Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2371
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2371, 790 aa
1>>>pF1KE2371 790 - 790 aa - 790 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6582+/-0.000497; mu= 15.0906+/- 0.031
mean_var=128.5652+/-24.993, 0's: 0 Z-trim(112.4): 83 B-trim: 316 in 1/51
Lambda= 0.113113
statistics sampled from 21218 (21299) to 21218 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 12.500
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient r ( 790) 5208 862.3 0
NP_001245134 (OMIM: 607066,614594,616400) transien ( 791) 5196 860.3 0
NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61
NP_542436 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61
NP_061197 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61
NP_542435 (OMIM: 602076) transient receptor potent ( 839) 1383 238.1 1.2e-61
XP_011536936 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 793) 1336 230.4 2.4e-59
XP_011536937 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 695) 1307 225.6 5.7e-58
XP_006721606 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 680) 1151 200.1 2.6e-50
XP_011522224 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 719) 1151 200.2 2.7e-50
XP_006721604 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 733) 1151 200.2 2.7e-50
NP_057197 (OMIM: 606676) transient receptor potent ( 764) 1151 200.2 2.8e-50
XP_016880219 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 679) 1131 196.9 2.5e-49
XP_005256733 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 763) 1131 196.9 2.7e-49
XP_016880220 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 629) 1038 181.7 8.6e-45
XP_005256735 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 548) 1036 181.3 9.7e-45
XP_011522225 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 531) 1031 180.5 1.7e-44
XP_016880221 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 585) 1031 180.5 1.8e-44
XP_005256734 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 630) 1031 180.5 1.9e-44
XP_011536938 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 603) 1020 178.7 6.4e-44
NP_062815 (OMIM: 606679) transient receptor potent ( 729) 665 120.9 2e-26
NP_001170904 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 764) 520 97.2 2.8e-19
NP_671737 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 811) 520 97.2 2.9e-19
XP_011536935 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 815) 520 97.2 2.9e-19
NP_001170899 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 824) 520 97.2 3e-19
NP_001170902 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 837) 520 97.3 3e-19
XP_011536934 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 862) 520 97.3 3.1e-19
NP_067638 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18409 ( 871) 520 97.3 3.1e-19
XP_016875263 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 520 97.3 3.1e-19
XP_005253975 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 871) 520 97.3 3.1e-19
XP_011536933 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 875) 520 97.3 3.1e-19
XP_011536932 (OMIM: 113500,156530,168400,181405,18 ( 922) 520 97.3 3.2e-19
XP_011522227 (OMIM: 606676) PREDICTED: transient r ( 334) 354 69.8 2.1e-11
NP_061116 (OMIM: 606680) transient receptor potent ( 765) 246 52.5 8.1e-06
NP_001245377 (OMIM: 604669) polycystic kidney dise ( 602) 185 42.5 0.0067
>>NP_659505 (OMIM: 607066,614594,616400) transient recep (790 aa)
initn: 5208 init1: 5208 opt: 5208 Z-score: 4601.5 bits: 862.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5208; 100.0% identity (100.0% similar) in 790 aa overlap (1-790:1-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_659 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTDFNKIQDSSRNNSKTTLNAFE
730 740 750 760 770 780
790
pF1KE2 EVEEFPETSV
::::::::::
NP_659 EVEEFPETSV
790
>>NP_001245134 (OMIM: 607066,614594,616400) transient re (791 aa)
initn: 5014 init1: 5014 opt: 5196 Z-score: 4590.9 bits: 860.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5196; 99.9% identity (99.9% similar) in 791 aa overlap (1-790:1-791)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKAHPKEMVPLMGKRVAAPSGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNPTVAKTS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRRKKRRLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMKALLNIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALLIAAGAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHEQTDITSRDSRGNNIL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNWELETTRNNDGLTPLQLAAKMGKAEILKYI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITVYNTNIDNRHEML
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEEAIPHPLALTHKMG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFFIQAVLVILSVFLY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDVLKFLFVYIVFLLG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGVALASLIEKCPKDNKDCSSYGSFSDAVLELFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLIT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERIWRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGEL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KE2 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRT-DFNKIQDSSRNNSKTTLNAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 CKVAEDDFRLCLRINEVKWTEWKTHVSFLNEDPGPVRRTADFNKIQDSSRNNSKTTLNAF
730 740 750 760 770 780
780 790
pF1KE2 EEVEEFPETSV
:::::::::::
NP_001 EEVEEFPETSV
790
>>NP_542437 (OMIM: 602076) transient receptor potential (839 aa)
initn: 1685 init1: 394 opt: 1383 Z-score: 1227.7 bits: 238.1 E(85289): 1.2e-61
Smith-Waterman score: 1842; 41.3% identity (69.8% similar) in 782 aa overlap (10-759:15-773)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MKAHPKEMVPLMGKRVAAP-SGNPAILPEKRPAEITPTKKSAHFFLEIEGFEPNP
::. : .:.: : ... .:. ...: . .. : :
NP_542 MKKWSSTDLGAAADPLQKDTCPDPLDGDPNSRPPPAKPQLSTAKSRTRLFGKGDSEEAFP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 TVAKTSPPVFSKPMDSNIRQCISGNCDDMDSPQSPQDDVTETPSNPNSPSAQLAKEEQRR
. . : .:: : . . . . . : : : : . .. : ... :
NP_542 V----DCPHEEGELDS----CPTITVSPVITIQRPGDGPTGARLLSQDSVAASTEKTLRL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 KKRRLKKRIFAAVSEGCVEELVELLVELQELCRRRHDEDVPDFLMHKLTASDTGKTCLMK
:: :: ::... ..: ::. ::. ..: : ... .::::::.:
NP_542 YDRR---SIFEAVAQNNCQDLESLLLFLQK--SKKHLTD------NEFKDPETGKTCLLK
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ALLNINPNTKEIVRILLAFAEENDILGRFINAEYTEEAYEGQTALNIAIERRQGDIAALL
:.::.. . . . .:: .:...: : ...:: ::. :.:::::.::::::. ...::
NP_542 AMLNLHDGQNTTIPLLLEIARQTDSLKELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 IAAGADVNAHAKGAFFNPKYQHEGFYFGETPLALAACTNQPEIVQLLMEHE-QT-DITSR
. ::::.: :.: ::. . :::::: ::.::::::: ::..:... :: ::..:
NP_542 VENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPGFYFGELPLSLAACTNQLGIVKFLLQNSWQTADISAR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KE2 DSRGNNILHALVTVAEDFKTQNDFVKRMYDMILLRSGNW----ELETTRNNDGLTPLQLA
:: ::..::::: ::.. .. :: ::. ::. ... .:: :. :.::: ::
NP_542 DSVGNTVLHALVEVADNTADNTKFVTSMYNEILMLGAKLHPTLKLEELTNKKGMTPLALA
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 AKMGKAEILKYILSREIKEKRLRSLSRKFTDWAYGPVSSSLYDLTNVDTTTDNSVLEITV
: :: .: :::.:::.: . : ::::::.:::::: ::::::. .:: :::::. .
NP_542 AGTGKIGVLAYILQREIQEPECRHLSRKFTEWAYGPVHSSLYDLSCIDTCEKNSVLEVIA
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 YNTN-IDNRHEMLTLEPLHTLLHMKWKKFAKHMFFLSFCFYFFYNITLTLVSYYRPREEE
:... :::.:: .:::. ::. :: .:.:..:...: : .: : .:...:::: .
NP_542 YSSSETPNRHDMLLVEPLNRLLQDKWDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVD--
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 AIPHPLALTHKMGWLQLLGRMFVLIWAMCISVKEGIAIFLLRPSDLQSILSDAWFHFVFF
..: :. . . .... :... .. .. . . :: :: : ...... :.. ...::
NP_542 GLP-PFKMEKTGDYFRVTGEILSVLGGVYFFFR-GIQYFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFF
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 IQAVLVILSVFLYLFAYKEYLACLVLAMALGWANMLYYTRGFQSMGMYSVMIQKVILHDV
.:..... .: ::. :::.: .:...::::.::::::::::.::.:.:::.:.::.:.
NP_542 LQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFSLALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDL
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630
pF1KE2 LKFLFVYIVFLLGFGVALASLIEKCPKDN------------KDC----SSYGSFSDAVLE
.:.:::::::.::..:...::: .:. : :::.:. .. ::
NP_542 CRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLE
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LFKLTIGLGDLNIQQNSKYPILFLFLLITYVILTFVLLLNMLIALMGETVENVSKESERI
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pF1KE2 WRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVA-----EDDFRLCLRINEVKWTEWKTHV
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NP_542 CRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKNDSLPSESTSHRWRGPACRPPDSSYNSLYSTCLE
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pF1KE2 WRLQRARTILEFEKMLPEWLRSRFRMGELCKVA-----EDDFRLCLRINEVKWTEWKTHV
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NP_542 WKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFRSGKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNV
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NP_542 GIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQ
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.::.. :::::.::..::: :: :...:. ::. .. : ::::: ::::::: :::::
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790 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 19:40:23 2016 done: Sun Nov 6 19:40:25 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]