Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2276
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2276, 564 aa
1>>>pF1KE2276 564 - 564 aa - 564 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7299+/-0.00131; mu= -0.6815+/- 0.078
mean_var=303.1254+/-58.980, 0's: 0 Z-trim(110.2): 123 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.073665
statistics sampled from 11348 (11465) to 11348 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 3.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 3628 399.7 4.9e-111
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 3606 397.4 2.5e-110
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 3592 395.9 7e-110
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 2773 308.9 1.1e-83
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 2364 265.4 1.3e-70
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 2167 244.5 2.9e-64
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 2089 236.2 9.3e-62
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 2051 232.2 1.5e-60
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 2028 229.6 7.1e-60
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 1989 225.5 1.4e-58
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 1980 224.5 2.5e-58
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 1975 224.1 4.1e-58
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 1866 212.4 1.1e-54
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 1846 210.3 4.8e-54
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 1830 208.6 1.5e-53
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 1797 205.1 1.8e-52
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 1753 200.5 5e-51
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 1702 195.0 1.8e-49
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 1702 195.0 1.9e-49
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 1701 194.8 1.9e-49
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 1613 185.5 1.3e-46
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 1508 174.4 3.1e-43
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 1440 167.1 4.5e-41
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 1424 165.4 1.5e-40
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 1383 161.1 2.9e-39
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 1382 161.0 3.2e-39
CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 410) 1259 147.8 2.4e-35
CCDS53795.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 469) 1204 142.0 1.5e-33
CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 1056 126.2 7.7e-29
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 1056 126.3 8.1e-29
CCDS73472.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 295) 885 107.9 1.8e-23
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 786 97.6 3.6e-20
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 766 95.6 1.8e-19
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 759 94.7 2.6e-19
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 755 94.4 3.9e-19
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 744 93.2 9.7e-19
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 729 91.5 2.4e-18
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 700 88.4 1.9e-17
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 700 88.4 1.9e-17
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 700 88.4 1.9e-17
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 661 84.3 3.5e-16
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 663 84.8 5e-16
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 652 83.4 7.3e-16
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 648 82.9 8.6e-16
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 639 82.0 2e-15
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 625 80.5 5.1e-15
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 609 78.8 1.7e-14
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 601 78.0 3.1e-14
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22 (1020) 585 76.6 1.7e-13
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 570 74.6 2.9e-13
>>CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3628 init1: 3628 opt: 3628 Z-score: 2106.9 bits: 399.7 E(32554): 4.9e-111
Smith-Waterman score: 3628; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3606 init1: 3606 opt: 3606 Z-score: 2094.3 bits: 397.4 E(32554): 2.5e-110
Smith-Waterman score: 3606; 98.8% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS88 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS88 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
:::::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: :::::
CCDS88 VGQVNVSVVQSTISSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSSSSGRAIGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 (564 aa)
initn: 3592 init1: 3592 opt: 3592 Z-score: 2086.2 bits: 395.9 E(32554): 7e-110
Smith-Waterman score: 3592; 98.6% identity (99.8% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS41 VRFLEQQNKVLETKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GMQDLVEDFKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EELQVTAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMAL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS41 VGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRAIGGGLS
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KE2 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
550 560
>>CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 (590 aa)
initn: 2636 init1: 2488 opt: 2773 Z-score: 1615.6 bits: 308.9 E(32554): 1.1e-83
Smith-Waterman score: 2864; 77.0% identity (90.1% similar) in 588 aa overlap (3-563:2-589)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLG-----GACGGAG
: .... .:.. :.::. :: :.:::..:.:.: : . :.::.: :::: .:
CCDS88 MSRQSSVSFRSGGSRSFSTASAITPSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 FGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGG-AGSGFGFGGGAGIGFGLGG
.::::::.:::::::::. .. .. . .:. :::.::::: :::::::::::: ::::::
CCDS88 YGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 GAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKF
:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::
CCDS88 GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS88 ASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDE
::::::::::::::.::::::::::::.:::::: :::::::::::::::.::.:.: ::
CCDS88 LDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 INFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAES
:::.. ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::
CCDS88 INFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 WYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQ
:::::::::: :::::::::::::.::.:.::::::::.:::.::::::::: :::::::
CCDS88 WYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEC
:::.:::::.::: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::
CCDS88 RGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEEC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE2 RLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLG----------LGGGSSYSY-------
::.::::: :::::: :.::::::..:: :.::: :.:::: ::
CCDS88 RLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGLGGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE2 ---GSGLGVGG-GFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
:.::.::: :::.::::. : :..: ::.::..:...:.::::::.:
CCDS88 VGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
540 550 560 570 580 590
>>CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 (551 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSR-GSGGLGG-ACGGAGFGS
: ...: .:.::::::..:: :...:: :::.::.:: :::::: . .::.:::
CCDS88 MSRQSSITFQSGSRRGFSTTSAITPAAGRSRFSSVSVARSAAGSGGLGRISSAGASFGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGL
::::.:::.::.::.: . . .:.:.::.. .: ..::::.:::.:
CCDS88 RSLYNLGGAKRVSINGCGSSCRSGFGGRASNRFG---VNSGFGYGGGVG-----------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
:::.::.::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS88 -GGFSGPSFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLHLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 DKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSE
:::::::::::::.:::.::::::..::::::::::..: ..:::::..:. :::::..:
CCDS88 DKVRFLEQQNKVLETKWALLQEQGSRTVRQNLEPLFDSYTSELRRQLESITTERGRLEAE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFL
::::::.:::.: .::::::::::::::::.:::::::::::::::.::. .: .::::.
CCDS88 LRNMQDVVEDFKVRYEDEINKRTAAENEFVALKKDVDAAYMNKVELEAKVKSLPEEINFI
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 RALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQT
....::::::.::...::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::
CCDS88 HSVFDAELSQLQTQVGDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEDIANRSRAEAESWYQT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 KYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEM
::::::.::::::::::::::::.:.::::::::.::: :::::..::.::::::::::.
CCDS88 KYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEISEMNRMIQRLRAEIDSVKKQCSSLQTAIADAEQRGEL
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 ALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNG
:::::. :: ::.::::::::.::::.:::::::.::::::::::::::::::::::.:
CCDS88 ALKDARAKLVDLEEALQKAKQDMARLLREYQELMNIKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSG
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE2 EGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSG-LGLGGGSSYSY--------GSGLGVGGGFSS
:::. :::::: ::.:::::..:..:.: :::::::.::. :.::: :.:::.
CCDS88 EGVSPVNISVVTSTLSSGYGSGSSIGGGNLGLGGGSGYSFTTSGGHSLGAGLG-GSGFSA
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560
pF1KE2 SSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
.:.: :: ::..:..:...:.:::.::: :
CCDS88 TSNR----GL---GGSGSSVKFVSTTSSSQKSYTH
530 540 550
>>CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 (628 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
.. ... .:::. :: . : :: .: .. : . :.:. : :..::::::
CCDS44 MSRQASKTSGGGSQGFSGRSAVVSGSSR--MSCVAHSGGAGGGAYGFRSGAGGFGSRS
10 20 30 40 50
70 80 90
pF1KE2 LYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-------G
::.:::.: ::: ::: :::..::::. :..:: :::. :
CCDS44 LYNLGGNKSISISVAAGGSRAGGFGGGRSSCAFAGGYGGGFGSGYGGGFGGGFGGGRGMG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KE2 SGFG----FGGGAGIG----FGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCP--------PGGIQEVTVN
.::: :::..:.: :: :: : .::::::: : ::::::::.:
CCDS44 GGFGGAGGFGGAGGFGGAGGFGGPGGFGGSGGFGGPGSLGSPGGFGPGGFPGGIQEVTIN
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 QSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQ
:::: :::..::: : .:.:.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.:
CCDS44 QSLLQPLNVEIDPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWNLLQQQ
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KE2 GTKTVR--QNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINK
::... .:::::::..:: :: ::::.::::::::::.::.:::::.:.::::::::
CCDS44 GTSSISGTNNLEPLFENHINYLRSYLDNILGERGRLDSELKNMEDLVEDFKKKYEDEINK
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 RTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVV
::::::::::::::::.:::::::::::.:.: :::.:::.::::::::::.::::::::
CCDS44 RTAAENEFVTLKKDVDSAYMNKVELQAKVDALIDEIDFLRTLYDAELSQMQSHISDTSVV
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 LSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQ
:::::::.::::::::::.::::.:::::.::::. :::: ::: :::::::::::::.
CCDS44 LSMDNNRSLDLDSIIAEVRAQYEDIAQRSKAEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKS
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 EIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQ
:: :.::::::::.::. :::: ::::.:::.:::.::::::::. ::. :. :::.::.
CCDS44 EIIELNRMIQRLRAEIEGVKKQNANLQTAIAEAEQHGEMALKDANAKLQELQAALQQAKD
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 DLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSS----
::::::..:::::::::::::::::::::::::: :..:: . :.::::.:...:
CCDS44 DLARLLRDYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEEYRMSGECPSAVSISVVSSSTTSASAG
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KE2 GYGGASGVGSGLGLGGG--------SSYSYGSGLGVGGGFSS-SSGRATGGGLSSVGGGS
::::. : : : ::::: :... :.: :.::::.. ::: . :.:..:..:.
CCDS44 GYGGGYGGGMGGGLGGGFSAGGGSGSGFGRGGGGGIGGGFGGGSSGFSGGSGFGSISGAR
540 550 560 570 580 590
550 560
pF1KE2 STIKYTTTSSSSRKSYKH
.. ::.: .
CCDS44 YGVSGGGFSSASNRGGSIKFSQSSQSSQRYSR
600 610 620
>>CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 (644 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAG-----
: . . :: : :::..:: . . .: :: :. :: :.:: ..:::.:
CCDS88 MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSS-STRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE2 ---FGSRSLYGLGGSKRISI----GGG-SCAISGGYGSRAGGSYGFGGAG-SGFGFGGGA
:::::: .::::: ::: ::: . ...::::. . :. ::::.: .: :.:::.
CCDS88 GGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFGGGGFGGGGFGGGGIGGGG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 GIGFGLGGGAGLAGGFGGPGF-----PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRA
::: :::. .::::: :. ::::::::::::.::::: :::..::: ::.:..
CCDS88 FGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKS
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 EEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNL
.::::::.:::.:::::::::::::::.::.::: :::. :.: .:::: ::..::::
CCDS88 REREQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNK
::..:.. ....::::::.::::.::: .::::::::::: :::::::.:::::.:::.:
CCDS88 RRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 VELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQY
:.:::: :.: .::.:: :::.::::::::.::.:.:.:::::::.::::::::::::::
CCDS88 VDLQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQY
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQ
:.:::.:.::::: ::.::::::::::::::..::.: ::.:.::.:::::::::.::::
CCDS88 EDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISELNRVIQRLRSEIDNVKKQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 CANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVE
.::: .:.::::::: :::::::::. ::::::.::.::::::..::::::.:::::.:
CCDS88 ISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 IATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSSGYGGASGVGSGLGLG-GGSSY-----
::::: :::::: :..:: . .:..:: : .. . ::. : :.: : : :::::
CCDS88 IATYRTLLEGEESRMSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSRG-GGGGGYGSGGSSYGSGGG
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE2 SYGSGLGVGGGFSS----SSGRATGGG-LSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYKH
::::: : ::: .: .:. ..::: .: :::.. .: . :::
CCDS88 SYGSGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGG
540 550 560 570 580 590
CCDS88 SSGGRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR
600 610 620 630 640
>>CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 (638 aa)
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Smith-Waterman score: 2208; 65.6% identity (81.0% similar) in 588 aa overlap (9-559:8-584)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACG---GAG-F
.: :. .:::. :: . : :: . :.:: :.:: :::: ::: :
CCDS88 MNRQVCKKSFSGRSQGFSGRSAVVSGSSRMS----CVARSGGAGG--GACGFRSGAGSF
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KE2 GSRSLYGLGGSKRISI------------GGG--SCAISGGYGSRAGGSYG--FGGA-GSG
::::::.::..: ::: ::: ::...::::. ::::: :::. : :
CCDS88 GSRSLYNLGSNKSISISVAAGSSRAGGFGGGRSSCGFAGGYGGGFGGSYGGGFGGGRGVG
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 FGFGGGAGIGFGLGG--GAGLAGG---FGGPG-F-PVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQI
::::..:.: : :: : :. :: ::::: : : ::::::: :::::: :::..:
CCDS88 SGFGGAGGFG-GAGGFGGPGVFGGPGSFGGPGGFGPGGFPGGIQEVIVNQSLLQPLNVEI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEP
:: : .:.:.:::::::::::::::::::::::::::::.::: :::.: : . ..:::
CCDS88 DPQIGQVKAQEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWELLQQQTTGSGPSSLEP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKK
::.::. : .:::...:::: :..::..:::::::.:.::::::::::::::::: :::
CCDS88 CFESYISFLCKQLDSLLGERGNLEGELKSMQDLVEDFKKKYEDEINKRTAAENEFVGLKK
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 DVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDS
:::::.:::::::::.:.::::..:::.::. ::::::.: ::::::::::::: ::: :
CCDS88 DVDAAFMNKVELQAKVDSLTDEVSFLRTLYEMELSQMQSHASDTSVVLSMDNNRCLDLGS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 IIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEIAEINRMIQRLR
:::::.::::::::::..:::. :::: ::: :::::::::::::.:: :.::::::::
CCDS88 IIAEVRAQYEEIAQRSKSEAEALYQTKLGELQTTAGRHGDDLRNTKSEIMELNRMIQRLR
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 SEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDLARLLKEYQELM
.::..:::: ::::.:::.::::::::::::. ::. :. ::::::.::::::..:::::
CCDS88 AEIENVKKQNANLQTAIAEAEQRGEMALKDANAKLQDLQTALQKAKDDLARLLRDYQELM
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KE2 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVS-SG--------YGGASGV
:::::::::::::::::::::::..:: . : ::::....: :: .::.::
CCDS88 NVKLALDVEIATYRKLLEGEECRMSGECQSAVCISVVSNVTSTSGSSGSSRGVFGGVSGS
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 GSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYTTTSSSSRKSYK
::: : :::: : .:: ::.:: .:. : ...: :.:: .:. .: ..::.::
CCDS88 GSG-GYKGGSSSSSSSGYGVSGGSGSGYGGVSSG---STGGRGSSGSYQSSSSGSRLGGA
540 550 560 570 580
pF1KE2 H
CCDS88 GSISVSHSGMGSSSGSIQTSGGSGYKSGGGGSTSIRFSQTTSSSQHSSTK
590 600 610 620 630
>>CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 (520 aa)
initn: 1961 init1: 1865 opt: 2028 Z-score: 1188.4 bits: 229.6 E(32554): 7.1e-60
Smith-Waterman score: 2118; 67.1% identity (86.1% similar) in 517 aa overlap (16-531:13-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MASTSTTIRSHSSSRRGFSANSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRS
:::: .:: . : .:..:::.:.: :: .: :...::::::
CCDS41 MIARQQCVRGGPRGFSCGSAIVGGGKRGAFSSVSMS-----GG-AGRCSSGGFGSRS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYGSRAGGSYGFGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAG
::.: :.: ::. : : ::: :. ::::: ::: :: :: :: .: .
CCDS41 LYNLRGNKSISM---SVA-----GSRQGAC--FGGAG-GFGTGG-----FG-GGFGGSFS
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDK
: ::::::::: :::::::.::::::::...::: ::.::.::::::: :::::::::::
CCDS41 GKGGPGFPVCPAGGIQEVTINQSLLTPLHVEIDPEIQKVRTEEREQIKLLNNKFASFIDK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 VRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELR
:.:::::::::.:::.:::.: : : .::::::: :.. ::.:::.. ...:::.:::.
CCDS41 VQFLEQQNKVLETKWNLLQQQTTTTSSKNLEPLFETYLSVLRKQLDTLGNDKGRLQSELK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 NMQDLVEDLKNKYEDEINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRA
.::: :::.:.:::.::::::::::.::.:::::::::.:::::.::.:.:.::::::..
CCDS41 TMQDSVEDFKTKYEEEINKRTAAENDFVVLKKDVDAAYLNKVELEAKVDSLNDEINFLKV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LYDAELSQMQTHISDTSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]