Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2084
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2084, 759 aa
1>>>pF1KE2084 759 - 759 aa - 759 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8445+/- 0.001; mu= 17.6438+/- 0.061
mean_var=75.9569+/-15.148, 0's: 0 Z-trim(104.8): 48 B-trim: 57 in 1/51
Lambda= 0.147160
statistics sampled from 8070 (8112) to 8070 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 3.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 759) 5030 1077.9 0
CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 793) 4345 932.5 0
CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 893) 2019 438.7 1.9e-122
CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 977) 2019 438.7 2.1e-122
CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 982) 2007 436.2 1.2e-121
CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX ( 973) 1998 434.2 4.6e-121
CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 836) 1946 423.2 8.5e-118
CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 828) 1656 361.6 2.9e-99
CCDS45035.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 804) 1397 306.6 1e-82
CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 848) 747 168.6 3.7e-41
CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 921) 747 168.6 3.9e-41
CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 ( 931) 737 166.5 1.7e-40
CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 862) 692 156.9 1.2e-37
CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 801) 387 92.2 3.5e-18
CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 746) 362 86.9 1.3e-16
>>CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 (759 aa)
initn: 5030 init1: 5030 opt: 5030 Z-score: 5767.6 bits: 1077.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5030; 100.0% identity (100.0% similar) in 759 aa overlap (1-759:1-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQKLMERIQNPEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQKLMERIQNPEY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 STTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 STTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 QARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 WFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 FTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 RNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTD
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 QATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
730 740 750
>>CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 (793 aa)
initn: 5016 init1: 4338 opt: 4345 Z-score: 4981.3 bits: 932.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4938; 95.7% identity (95.7% similar) in 791 aa overlap (3-759:3-793)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE2 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQ-----------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YMVKKILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140
pF1KE2 -----------------------KLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EVVGAVDILLNHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLK
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QDVSLPKPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFEL
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGL
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFS
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEW
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEW
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
730 740 750 760 770 780
750
pF1KE2 FRTSKYAMFYPRN
:::::::::::::
CCDS58 FRTSKYAMFYPRN
790
>>CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (893 aa)
initn: 2122 init1: 881 opt: 2019 Z-score: 2311.6 bits: 438.7 E(32554): 1.9e-122
Smith-Waterman score: 2139; 46.4% identity (72.4% similar) in 765 aa overlap (37-759:20-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
.: :. :. :. :: .: : .:::: ::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
10 20 30 40
70 80 90 100
pF1KE2 KILEENSSG-DLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDY-----------------
: ::: .::::.: :::.:. :.::::::....:::..
CCDS45 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KE2 GCQKLMERIQNP-------------EYST-TMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLP
: .:. ..: ..: : :..:.::::: :::::. .:... ::.:
CCDS45 GAVELLLNHKKPSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVP
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 KPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKE
.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .:.:
CCDS45 RPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQE
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERM-
:: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::.
CCDS45 LSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEEQSG
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 -NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVL
.:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...::.
CCDS45 NDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVF
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERID
:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : : ... : .:: ..
CCDS45 SVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVE
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 YLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFA
.... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :. .
CCDS45 WMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALN
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 DRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMF
:..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. ::: ..
CCDS45 PRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIY
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KE2 LLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKD--CVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLA
:::..:. ::.::: . .: : : :: ::.: :..: ... : .::: ::.:
CCDS45 CLVLLAFANGLNQLY---FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIFGL-
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 HVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKF
. ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : ::::
CCDS45 -INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKF
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 ARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQ----NSLK
::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:. ...
CCDS45 ARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIG
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 EWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDL
. . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :. :
CCDS45 RRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGL
700 710 720 730 740 750
750
pF1KE2 LGFRTSKYAMFYPRN
: : :: . . :
CCDS45 L--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRG
760 770 780 790 800 810
>>CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (977 aa)
initn: 2122 init1: 881 opt: 2019 Z-score: 2311.0 bits: 438.7 E(32554): 2.1e-122
Smith-Waterman score: 2139; 46.4% identity (72.4% similar) in 765 aa overlap (37-759:20-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLN--EKLFLLACDKGDYYMVK
.: :. :. :. :: .: : .:::: ::
CCDS93 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVK
10 20 30 40
70 80 90 100
pF1KE2 KILEENSSG-DLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDY-----------------
: ::: .::::.: :::.:. :.::::::....:::..
CCDS93 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KE2 GCQKLMERIQNP-------------EYST-TMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLP
: .:. ..: ..: : :..:.::::: :::::. .:... ::.:
CCDS93 GAVELLLNHKKPSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVP
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 KPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKE
.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .:.:
CCDS93 RPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQE
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERM-
:: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::.
CCDS93 LSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEEQSG
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 -NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVL
.:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...::.
CCDS93 NDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVF
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERID
:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : : ... : .:: ..
CCDS93 SVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVE
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 YLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFA
.... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :. .
CCDS93 WMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALN
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:..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. ::: ..
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. ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : ::::
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::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:. ...
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. . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :. :
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750
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: : :: . . :
CCDS93 L--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIA
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.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .:.:
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. ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : ::::
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::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:.
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740 750
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CCDS45 EVLGLL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPR
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.. .:..::.::::.:::::.: ::::.: :.:. . :.::: :..: .:.:..
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CCDS14 TVVEWMILPWVLGFIWGEIKEMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKY
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.:.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: :
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CCDS14 IEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPPFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNL
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:. : . ....::.:. ::.::...: .. .. . : ::..::.::.:.:: :
CCDS14 RSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNLVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYE
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. :::: :
CCDS14 VLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRT
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pF1KE2 SLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERID
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CCDS45 SVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVE
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pF1KE2 YLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFA
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CCDS45 WMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALN
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 DRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMF
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CCDS45 PRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIY
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pF1KE2 LLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHV
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CCDS45 CLVLLAFANGLNQLY-FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIFGL--I
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CCDS45 NLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFAR
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.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:. ... .
CCDS45 TKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRR
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pF1KE2 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
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CCDS45 AADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGD
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pF1KE2 FRTSKYAMFYPRN
CCDS45 LSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSS
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CCDS45 KSLEEAEIYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVV
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CCDS45 GAVELLLNHKKPSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVP
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pF1KE2 KPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKE
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CCDS45 RPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQE
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pF1KE2 LSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERM-
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CCDS45 LSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEEQSG
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280 290 300 310 320 330
pF1KE2 -NLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVL
.:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...::.
CCDS45 NDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVF
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 SLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERID
:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : : ... : .:: ..
CCDS45 SVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVE
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 YLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFA
.... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :. .
CCDS45 WMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALN
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
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:..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. ::: ..
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:::..:. ::.::: . .: : : :: ::.: :..: ... : .::: ::.:
CCDS45 CLVLLAFANGLNQLY---FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIFGL-
530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 HVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKF
. ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::
CCDS45 -INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIAR--------
580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 ARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQNSLKEWRN
:: : :
CCDS45 -RAA------D------------------------------------------------N
630
690 700 710 720 730 740
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: .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :. :: :
CCDS45 L--RRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLL--R
640 650 660 670 680 690
750
pF1KE2 TSKYAMFYPRN
:: . . :
CCDS45 GSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSI
700 710 720 730 740 750
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:..: . .:...::.:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : :
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... : .:: ...... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::
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::..::.:: :. . :..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::
CCDS45 ATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQ
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CCDS45 ISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLY---FYYEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFS
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... : .::: ::.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::.
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..:.::::.: : ::::::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .:
CCDS45 NNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTH
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: :..:. ... . . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::.
CCDS45 LCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENF
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.::.::.:.:: :. :: : :: . . :
CCDS45 KELKQDISSFRFEVLGLL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNF
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CCDS45 SLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVTDIKNFGLFHRRSKQ
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CCDS37 LNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEAILNH
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: .... :..:.::::: ..::.. ::: . .
CCDS37 PGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLLMKGA
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150 160 170 180 190 200
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. .:: :.: : :...::. ::: :.. :. ::::: . :. :::.: :.::: .
CCDS37 RIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALELSNE
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CCDS37 LAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLE---VHR
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CCDS37 HKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGLP
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CCDS37 ITVTDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGM
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CCDS37 LSIFIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]