Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2302
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2302, 2174 aa
1>>>pF1KE2302 2174 - 2174 aa - 2174 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5220+/-0.0011; mu= 5.7835+/- 0.066
mean_var=206.0502+/-41.153, 0's: 0 Z-trim(110.0): 14 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.089349
statistics sampled from 11305 (11308) to 11305 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.347), width: 16
Scan time: 5.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42366.1 MED13 gene_id:9969|Hs108|chr17 (2174) 14845 1927.9 0
CCDS9177.1 MED13L gene_id:23389|Hs108|chr12 (2210) 4157 550.2 3.7e-155
>>CCDS42366.1 MED13 gene_id:9969|Hs108|chr17 (2174 aa)
initn: 14845 init1: 14845 opt: 14845 Z-score: 10345.0 bits: 1927.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 14845; 100.0% identity (100.0% similar) in 2174 aa overlap (1-2174:1-2174)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSASFVPNGASLEDCHCNLFCLADLTGIKWKKYVWQGPTSAPILFPVTEEDPILSSFSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSASFVPNGASLEDCHCNLFCLADLTGIKWKKYVWQGPTSAPILFPVTEEDPILSSFSRC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LKADVLGVWRRDQRPGRRELWIFWWGEDPSFADLIHHDLSEEEDGVWENGLSYECRTLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LKADVLGVWRRDQRPGRRELWIFWWGEDPSFADLIHHDLSEEEDGVWENGLSYECRTLLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KAVHNLLERCLMNRNFVRIGKWFVKPYEKDEKPINKSEHLSCSFTFFLHGDSNVCTSVEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KAVHNLLERCLMNRNFVRIGKWFVKPYEKDEKPINKSEHLSCSFTFFLHGDSNVCTSVEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 NQHQPVYLLSEEHITLAQQSNSPFQVILCPFGLNGTLTGQAFKMSDSATKKLIGEWKQFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NQHQPVYLLSEEHITLAQQSNSPFQVILCPFGLNGTLTGQAFKMSDSATKKLIGEWKQFY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PISCCLKEMSEEKQEDMDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPTPSPVGSTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PISCCLKEMSEEKQEDMDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPTPSPVGSTH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CSSSCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSVQKWVKFSSVSDGFNSDST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CSSSCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSVQKWVKFSSVSDGFNSDST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRAQNKRKYSASSGGLCEEATAAKVASWDFVEATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRAQNKRKYSASSGGLCEEATAAKVASWDFVEATQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RTNCSCLRHKNLKSRNAGQQGQAPSLGQQQQILPKHKTNEKQEKSEKPQKRPLTPFHHRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RTNCSCLRHKNLKSRNAGQQGQAPSLGQQQQILPKHKTNEKQEKSEKPQKRPLTPFHHRV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SVSDDVGMDADSASQRLVISAPDSQVRFSNIRTNDVAKTPQMHGTEMANSPQPPPLSPHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SVSDDVGMDADSASQRLVISAPDSQVRFSNIRTNDVAKTPQMHGTEMANSPQPPPLSPHP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 CDVVDEGVTKTPSTPQSQHFYQMPTPDPLVPSKPMEDRIDSLSQSFPPQYQEAVEPTVYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CDVVDEGVTKTPSTPQSQHFYQMPTPDPLVPSKPMEDRIDSLSQSFPPQYQEAVEPTVYV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GTAVNLEEDEANIAWKYYKFPKKKDVEFLPPQLPSDKFKDDPVGPFGQESVTSVTELMVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTAVNLEEDEANIAWKYYKFPKKKDVEFLPPQLPSDKFKDDPVGPFGQESVTSVTELMVQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 CKKPLKVSDELVQQYQIKNQCLSAIASDAEQEPKIDPYAFVEGDEEFLFPDKKDRQNSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CKKPLKVSDELVQQYQIKNQCLSAIASDAEQEPKIDPYAFVEGDEEFLFPDKKDRQNSER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 EAGKKHKVEDGTSSVTVLSHEEDAMSLFSPSIKQDAPRPTSHARPPSTSLIYDSDLAVSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EAGKKHKVEDGTSSVTVLSHEEDAMSLFSPSIKQDAPRPTSHARPPSTSLIYDSDLAVSY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 TDLDNLFNSDEDELTPGSKKSANGSDDKASCKESKTGNLDPLSCISTADLHKMYPTPPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TDLDNLFNSDEDELTPGSKKSANGSDDKASCKESKTGNLDPLSCISTADLHKMYPTPPSL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 EQHIMGFSPMNMNNKEYGSMDTTPGGTVLEGNSSSIGAQFKIEVDEGFCSPKPSEIKDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EQHIMGFSPMNMNNKEYGSMDTTPGGTVLEGNSSSIGAQFKIEVDEGFCSPKPSEIKDFS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 YVYKPENCQILVGCSMFAPLKTLPSQYLPPIKLPEECIYRQSWTVGKLELLSSGPSMPFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YVYKPENCQILVGCSMFAPLKTLPSQYLPPIKLPEECIYRQSWTVGKLELLSSGPSMPFI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 KEGDGSNMDQEYGTAYTPQTHTSFGMPPSSAPPSNSGAGILPSPSTPRFPTPRTPRTPRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KEGDGSNMDQEYGTAYTPQTHTSFGMPPSSAPPSNSGAGILPSPSTPRFPTPRTPRTPRT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 PRGAGGPASAQGSVKYENSDLYSPASTPSTCRPLNSVEPATVPSIPEAHSLYVNLILSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRGAGGPASAQGSVKYENSDLYSPASTPSTCRPLNSVEPATVPSIPEAHSLYVNLILSES
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 VMNLFKDCNFDSCCICVCNMNIKGADVGVYIPDPTQEAQYRCTCGFSAVMNRKFGNNSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VMNLFKDCNFDSCCICVCNMNIKGADVGVYIPDPTQEAQYRCTCGFSAVMNRKFGNNSGL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 FLEDELDIIGRNTDCGKEAEKRFEALRATSAEHVNGGLKESEKLSDDLILLLQDQCTNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FLEDELDIIGRNTDCGKEAEKRFEALRATSAEHVNGGLKESEKLSDDLILLLQDQCTNLF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 SPFGAADQDPFPKSGVISNWVRVEERDCCNDCYLALEHGRQFMDNMSGGKVDEALVKSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPFGAADQDPFPKSGVISNWVRVEERDCCNDCYLALEHGRQFMDNMSGGKVDEALVKSSC
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 LHPWSKRNDVSMQCSQDILRMLLSLQPVLQDAIQKKRTVRPWGVQGPLTWQQFHKMAGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LHPWSKRNDVSMQCSQDILRMLLSLQPVLQDAIQKKRTVRPWGVQGPLTWQQFHKMAGRG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 SYGTDESPEPLPIPTFLLGYDYDYLVLSPFALPYWERLMLEPYGSQRDIAYVVLCPENEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SYGTDESPEPLPIPTFLLGYDYDYLVLSPFALPYWERLMLEPYGSQRDIAYVVLCPENEA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 LLNGAKSFFRDLTAIYESCRLGQHRPVSRLLTDGIMRVGSTASKKLSEKLVAEWFSQAAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLNGAKSFFRDLTAIYESCRLGQHRPVSRLLTDGIMRVGSTASKKLSEKLVAEWFSQAAD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 GNNEAFSKLKLYAQVCRYDLGPYLASLPLDSSLLSQPNLVAPTSQSLITPPQMTNTGNAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GNNEAFSKLKLYAQVCRYDLGPYLASLPLDSSLLSQPNLVAPTSQSLITPPQMTNTGNAN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 TPSATLASAASSTMTVTSGVAISTSVATANSTLTTASTSSSSSSNLNSGVSSNKLPSFPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TPSATLASAASSTMTVTSGVAISTSVATANSTLTTASTSSSSSSNLNSGVSSNKLPSFPP
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 FGSMNSNAAGSMSTQANTVQSGQLGGQQTSALQTAGISGESSSLPTQPHPDVSESTMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FGSMNSNAAGSMSTQANTVQSGQLGGQQTSALQTAGISGESSSLPTQPHPDVSESTMDRD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 KVGIPTDGDSHAVTYPPAIVVYIIDPFTYENTDESTNSSSVWTLGLLRCFLEMVQTLPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KVGIPTDGDSHAVTYPPAIVVYIIDPFTYENTDESTNSSSVWTLGLLRCFLEMVQTLPPH
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 IKSTVSVQIIPCQYLLQPVKHEDREIYPQHLKSLAFSAFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IKSTVSVQIIPCQYLLQPVKHEDREIYPQHLKSLAFSAFTQCRRPLPTSTNVKTLTGFGP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 GLAMETALRSPDRPECIRLYAPPFILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GLAMETALRSPDRPECIRLYAPPFILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQ
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE2 RWILASCTDLYGELLETCIINIDVPNRARRKKSSARKFGLQKLWEWCLGLVQMSSLPWRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RWILASCTDLYGELLETCIINIDVPNRARRKKSSARKFGLQKLWEWCLGLVQMSSLPWRV
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE2 VIGRLGRIGHGELKDWSCLLSRRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VIGRLGRIGHGELKDWSCLLSRRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQ
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE2 GSFVIMPDSVSTGSVFGRSTTLNMQTSQLNTPQDTSCTHILVFPTSASVQVASATYTTEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GSFVIMPDSVSTGSVFGRSTTLNMQTSQLNTPQDTSCTHILVFPTSASVQVASATYTTEN
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE2 LDLAFNPNNDGADGMGIFDLLDTGDDLDPDIINILPASPTGSPVHSPGSHYPHGGDAGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LDLAFNPNNDGADGMGIFDLLDTGDDLDPDIINILPASPTGSPVHSPGSHYPHGGDAGKG
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE2 QSTDRLLSTEPHEEVPNILQQPLALGYFVSTAKAGPLPDWFWSACPQAQYQCPLFLKASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QSTDRLLSTEPHEEVPNILQQPLALGYFVSTAKAGPLPDWFWSACPQAQYQCPLFLKASL
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE2 HLHVPSVQSDELLHSKHSHPLDSNQTSDVLRFVLEQYNALSWLTCDPATQDRRSCLPIHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HLHVPSVQSDELLHSKHSHPLDSNQTSDVLRFVLEQYNALSWLTCDPATQDRRSCLPIHF
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170
pF1KE2 VVLNQLYNFIMNML
::::::::::::::
CCDS42 VVLNQLYNFIMNML
2170
>>CCDS9177.1 MED13L gene_id:23389|Hs108|chr12 (2210 aa)
initn: 5428 init1: 1745 opt: 4157 Z-score: 2899.1 bits: 550.2 E(32554): 3.7e-155
Smith-Waterman score: 7487; 53.4% identity (75.5% similar) in 2272 aa overlap (3-2174:5-2210)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSASFVPNGASLEDCHCNLFCLADLTGIKWKKYVWQGPTS-APILFPVTEEDPILSSF
:..: ::::::::: ::: ::.::::::..: . : . .::. ...:::: ::
CCDS91 MTAAANWVANGASLEDCHSNLFSLAELTGIKWRRYNFGGHGDCGPIISAPAQDDPILLSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 SRCLKADVLGVWRRDQRPGRRELWIFWWGEDPSFADLIHHDLSEEEDGVWENGLSYECRT
:::.:..: ::::: .: .::::::::..:... .:::.:. :.:.:::::::::::
CCDS91 IRCLQANLLCVWRRDVKPDCKELWIFWWGDEPNLVGVIHHELQVVEEGLWENGLSYECRT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 LLFKAVHNLLERCLMNRNFVRIGKWFVKPYEKDEKPINKSEHLSCSFTFFLHGDSNVCTS
:::::.:::::::::..::::::::::.::::::::.::::::::.:::::::.::::::
CCDS91 LLFKAIHNLLERCLMDKNFVRIGKWFVRPYEKDEKPVNKSEHLSCAFTFFLHGESNVCTS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VEINQHQPVYLLSEEHITLAQQSNSPFQVILCPFGLNGTLTGQAFKMSDSATKKLIGEWK
::: ::::.::..:::: .::.: .::::.. :.::::::::::.:::: ::.::: ::.
CCDS91 VEIAQHQPIYLINEEHIHMAQSSPAPFQVLVSPYGLNGTLTGQAYKMSDPATRKLIEEWQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QFYPISCCLKEMSEEKQED-MDWEDDSLAAVEVLVAGVRMIYPACFVLVPQSDIPTPSPV
:::. ::. : :.:: . ..:: .::::.:.::::.::. :::. :.:::.:. :
CCDS91 YFYPM--VLKKKEESKEEDELGYDDDFPVAVEVIVGGVRMVYPSAFVLISQNDIPVPQSV
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GST--HCSSSCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSVQKWVKFSSVSDG
.:. : . . :. .:..::. .. ::::::::.. . ..:. .. .::
CCDS91 ASAGGHIAVGQQGL----GSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQAILGESGGMQSAASHLVSQDG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 -FNSDSTSHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRAQNKRKYSASSGGLCEEATAAKVASW
. . . ...:::: :: ::.: :::.:: .::.:.:: : : :: :.. :.:
CCDS91 GMITMHSPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKR--SQMSTPTLEEEPASNPATW
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE2 DFVEATQRTNCSCLRHKNLKSRNAGQQGQAPSLGQ--------QQQILP-----KHKTNE
:::. :::..::: ::: :: : : .. :...: ... :: :::: :
CCDS91 DFVDPTQRVSCSCSRHKLLK-RCAVGPNRPPTVSQPGFSAGPSSSSSLPPPASSKHKTAE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 KQEKSEKPQKRPLTPFHHRVSVSDDVGMDADSASQRLVISAPDSQVRFSNIRTNDVA---
.:::..: ::::: ::::: ::.... :. :. .:.: ... ::... :. : :
CCDS91 RQEKGDKLQKRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVSSSRKYDKQMAV
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE2 ----KTPQMHGTEMAN-----SPQPPPLSPHPCDVVDEGVTKTPSTPQSQHFYQMPTPDP
. ::. . : . :: :: :::.: :.. ::.: . .:
CCDS91 PSRNTSKQMNLNPMDSPHSPISPLPPTLSPQPRGQETESLDP-PSVPVNPALYGNGL--E
540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 LVPSKPMEDRIDSLSQSFPPQYQEAVEPTVYVGT-AVNLEEDEANIAWKYYKFPKKKDVE
: . ..:: ..: .: . :. : ..: : : : .: :. :..: . :.:
CCDS91 LQQLSTLDDRTVLVGQRLP-LMAEVSETALYCGIRPSNPESSEK--WWHSYRLPPSDDAE
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 FLPPQLPSDKFKDDPVGPFGQESVTSVTELMVQCKKPLKVSDELVQQYQ----IKNQCLS
: ::.: ... : ..:: :.. .:..: .: .:. .. : : . ::
CCDS91 FRPPELQGERC--DAKMEVNSES-TALQRLLAQPNKRFKIWQDKQPQLQPLHFLDPLPLS
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 AIASDAEQEPKIDPYAFVEGDEEFLFP-DKKDRQNSEREAGKKHKVEDG--TSSVTVLSH
.:. : . :::.: .:: ...: .:: .:..:... ::.: ::: :..::. .:
CCDS91 QQPGDSLGEVN-DPYTFEDGDIKYIFTANKKCKQGTEKDSLKKNKSEDGFGTKDVTTPGH
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790
pF1KE2 E------EDAMSLFSPSIKQDAPRPTSHARPPSTSLIYDSDLAVSYTDLDNLF-NSDEDE
..:::.:: . : :. . .. .: :.:: .::: : ::::.: :::.::
CCDS91 STPVPDGKNAMSIFSSATKTDVRQDNAAGRAGSSSLTQVTDLAPSLHDLDNIFDNSDDDE
770 780 790 800 810 820
800 810 820 830 840
pF1KE2 L---TPG---SKKSANGSDDKASCKESKTGNLDPLSCISTADLHKMYPTPPSLEQHIMGF
: .:. :: : :..:. :..... : ..:::..:.::::::::: .:
CCDS91 LGAVSPALRSSKMPAVGTEDRPLGKDGRAAVPYP---PTVADLQRMFPTPPSLEQHP-AF
830 840 850 860 870
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 SPMNMNNKEYGSMDTTPGGTVLEGNSSS-IGAQ---FKIEVDEGFCSPKPSEIKDFSYVY
::. :: :. : .:. . ..:. : ...: ::.::..:. :::: ::::::::.
CCDS91 SPV-MNYKDGISSETVTALGMMESPMVSMVSTQLTEFKMEVEDGLGSPKPEEIKDFSYVH
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 KPENCQILVGCSMFAPLKTLPSQYLPPIKLPEECIYRQSWTVG-KLELLSSGPSMPFIKE
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CCDS91 KVPSFQPFVGSSMFAPLKMLPSHCLLPLKIPDACLFRPSWAIPPKIEQLPMPPAATFIRD
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000 1010
pF1KE2 GD------GSNMDQEYGTAYTPQTHTSFGMPPSSAPPSNSGAGILPSPSTPRF--PTPRT
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CCDS91 GYNNVPSVGSLADPDYLN--TPQMNTPVTLN-SAAPASNSGAGVLPSPATPRFSVPTPRT
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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CCDS91 PRTPRTPRG-GGTASGQGSVKYDSTDQGSPASTPSTTRPLNSVEPATMQPIPEAHSLYVT
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE2 LILSESVMNLFKDCNFDSCCICVCNMNIKGADVGVYIPDPTQEAQYRCTCGFSAVMNRKF
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CCDS91 LILSDSVMNIFKDRNFDSCCICACNMNIKGADVGLYIPDSSNEDQYRCTCGFSAIMNRKL
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CCDS91 GYNSGLFLEDELDIFGKNSDIGQAAERRLMMCQSTFLPQVEGTKKPQEP-PISLLLLLQN
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pF1KE2 QCTNLFSPFGAAD------QDPFPKSGVISNWVRVEERDCCNDCYLALEHGRQFMDNMSG
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CCDS91 QHTQPFASLNFLDYISSNNRQTLPCVSWSYDRVQADNNDYWTECFNALEQGRQYVDNPTG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KE2 GKVDEALVKSSCLHPWSKRN--DVSMQCSQDILRMLLSLQPVLQDAIQKKRTVRPW----
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CCDS91 GKVDEALVRSATVHSWPHSNVLDISMLSSQDVVRMLLSLQPFLQDAIQKKRTGRTWENIQ
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CCDS91 HVQGPLTWQQFHKMAGRGTYGSEESPEPLPIPTLLVGYDKDFLTISPFSLPFWERLLLDP
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pF1KE2 YGSQRDIAYVVLCPENEALLNGAKSFFRDLTAIYESCRLGQHRPVSRLLTDGIMRVGSTA
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CCDS91 YGGHRDVAYIVVCPENEALLEGAKTFFRDLSAVYEMCRLGQHKPICKVLRDGIMRVGKTV
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CCDS91 AQKLTDELVSEWFNQPWSGEENDNHSRLKLYAQVCRHHLAPYLATLQLDSSLLIPPKYQT
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pF1KE2 P--TSQSLITPPQMTNTGNAN--TPSATLASAASSTMTVTSGVAISTSVATANSTLTTAS
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CCDS91 PPAAAQGQATP------GNAGPLAPNGSAAPPAGSAFNPTSNS--SSTNPAASSSASGSS
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CCDS91 VPPVSSSASAPGISQISTTSSSGFSGSVGGQNPSTGGISADRTQ-GNIGCGGDTD-----
1590 1600 1610 1620 1630
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pF1KE2 GISGESSSLPTQPHPDVSESTMDRDKVGIPTD---GDSHAVTYPPAIVVYIIDPFTYENT
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CCDS91 --PGQSSSQPSQ---DGQESVTERERIGIPTEPDSADSHA--HPPAVVIYMVDPFTYAAE
1640 1650 1660 1670 1680 1690
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pF1KE2 DESTNSSSVWTLGLLRCFLEMVQTLPPHIKSTVSVQIIPCQYLLQPVKHEDREIYPQHLK
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CCDS91 EDST-SGNFWLLSLMRCYTEMLDNLPEHMRNSFILQIVPCQYMLQTMKDE-QVFYIQYLK
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CCDS91 SMAFSVYCQCRRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPSPIQLYSPPFILAPIKDK
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CCDS91 QTELGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLETCVVNIALPNRSRRSK
1810 1820 1830 1840 1850 1860
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CCDS91 VSARKIGLQKLWEWCIGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDWSILLGECSLQTISKKL
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KE2 KDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVIMPDSVSTGSVFGRSTTLNMQTSQLNTP
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CCDS91 KDVCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVVMPDAVTMGSVFGRSTALNMQSSQLNTP
1930 1940 1950 1960 1970 1980
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CCDS91 QDASCTHILVFPTSSTIQVAPANYPNED---GFSPNND-----DMFVDLPFPDDMDNDIG
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pF1KE2 ---INILPASPTGSPVHSPGSHYPHGGDAG------KGQSTDRLLSTEPHEEVPNILQQP
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CCDS91 LALGYFVSTAKAENLPQWFWSSCPQAQNQCPLFLKASLHHHISVAQTDELLPARNSQRVP
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CCDS91 HPLDSKTTSDVLRFVLEQYNALSWLTCNPATQDRTSCLPVHFVVLTQLYNAIMNIL
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 19:53:12 2016 done: Sun Nov 6 19:53:13 2016
Total Scan time: 5.960 Total Display time: 0.190
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]