Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2330
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2330, 1386 aa
1>>>pF1KE2330 1386 - 1386 aa - 1386 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8180+/-0.00133; mu= 13.4646+/- 0.080
mean_var=224.3043+/-44.770, 0's: 0 Z-trim(107.4): 66 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.085636
statistics sampled from 9526 (9563) to 9526 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 5.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 9127 1142.4 0
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 866 121.8 1.4e-26
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 771 110.1 4.5e-23
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 753 107.7 1.7e-22
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 753 107.7 1.7e-22
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 754 107.9 1.7e-22
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 732 105.2 1.2e-21
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 659 96.2 6e-19
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 636 93.3 4e-18
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 629 92.4 7.7e-18
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382) 625 92.0 1.2e-17
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 610 90.1 4e-17
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 610 90.1 4.1e-17
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 603 89.1 5.6e-17
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 560 83.7 2e-15
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 545 82.1 1.1e-14
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 535 80.6 1.7e-14
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 535 80.6 1.7e-14
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 489 74.9 8.9e-13
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 489 75.0 9.6e-13
>>CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386 aa)
initn: 9127 init1: 9127 opt: 9127 Z-score: 6106.9 bits: 1142.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9127; 99.9% identity (99.9% similar) in 1386 aa overlap (1-1386:1-1386)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSSSVRRKGKPGKGGGKGSSRGGRGGRSHASKSHGSGGGGGGGGGGGGGNRKASSRIWDD
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CCDS18 MSSSVRRKGKPGKGGGKGSSRGGRGGRSHASKSHGSGGGGGGGGGGGGGNRKASSRIWDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GDDFCIFSESRRPSRPSNSNISKGESRPKWKPKAKVPLQTLHMTSENQEKVKALLRDLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GDDFCIFSESRRPSRPSNSNISKGESRPKWKPKAKVPLQTLHMTSENQEKVKALLRDLQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 QDADAGSERGLSGEEEDDEPDCCNDERYWPAGQEPSLVPDLDPLEYAGLASVEPYVPEFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QDADAGSERGLSGEEEDDEPDCCNDERYWPAGQEPSLVPDLDPLEYAGLASVEPYVPEFT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VSPFAVQKLSRYGFNTERCQAVLRMCDGDVGASLEHLLTQCFSETFGERMKISEAVNQIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VSPFAVQKLSRYGFNTERCQAVLRMCDGDVGASLEHLLTQCFSETFGERMKISEAVNQIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LDECMEQRQEEAFALKSICGEKFIERIQNRVWTIGLELEYLTSRFRKSKPKESTKNVQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LDECMEQRQEEAFALKSICGEKFIERIQNRVWTIGLELEYLTSRFRKSKPKESTKNVQEN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SLEICKFYLKGNCKFGSKCRFKHEVPPNQIVGRIERSVDDSHLNAIEDASFLYELEIRFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 SLEICKFYLKGNCKFGSKCRFKHEVPPNQIVGRIERSVDDSHLNAIEDASFLYELEIRFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KDHKYPYQAPLVAFYSTNENLPLACRLHISEFLYDKALTFAETSEPVVYSLITLLEEESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KDHKYPYQAPLVAFYSTNENLPLACRLHISEFLYDKALTFAETSEPVVYSLITLLEEESE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 IVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQIPEVEKASESEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQIPEVEKASESEES
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFRMKQASRQFQSILQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 DEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFRMKQASRQFQSILQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSLSGPPEKVANIICTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS18 RQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSLNGPPEKVANIICTQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 PRRISAISVAERVAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQ
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CCDS18 PRRISAISVAERVAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNAELFSDYFNSCPVITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNAELFSDYFNSCPVITI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 PGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 PGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 LHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFEKVNLELIEALLEWIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFEKVNLELIEALLEWIVD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 GKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCVIHPLHSSLSSEEQQAVFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 GKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCVIHPLHSSLSSEEQQAVFV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 KPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGMESLEDTFVSQANALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 KPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGMESLEDTFVSQANALQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 RKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 FSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 FSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 ASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAREIEKRAQGGDGVLDATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAREIEKRAQGGDGVLDATG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 EEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAVRMQPKSAELKFVTKNDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAVRMQPKSAELKFVTKNDG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 YVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRDCSMVSVYPLVLFGGGQVNVQLQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 YVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRDCSMVSVYPLVLFGGGQVNVQLQRG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 EFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIKNPSIDLCMCPRGSRIISTIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS18 EFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIKNPSIDLCTCPRGSRIISTIV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 KLVTTQ
::::::
CCDS18 KLVTTQ
>>CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430 aa)
initn: 1239 init1: 434 opt: 866 Z-score: 590.9 bits: 121.8 E(32554): 1.4e-26
Smith-Waterman score: 1495; 35.1% identity (60.0% similar) in 929 aa overlap (524-1310:176-1065)
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 ESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETI
:. .:.. .:.:. :::::..:..: :
CCDS41 PKTERGNVFAVEAENREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSF---RQSLPVFEKQEEI
150 160 170 180 190 200
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 LNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSL-SGPPEKVANIICTQPRRISAISVAER
........::.: : :: :::::::::.::: . .: : . :.::::::..::.::::
CCDS41 VKIIKENKVVLIVGETGSGKTTQIPQFLLDDCFKNGIPCR---IFCTQPRRLAAIAVAER
210 220 230 240 250
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pF1KE2 VAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRL-EGDTALQGVSHIIVDEVH
:: :: ::.: :.:::::::: : : : .::.::::: : ::..:. :.:.::::::
CCDS41 VAAERRERIGQTIGYQIRLESRVSPKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVH
260 270 280 290 300 310
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pF1KE2 ERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNAELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFF
:: . ::::: :.:.....: :..:: ::.:...:: ::.::::: : :: : : ..:
CCDS41 ERDRFSDFLLTKLRDLLQKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMF
320 330 340 350 360 370
740 750 760 770
pF1KE2 LEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKE---------------KLKARRNRTAFEEVEE-
::: . .: :. .. : . .: :. : ...:.::... ..:
CCDS41 LEDILRTTGYTNKEMLKYKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEY
380 390 400 410 420 430
780 790
pF1KE2 ------------------------------DLRLS---LHLQDQDSVKDA-----VPDQQ
: :: :: .: :. .. . . .
CCDS41 DLLDDGGDAVFSQLTEKDVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLH-KDIDAFAQVFHLILTENVS
440 450 460 470 480 490
800 810 820
pF1KE2 LDFKQ--------LLARYKGVSKSVIKTMS--------------------------IMDF
.:... ..: .: ...: . .: :.:.
CCDS41 VDYRHSETSATALMVAAGRGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDL
500 510 520 530 540 550
830 840
pF1KE2 -------------------------------------------EKVNLELIEALLEWIVD
:::.:.:: :: :
CCDS41 LESYSATLEFGNLDESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNIC-
560 570 580 590 600 610
850 860 870 880 890
pF1KE2 GKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRR----SNRCVIHPLHSSLSSEEQQ
:: ::.:.:::: :: : ... ::...: ..: . :::.... .:.
CCDS41 --HSCDAGAVLIFLPGYDEIVGLRDRI----LFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQK
620 630 640 650 660 670
900 910 920 930 940 950
pF1KE2 AVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDASKGMESLEDTFVSQA
:. .::::: :::.::::::::::..:::.::::::.::: .:: . . :. ...:.:
CCDS41 KVLKNPPAGVRKIILSTNIAETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKA
680 690 700 710 720 730
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE2 NALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHN
.:.:::::::: :.::.::. .. ...:. : ::. :.::..:::. :.: .
CCDS41 SAIQRKGRAGRCRPGICFRLFSRLRF-QNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCP-
740 750 760 770 780
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE2 LQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDERLTPLGYHLASLPVDVRIGKLMLFGS
. . . . ::: . .: . :. . :. : :: ::::::.:::. ..::..: .
CCDS41 IADFLMKAPEPPPALIVRNAVQMLKTIDAMDTWEDLTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAV
790 800 810 820 830 840
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 IFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWD--KKEEANQKKLEF-AFANSDYLALLQAYKGWQL
...:::: :::: .::...::: : . .:. : . .: : : ::..:::.:...::
CCDS41 VLKCLDPILTIACTLAYRDPFVLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQK
850 860 870 880 890 900
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE2 STKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAREIEKRAQGGD
. ..: . .. :..:::: ... . ... :. : ::.: :.::
CCDS41 ARSDGWERAF--CEKNFLSQATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVR-----------ARGGG
910 920 930 940 950
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE2 GVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAVRMQPKSAELK
. :. :.:.:: ...: : :..:::.:.: . . . ::..: :
CCDS41 DIRDV-----NTNSENWAVVKAALVAGMYPNLVHVDRENLVLTGPKEKKVRFHPAS----
960 970 980 990 1000
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE2 FVTKNDGYVHIHPSSVNYQ-VRHFDSPYLLYHEKIKTSRVF-IRDCSMVSVYPLVLFGGG
: .. : .: :.. . .. . . .:.: : .. :. :: :: :. ...: :
CCDS41 -VLSQPQYKKIPPANGQAAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGP
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE2 QVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIKNPSIDLCMCPR
CCDS41 ARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTANLAALKLDEWLHFTLEPEAASLLLQL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
>>CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369 aa)
initn: 1763 init1: 477 opt: 771 Z-score: 527.7 bits: 110.1 E(32554): 4.5e-23
Smith-Waterman score: 1978; 37.9% identity (68.2% similar) in 956 aa overlap (445-1386:476-1367)
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LEEESEIVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQIPEVEKA
: ..:. .: : . :... . ....
CCDS34 YRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNK---PRDLFIAKLLNKLKQQ
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGK----ICKQFRMKQA
...... .. .::. :: .: . :..: :... : . . . :: :.
CCDS34 QQQQQQHSENKRENSEDPEESWENL---VSDE-DFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQS
510 520 530 540 550
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 SRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSLSGPP
. ..:..:.:::.::....:..:.. :..:.:::..: :: ::.::.:.:.:.: : .
CCDS34 TPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEW
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640
pF1KE2 EKVA-NIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVG-----LTVGYQIRLESVKSSATRLLYC
: ::.:::::::::.:.:.:: : . . : :::::.:: .::::::
CCDS34 EASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYC
620 630 640 650 660 670
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 TTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLN
:::::::.:. : :..:::.::::::::. .:::::..::.:...: :..::::::..
CCDS34 TTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVD
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CCDS34 SEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLE---------
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pF1KE2 RNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFE
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CCDS34 ------EEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPH
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CCDS34 VIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHES
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CCDS34 SQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEG-FMDYSVPEILRVPLEEL
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pF1KE2 CLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDE-RLTPLGYHLAS
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CCDS34 CLHIMKCNLGSPEDF---LSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAA
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CCDS34 LPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDH
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pF1KE2 LALLQAYKGWQLSTKEG-VRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGL
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CCDS34 LTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTT
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pF1KE2 RAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTST
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CCDS34 STSWEGNRAS------------QTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNV-------GKIIYTKS
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CCDS34 --VDVTEKLACI--VETAQGKAQVHPSSVNRDLQTHG--WLLYQEKIRYARVYLRETTLI
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pF1KE2 SVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIK
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CCDS34 TPFPVLLFGG---DIEVQHRERLLSID-GWIYF-QAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLE
1300 1310 1320 1330 1340
1370 1380
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CCDS34 NPKMSL----ENDKILQIITELIKTENN
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CCDS54 QEKIESPHPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
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pF1KE2 ICKQFRMKQASRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQF
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CCDS31 LLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQF
190 200 210 220 230 240
590 600 610 620 630
pF1KE2 ILDDSLSGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGL--TVGYQIRLES-VKSS
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CCDS31 ILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRLQSRLPRK
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CCDS31 QGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVI
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CCDS31 LMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYV-----PEQKEHRSQF
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pF1KE2 SKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIK
.. .... :: :: : ... :. :: ..: :: : :..
CCDS31 KRGFMQGHVNRQEKEEKE-----AIY-------KERWPDY---VRELRRRY---SASTVD
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CCDS31 VIEMMEDDKVDLNLIVALIRYIVLEEED---GAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMF---
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CCDS31 THFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRAS-LLDDYQLPEILR
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CCDS31 TPLEELCLQIKILRL---GGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLG
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CCDS31 VHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRKELAK
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pF1KE2 -ANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGF
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CCDS31 DTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGF
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pF1KE2 AREGLRAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKF
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CCDS31 ---------VSSR--------NPKDPESNINSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKK
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pF1KE2 QKTSTGAVRMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIR
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CCDS31 RKM-------------VKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLY
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pF1KE2 DCSMVSVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLL
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CCDS31 DCTEVSPYCLLFFGG-DISIQKDNDQETIAVDE-WIVFQSPA-RIAHLVKELRKELDILL
910 920 930 940 950
1360 1370 1380
pF1KE2 QDKIKNPS-IDLC-MCPRGSRIISTIVKLVTTQ
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CCDS31 QEKIESPHPVDWNDTKSRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS
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CCDS92 PPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIMEAVAEHPIVIVCGE
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CCDS92 TGSGKTTQVPQFLYEAGFSSE-DSIIGV--TEPRRVAAVAMSQRVAKEMNLSQRV---VS
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CCDS92 YQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLRYKVVIIDEAHERSVYTDILIGLLSR
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::. : :....::::: .: :.. . . ::: . .: ::: : ::
CCDS92 IVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQNPRLFAKPPPVIKVESRQFPVTVHFNKRTPLE
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CCDS92 DYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQAEVHAL-CRRLRKAFPPS----RARPQEKDD
460 470 480 490 500
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CCDS92 DQ-KDSVEEMR-KFKKSRARAKKARAEVLP--------QINLDHYSVLPA----GEGDED
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CCDS92 REAEVDEEEGALDSDLDLDLGDGGQDGGEQPDASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPPE
560 570 580 590 600 610
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CCDS92 GTRLCVVATNVAETSLTIPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAGR
620 630 640 650 660 670
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pF1KE2 AGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQLCLRIKILEMFSAHNLQSVFSRL
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CCDS92 AGRTEPGHCYRLYSSAVFG-DFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINFP-----F
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1030 1040 1050 1060
pF1KE2 IEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDER---------------LTPLGYHLASLPVDVRIG
:: ...: :.. : :::: : .. .: :: .:..:: : .
CCDS92 PTPPSVEALLAAEELLIALGALQPPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYA
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pF1KE2 KLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDYLALLQAYK
:.. .. :: :.::.::.. . : :. ... :.. .: . : .
CCDS92 KMLALSRQHGCLPYAITIVASMTVRELF-EELDRPAASDE---ELTRLKSKRARVAQMKR
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pF1KE2 GWQLSTKEGVRASYNYCRQNFLSGRVLQ-EMASLKRQFTELLSDIGFAREGLRAR---EI
: : :: . : : : :.:: :: : .::: . ::
CCDS92 TWA-----GQGASLKLGDLMVLLGAVGACEYASCTPQFCEA--------NGLRYKAMMEI
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pF1KE2 EK-RAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTSTGAVR
.. :.: .: .:. ::. .. ::. . : . : . : . . .
CCDS92 RRLRGQLTTAV-NAVCPEAELFVD-PKMQPPTESQVTYLRQI-VTAGLGDHLARRVQSEE
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: . . . : : : :::::: .. . : ...:.: ..:...... : : :
CCDS92 MLEDKWRNAYKTPLLDDPVFIHPSSVLFK----ELPEFVVYQEIVETTKMYMKGVSSVEV
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CCDS92 QWIPALLPSYCQFDKPLEEPAPTYCPERGRVLCHRASVFYRVGWPLPAIEVDFPEGIDRY
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:.. . : .. ... . . . :: . : :: :.. : . .:. :
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: . . :. :.:: . .. ..::... ...
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..: ....:.:::::. ::. . . ::. . ...::.: : ::::::::.::::::: .
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.. ::. ::::::::.::::::: ::.:. : . ::..:.::. . ...::
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.:::::.:: ....:.::.::::.::: ..::::.::.:.:. : ....:::::...
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.: .:: .::.: . :::.::...:::: : .:..: : :.: : .
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. . : ..: .: :. . :. .: .:: .. ..
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. .:::::::..: . :::.:::::: : . ..:. : :. :.: : :
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:::.. :::. :: :.::::.:.:::::::::::.:::::::: :.: : . : ..:
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. ...:..: ::::::::: : :::: . ... .: .. ::. :.::... :
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::.:.. .. . ... :::: :.. .. ::.: :: ...::::: ::.::..
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:.....:. . : .: .:... :. .:. : :. :.: . :: .. : ..
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:. :: . : . .. ..: ..:::: ..: . .
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. ..: :: :::: : .. ::.... :::.: . . ..:
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. :.::.. .:. . : .: .:: ::.. ::..: . :: .. :. . :
CCDS41 TPLQLLLFASKKVQSDGQ----IVLVDD-WIKL-QISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTK
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.:.: . : . :... : ..
CCDS41 QPAIISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRG
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CCDS27 THAMYNLAS-----LRELGETQRR---PCTIQVPEPILRKIETFLNHYPV--ESSWIA--
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CCDS27 -PELRLQSDDILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPL--------------LEAEEVRLSQS--
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. :.: ::::::::.:::.::..: . . .::.:.:::: : . ::.::
CCDS27 TEGRGARCNVIITQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCT
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.:.:::.:... .:.::::.:::::::: ..::::..:: . :.:...::::: .
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CCDS27 ERFSRYFGGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILA----------------KLGKHQYLHRHR
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CCDS27 HHESEDECALDL---------DLVTDLV--LHID-----AR-------------------
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:: . .. .:. .. :. .. . : :...:.: : :: :: .:: . .:
CCDS27 AKI--HMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTD
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CCDS27 PRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAF
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..: ::. . :.: :: ..:.: . :. . .: .::.: . . ..
CCDS27 VRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLV-------
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.. .: .: .. . : .:. .:....: :.::::..::. .:: : :
CCDS27 -----GKPSDCTLASA--QCNEYSEEEELVKGVLMAGLYPNLIQVR--QGKV--TRQG--
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CCDS27 KFKPNSVTYR--TKS-GNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHP
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CCDS27 LAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTVRLLKELRRALGRMVERSLRSE
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pF1KE2 SIDLCMCPRGSRIISTIVKLVTTQ
CCDS27 LAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD
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CCDS46 VLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANH
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::..: : :: ::::::::...... .. :.: ::::::..:.::: :::.: . .
CCDS46 QVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIA---CTQPRRVAAMSVAARVAREMGVK
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pF1KE2 VGLTVGYQIRLESVKSSATRLLYCTTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFL
.: :::.::.:. : : : : : :.:::.. .. : . : ..:::.:::: ..:.:
CCDS46 LGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDIL
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pF1KE2 LLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLNAELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTR
. ..::.. :: :.:.. :::... :: .:.. ::. :::: :::: :. .
CCDS46 FGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTK-------
540 550 560 570 580
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pF1KE2 YVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKARRNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDF
.: : :
CCDS46 ------AP-------------------------EADY-----------------------
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pF1KE2 KQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFEKVNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEI
.:: . ... . . ::: ::::: : ::
CCDS46 ------------------------------LEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEI
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. :.::. . . . .. :....: :. : .: : :. :....:::::::.
CCDS46 EAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSL
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::. ..::.: : :.: :. ::::: : :.:.: :: :::::::.: ::.:.:.
CCDS46 TIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAW
690 700 710 720 730 740
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CCDS46 AYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSL---GIHDLMH-FD-FLDPPPYETLLLALEQL
750 760 770 780 790
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