FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2298, 424 aa
1>>>pF1KE2298 424 - 424 aa - 424 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6114+/-0.000928; mu= 15.6937+/- 0.056
mean_var=72.8840+/-14.187, 0's: 0 Z-trim(104.4): 44 B-trim: 52 in 1/50
Lambda= 0.150231
statistics sampled from 7846 (7890) to 7846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 ( 424) 2815 619.7 1.7e-177
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 1052 237.6 1.8e-62
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 443 105.6 1e-22
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 433 103.4 4.5e-22
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 430 102.8 6.4e-22
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 411 98.6 1.1e-20
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 409 98.3 1.8e-20
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CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 383 92.6 8.3e-19
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CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 338 82.8 5.7e-16
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 329 80.9 2.4e-15
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 325 80.0 4.2e-15
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 316 78.0 1.7e-14
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 314 77.6 2.4e-14
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 308 76.4 6.7e-14
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 308 76.4 6.8e-14
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 298 74.1 2.5e-13
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 293 73.1 5.9e-13
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 287 71.8 1.4e-12
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 282 70.7 2.6e-12
>>CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 (424 aa)
initn: 2815 init1: 2815 opt: 2815 Z-score: 3300.2 bits: 619.7 E(32554): 1.7e-177
Smith-Waterman score: 2815; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGSLVLTLCALFCLAAYLVSGSPIMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKD
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CCDS18 MGSLVLTLCALFCLAAYLVSGSPIMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 EFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 NGLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 NGLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 RNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 QMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 QMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 AEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 AEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSE
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CGCR
::::
CCDS18 CGCR
>>CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 (429 aa)
initn: 821 init1: 540 opt: 1052 Z-score: 1235.1 bits: 237.6 E(32554): 1.8e-62
Smith-Waterman score: 1052; 41.9% identity (71.6% similar) in 437 aa overlap (2-424:4-429)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGSLVLTLCALFCLAAYLVSGSPIMNLEQSPL----EEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTL
:.: ..: :. : : ..:.:... .. . ... : . :. ... .
CCDS73 MCPGALWVAL-PLLSLLAGSLQGKPLQSWGRGSAGGNAHSPLGVPGGGLPEHT-FNLKMF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLF
:...: .::..:::: .:.::...:.::.::..:::....:... :..::.:::. :: .
CCDS73 LENVKVDFLRSLNLSGVPSQDKTRVEPPQYMIDLYNRYTSDKSTTPASNIVRSFSMEDAI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 SQPVSFN-GLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLES
: .. . ..:. ::::.:::.::.. ::::::. : . ...:..::..
CCDS73 SITATEDFPFQKHILLFNISIPRHEQITRAELRLYVSCQNHVDPSHDLKGSVVIYDVLDG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE2 KG--DNEGERNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGS--STHQLEVHIESKHD
:. : . . ::: .: . :::..:..:..:: .: : : ..::: .:: :
CCDS73 TDAWDSATETKTF-LVSQDIQ--DEGWETLEVSSAVKRWVRSDSTKSKNKLEVTVES-HR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 EAEDASSGRLEIDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSD-KERKEELNEMISHEQLPELDNLGLD
.. :. :.:.. ... :...:::.:.:: :: . :: ::::::: : .:. :
CCDS73 KGCDT----LDISVPPGSRNLPFFVVFSNDHSSGTKETRLELREMISHEQESVLKKLSKD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 SFSSGPGEEALLQ-MRSNIIYDST-ARIRRNA-KGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPP
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CCDS73 G-STEAGESSHEEDTDGHVAAGSTLARRKRSAGAGSHCQKTSLRVNFEDIGWDSWIIAPK
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 GYEAYECRGVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDK-
::::::.: : .:::. .:::::::.:.::::: :..::::::::: :::.:: :
CCDS73 EYEAYECKGGCFFPLADDVTPTKHAIVQTLVHLKFPTKVGKACCVPTKLSPISVLYKDDM
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KE2 GVVTYKFKYEGMAVSECGCR
:: : :..::::.:.:::::
CCDS73 GVPTLKYHYEGMSVAECGCR
410 420
>>CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 (455 aa)
initn: 588 init1: 433 opt: 443 Z-score: 521.3 bits: 105.6 E(32554): 1e-22
Smith-Waterman score: 510; 32.6% identity (52.7% similar) in 389 aa overlap (72-424:85-455)
50 60 70 80 90
pF1KE2 VFSEQDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKF---------
: . .: : :::: .: .
CCDS34 PRDSDAGREGQEPQPRPQDEPRAQQPRAQEPPGRGPRVVPHEYMLSIYRTYSIAEKLGIN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 ATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFNVSI-PHHEEVIMAELRLYTLV
:. : ::: : :: .. : . .: . ::. ::.::. .::.. :::::. .
CCDS34 ASFFQSSKSANTITSFVDRGL--DDLSHTPLRRQKYLFDVSMLSDKEELVGAELRLFRQA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 QRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSGEIYGTNSE-WETFDVTDAIRRW
. .. .: : .: . . :. ::.::: ...:.
CCDS34 PSAPWGPPAGPLHVQLFPCLSPL--------LLDARTLDPQGAPPAGWEVFDVWQGLRHQ
180 190 200 210 220
220 230 240 250
pF1KE2 QKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEI---DTSAQN--------KHNPLLIVFSDD
. . . : ::: . : . : . . .. ::.::. .
CCDS34 PWKQLCLELRAAWGELDAGEAEARARGPQQPPPPDLRSLGFGRRVRPPQERALLVVFTRS
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300
pF1KE2 QSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSG--------PGEEALL----QMRSNII
: ::. . :: .::: . : . . : : . : . :
CCDS34 Q-----RKNLFAEM--REQLGSAEAAGPGAGAEGSWPPPSGAPDARPWLPSPGRRRRRTA
290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 YDSTARIRRNAKGNY-CKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEHLTP
. : :.. :. :.. ::...:::.:::.::::: ::::.:.:::..:: :: :
CCDS34 FASRHGKRHGKKSRLRCSKKPLHVNFKELGWDDWIIAPLEYEAYHCEGVCDFPLRSHLEP
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGV-VTYKFKYEGMAVSECGCR
:.:::::.:.. . .. .::::::: ::::::.: : :.:: .:: :.: ::::
CCDS34 TNHAIIQTLMNSMDPGSTPPSCCVPTKLTPISILYIDAGNNVVYK-QYEDMVVESCGCR
400 410 420 430 440 450
>>CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 (450 aa)
initn: 508 init1: 428 opt: 433 Z-score: 509.7 bits: 103.4 E(32554): 4.5e-22
Smith-Waterman score: 473; 29.4% identity (56.2% similar) in 377 aa overlap (76-424:83-450)
50 60 70 80 90
pF1KE2 QDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFA---------TDR
...: : ..:. :: ..: ..
CCDS17 LAQAAGAAAVPAAAVPRARAARRAAGSGFRNGSVVPHHFMMSLYRSLAGRAPAGAAAVSA
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 TSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDR
.. :. : .: .. .. .. .: .::.:: . .::. ::::. : . .
CCDS17 SGHGRADTITGFTDQATQDESAAETG---QSFLFDVSSLNDADEVVGAELRV--LRRGSP
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 MIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGS
: . .. . : .. : . .. . : ..::.:::.::.:: ..
CCDS17 ESGPGSWTSPPLLLLSTCPGAARAPRLLYSRAAEPLVG--QRWEAFDVADAMRRHRREPR
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KE2 STHQLEVHIESKHDEAEDASSGR-----LEIDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKE--
. . . ... . . . : .. .. .:.: : : ... .:
CCDS17 PPRAFCLLLRAVAGPVPSPLALRRLGFGWPGGGGSAAEERAVLVVSSRTQRKESLFREIR
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310
pF1KE2 ----ELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPG-----EEALLQMRSNIIYDSTARIRRNAK
:. .. : ::. . : : . : . :: :. . : .. .
CCDS17 AQARALGAALASEPLPD-PGTGTASPRAVIGGRRRRRTALAGTRTAQGSGGGAGRGHGRR
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 G-NYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHL
: . :.: ::..::::.:::.::::: ::::.:.:.:..:: :: ::.:::::.:..
CCDS17 GRSRCSRKPLHVDFKELGWDDWIIAPLDYEAYHCEGLCDFPLRSHLEPTNHAIIQTLLNS
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420
pF1KE2 KNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGV-VTYKFKYEGMAVSECGCR
. : .::::..: ::::::.: . :.:: .:: :.: ::::
CCDS17 MAPDAAPASCCVPARLSPISILYIDAANNVVYK-QYEDMVVEACGCR
410 420 430 440 450
>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa)
initn: 511 init1: 294 opt: 430 Z-score: 507.0 bits: 102.8 E(32554): 6.4e-22
Smith-Waterman score: 607; 31.7% identity (59.8% similar) in 391 aa overlap (52-424:47-396)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 SPIMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDP
. .:. .. ..:. ..:.. :: . : :
CCDS13 LLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVP
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130
pF1KE2 PEYMLELYNKF-------ATDRT---SMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFN
: :::.:: . : :. . :: .:::..:. . . .: ..::
CCDS13 P-YMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFN
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180
pF1KE2 VS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDG-VDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSG
.: :: .: . :::... ..: . .. ..:.:.:... : .: .
CCDS13 LSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTR
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 EIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEIDTSA-QNK
. . :.::.:::: :. :: .: ..: . :.. .. .: . .:. ...:. : :..
CCDS13 LVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEV-AHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDE
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HN-----PLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALLQMR
:. :::..:. : .. .:.: ... .:.:
CCDS13 HSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKRE-KRQAKHKQ-------------------------
260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEH
:. :.. ::: :::.::...::..::.:::::.:. :.: : .:::.:
CCDS13 -----------RKRLKSS-CKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADH
290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSECGC
:. :.:::.:.::. :: : :::::::.: ::.::::.. . .:. :.: :::
CCDS13 LNSTNHAIVQTLVNSVNS-KIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGC
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 R
:
CCDS13 R
>>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 (408 aa)
initn: 536 init1: 286 opt: 411 Z-score: 484.6 bits: 98.6 E(32554): 1.1e-20
Smith-Waterman score: 537; 31.6% identity (57.3% similar) in 393 aa overlap (54-424:53-408)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 IMNLEQSPLEEDMSLFGDVFSEQDGVDFNTLLQSMKDEFLKTLNLSDIPTQDSAKVDPPE
::.... .:. ..: : : : .. :.
CCDS97 HASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRP-QPSKSAVIPD
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120
pF1KE2 YMLELY------------NKFATDRTSMPS--ANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLRKYPLL
:: .:: .. . . :. :: .:::..:. . . . . . .:
CCDS97 YMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPASRANTVRSFHHEEHLENIPGTSENSAFRFL
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVD-----RKITIFEVLESKGDN-EGERN
::.: ::..: . :::::. :.. . .: : ..:.:.::.. .. :.
CCDS97 FNLSSIPENEVISSAELRLF----REQ-VDQGPDWERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLI
150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEID
.: . .. . ..::::::. :. :: . . .. : ... :.
CCDS97 TRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTHLHQT------------
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQL-PELDNLGLDSFSSGPGEEALLQ
. :..: . : : :.: . :: : : ..: : : :. :: .
CCDS97 RTHQGQH--VRISRSLPQGSG-----------NWAQLRPLLVTFGHD----GRGH-ALTR
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 MRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLA
: . : :.. :.: ::.::...::..::.:::::.:. :.: : .:::
CCDS97 RRRAKRSPKHHSQRARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSEC
.::. :.:::.:.::. ::. :::::::.: ::.::::. . .:. :.: :
CCDS97 DHLNSTNHAIVQTLVNSVNSS-IPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGC
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 GCR
:::
CCDS97 GCR
>>CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 (501 aa)
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50 60 70 80 90 100
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. : :::: :: .. .:: . :
CCDS13 AGSVPSSFLLKKAREPGPPREPKEPFRPPPITPHEYMLSLYRTLSDADRKGGNSSVKLEA
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150
pF1KE2 --ANIIRSF--KNEDLFSQPVSFNGLRKYPLLFNVSIPHHEEVIMAELRLYTLVQRD--R
:: : :: :..: :: .:: .:..: ... .. ::::. : .
CCDS13 GLANTITSFIDKGQDD-RGPV----VRKQRYVFDISALEKDGLLGAELRILRKKPSDTAK
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 MIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGERNMLVLVSGEIYGTN-SEWETFDVTDAIRRWQKSG
: : :. .. :.. .: . : . : ::.::. .: ...:.
CCDS13 PAAPGGGRAAQ----LKLSSCPSGRQPAALLDVRSVPGLDGSGWEVFDIWKLFRNFKNSA
260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 SSTHQLEVHIES-KHDEAEDASSGRLEIDTSAQNKHNP-LLIVFSDDQSSDKERKEELNE
:: ...:. .. .: : . : .: .:.. :. :..::. :.: .::
CCDS13 ----QLCLELEAWERGRAVDLRG--LGFDRAARQVHEKALFLVFG----RTKKRDLFFNE
310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 MISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALLQMRSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDF
:. .. . .. ::. ..: : :.. : .: :. :.: :...:
CCDS13 -IKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLATRQG------KRPSKNLKAR-CSRKALHVNF
360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 KEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPT
:..:::.::::: :::..:.:.:..:: :: ::.::.::.:.. . ... .:::::
CCDS13 KDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPESTPPTCCVPT
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400 410 420
pF1KE2 KLEPISILYLDKGV-VTYKFKYEGMAVSECGCR
.: :::::..:.. :.:: .:: :.: ::::
CCDS13 RLSPISILFIDSANNVVYK-QYEDMVVESCGCR
470 480 490 500
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70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLR
: . .:... :: : .. .
CCDS13 EEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFHPRYH
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KYPLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEG-ERN
. . :..: ::. : : ::.:.: :.: .:. .:....::. .. : : .
CCDS13 HREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRER--FDNETFRISVYQVLQ---EHLGRESD
160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 MLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEID
...: : ..... : .::.: . .: . . :.. .:. .. . . . :
CCDS13 LFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQSINPKLAGLIGR
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEALLQM
. :::. :....: : . .. . : . . .: :. : .. :.:
CCDS13 HGPQNKQ-PFMVAFF------KATEVHFRSIRSTGSKQRSQN-----RSKTPKNQEALRM
270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RSNIIYDSTARIRRNAKGNYCKRTPLYIDFKEIGWDSWIIAPPGYEAYECRGVCNYPLAE
.:. .:.. :. ::. ::..:...::..::::: :: :: :.: : .::
CCDS13 -ANVAENSSSDQRQA-----CKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNS
320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVSECG
... :.:::.:.:::. : . . : ::.::.:. ::.::.: . . ::..:.: ::
CCDS13 YMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACG
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 CR
:
CCDS13 CH
430
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70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LKTLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNG
: : . . .:... :: : ... :
CCDS45 QPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQ
180 190 200 210 220 230
130 140 150 160 170
pF1KE2 LRKYPLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMI--YDGVDRKITIFEVLESKGDNEG
.. . ::.: ::. : : ::.:.: .: .. . . :.:..::. . ..
CCDS45 RHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIY----KDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDS
240 250 260 270 280
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pF1KE2 ERNMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRL
....: . ..... : ::.: . : . . . :.. . .. .. :
CCDS45 --DLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGL
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 EIDTSAQNKHNPLLIVFSDDQSSDKERKEELNEMISHEQLPELDNLGLDSFSSGPGEEAL
. .. ..:....: . .: . . .. : .. . : . .: . .
CCDS45 -VGRDGPYDKQPFMVAFF----KVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQS-------QDV
350 360 370 380 390
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.. : :.:. ..: :.. ::..:...::..::::: :: : : : :..:
CCDS45 ARVSSASDYNSSEL--KTA----CRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFP
400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LAEHLTPTKHAIIQALVHLKNSQKASKACCVPTKLEPISILYLDKGVVTYKFKYEGMAVS
: :.. :.:::.:.:::: : . . : ::.::::. ::.::.: . . ::..:.:
CCDS45 LNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVR
450 460 470 480 490 500
420
pF1KE2 ECGCR
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CCDS45 ACGCH
510
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Smith-Waterman score: 480; 26.8% identity (60.9% similar) in 340 aa overlap (95-423:147-453)
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pF1KE2 TLNLSDIPTQDSAKVDPPEYMLELYNKFATDRTSMPSANIIRSFKNEDLFSQPVSFNGLR
: . . .:... :: : : . .:. :
CCDS49 PASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDADMVMSFVN--LVERDKDFSHQR
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 KY--PLLFNVS-IPHHEEVIMAELRLYTLVQRDRMIYDGVDRKITIFEVLESKGDNEGER
.. . :... ::: : : ::.:.: . .: ... ::.:..... . ..
CCDS49 RHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNR--FENETIKISIYQIIKEYTNRDA--
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 NMLVLVSGEIYGTNSEWETFDVTDAIRRWQKSGSSTHQLEVHIESKHDEAEDASSGRLEI
....: . . . . : .::.: . .: . ... :.. :. .. ...:. :
CCDS49 DLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVG
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290
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. :.:. :....: . ....:..... :. ::.. .....: .....
CCDS49 RQGPQSKQ-PFMVAFFKASEVLLRSVRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVG--DYNTS
300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
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CCDS49 EQKQA------------------------CKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCD
350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
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CCDS49 GECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKY
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CCDS49 RNMVVRSCGCH
450
424 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]