Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2085
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2085, 759 aa
1>>>pF1KE2085 759 - 759 aa - 759 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6247+/-0.000448; mu= 19.5011+/- 0.028
mean_var=84.3880+/-17.360, 0's: 0 Z-trim(111.7): 63 B-trim: 288 in 2/53
Lambda= 0.139616
statistics sampled from 20290 (20353) to 20290 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16
Scan time: 11.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001008895 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 1 [H ( 759) 4978 1013.3 0
NP_003580 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 2 [Homo ( 659) 4320 880.7 0
NP_001265442 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 2 [H ( 659) 4320 880.7 0
XP_011535825 (OMIM: 603137) PREDICTED: cullin-4A i ( 659) 4320 880.7 0
NP_001265443 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 3 [H ( 667) 4276 871.8 0
NP_001073341 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isofo ( 895) 4106 837.7 0
NP_001317553 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isofo ( 900) 4106 837.7 0
NP_003579 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isoform ( 913) 4106 837.7 0
XP_006724847 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 902) 4092 834.9 0
XP_005262538 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 915) 4092 834.9 0
XP_011529702 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 717) 4031 822.5 0
XP_011529701 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 719) 4017 819.7 0
XP_011529703 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 701) 3808 777.6 0
NP_003581 (OMIM: 603136,614496) cullin-3 isoform 1 ( 768) 1009 213.8 2.1e-54
XP_011510297 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 754) 1002 212.4 5.6e-54
XP_006712863 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 757) 1002 212.4 5.6e-54
NP_001244127 (OMIM: 603136,614496) cullin-3 isofor ( 774) 1002 212.4 5.7e-54
NP_001244126 (OMIM: 603136,614496) cullin-3 isofor ( 702) 932 198.3 9.2e-50
XP_011510298 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 704) 932 198.3 9.2e-50
XP_011510296 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 719) 932 198.3 9.4e-50
NP_001311305 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform e [Ho ( 614) 915 194.8 8.9e-49
NP_001311304 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform d [Ho ( 682) 915 194.9 9.7e-49
NP_003582 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform c [Homo ( 745) 915 194.9 1e-48
NP_001185706 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform c [Ho ( 745) 915 194.9 1e-48
XP_011518049 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 745) 915 194.9 1e-48
NP_001185708 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform b [Ho ( 758) 915 194.9 1.1e-48
NP_001185707 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform a [Ho ( 764) 915 194.9 1.1e-48
XP_011518047 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 808) 915 194.9 1.1e-48
XP_011518045 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 808) 915 194.9 1.1e-48
XP_011518046 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 808) 915 194.9 1.1e-48
XP_011514932 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43
XP_011514931 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43
XP_011514934 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43
NP_003583 (OMIM: 603134) cullin-1 [Homo sapiens] ( 776) 831 178.0 1.3e-43
XP_005250117 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43
XP_011514933 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43
XP_016868212 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 455) 822 176.0 3.1e-43
XP_016873853 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 519) 441 99.3 4.3e-20
XP_016873854 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 519) 441 99.3 4.3e-20
XP_005271739 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 721) 441 99.4 5.6e-20
XP_016873852 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 742) 441 99.4 5.7e-20
NP_003469 (OMIM: 601741) cullin-5 [Homo sapiens] ( 780) 441 99.4 5.9e-20
NP_037498 (OMIM: 606946) anaphase-promoting comple ( 822) 230 56.9 3.8e-07
XP_011541315 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 396) 190 48.7 5.8e-05
>>NP_001008895 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 1 [Homo (759 aa)
initn: 4978 init1: 4978 opt: 4978 Z-score: 5418.3 bits: 1013.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4978; 100.0% identity (100.0% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 DTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 HIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 CLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 NKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPME
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 VHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 MFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 KHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELY
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 NQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
730 740 750
>>NP_003580 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 2 [Homo sap (659 aa)
initn: 4320 init1: 4320 opt: 4320 Z-score: 4702.9 bits: 880.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4320; 100.0% identity (100.0% similar) in 659 aa overlap (101-759:1-659)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 KTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRL
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKD
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 KVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELE
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 RTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSK
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 LEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKL
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 QEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSF
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 EEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKIN
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 QIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPG
580 590 600 610 620 630
740 750
pF1KE2 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650
>>NP_001265442 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 2 [Homo (659 aa)
initn: 4320 init1: 4320 opt: 4320 Z-score: 4702.9 bits: 880.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4320; 100.0% identity (100.0% similar) in 659 aa overlap (101-759:1-659)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 KTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRL
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 MQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKD
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 KVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELE
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 RTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSK
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 LEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKL
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 QEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSF
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 EEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKIN
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KE2 QIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPG
580 590 600 610 620 630
740 750
pF1KE2 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650
>>XP_011535825 (OMIM: 603137) PREDICTED: cullin-4A isofo (659 aa)
initn: 4320 init1: 4320 opt: 4320 Z-score: 4702.9 bits: 880.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4320; 100.0% identity (100.0% similar) in 659 aa overlap (101-759:1-659)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
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140 150 160 170 180 190
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQS
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200 210 220 230 240 250
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELE
280 290 300 310 320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKIN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPG
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pF1KE2 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650
>>NP_001265443 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 3 [Homo (667 aa)
initn: 3829 init1: 3829 opt: 4276 Z-score: 4654.9 bits: 871.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4276; 98.7% identity (98.7% similar) in 667 aa overlap (101-759:1-667)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 RAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL
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pF1KE2 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSI--------WDMGLELFRTHI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
NP_001 FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSICPVSYCLYRDMGLELFRTHI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCL
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pF1KE2 YAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAI
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pF1KE2 LQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMV
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pF1KE2 QDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNK
280 290 300 310 320 330
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pF1KE2 EATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHE
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pF1KE2 CGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVH
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pF1KE2 LTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMF
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pF1KE2 NEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKH
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pF1KE2 KLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQ
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pF1KE2 LKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
640 650 660
>>NP_001073341 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isoform 2 (895 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4106 Z-score: 4468.0 bits: 837.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4106; 82.8% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (13-759:150-895)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
NP_001 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
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pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
NP_001 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
NP_001 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
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pF1KE2 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
NP_001 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
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pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
NP_001 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
360 370 380 390 400 410
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pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
NP_001 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
420 430 440 450 460 470
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pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
NP_001 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
480 490 500 510 520 530
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pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
NP_001 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::. :
NP_001 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGN
600 610 620 630 640 650
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pF1KE2 IDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKA
:.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:::: ::::
NP_001 IELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKA
660 670 680 690 700 710
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLI
::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.:::::::::::::::::
NP_001 EFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLA
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pF1KE2 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAI
:.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_001 KNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAI
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pF1KE2 VRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
NP_001 VRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
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>>NP_001317553 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isoform 3 (900 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4106 Z-score: 4468.0 bits: 837.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4106; 82.8% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (13-759:155-900)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
NP_001 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
130 140 150 160 170 180
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
NP_001 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
NP_001 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
250 260 270 280 290 300
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::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
NP_001 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
NP_001 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
NP_001 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
NP_001 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
NP_001 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
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pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::. :
NP_001 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGN
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pF1KE2 IDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKA
:.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:::: ::::
NP_001 IELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKA
670 680 690 700 710 720
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLI
::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.:::::::::::::::::
NP_001 EFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLA
730 740 750 760 770 780
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pF1KE2 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAI
:.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_001 KNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAI
790 800 810 820 830 840
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pF1KE2 VRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
NP_001 VRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
850 860 870 880 890 900
>>NP_003579 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isoform 1 [H (913 aa)
initn: 4072 init1: 4072 opt: 4106 Z-score: 4467.9 bits: 837.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4106; 82.8% identity (94.8% similar) in 749 aa overlap (13-759:168-913)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
NP_003 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
NP_003 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
NP_003 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
NP_003 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
320 330 340 350 360 370
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pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
NP_003 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
NP_003 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
NP_003 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
500 510 520 530 540 550
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
NP_003 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
560 570 580 590 600 610
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::. :
NP_003 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVPGN
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530 540 550 560 570 580
pF1KE2 IDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKA
:.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:::: ::::
NP_003 IELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKA
680 690 700 710 720 730
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 EFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLI
::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.:::::::::::::::::
NP_003 EFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARVLA
740 750 760 770 780 790
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 KSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAI
:.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_003 KNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAI
800 810 820 830 840 850
710 720 730 740 750
pF1KE2 VRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.:
NP_003 VRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYIA
860 870 880 890 900 910
>>XP_006724847 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cullin-4 (902 aa)
initn: 4065 init1: 2640 opt: 4092 Z-score: 4452.7 bits: 834.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4092; 82.6% identity (94.5% similar) in 751 aa overlap (13-759:155-902)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
XP_006 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
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pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
XP_006 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
190 200 210 220 230 240
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
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pF1KE2 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
XP_006 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
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pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
XP_006 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
XP_006 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
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350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
XP_006 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
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410 420 430 440 450 460
pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
XP_006 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
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470 480 490 500 510
pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQ--HMQNQSDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: .::::.
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pF1KE2 GPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVL
: :.::::::::::::::.:::::: :::.::::.::.::::::::::::::.:::: ::
XP_006 GNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVL
670 680 690 700 710 720
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 KAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARV
::::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.::::::::::::::::
XP_006 KAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARV
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pF1KE2 LIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDA
: :.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
XP_006 LAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDA
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pF1KE2 AIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYV
::::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.
XP_006 AIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYI
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pF1KE2 A
:
XP_006 A
>>XP_005262538 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cullin-4 (915 aa)
initn: 4065 init1: 2640 opt: 4092 Z-score: 4452.7 bits: 834.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4092; 82.6% identity (94.5% similar) in 751 aa overlap (13-759:168-915)
10 20 30 40
pF1KE2 MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAA--APAKPGGAGGS
: : ..:::.: .. .. : .:::.:
XP_005 SSSSSSSSSPTAATSQQQQLKNKSILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSA---
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 KKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSP
::::::::.:.:.::.:::..::.::.:::.:.:.::::.:::::::::::::::.:.:
XP_005 KKLVIKNFKDKPKLPENYTDETWQKLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISA
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
::::::: ::::..::: :::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::
XP_005 NLYKQLRQICEDHIKAQIHQFREDSLDSVLFLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTY
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGM
::::: :::::::::::::.:::::. ::.::::::::::::::.:::.:::::::::.:
XP_005 VLQNSMLPSIWDMGLELFRAHIISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSM
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDH
:::::.:.:::: .:::::: :::::::.:::::::::::.::.::::::.::.:::::.
XP_005 LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQ
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 STQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHW
.::: ::: ::::::::::::::::::..::::::. ::. .:::::::::: :.:::.:
XP_005 TTQKSLIATVEKQLLGEHLTAILQKGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQW
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 SEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINK
::::.::..::::::::: :::.::::::::::.:..:: :::.:.: :::.:::::::
XP_005 IEYIKAFGSTIVINPEKDKTMVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINK
500 510 520 530 540 550
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 RPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKR
:::::::::::.::::::::::::::::::. ::::::.::::.::::::::::::::::
XP_005 RPNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKR
560 570 580 590 600 610
470 480 490 500 510
pF1KE2 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQ--HMQNQSDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::: .::::.
XP_005 LLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQVKYMQNQNVP
620 630 640 650 660 670
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 GPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVL
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XP_005 GNIELTVNILTMGYWPTYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVL
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pF1KE2 KAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARV
::::::::::.::::::::::::::::. ::.::::.::::::.::::::::::::::::
XP_005 KAEFKEGKKELQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRTLQSLACGKARV
740 750 760 770 780 790
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 LIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDA
: :.::::..::::::: : .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
XP_005 LAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDA
800 810 820 830 840 850
700 710 720 730 740 750
pF1KE2 AIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYV
::::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:.
XP_005 AIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYI
860 870 880 890 900 910
pF1KE2 A
:
XP_005 A
759 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 14:32:03 2016 done: Sun Nov 6 14:32:05 2016
Total Scan time: 11.760 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]