Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2303
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2303, 2210 aa
1>>>pF1KE2303 2210 - 2210 aa - 2210 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2274+/-0.00106; mu= 3.7301+/- 0.064
mean_var=260.7362+/-54.176, 0's: 0 Z-trim(111.8): 11 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.079428
statistics sampled from 12683 (12689) to 12683 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.698), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 5.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9177.1 MED13L gene_id:23389|Hs108|chr12 (2210) 15155 1751.6 0
CCDS42366.1 MED13 gene_id:9969|Hs108|chr17 (2174) 4157 491.3 2e-137
>>CCDS9177.1 MED13L gene_id:23389|Hs108|chr12 (2210 aa)
initn: 15155 init1: 15155 opt: 15155 Z-score: 9391.7 bits: 1751.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 15155; 100.0% identity (100.0% similar) in 2210 aa overlap (1-2210:1-2210)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAANWVANGASLEDCHSNLFSLAELTGIKWRRYNFGGHGDCGPIISAPAQDDPILLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MTAAANWVANGASLEDCHSNLFSLAELTGIKWRRYNFGGHGDCGPIISAPAQDDPILLSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IRCLQANLLCVWRRDVKPDCKELWIFWWGDEPNLVGVIHHELQVVEEGLWENGLSYECRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 IRCLQANLLCVWRRDVKPDCKELWIFWWGDEPNLVGVIHHELQVVEEGLWENGLSYECRT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLFKAIHNLLERCLMDKNFVRIGKWFVRPYEKDEKPVNKSEHLSCAFTFFLHGESNVCTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LLFKAIHNLLERCLMDKNFVRIGKWFVRPYEKDEKPVNKSEHLSCAFTFFLHGESNVCTS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VEIAQHQPIYLINEEHIHMAQSSPAPFQVLVSPYGLNGTLTGQAYKMSDPATRKLIEEWQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VEIAQHQPIYLINEEHIHMAQSSPAPFQVLVSPYGLNGTLTGQAYKMSDPATRKLIEEWQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YFYPMVLKKKEESKEEDELGYDDDFPVAVEVIVGGVRMVYPSAFVLISQNDIPVPQSVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 YFYPMVLKKKEESKEEDELGYDDDFPVAVEVIVGGVRMVYPSAFVLISQNDIPVPQSVAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AGGHIAVGQQGLGSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQAILGESGGMQSAASHLVSQDGGMITMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 AGGHIAVGQQGLGSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQAILGESGGMQSAASHLVSQDGGMITMH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKRSQMSTPTLEEEPASNPATWDFVDPTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKRSQMSTPTLEEEPASNPATWDFVDPTQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VSCSCSRHKLLKRCAVGPNRPPTVSQPGFSAGPSSSSSLPPPASSKHKTAERQEKGDKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VSCSCSRHKLLKRCAVGPNRPPTVSQPGFSAGPSSSSSLPPPASSKHKTAERQEKGDKLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 KRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAVPSRNTSKQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAVPSRNTSKQM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDPPSVPVNPALYGNGLELQQLSTLDDRTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 NLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDPPSVPVNPALYGNGLELQQLSTLDDRTV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LVGQRLPLMAEVSETALYCGIRPSNPESSEKWWHSYRLPPSDDAEFRPPELQGERCDAKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LVGQRLPLMAEVSETALYCGIRPSNPESSEKWWHSYRLPPSDDAEFRPPELQGERCDAKM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EVNSESTALQRLLAQPNKRFKIWQDKQPQLQPLHFLDPLPLSQQPGDSLGEVNDPYTFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 EVNSESTALQRLLAQPNKRFKIWQDKQPQLQPLHFLDPLPLSQQPGDSLGEVNDPYTFED
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 GDIKYIFTANKKCKQGTEKDSLKKNKSEDGFGTKDVTTPGHSTPVPDGKNAMSIFSSATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 GDIKYIFTANKKCKQGTEKDSLKKNKSEDGFGTKDVTTPGHSTPVPDGKNAMSIFSSATK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 TDVRQDNAAGRAGSSSLTQVTDLAPSLHDLDNIFDNSDDDELGAVSPALRSSKMPAVGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TDVRQDNAAGRAGSSSLTQVTDLAPSLHDLDNIFDNSDDDELGAVSPALRSSKMPAVGTE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 DRPLGKDGRAAVPYPPTVADLQRMFPTPPSLEQHPAFSPVMNYKDGISSETVTALGMMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 DRPLGKDGRAAVPYPPTVADLQRMFPTPPSLEQHPAFSPVMNYKDGISSETVTALGMMES
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 PMVSMVSTQLTEFKMEVEDGLGSPKPEEIKDFSYVHKVPSFQPFVGSSMFAPLKMLPSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PMVSMVSTQLTEFKMEVEDGLGSPKPEEIKDFSYVHKVPSFQPFVGSSMFAPLKMLPSHC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 LLPLKIPDACLFRPSWAIPPKIEQLPMPPAATFIRDGYNNVPSVGSLADPDYLNTPQMNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LLPLKIPDACLFRPSWAIPPKIEQLPMPPAATFIRDGYNNVPSVGSLADPDYLNTPQMNT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PVTLNSAAPASNSGAGVLPSPATPRFSVPTPRTPRTPRTPRGGGTASGQGSVKYDSTDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PVTLNSAAPASNSGAGVLPSPATPRFSVPTPRTPRTPRTPRGGGTASGQGSVKYDSTDQG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 SPASTPSTTRPLNSVEPATMQPIPEAHSLYVTLILSDSVMNIFKDRNFDSCCICACNMNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 SPASTPSTTRPLNSVEPATMQPIPEAHSLYVTLILSDSVMNIFKDRNFDSCCICACNMNI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 KGADVGLYIPDSSNEDQYRCTCGFSAIMNRKLGYNSGLFLEDELDIFGKNSDIGQAAERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KGADVGLYIPDSSNEDQYRCTCGFSAIMNRKLGYNSGLFLEDELDIFGKNSDIGQAAERR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 LMMCQSTFLPQVEGTKKPQEPPISLLLLLQNQHTQPFASLNFLDYISSNNRQTLPCVSWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LMMCQSTFLPQVEGTKKPQEPPISLLLLLQNQHTQPFASLNFLDYISSNNRQTLPCVSWS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 YDRVQADNNDYWTECFNALEQGRQYVDNPTGGKVDEALVRSATVHSWPHSNVLDISMLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 YDRVQADNNDYWTECFNALEQGRQYVDNPTGGKVDEALVRSATVHSWPHSNVLDISMLSS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 QDVVRMLLSLQPFLQDAIQKKRTGRTWENIQHVQGPLTWQQFHKMAGRGTYGSEESPEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 QDVVRMLLSLQPFLQDAIQKKRTGRTWENIQHVQGPLTWQQFHKMAGRGTYGSEESPEPL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 PIPTLLVGYDKDFLTISPFSLPFWERLLLDPYGGHRDVAYIVVCPENEALLEGAKTFFRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PIPTLLVGYDKDFLTISPFSLPFWERLLLDPYGGHRDVAYIVVCPENEALLEGAKTFFRD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 LSAVYEMCRLGQHKPICKVLRDGIMRVGKTVAQKLTDELVSEWFNQPWSGEENDNHSRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LSAVYEMCRLGQHKPICKVLRDGIMRVGKTVAQKLTDELVSEWFNQPWSGEENDNHSRLK
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 LYAQVCRHHLAPYLATLQLDSSLLIPPKYQTPPAAAQGQATPGNAGPLAPNGSAAPPAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LYAQVCRHHLAPYLATLQLDSSLLIPPKYQTPPAAAQGQATPGNAGPLAPNGSAAPPAGS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 AFNPTSNSSSTNPAASSSASGSSVPPVSSSASAPGISQISTTSSSGFSGSVGGQNPSTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 AFNPTSNSSSTNPAASSSASGSSVPPVSSSASAPGISQISTTSSSGFSGSVGGQNPSTGG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 ISADRTQGNIGCGGDTDPGQSSSQPSQDGQESVTERERIGIPTEPDSADSHAHPPAVVIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ISADRTQGNIGCGGDTDPGQSSSQPSQDGQESVTERERIGIPTEPDSADSHAHPPAVVIY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 MVDPFTYAAEEDSTSGNFWLLSLMRCYTEMLDNLPEHMRNSFILQIVPCQYMLQTMKDEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MVDPFTYAAEEDSTSGNFWLLSLMRCYTEMLDNLPEHMRNSFILQIVPCQYMLQTMKDEQ
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 VFYIQYLKSMAFSVYCQCRRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPSPIQLYSPPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VFYIQYLKSMAFSVYCQCRRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPSPIQLYSPPF
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 ILAPIKDKQTELGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLETCVVNIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ILAPIKDKQTELGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLETCVVNIAL
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 PNRSRRSKVSARKIGLQKLWEWCIGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDWSILLGECS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PNRSRRSKVSARKIGLQKLWEWCIGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDWSILLGECS
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 LQTISKKLKDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSVFGRSTALNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LQTISKKLKDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSVFGRSTALNM
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 QSSQLNTPQDASCTHILVFPTSSTIQVAPANYPNEDGFSPNNDDMFVDLPFPDDMDNDIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 QSSQLNTPQDASCTHILVFPTSSTIQVAPANYPNEDGFSPNNDDMFVDLPFPDDMDNDIG
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE2 ILMTGNLHSSPNSSPVPSPGSPSGIGVGSHFQHSRSQGERLLSREAPEELKQQPLALGYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ILMTGNLHSSPNSSPVPSPGSPSGIGVGSHFQHSRSQGERLLSREAPEELKQQPLALGYF
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE2 VSTAKAENLPQWFWSSCPQAQNQCPLFLKASLHHHISVAQTDELLPARNSQRVPHPLDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VSTAKAENLPQWFWSSCPQAQNQCPLFLKASLHHHISVAQTDELLPARNSQRVPHPLDSK
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210
pF1KE2 TTSDVLRFVLEQYNALSWLTCNPATQDRTSCLPVHFVVLTQLYNAIMNIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TTSDVLRFVLEQYNALSWLTCNPATQDRTSCLPVHFVVLTQLYNAIMNIL
2170 2180 2190 2200 2210
>>CCDS42366.1 MED13 gene_id:9969|Hs108|chr17 (2174 aa)
initn: 5428 init1: 1745 opt: 4157 Z-score: 2580.8 bits: 491.3 E(32554): 2e-137
Smith-Waterman score: 7488; 53.4% identity (75.4% similar) in 2272 aa overlap (4-2210:2-2174)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MTAAANWVANGASLEDCHSNLFSLAELTGIKWRRYNFGGHGDCGPIISAPAQDDPILLSF
.:..: ::::::::: ::: ::.::::::..: . : .::. ...:::: ::
CCDS42 MSASFVPNGASLEDCHCNLFCLADLTGIKWKKYVWQGP-TSAPILFPVTEEDPILSSF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IRCLQANLLCVWRRDVKPDCKELWIFWWGDEPNLVGVIHHELQVVEEGLWENGLSYECRT
:::.:..: ::::: .: .::::::::..:... .:::.:. :.:.:::::::::::
CCDS42 SRCLKADVLGVWRRDQRPGRRELWIFWWGEDPSFADLIHHDLSEEEDGVWENGLSYECRT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LLFKAIHNLLERCLMDKNFVRIGKWFVRPYEKDEKPVNKSEHLSCAFTFFLHGESNVCTS
:::::.:::::::::..::::::::::.::::::::.::::::::.:::::::.::::::
CCDS42 LLFKAVHNLLERCLMNRNFVRIGKWFVKPYEKDEKPINKSEHLSCSFTFFLHGDSNVCTS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VEIAQHQPIYLINEEHIHMAQSSPAPFQVLVSPYGLNGTLTGQAYKMSDPATRKLIEEWQ
::: ::::.::..:::: .::.: .::::.. :.::::::::::.:::: ::.::: ::.
CCDS42 VEINQHQPVYLLSEEHITLAQQSNSPFQVILCPFGLNGTLTGQAFKMSDSATKKLIGEWK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE2 YFYPM--VLKKKEESKEEDELGYDDDFPVAVEVIVGGVRMVYPSAFVLISQNDIPVPQSV
:::. ::. : :.:: . ..:: .::::.:.::::.::. :::. :.:::.:. :
CCDS42 QFYPISCCLKEMSEEKQED-MDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPTPSPV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 ASAGGHIAVGQQGL----GSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQAILGESGGMQSAASHLVSQDG
.:. : . . :. .:..::. .. ::::::::.. . ..:. .. . : .
CCDS42 GST--HCSSSCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSVQKWVK-FSSVSD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 GMITMHSPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKR--SQMSTPTLEEEPASNPATW
:. . . ...:::: :: ::.: :::.:: .::.:.:: : : :: :.. :.:
CCDS42 GFNSDSTSHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRAQNKRKYSASSGGLCEEATAAKVASW
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 DFVDPTQRVSCSCSRHKLLK-RCAVGPNRPPTVSQPGFSAGPSSSSSLPPPASSKHKTAE
:::. :::..::: ::: :: : : .. :...: ... :: :::: :
CCDS42 DFVEATQRTNCSCLRHKNLKSRNAGQQGQAPSLGQ--------QQQILP-----KHKTNE
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 RQEKGDKLQKRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAV
.:::..: ::::: ::::: ::.... :. :. .:.: ... ::... :. : :
CCDS42 KQEKSEKPQKRPLTPFHHRVSVSDDVGMDADSASQRLVISAPDSQVRFSNIRTNDVA---
470 480 490 500 510
540 550 560 570 580
pF1KE2 PSRNTSKQMNLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDP-PSVPVNPALYGNGLE--
. ::. . : . :: :: :::.: :.. ::.: . .:
CCDS42 ----KTPQMHGTEMAN-----SPQPPPLSPHPCDVVDEGVTKTPSTPQSQHFYQMPTPDP
520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 LQQLSTLDDRTVLVGQRLP-LMAEVSETALYCGIRPSNPESSEK--WWHSYRLPPSDDAE
: . ..:: ..: .: . :. : ..: : : : .: :. :..: . :.:
CCDS42 LVPSKPMEDRIDSLSQSFPPQYQEAVEPTVYVGT-AVNLEEDEANIAWKYYKFPKKKDVE
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 FRPPELQGERC--DAKMEVNSES-TALQRLLAQPNKRFKIWQDKQPQLQPLHFLDPLPLS
: ::.: ... : ..:: :.. .:..: .: .:. .. : : . ::
CCDS42 FLPPQLPSDKFKDDPVGPFGQESVTSVTELMVQCKKPLKVSDELVQQYQ----IKNQCLS
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KE2 QQPGDSLGEVN-DPYTFEDGDIKYIFTANKKCKQGTEKDSLKKNKSEDGFGTKDVTTPGH
.:. : . :::.: .:: ...: .:: .:..:... ::.: ::: :..::. .:
CCDS42 AIASDAEQEPKIDPYAFVEGDEEFLFP-DKKDRQNSEREAGKKHKVEDG--TSSVTVLSH
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KE2 STPVPDGKNAMSIFSSATKTDVRQDNAAGRAGSSSLTQVTDLAPSLHDLDNIFDNSDDDE
..:::.:: . : :. . .. .: :.:: .::: : ::::.: :::.::
CCDS42 E------EDAMSLFSPSIKQDAPRPTSHARPPSTSLIYDSDLAVSYTDLDNLF-NSDEDE
750 760 770 780 790
830 840 850 860 870
pF1KE2 LGAVSPALRSSKMPAVGTEDRPLGKDGRAAVPYP---PTVADLQRMFPTPPSLEQHP-AF
: .: .:: : :..:. :..... : ..:::..:.::::::::: .:
CCDS42 L---TP---GSKKSANGSDDKASCKESKTGNLDPLSCISTADLHKMYPTPPSLEQHIMGF
800 810 820 830 840
880 890 900 910 920 930
pF1KE2 SPV-MNYKDGISSETVTALGMMESPMVSMVSTQLTEFKMEVEDGLGSPKPEEIKDFSYVH
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CCDS42 GISGESSSLPTQPHPDVSESTMDRDKVGIPTD---GDSHAVTYPPAIVVYIIDPFTYENT
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CCDS42 DESTNSSSVWTLGLLRCFLEMVQTLPPHIKSTVSVQIIPCQYLLQPVKHEDREIYPQHLK
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CCDS42 KDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVIMPDSVSTGSVFGRSTTLNMQTSQLNTP
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CCDS42 ALGYFVSTAKAGPLPDWFWSACPQAQYQCPLFLKASLHLHVPSVQSDELLHSKHS----H
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]