FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2123, 914 aa
1>>>pF1KE2123 914 - 914 aa - 914 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.4617+/-0.00133; mu= -15.9298+/- 0.080
mean_var=463.4254+/-95.893, 0's: 0 Z-trim(112.5): 51 B-trim: 138 in 1/50
Lambda= 0.059578
statistics sampled from 13188 (13229) to 13188 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.406), width: 16
Scan time: 4.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 914) 6057 535.9 1.3e-151
CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 913) 5641 500.1 7.5e-141
CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 859) 5624 498.7 2e-140
CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 885) 4891 435.7 1.9e-121
CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 ( 902) 4891 435.7 1.9e-121
CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 768) 1750 165.7 3.1e-40
CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 ( 803) 1750 165.7 3.2e-40
CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 ( 777) 1001 101.3 7.5e-21
CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 716) 989 100.2 1.4e-20
CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 ( 710) 985 99.9 1.8e-20
CCDS13811.1 RGL4 gene_id:266747|Hs108|chr22 ( 473) 830 86.4 1.3e-16
>>CCDS6959.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (914 aa)
initn: 6057 init1: 6057 opt: 6057 Z-score: 2835.4 bits: 535.9 E(32554): 1.3e-151
Smith-Waterman score: 6057; 100.0% identity (100.0% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-914)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE2 RMKQKGLKIAKGIF
::::::::::::::
CCDS69 RMKQKGLKIAKGIF
910
>>CCDS65173.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (913 aa)
initn: 5628 init1: 5628 opt: 5641 Z-score: 2642.2 bits: 500.1 E(32554): 7.5e-141
Smith-Waterman score: 5641; 95.1% identity (96.6% similar) in 913 aa overlap (7-914:2-913)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCP--VVLHSFTQLDPDLP
:. :: . :.: : .:.. . : . .. . ..:.: : ::
CCDS65 MAREAGQVC-ARPAVPRGRKGSVFFACVSVVTARRRAVARRAALQSPTPWLAPLP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 RP---ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRT
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APATTESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 VKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 YGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 DLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 APTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 APVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIW
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 SQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKE
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 GTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKR
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 RKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE2 LRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE2 SSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTH
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE2 KRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDK
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE2 HNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGA
840 850 860 870 880 890
900 910
pF1KE2 SSTLPRMKQKGLKIAKGIF
:::::::::::::::::::
CCDS65 SSTLPRMKQKGLKIAKGIF
900 910
>>CCDS43897.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (859 aa)
initn: 5624 init1: 5624 opt: 5624 Z-score: 2634.7 bits: 498.7 E(32554): 2e-140
Smith-Waterman score: 5624; 99.9% identity (100.0% similar) in 854 aa overlap (61-914:6-859)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 DAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGG
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MMVDCQSSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGG
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 NKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSE
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 DFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPT
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 PELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPA
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 PALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLV
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 AEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLG
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 NRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFR
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 IFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTF
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 LTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAV
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 ERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCD
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 QLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETS
640 650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KE2 GISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDN
700 710 720 730 740 750
820 830 840 850 860 870
pF1KE2 GNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAM
760 770 780 790 800 810
880 890 900 910
pF1KE2 NSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
820 830 840 850
>>CCDS65174.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (885 aa)
initn: 4891 init1: 4891 opt: 4891 Z-score: 2294.0 bits: 435.7 E(32554): 1.9e-121
Smith-Waterman score: 5521; 97.0% identity (97.6% similar) in 873 aa overlap (43-914:26-885)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 AGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDP-DLPRPESSTQEIGEEL
: . :. : : ..:: .::::::::::
CCDS65 MCLWGHSTAPAHTLSSPPLLFCSLPCALHLQPGTGHPPGQVPR-KSSTQEIGEEL
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 INGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 INGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPA
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 FQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQD
:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS65 FQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYG------------CILPYSDEDGGPQD
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 QLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHS
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 EPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAP
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 APELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVA
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 ENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIR
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 ATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQS
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 NSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQ
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 KRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSA
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 CNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 CNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDR
590 600 610 620 630 640
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 QAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESP
650 660 670 680 690 700
740 750 760 770 780 790
pF1KE2 DGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPL
710 720 730 740 750 760
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 YNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 YNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQI
770 780 790 800 810 820
860 870 880 890 900 910
pF1KE2 LSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAK
830 840 850 860 870 880
pF1KE2 GIF
:::
CCDS65 GIF
>>CCDS65172.1 RALGDS gene_id:5900|Hs108|chr9 (902 aa)
initn: 4891 init1: 4891 opt: 4891 Z-score: 2293.9 bits: 435.7 E(32554): 1.9e-121
Smith-Waterman score: 5942; 98.7% identity (98.7% similar) in 914 aa overlap (1-914:1-902)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MVQRMWAEAAGPAGGAEPLFPGSRRSRSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQRWLGYENESALNLYETCKVRTVKAGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS65 LEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYG------------CIL
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 AHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPA
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPS
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDK
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKF
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ATLEMNPKRAQKRPKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFE
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKK
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVE
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVS
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 GLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEE
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLP
830 840 850 860 870 880
910
pF1KE2 RMKQKGLKIAKGIF
::::::::::::::
CCDS65 RMKQKGLKIAKGIF
890 900
>>CCDS72992.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 (768 aa)
initn: 1881 init1: 751 opt: 1750 Z-score: 835.8 bits: 165.7 E(32554): 3.1e-40
Smith-Waterman score: 2153; 45.0% identity (68.0% similar) in 871 aa overlap (62-906:10-757)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 AVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGN
:: :. :::. .:..: ..:..::.....:
CCDS72 MKLLWQAKMSSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQIQQAAN
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KE2 KGQRWLGYENES-----ALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCT
:: :::: :... ... :::::.::.::::::::::.:. :: .:..:..::: :
CCDS72 KGARWLGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLLTAFGDNDFTYISIFLST
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 YRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQ-----LKNAISSIL
::.:..:..::.::. ::: ::. : .:::. ... ..:::.:::
CCDS72 YRGFASTKEVLELLLDRYGN---LTS--------PNCEEDGSQSSSESKMVIRNAIASIL
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 GTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEAL
.:::: .::: .:: ::::..:. :. ::::: ::::. :: :....: .:..
CCDS72 RAWLDQCAEDFREPPHFPCLQKLLDYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQE-VETDN---
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 SPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEP
CCDS72 ------------------------------------------------------------
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 AVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPH
:: .. . .:: : ::: .: : :
CCDS72 --GLPNTISFSLEEEE------------ELE--------------------GGESAE---
210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 LLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVA
. : ::::::.: :::.:::::::.:::: :::.:::: ..:::::::::..:::...
CCDS72 FTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQFNTLT
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 NCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTW
.::..: ::.. :. .::...:.::..:.:::.::::::: ::.::::::::.::::::
CCDS72 KCVVSTILGGKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYRLKKTW
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550
pF1KE2 EDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEM----NPKRAQKR---P
: :: . .:..::.::::.::. :::::.::::::::.:. : ::.:.:
CCDS72 AAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQRRLQLQ
350 360 370 380 390 400
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 KETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNN
:. :..::::::::::::::.:::::..::. : ::::::::.::::::::::::::::.
CCDS72 KDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQSACNS
410 420 430 440 450 460
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 YSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAP
: ..::..: ::. . :.: ::: ::::.: ....... . .:. .::: :
CCDS72 YCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRKS--MVKRLSLLFLG
470 480 490 500 510 520
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 STELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQ
: .. : . . .: . :::. :..:: : :. :..:: .:. . ..::
CCDS72 SDMIT----SPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPM-DTPDEP
530 540 550 560 570 580
740 750 760 770 780
pF1KE2 EKKFWESASQSSP------ETSGISSASSSTSSS-SASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSS
.::. ::.:. : ..::.:: . :: : ...: . :::::: .:.
CCDS72 QKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNP----KIHKRSVSVTSITST
590 600 610 620 630
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 ALP-LYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDY
.:: .:::: : ::::.:.. .::::::::..:::::.::::..:: ::::. . :.:
CCDS72 VLPPVYNQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSDPAEEY
640 650 660 670 680 690
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 ELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR-TFTKGVKVKHGASSTLPRMKQK
::.:..:.:..: ::..::::::::: .:.::.:.:. .. . ::.. .: :::: ..
CCDS72 ELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLPRTAKR
700 710 720 730 740 750
910
pF1KE2 GLKIAKGIF
:
CCDS72 GCWSNRHSKITL
760
>>CCDS1359.1 RGL1 gene_id:23179|Hs108|chr1 (803 aa)
initn: 1749 init1: 751 opt: 1750 Z-score: 835.5 bits: 165.7 E(32554): 3.2e-40
Smith-Waterman score: 2161; 45.0% identity (67.8% similar) in 876 aa overlap (57-906:40-792)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 RSVWDAVRLEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQL
: ::: :. :::. .:..: ..:..::.
CCDS13 TQEVSKFKLSTKVESTGHWLVEDHVRIWEVLKTEESSIQDWGEEVEEGAVYHVTLKRVQI
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 HHGGNKGQRWLGYENES-----ALNLYETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVT
....::: :::: :... ... :::::.::.::::::::::.:. :: .:..:..
CCDS13 QQAANKGARWLGVEGDQLPPGHTVSQYETCKIRTIKAGTLEKLVENLLTAFGDNDFTYIS
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190
pF1KE2 IFLCTYRAFTTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGCILPYSDEDGGPQDQ-----LKNA
::: :::.:..:..::.::. ::: ::. : .:::. ... ..::
CCDS13 IFLSTYRGFASTKEVLELLLDRYGN---LTS--------PNCEEDGSQSSSESKMVIRNA
130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 ISSILGTWLDQYSEDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEA
:.::: .:::: .::: .:: ::::..:. :. ::::: ::::. :: :....: .:.
CCDS13 IASILRAWLDQCAEDFREPPHFPCLQKLLDYLTRMMPGSDPERRAQNLLEQFQKQE-VET
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 EPEALSPVPALKPTPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQ
.
CCDS13 DN----------------------------------------------------------
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 QAPEPAVGLESAPAPALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLS
:: .. . .:: : ::: .: :
CCDS13 -------GLPNTISFSLEEEE------------ELE--------------------GGES
240 250 260
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 EEKPHLLVFPPDLVAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQ
: . : ::::::.: :::.:::::::.:::: :::.:::: ..:::::::::..:
CCDS13 AE---FTCFSEDLVAEQLTYMDAQLFKKVVPHHCLGCIWSRRDKKENKHLAPTIRATISQ
270 280 290 300 310
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 FNSVANCVITTCLGNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHR
::....::..: ::.. :. .::...:.::..:.:::.::::::: ::.::::::::.:
CCDS13 FNTLTKCVVSTILGGKELKTQQRAKIIEKWINIAHECRLLKNFSSLRAIVSALQSNSIYR
320 330 340 350 360 370
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 LKKTWEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEM----NPKRAQK
::::: : :: . .:..::.::::.::. :::::.::::::::.:. : ::.:.
CCDS13 LKKTWAAVPRDRMLMFEELSDIFSDHNNHLTSRELLMKEGTSKFANLDSSVKENQKRTQR
380 390 400 410 420 430
560 570 580 590 600
pF1KE2 R---PKETGIIQGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQ
: :. :..::::::::::::::.:::::..::. : ::::::::.::::::::::::
CCDS13 RLQLQKDMGVMQGTVPYLGTFLTDLTMLDTALQDYIEGGLINFEKRRREFEVIAQIKLLQ
440 450 460 470 480 490
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 SACNNYSIAPDEQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWS
::::.: ..::..: ::. . :.: ::: ::::.: ....... . .: ..::: :
CCDS13 SACNSYCMTPDQKFIQWFQRQQLLTEEESYALSCEIEAAADASTTSPKPRK--SMVKRLS
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DRQAPSTELSTSGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPE
: .. : . . .: . :::. :..:: : :. :..:: .:. . .
CCDS13 LLFLGSDMIT----SPTPTKEQPKSTASGSSGESMDSVSVSSCESNHSEAEEGSITPM-D
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 SPDGQEKKFWESASQSSP------ETSGISSASSSTSSS-SASTTPVAATRTHKRSVSGL
.:: .::. ::.:. : ..::.:: . :: : ...: . ::::::
CCDS13 TPDEPQKKLSESSSSCSSIHSMDTNSSGMSSLINPLSSPPSCNNNP----KIHKRSVSVT
620 630 640 650 660
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 CNSSSALP-LYNQQVGDCCIIRVSLDVDNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEE
.:..:: .:::: : ::::.:.. .::::::::..:::::.::::..:: ::::. .
CCDS13 SITSTVLPPVYNQQNEDTCIIRISVEDNNGNMYKSIMLTSQDKTPAVIQRAMLKHNLDSD
670 680 690 700 710 720
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 EPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR-TFTKGVKVKHGASSTLP
:.:::.:..:.:..: ::..::::::::: .:.::.:.:. .. . ::.. .: :::
CCDS13 PAEEYELVQVISEDKELVIPDSANVFYAMNSQVNFDFILRKKNSMEEQVKLRSRTSLTLP
730 740 750 760 770 780
910
pF1KE2 RMKQKGLKIAKGIF
: ..:
CCDS13 RTAKRGCWSNRHSKITL
790 800
>>CCDS4774.1 RGL2 gene_id:5863|Hs108|chr6 (777 aa)
initn: 1296 init1: 353 opt: 1001 Z-score: 487.8 bits: 101.3 E(32554): 7.5e-21
Smith-Waterman score: 1267; 39.0% identity (67.2% similar) in 589 aa overlap (363-914:220-777)
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 LELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDLVAE
:. :.:.. . . .::: : .::
CCDS47 LQTGYAAGKGVGGGSADLIRNLRSRVDPQAPDLPKPLALPGDPPADPTDVLVFLADHLAE
190 200 210 220 230 240
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCLGNR
:.::.::::: ...: .:::..:..::. :. :: :..::::::::.::. :... ::
CCDS47 QLTLLDAELFLNLIPSQCLGGLWGHRDRPGHSHLCPSVRATVTQFNKVAGAVVSSVLGAT
250 260 270 280 290 300
460 470 480 490 500
pF1KE2 ST------------KAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKT
:: . :.:::..:.::.::.:::.:.::::.::..:::::. ::::. .
CCDS47 STGEGPGEVTIRPLRPPQRARLLEKWIRVAEECRLLRNFSSVYAVVSALQSSPIHRLRAA
310 320 330 340 350 360
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 WEDVSRDSFRIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMNPKRAQKRPKETGII
: ...:::.:.:..: .:::.:.::: :::::..: . . :: . :.: . .. :
CCDS47 WGEATRDSLRVFSSLCQIFSEEDNYSQSRELLVQEVKLQ-SPLEPHSKKAPRSGSRGG--
370 380 390 400 410 420
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 QGTVPYLGTFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPD
:.:::::::: ::::::.: :: : . :::.:::::: :..... ::. : .:.. ::
CCDS47 -GVVPYLGTFLKDLVMLDAASKDELENGYINFDKRRKEFAVLSELRRLQNECRGYNLQPD
430 440 450 460 470 480
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 EQFGAWFRAVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELST
... :..... :.:..:. .:::.:::. : . :. . : ....:.. . :.
CCDS47 HDIQRWLQGLRPLTEAQSHRVSCEVEPPGSSDPPAPRVLRPTLVISQWTEVLG-----SV
490 500 510 520 530 540
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 SGSSHSKSCDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWE
. . :::. : :: : . . .. .. ..: . .
CCDS47 GVPTPLVSCDRPSTG-----GDEAPTTPAPLLTRLAQHMKWPSVSSL------------D
550 560 570 580
750 760 770 780 790
pF1KE2 SASQSSPETSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRS------VSGLCNSSSALPLYNQ
:: .::: .. : .. . : ...: .: :.:: .:: . .:. :.
CCDS47 SALESSP---SLHSPADPSHLSPPASSP-RPSRGHRRSASCGSPLSGGAEEASGGTGYGG
590 600 610 620 630
800 810 820 830 840
pF1KE2 Q-----VGDCCIIRVSLDV-DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYEL
. ..:: ::::.... ..:..:::::::::::::.:: ... :.: . .:::
CCDS47 EGSGPGASDCRIIRVQMELGEDGSVYKSILVTSQDKAPSVISRVLKKNNRDSAVASEYEL
640 650 660 670 680 690
850 860 870 880 890
pF1KE2 LQILSDDRKLKIPENANVFYAMNSTANYDFVLKKR----TFTKGVKVKHGASST------
.:.: .:.: :: .:::::::.. :..::.:..: : : :: .::.:
CCDS47 VQLLPGERELTIPASANVFYAMDG-ASHDFLLRQRRRSSTATPGVTSGPSASGTPPSEGG
700 710 720 730 740 750
900 910
pF1KE2 ---LPRMKQKGLKIAKGIF
.::.: : :::...:
CCDS47 GGSFPRIKATGRKIARALF
760 770
>>CCDS54221.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (716 aa)
initn: 1551 init1: 617 opt: 989 Z-score: 482.7 bits: 100.2 E(32554): 1.4e-20
Smith-Waterman score: 1362; 36.6% identity (58.1% similar) in 829 aa overlap (65-887:15-708)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQ
:. ::: .:..::.:::. : . . ..
CCDS54 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRR-QRSQRRSPAE
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RWLGYENESAL-NL---YETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
: . : . : :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: :.. :: :::.:
CCDS54 GPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTF
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200
pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYS
. : .: .:. . : : . .: . . .:. :. :.::.::...
CCDS54 VPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-AVVSVLGSWLQDHP
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 EDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKP
.:: . : : .. ... ::: ..:. :: .. . ::: :
CCDS54 QDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ---------
160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 TPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAP
: :: :.. .: : :
CCDS54 ----------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV------
210
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 APALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDL
: .:: :.. : :.:: . :.:: : :
CCDS54 --------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLLDFSVDE
220 230 240 250
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 VAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCL
::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::.:..::. . :
CCDS54 VAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVL
260 270 280 290 300 310
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 GNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSF
: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..: :::. .
CCDS54 GAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPL
320 330 340 350 360 370
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQGTVPYLG
:.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: : :::::
CCDS54 STFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----GPVPYLG
380 390 400 410 420
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 TFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFR
::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:...: . : ..
CCDS54 TFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALH
430 440 450 460 470 480
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 AVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKS
: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : : :::
CCDS54 AQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS-----
490 500 510 520 530 540
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 CDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPE
: :: :: .. :. : : :: .. . :...:
CCDS54 -------P----GD----------PSSPTSSLCISPSVSPGSPPSSPR------SRDAP-
550 560 570
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 TSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDV
.: :: . .. : . :.. : . : .: .:: :: .. .::::.:
CCDS54 -AGSPPASPGPQGPS-TKLPLSLDLPSPRPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDN
580 590 600 610 620
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFY
:.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :: : ::.::::::
CCDS54 DHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFY
630 640 650 660 670 680
870 880 890 900 910
pF1KE2 AMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
::. .: ::.:... :.
CCDS54 AMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
690 700 710
>>CCDS32910.1 RGL3 gene_id:57139|Hs108|chr19 (710 aa)
initn: 1544 init1: 617 opt: 985 Z-score: 480.9 bits: 99.9 E(32554): 1.8e-20
Smith-Waterman score: 1358; 36.4% identity (57.7% similar) in 829 aa overlap (65-887:15-702)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 LEVGVPDSCPVVLHSFTQLDPDLPRPESSTQEIGEELINGVIYSISLRKVQLHHGGNKGQ
:. ::: .:..::.:::. : . . ..
CCDS32 MERTAGKELALAPLQDWGEETEDGAVYSVSLRR-QRSQRRSPAE
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RWLGYENESAL-NL---YETCKVRTVKAGTLEKLVEHLVPAFQGSDLSYVTIFLCTYRAF
: . : . : :.: :::...:. ::.:: .:: . . .: :.. :: :::.:
CCDS32 GPGGSQAPSPIANTFLHYRTSKVRVLRAARLERLVGELVFGDREQDPSFMPAFLATYRTF
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200
pF1KE2 TTTQQVLDLLFKRYGRCDALTASSRYGC-ILPYSDEDGGPQDQLKNAISSILGTWLDQYS
. : .: .:. . : : . .: . . .:. :. :.::.::...
CCDS32 VPTACLLGFLLP------PMPPPPPPGVEIKKTAVQDLSFNKNLR-AVVSVLGSWLQDHP
110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 EDFCQPPDFPCLKQLVAYVQLNMPGSDLERRAHLLLAQLEHSEPIEAEPEALSPVPALKP
.:: . : : .. ... ::: ..:. :: .. . ::: :
CCDS32 QDFRDHPAHSDLGSVRTFLGWAAPGSAEAQKAEKLLEDFLE----EAEREQ---------
160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 TPELELALTPARAPSPVPAPAPEPEPAPTPAPGSELEVAPAPAPELQQAPEPAVGLESAP
: :: :.. .: : :
CCDS32 ----------------------EEEP-----------------PQVWTGP-PRV------
210
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 APALELEPAPEQDPAPSQTLELEPAPAPVPSLQPSWPSPVVAENGLSEEKPHLLVFPPDL
: .:: :.. : :.:: . :.:: : :
CCDS32 --------AQTSDPDSSEACAEE-------------------EEGLMPQGPQLLDFSVDE
220 230 240 250
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 VAEQFTLMDAELFKKVVPYHCLGSIWSQRDKKGKEHLAPTIRATVTQFNSVANCVITTCL
::::.::.: :::.:: :.::::.:::::. : .::.::::.:::.:..::. . :
CCDS32 VAEQLTLIDLELFSKVRLYECLGSVWSQRDRPGAAGASPTVRATVAQFNTVTGCVLGSVL
260 270 280 290 300 310
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 GNRSTKAPDRARVVEHWIEVARECRILKNFSSLYAILSALQSNSIHRLKKTWEDVSRDSF
: . ::.::. .:.::..:..:: :.::::: ::::::::: :.:::..: :::. .
CCDS32 GAPGLAAPQRAQRLEKWIRIAQRCRELRNFSSLRAILSALQSNPIYRLKRSWGAVSREPL
320 330 340 350 360 370
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RIFQKLSEIFSDENNYSLSRELLIKEGTSKFATLEMN-PKRAQKRPKETGIIQGTVPYLG
:.:::.:::::::. :::.:..: ... . : : : ..: : :::::
CCDS32 STFRKLSQIFSDENNHLSSREILFQEEATEGSQEEDNTPGSLPSKPPP-----GPVPYLG
380 390 400 410 420
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 TFLTDLVMLDTAMKDYLYGRLINFEKRRKEFEVIAQIKLLQSACNNYSIAPDEQFGAWFR
::::::::::::. :.: : ::::::::::.:..:.:. :: :..:...: . : ..
CCDS32 TFLTDLVMLDTALPDMLEGDLINFEKRRKEWEILARIQQLQRRCQSYTLSPHPPILAALH
430 440 450 460 470 480
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 AVERLSETESYNLSCELEPPSESASNTLRTKKNTAIVKRWSDRQAPSTELSTSGSSHSKS
: ..:.: .:: :: .:::. : .. : .. ...:: : . : : :::
CCDS32 AQNQLTEEQSYRLSRVIEPPAASCPSSPRIRRRISLTKRLSAKLAREKSSSPSGS-----
490 500 510 520 530 540
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 CDQLRCGPYLSSGDIADALSVHSAGSSSSDVEEINISFVPESPDGQEKKFWESASQSSPE
: :: .. : : :: : :: ... . . : :
CCDS32 -------P----GDPSSPTSSVSPGSP------------PSSPRSRD-----APAGSPPA
550 560 570
750 760 770 780 790 800
pF1KE2 TSGISSASSSTSSSSASTTPVAATRTHKRSVSGLCNSSSALPLYNQQVGDCCIIRVSLDV
. : .. :.. : .: : . : .: .:: :: .. .::::.:
CCDS32 SPGPQGPSTKLPLSLDLPSP--------RPFA-LPLGSPRIPLPAQQSSEARVIRVSIDN
580 590 600 610 620
810 820 830 840 850 860
pF1KE2 DNGNMYKSILVTSQDKAPAVIRKAMDKHNLEEEEPEDYELLQILSDDRKLKIPENANVFY
:.::.:.:::.:::::::.:.:.:..:::. . ::.:.:.: :: : ::.::::::
CCDS32 DHGNLYRSILLTSQDKAPSVVRRALQKHNVPQPWACDYQLFQVLPGDRVLLIPDNANVFY
630 640 650 660 670 680
870 880 890 900 910
pF1KE2 AMNSTANYDFVLKKRTFTKGVKVKHGASSTLPRMKQKGLKIAKGIF
::. .: ::.:... :.
CCDS32 AMSPVAPRDFMLRRKEGTRNTLSVSPS
690 700 710
914 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 10:57:39 2016 done: Tue Nov 8 10:57:40 2016
Total Scan time: 4.510 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]