Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2115
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2115, 304 aa
1>>>pF1KE2115 304 - 304 aa - 304 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1049+/-0.000744; mu= 12.5621+/- 0.045
mean_var=92.2330+/-18.732, 0's: 0 Z-trim(110.6): 73 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.133546
statistics sampled from 11641 (11721) to 11641 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 1856 367.3 9.3e-102
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 1819 360.2 1.3e-99
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 1610 320.0 2.1e-87
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 1595 317.1 1.6e-86
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1145 230.4 2e-60
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 1099 221.4 6.2e-58
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1040 210.1 2.3e-54
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 948 192.3 4.3e-49
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 666 138.2 1.6e-32
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 666 138.2 1.6e-32
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 640 133.2 5.2e-31
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 598 125.1 1.4e-28
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 598 125.1 1.4e-28
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 596 124.6 1.5e-28
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 596 124.7 1.9e-28
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 596 124.7 1.9e-28
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 560 117.7 1.8e-26
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 560 117.7 1.9e-26
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 560 117.7 2.1e-26
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 558 117.3 2.8e-26
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 553 116.3 4.7e-26
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 543 114.4 1.8e-25
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 539 113.6 3e-25
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 532 112.3 7.7e-25
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 532 112.3 8.9e-25
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 532 112.3 8.9e-25
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 528 111.5 1.2e-24
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 528 111.5 1.3e-24
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 494 104.8 8.2e-23
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 468 99.8 2.6e-21
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 445 95.4 5.5e-20
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 428 92.1 5.6e-19
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 428 92.1 5.6e-19
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 399 86.5 2.6e-17
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 367 80.4 2.1e-15
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 367 80.6 3.5e-15
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 338 74.8 9.7e-14
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 322 71.7 7.2e-13
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 312 69.7 2.8e-12
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 312 69.8 2.8e-12
CCDS12874.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 252) 296 66.6 2.2e-11
CCDS12875.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 263) 286 64.7 8.6e-11
CCDS12873.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 267) 286 64.7 8.7e-11
>>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa)
initn: 1856 init1: 1856 opt: 1856 Z-score: 1940.4 bits: 367.3 E(32554): 9.3e-102
Smith-Waterman score: 1856; 88.2% identity (94.1% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:::::. :.::::::::::::.::::::::.:: :: :::::::::::::::: :.::::
CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM
::::::..::::::::::::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::::::.
CCDS33 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSINGT
:: :::::::::::::::: :::.::::::::::::::::::::::::::. : ..:::
CCDS33 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS33 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSETGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQE
::::::::::::: : : .:::::::::: .::::.::::::::::::: ::::::: ::
CCDS33 PRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQE
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VSYA
:.::
CCDS33 VTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
310 320 330 340
>>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa)
initn: 2040 init1: 1580 opt: 1819 Z-score: 1901.7 bits: 360.2 E(32554): 1.3e-99
Smith-Waterman score: 1819; 88.1% identity (94.4% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:::.:. ::::::::::::::.::::::::.:: ::.:::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM
:::: ::.::.::::::::::::::::. : ::::::::::: :::::.::::::::.
CCDS12 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSINGT
:::::::::::::: :::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:::
CCDS12 VIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
::::::::::::::::::::::.:.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 PRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQE
:::::.::::::: : : ::::::::::::.:::::::::: :::::.::::::::: ::
CCDS12 PRHLHILIGTSVVIILF-ILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQE
250 260 270 280 290
pF1KE2 VSYA
:.:
CCDS12 VTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
300 310 320 330 340
>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 (444 aa)
initn: 1610 init1: 1610 opt: 1610 Z-score: 1682.6 bits: 320.0 E(32554): 2.1e-87
Smith-Waterman score: 1610; 82.2% identity (91.5% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-399)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV
: :::::.:: :: :::: : ::::::::.
CCDS42 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
:::::.::.:: .. .:.:. ::::::::::::::: .::::::::::: :.::::::
CCDS42 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PSDPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::.:. : :::::::::::: :::::.:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS42 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
::..: :::::::::::::::::::::::: .:::::. :::::::::::::.:::::::
CCDS42 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
::::.:::::::.::::::: : : .::::::: :::.::::::::::::::::.:::::
CCDS42 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS
330 340 350 360 370 380
300
pF1KE2 DEQDHQEVSYA
:::: .::.::
CCDS42 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
390 400 410 420 430 440
>>CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (455 aa)
initn: 1595 init1: 1595 opt: 1595 Z-score: 1666.8 bits: 317.1 E(32554): 1.6e-86
Smith-Waterman score: 1595; 83.3% identity (91.1% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-399)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV
: :::::.:: :: :.:: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
:::::.::::: .. .:.:. :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS12 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PSDPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::: :
CCDS12 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
: ..: :::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::::::.:::::::
CCDS12 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
::::.: :::::::::::: . : .::::::.::::.:::::::::::::.:::: .::
CCDS12 PSSKSGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
330 340 350 360 370 380
300
pF1KE2 DEQDHQEVSYA
:::: :::.::
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
390 400 410 420 430 440
>--
initn: 379 init1: 176 opt: 332 Z-score: 351.7 bits: 73.7 E(32554): 2.9e-13
Smith-Waterman score: 332; 44.3% identity (63.1% similar) in 122 aa overlap (1-122:1-117)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
::: :. :::::::::::::: : . :: . : :. .: : ::: :..:.:
CCDS12 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM
..: . . . : . . .: .::. :. :::::: :: ::: ::::.:: .
CCDS12 YKEDRSHVPIF-----HGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSINGT
..
CCDS12 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
>>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 1145 init1: 1145 opt: 1145 Z-score: 1198.5 bits: 230.4 E(32554): 2e-60
Smith-Waterman score: 1436; 77.9% identity (85.1% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-382)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV
: :::::.:: :: :.:: :::::::::::
CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
:::::.::::: .. .:.:. :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PSDPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::: :
CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
: ..: :::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::::
CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGIC---------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
:::::::::::: . : .::::::.::::.:::::::::::::.:::: .::
CCDS58 --------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
320 330 340 350 360 370
300
pF1KE2 DEQDHQEVSYA
:::: :::.::
CCDS58 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 379 init1: 176 opt: 332 Z-score: 351.9 bits: 73.7 E(32554): 2.8e-13
Smith-Waterman score: 332; 44.3% identity (63.1% similar) in 122 aa overlap (1-122:1-117)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
::: :. :::::::::::::: : . :: . : :. .: : ::: :..:.:
CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM
..: . . . : . . .: .::. :. :::::: :: ::: ::::.:: .
CCDS58 YKEDRSHVPIF-----HGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSINGT
..
CCDS58 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHF
:: :::.::.:::: :..: . : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPL
:... . : .. . .: :.:. :. :::::: : :::: . ::::.::
CCDS42 TLYKKDGVP-----VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSIN
... ::::::::.:.:::::.:::::::::::.::.:.::::::::::: ::::: :::
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
::::::::::::::: ::::::::. .:::::. :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH
: ::::..: ::. : :::: ::::::::: ::
CCDS42 GIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKKKMLL
240 250 260 270
300
pF1KE2 QEVSYA
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV
:::::::.:: :: :::: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV
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60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
::.::::::: .. :.:.:. ::. :..:.:.::: :.:::::::.::: : ::.:::
CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 PSDPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPA
::::::.:..::: :::::::::::::::::::::::::: .:.::::::.:: : :: :
CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
: .::::::.:::::.::::.:::::::: :. ::. :::: ::::::
CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS---------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
:.:::::::::: :::.:::::::::::..::::.::::::::::::: :::
CCDS12 --------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
320 330 340 350 360 370
300
pF1KE2 DEQDHQEVSYA
:::: :::.::
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTSV
380 390 400 410
>--
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Smith-Waterman score: 345; 44.3% identity (67.2% similar) in 122 aa overlap (1-122:1-117)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:::::. :::::::::.: ::. : . :: . : :: .:. . : ::: : . :..: :
CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 HREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPLDM
.: . . : .. . . .: .::. :. :::::: .: :::: ::::.:. .
CCDS12 SKEDGMP-----VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSINGT
..
CCDS12 MVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAG
120 130 140 150 160 170
>>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHF
:: :::.::.:::: :..: . : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LLHREGKFNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPSDPL
:... . : .. . .: :.:. :. :::::: : :::: . ::::.::
CCDS42 TLYKKDGVP-----VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAVRSIN
... ::::::::.:.:::::.:::::::::::.::.:.::::::::::: ::::: :::
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
::::::::::::::: ::::::::. .:::::. :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH
.::::.:::::.:::: :::::::
CCDS42 -----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDP
240 250 260
300
pF1KE2 QEVSYA
:::.::
CCDS42 QEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGS
270 280 290 300 310 320
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10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV
:: ::::.:.: : .. ... ::: :::
CCDS33 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLS
...:.:..::. . :. :.. . :.:.:::..::. .: :::::. : . :
CCDS33 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 APSDPLDMVIIG-LYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRL
:::::::..: : .:. :::::::::: .:::.:: :.::. .: . :..:: ::
CCDS33 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHP---
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KE2 PA-VRSINGT--FQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSN
: .::. :. .::.::..:.: :.:::::.:: . :. : :.:: . :.:. ..
CCDS33 PLRLRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGG
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270
pF1KE2 SWPSPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSDKKNAAVM
: :: : : : :.:.::::.::. . . .::.::: :: ::....
CCDS33 SSLPPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHR-TSDQRKTDF-
430 440 450 460 470 480
280 290 300
pF1KE2 DQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQEVSYA
:.::: .. .:
CCDS33 -QRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQSPHDEDPQAV
490 500 510 520 530 540
>--
initn: 312 init1: 199 opt: 426 Z-score: 447.5 bits: 91.9 E(32554): 1.3e-18
Smith-Waterman score: 426; 35.2% identity (59.0% similar) in 227 aa overlap (1-218:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:. . . :.:. : . : : ::.. : :: ... : . : ... ... :
CCDS33 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 HREGK-----FNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPS
.::. :: : . .:: ::: : :: :::. .: : ::
CCDS33 DKEGSPEPWDRNNPL-------EPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCHY---YSSAGWSEPS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRLPA
:::..:. :.:.::.::: :.:.: .: :.:: :.:...: . : .::: :. : : .
CCDS33 DPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDS
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSP
. .: ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: .
CCDS33 QQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSE
CCDS33 LQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRS
230 240 250 260 270 280
>>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (632 aa)
initn: 993 init1: 392 opt: 666 Z-score: 697.4 bits: 138.2 E(32554): 1.6e-32
Smith-Waterman score: 675; 43.3% identity (69.0% similar) in 284 aa overlap (24-292:220-495)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDV
:: ::::.:.: : .. ... ::: :::
CCDS46 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MFEHFLLHREGKFNNTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLS
...:.:..::. . :. :.. . :.:.:::..::. .: :::::. : . :
CCDS46 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 APSDPLDMVIIG-LYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRL
:::::::..: : .:. :::::::::: .:::.:: :.::. .: . :..:: ::
CCDS46 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHP---
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KE2 PA-VRSINGT--FQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSN
: .::. :. .::.::..:.: :.:::::.:: . :. : :.:: . :.:. ..
CCDS46 PLRLRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGG
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270
pF1KE2 SWPSPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSDKKNAAVM
: :: : : : :.:.::::.::. . . .::.::: :: ::....
CCDS46 SSLPPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHR-TSDQRKTDF-
430 440 450 460 470 480
280 290 300
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:.::: .. .:
CCDS46 -QRPAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQQSPHDEDPQA
490 500 510 520 530 540
>--
initn: 312 init1: 199 opt: 426 Z-score: 447.5 bits: 91.9 E(32554): 1.3e-18
Smith-Waterman score: 426; 35.2% identity (59.0% similar) in 227 aa overlap (1-218:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSLMVIIMACVGFFLLQGAWPQEGVHRKPSFLALPGHLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
:. . . :.:. : . : : ::.. : :: ... : . : ... ... :
CCDS46 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 HREGK-----FNNTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSAPS
.::. :: : . .:: ::: : :: :::. .: : ::
CCDS46 DKEGSPEPWDRNNPL-------EPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCHY---YSSAGWSEPS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DPLDMVIIGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRLPA
:::..:. :.:.::.::: :.:.: .: :.:: :.:...: . : .::: :. : : .
CCDS46 DPLELVMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDS
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 VRSINGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDAPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSP
. .: ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: .
CCDS46 QQLHSGGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSDKKNAAVMDQEPAGNRTVNSE
CCDS46 LQGPVLAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRS
230 240 250 260 270 280
304 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:47:06 2016 done: Sun Nov 6 21:47:07 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]