPEEVQELFIRDYGEIFNVQLPDKEERTK
:..::: ::::.::::.:..::.::. .: :::::. .: .: :.. .: : .:.: :
CCDS46 TVRATFLTLLQDIPSFSPIFLLSTSETMYSELPEEVKCIFRIQYEEVLYIQRPIEEDRRK
850 860 870 880 890 900
940 950 960 970 980 990
pF1KE2 FFEDLILKQAAKPPISKKKAVLQALEVLPVAPPPEPRSLTAEEVKRLEEQEEDTFRELRI
::..:::.::. : .:.:.: :.::::.: : ::.:. : .:.:.:::.:.::::.
CCDS46 FFQELILNQASMAPPRRKHAALCAMEVLPLALPSPPRQLSESEKSRMEDQEENTLRELRL
910 920 930 940 950 960
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE2 FLRNVTHRLAIDKRFRVFTKPVDPDEVPDYVTVIKQPMDLSSVISKIDLHKYLTVKDYLR
:::.::.::: :::: .:.:::: .:: ::. :::.:::::.::.::: :.:::.::.:.
CCDS46 FLRDVTKRLATDKRFNIFSKPVDIEEVSDYLEVIKEPMDLSTVITKIDKHNYLTAKDFLK
970 980 990 1000 1010 1020
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE2 DIDLICSNALEYNPDRDPGDRLIRHRACALRDTAYAIIKEELDEDFEQLCEEIQESRKKR
:::::::::::::::.::::..::::::.:.:::.::: ::: .:..:::::.:.: ::
CCDS46 DIDLICSNALEYNPDKDPGDKIIRHRACTLKDTAHAIIAAELDPEFNKLCEEIKEARIKR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE2 GCSSSKYAPSYYHVMPKQNSTLVGDKRSDPEQNEKLKTPSTPVACSTPAQLKRKIRKKSN
: : .. . . . ... : : . ..: .. :. ...:: :..:.
CCDS46 GLSVTSEQINPHSTGARKTETRVEEAFRHKQRNPMDVWHNSANKCAF--RVRRKSRRRSQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE2 WYLGTIKKRRKISQAKDDSQNAIDHKIESDTEETQDTSVDHNETGNTGESSVEENEKQQN
: : :::: :... : : . : :. . ..:.: .. .: :: : . ...:
CCDS46 WGKGIIKKR-KVNNLKKDEE---DTKFADYENHTEDRKLLEN-----GEFEVSTDCHEEN
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pF1KE2 ASES-KLELRNNSNTCNIENELEDSRKTTACTELRDKIACNGDASSSQIIHISDENEGKE
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CCDS46 GEETGDLSMTNDESSCDIMD-LDQGQRLNNGAGTKENFASTEEESSNESLLVNSSSSLNP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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pF1KE2 MCVLRMTRARRSQVEQQQLITVEKALAILSQPTPSLVVDHERLKNLLKTVVKKSQNYNIF
CCDS46 EQTSRKETFLKGNCLNGEASTDSFEGIPVLECQNGKLEVVSFCDSGDKCSSEQKILLEDQ
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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: . : . . : .:..:: ...:
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CCDS65 GPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLT
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CCDS65 LMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKL
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CCDS65 AD-DVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTM
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::. :... :.. :
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450 460 470 480 490 500
>--
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: ....::: . :.:.: .:. .:. :
CCDS65 SLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKF
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460 470 480 490 500 510
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CCDS65 LKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANEC-----QANFISIKGPELLTMWFGESEAN
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pF1KE2 LRLLFDQAYQMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQ---IHSSIVSTLLALMDGLDSRGEIV
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CCDS65 VREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVF
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570 580 590 600 610 620
pF1KE2 VIGATNRLDSIDPALRRPGRFDREFLFSLPDKEARKEILKIHTRDWNPKPLDTFLEELAE
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CCDS65 IIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAILKANLRK-SPVAKDVDLEFLAK
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630 640 650 660 670 680
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CCDS65 MTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFE
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690 700 710 720 730 740
pF1KE2 SQRAVTSPGQALSTVVKPLLQNTVDKILEALQRVFPHAEFRTNKTLDSDISCPLLESDLA
CCDS65 EAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYT
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CCDS37 EQLTEEERLLKFSIGAKCNTDTFYFISSTTRVNFTEIDKNSKEQDNQFKVTYDMIGGLSS
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CCDS37 QLKAIREIIELPLKQPELFKSYGIPAPRGVLLYGPPGTGKTMIARAVANEVGA---YVSV
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CCDS37 I--NGPEIISKFYGETEAKLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKREGAQNEVEKRVVA
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CCDS37 SLLTLMDGIGSEVSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIGVPNAQDRLDILQK
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CCDS37 LLRRVPHLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKVLCNEAGLCALRRILKKQPNLPDVKVAGL-
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CCDS37 -VKITLKDFLQAMNDIRPSAMREIAIDVPNVSWSDI--GGLESIKLKLEQAVEWPLKHPE
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CCDS37 SFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMIAKALANESGLNFLAIKGPELMNKYVGESERAVRE
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CCDS57 VTMMQVEEKPDVTYSDVGGCKEQIEKLREVVETPLLHPERFVNLGIEPPKGVLLFGPPGT
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CCDS57 DEIDAIGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELINQLDGFDPRGNIKVLMATNRPDTLDPALMRP
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CCDS57 GRLDRKIEFSLPDLEGRTHIFKIHARSMSVER-DIRFELLARLCPNSTGAEIRSVCTEAG
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CCDS57 MFAIRARR-KIATEKDFLEAVNKVIKSYAKFSATPRYMTYN
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pF1KE2 KRSRNRAINRCLPLNFRKDELKGIYKDRMKIGASLADVDP----MQLDSSVR--FDSVGG
::. . :.:: :..... . . ..::
CCDS32 EHYVSILSFVDKDLLEPGCSVLLNHKVHAVIGVLMDDTDPLVTVMKVEKAPQETYADIGG
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:.:.: .:: : .:: .:: .:.. :.::.: ..::::::::::.:.:.::. :
CCDS32 LDNQIQEIKESVELPLTHPEYYEEMGIKPPKGVILYGPPGTGKTLLAKAVANQTS-----
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: :.: :.. ..:..:.. . .: :: : . :::.:.::::... : . .. .
CCDS32 -ATFLRVVGSELIQKYLGDGPKLVRELFRVAEEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGER
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CCDS32 EIQRTMLELLNQLDGFDSRGDVKVIMATNRIETLDPALIRPGRIDRKIEFPLPDEKTKKR
310 320 330 340 350 360
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:..::: . :. :..: :::::.::.::.: :::.: ..
CCDS32 IFQIHTSRMTLAD-DVTLDDLIMAKDDLSGADIKAICTEAGLMALRERRMKVTNEDFKKS
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pF1KE2 LDLSSINISAKDFEVAMQKMIPASQRAVTSPGQALSTVVKPLLQNTVDKILEALQRVFPH
CCDS32 KENVLYKKQEGTPEGLYL
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pF1KE2 RRRHAIHSSDSTSSSSSEDEQHFERRRKRSRNRAINRCLP---LNFRKDE--LKGIYKDR
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CCDS56 SYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNK
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pF1KE2 MKIGASLADVDPMQLDSSVRFDSVGGLSNHIAALKEMVVFPLLYPEVFEKFKIQPPRGCL
. .:: :. . ::. .. .:::...: .::.. .:. .::.:: . : :.: :
CCDS56 VDPLVSLMMVEKVP-DST--YEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVL
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pF1KE2 FYGPPGTGKTLVARALAN--ECSQGDKRVAFFMR-KGADCLSKWVGESERQLRLLFDQAY
.::::::::::.:::.:. .:. :.: .:.. ..:..::. :..: :: .:
CCDS56 LYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCT--------FIRVSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAR
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pF1KE2 QMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALM---DGLDSRGEIVVIGATNRLD
. :::::.::::... : . : . :.: :. ::... .: :: ::::.:
CCDS56 EHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMATNRID
240 250 260 270 280 290
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pF1KE2 SIDPALRRPGRFDREFLFSLPDKEARKEILKIHTRDWN-PKPLDTFLEELAENCVGYCGA
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CCDS56 ILDSALLRPGRIDRKIEFPPPNEEARLDILKIHSRKMNLTRGIN--LRKIAELMPGASGA
300 310 320 330 340
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pF1KE2 DIKSICAEAALCALRRRYPQIYTTSEKLQLDLSSINISAKDFEVAMQKMIPASQRAVTSP
..:..:.::.. :::.: ....:.: ... .... . .. .....:.
CCDS56 EVKGVCTEAGMYALRER--RVHVTQEDFEMAVAKVMQKDSEKNMSIKKLWK
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pF1KE2 GQALSTVVKPLLQNTVDKILEALQRVFPHAEFRTNKTLDSDISCPLLESDLAYSDDDVPS
>>CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 479 init1: 216 opt: 610 Z-score: 368.6 bits: 78.9 E(32554): 3.3e-14
Smith-Waterman score: 610; 36.4% identity (68.3% similar) in 319 aa overlap (380-686:101-404)
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 RRRHAIHSSDSTSSSSSEDEQHFERRRKRSRNRAINRCLP---LNFRKDE--LKGIYKDR
.: :: : . .:.: :. : ..
CCDS11 SYVGEVVRAMDKKKVLVKVHPEGKFVVDVDKNIDINDVTPNCRVALRNDSYTLHKILPNK
80 90 100 110 120 130
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pF1KE2 MKIGASLADVDPMQLDSSVRFDSVGGLSNHIAALKEMVVFPLLYPEVFEKFKIQPPRGCL
. .:: :. . ::. .. .:::...: .::.. .:. .::.:: . : :.: :
CCDS11 VDPLVSLMMVEKVP-DST--YEMIGGLDKQIKEIKEVIELPVKHPELFEALGIAQPKGVL
140 150 160 170 180
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pF1KE2 FYGPPGTGKTLVARALAN--ECSQGDKRVAFFMR-KGADCLSKWVGESERQLRLLFDQAY
.::::::::::.:::.:. .:. :.: .:.. ..:..::. :..: :: .:
CCDS11 LYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCT--------FIRVSGSELVQKFIGEGARMVRELFVMAR
190 200 210 220 230
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pF1KE2 QMRPSIIFFDEIDGLAPVRSSRQDQIHSSIVSTLLALM---DGLDSRGEIVVIGATNRLD
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CCDS11 EHAPSIIFMDEIDSIGSSRLEGGSGGDSEVQRTMLELLNQLDGFEATKNIKVIMATNRID
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