FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2081, 754 aa
1>>>pF1KE2081 754 - 754 aa - 754 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0720+/-0.000541; mu= -15.2567+/- 0.034
mean_var=505.4755+/-99.042, 0's: 0 Z-trim(121.1): 469 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.057046
statistics sampled from 36746 (37260) to 36746 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.437), width: 16
Scan time: 14.780
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004783 (OMIM: 606093) peptidyl-prolyl cis-trans ( 754) 4981 425.2 4.8e-118
XP_005247023 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 754) 4981 425.2 4.8e-118
XP_005247024 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 754) 4981 425.2 4.8e-118
XP_016860791 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-pr ( 272) 1687 153.7 9.2e-37
XP_016861963 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1435) 1460 135.7 1.3e-30
XP_006713234 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1436) 1460 135.7 1.3e-30
NP_005376 (OMIM: 161565) NK-tumor recognition prot (1462) 1460 135.7 1.4e-30
XP_005265230 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1463) 1460 135.7 1.4e-30
XP_006713236 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1353) 892 88.9 1.5e-16
NP_005029 (OMIM: 601753) peptidyl-prolyl cis-trans ( 370) 735 75.5 4.4e-13
NP_000933 (OMIM: 123841,259440) peptidyl-prolyl ci ( 216) 604 64.5 5.2e-10
NP_006338 (OMIM: 606095) peptidyl-prolyl cis-trans ( 177) 579 62.4 1.9e-09
XP_016855546 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 177) 579 62.4 1.9e-09
XP_005270419 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 177) 579 62.4 1.9e-09
XP_016855541 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 217) 573 62.0 3.1e-09
NP_006103 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-trans ( 301) 573 62.1 3.9e-09
XP_006710353 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 288) 568 61.7 5.1e-09
NP_066953 (OMIM: 123840) peptidyl-prolyl cis-trans ( 165) 558 60.6 5.9e-09
NP_000934 (OMIM: 123842) peptidyl-prolyl cis-trans ( 212) 554 60.4 9e-09
NP_982281 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-trans ( 296) 553 60.4 1.2e-08
NP_005720 (OMIM: 604486) peptidyl-prolyl cis-trans ( 207) 548 59.9 1.2e-08
NP_001306222 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-tr ( 283) 548 60.0 1.6e-08
XP_011538803 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 230) 544 59.6 1.7e-08
XP_011532052 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1210) 562 61.7 2.1e-08
XP_016861964 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1210) 562 61.7 2.1e-08
XP_011532049 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1210) 562 61.7 2.1e-08
NP_001181936 (OMIM: 602435) peptidyl-prolyl cis-tr ( 314) 544 59.7 2.1e-08
XP_016855540 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 314) 544 59.7 2.1e-08
XP_006710352 (OMIM: 602435) PREDICTED: peptidyl-pr ( 301) 539 59.3 2.7e-08
XP_011509880 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (2281) 544 60.4 9.3e-08
XP_005264064 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (2282) 544 60.4 9.3e-08
XP_011509878 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3199) 544 60.6 1.2e-07
NP_006258 (OMIM: 601181,608033) E3 SUMO-protein li (3224) 544 60.6 1.2e-07
XP_005264061 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3232) 544 60.6 1.2e-07
XP_005264062 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3232) 544 60.6 1.2e-07
XP_005264060 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3250) 544 60.6 1.2e-07
XP_011509877 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3257) 544 60.6 1.2e-07
XP_005264059 (OMIM: 601181,608033) PREDICTED: E3 S (3258) 544 60.6 1.2e-07
NP_001137504 (OMIM: 608608) peptidyl-prolyl cis-tr ( 164) 461 52.7 1.5e-06
XP_005255283 (OMIM: 606032) PREDICTED: serine/argi (2751) 486 55.7 2.9e-06
NP_057417 (OMIM: 606032) serine/arginine repetitiv (2752) 486 55.7 2.9e-06
XP_016855548 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 134) 433 50.3 6.3e-06
NP_001317439 (OMIM: 606095) peptidyl-prolyl cis-tr ( 134) 433 50.3 6.3e-06
XP_016855547 (OMIM: 606095) PREDICTED: peptidyl-pr ( 134) 433 50.3 6.3e-06
XP_005269436 (OMIM: 604486) PREDICTED: peptidyl-pr ( 201) 437 50.8 6.8e-06
XP_016861966 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1163) 458 53.1 7.6e-06
XP_016861965 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor re (1163) 458 53.1 7.6e-06
NP_055885 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domain-c (1564) 450 52.6 1.5e-05
XP_005266369 (OMIM: 616453) PREDICTED: zinc finger (1564) 450 52.6 1.5e-05
NP_001317495 (OMIM: 616453) zinc finger CCCH domai (1668) 450 52.6 1.6e-05
>>NP_004783 (OMIM: 606093) peptidyl-prolyl cis-trans iso (754 aa)
initn: 4981 init1: 4981 opt: 4981 Z-score: 2240.2 bits: 425.2 E(85289): 4.8e-118
Smith-Waterman score: 4981; 99.9% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKDDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN
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490 500 510 520 530 540
pF1KE2 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
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670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
730 740 750
>>XP_005247023 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-prolyl (754 aa)
initn: 4981 init1: 4981 opt: 4981 Z-score: 2240.2 bits: 425.2 E(85289): 4.8e-118
Smith-Waterman score: 4981; 99.9% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
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pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
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pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
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pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
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250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
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pF1KE2 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE2 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
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pF1KE2 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
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pF1KE2 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
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pF1KE2 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
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>>XP_005247024 (OMIM: 606093) PREDICTED: peptidyl-prolyl (754 aa)
initn: 4981 init1: 4981 opt: 4981 Z-score: 2240.2 bits: 425.2 E(85289): 4.8e-118
Smith-Waterman score: 4981; 99.9% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
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pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
130 140 150 160 170 180
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pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
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pF1KE2 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
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pF1KE2 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
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pF1KE2 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKDDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
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pF1KE2 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
670 680 690 700 710 720
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pF1KE2 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
730 740 750
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initn: 1687 init1: 1687 opt: 1687 Z-score: 781.0 bits: 153.7 E(85289): 9.2e-37
Smith-Waterman score: 1687; 100.0% identity (100.0% similar) in 254 aa overlap (1-254:1-254)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
70 80 90 100 110 120
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pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
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pF1KE2 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
::::::::::::::
XP_016 HKKEKKKRKKSKKSWFVRGIEDFSHAITSLCI
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>>XP_016861963 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor recogn (1435 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
:: . .::.: ::: :: .:.::..:.::::.:::::.:: :::.:::: ::.: : : :
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pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
:. ::::::.::.::::::::::.::::::::.:.::.: .::.. :::::::::: ::
XP_016 KGSTFHRVVKNFMIQGGDFSEGNGKGGESIYGGYFKDENFILKHDRAFLLSMANRGKHTN
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pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::.::::: ::::: :::: ::...::: ::::::.:.:.::...:: : :
XP_016 GSQFFITTKPAPHLDGVHVVFGLVISGFEVIEQIENLKTDAASRPYADVRVIDCGVLATK
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pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATE-EKSKKRKKKHR---K
: ::::.: . : .: ::::.:.:::.:: ::: : :.:..::.:.: :
XP_016 SIKDVFEKKRKKPTHSEGS-----DSSSNSSSSSESS-SESELEHERSRRRKHKRRPKVK
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pF1KE2 NSRKHKKE----KKKRKK--------SKKSASSESEAENLEAQ-PQSTVRPEEIPPIPEN
:.:..:: .. :.: :..: ..:... . :. . .::::::::.:::
XP_016 RSKKRRKEASSSEEPRNKHAMNPKGHSERSDTNEKRSVDSSAKREKPVVRPEEIPPVPEN
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pF1KE2 RFLMRKSPPKADEKERKNRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRT
:::.:.. : . : : . :. : ... :..::::::::: ::.:
XP_016 RFLLRRDMPVVTA----------EPEPKIPDVAPIVSDQKPSVSKSGRKIKGRGTIRYHT
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pF1KE2 PSRSRS---RDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDK------SELNEIKEN
: :::: : :::::::..:::: . .: :::.: :::: :. .: . .
XP_016 PPRSRSCSESDDDDSSETPPHWKEEMQRLRAYRPPSGEKWSKGDKLSDPCSSRWDERSLS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 QRSPVRVKERKITDHRNVSESPN-RKNEKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVK
::: . .: .. .: . .: .:::::: .:...:.. :: .:. :
XP_016 QRSRSWSYNGYYSDLSTARHSGHHKKRRKEKKVKHKKKGKKQKHCRR-------HKQTKK
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pF1KE2 KRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRNEEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQER
.: : . :.:::. : : . ..:. :: : . .:.. :. ..:: :: .
XP_016 RRILIPS---DIESSKSSTRRMKSSCDRERSSRSSSLS-SHHSSKRDWSKSD---KDVQS
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pF1KE2 SRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDRRAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRS-
: .. . . .::: ::.: :..:::: : .: : .::.: .::: ..:
XP_016 SLTHSSRDSYRSKS----HSQSYS---RGSSRSR----TASKSSSHSRSRSKSRSSSKSG
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pF1KE2 RRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRRRGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSE
.: :. : . . .. . : : ..... . : ... . :.
XP_016 HRKRASKSPRKTASQLSENKPVKTEPLRATMAQNENVVVQPVVAENIPVIPLSDSPPPSR
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pF1KE2 REESQSRNKDKY-RNQE--SKSSHRKENSESEKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPF
. .:. : .: : :: .:..: . . . : .:: ..:::... ::: .
XP_016 WKPGQKPWKPSYERIQEMKAKTTHLLPIQSTYSLANIKETGSSSSYHKREKNSESDQSTY
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pF1KE2 SKIK----QSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRS-SVEKENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHES
:: . .:: .. .:: .. :: :. . ...:.. ... : .:: ::
XP_016 SKYSDRSSESSPRSRSRSSRSRSYSRSYTRSRSLASSHSRSRSP-SSRSHSRNKYSDHSQ
680 690 700 710 720 730
750
pF1KE2 SPGTDEDKSG
XP_016 CSRSSSYTSISSDDGRRAKRRLRSSGKKNSVSHKKHSSSSEKTLHSKYVKGRDRSSCVRK
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>>XP_006713234 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor recogn (1436 aa)
initn: 1435 init1: 1038 opt: 1460 Z-score: 670.4 bits: 135.7 E(85289): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 1612; 41.5% identity (64.8% similar) in 778 aa overlap (1-742:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
:: . .::.: ::: :: .:.::..:.::::.:::::.:: :::.:::: ::.: : : :
XP_006 MGAQ-DRPQCHFDIEINREPVGRIMFQLFSDICPKTCKNFLCLCSGEKGLGKTTGKKLCY
10 20 30 40 50
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pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
:. ::::::.::.::::::::::.::::::::.:.::.: .::.. :::::::::: ::
XP_006 KGSTFHRVVKNFMIQGGDFSEGNGKGGESIYGGYFKDENFILKHDRAFLLSMANRGKHTN
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pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::.::::: ::::: :::: ::...::: ::::::.:.:.::...:: : :
XP_006 GSQFFITTKPAPHLDGVHVVFGLVISGFEVIEQIENLKTDAASRPYADVRVIDCGVLATK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATE-EKSKKRKKKHR---K
: ::::.: . : .: ::::.:.:::.:: ::: : :.:..::.:.: :
XP_006 SIKDVFEKKRKKPTHSEGS-----DSSSNSSSSSESS-SESELEHERSRRRKHKRRPKVK
180 190 200 210 220 230
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pF1KE2 NSRKHKKE----KKKRKK--------SKKSASSESEAENLEAQ-PQSTVRPEEIPPIPEN
:.:..:: .. :.: :..: ..:... . :. . .::::::::.:::
XP_006 RSKKRRKEASSSEEPRNKHAMNPKGHSERSDTNEKRSVDSSAKREKPVVRPEEIPPVPEN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RFLMRKSPPKADEKERKNRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRT
:::.:.. : . : : . :. : ... :..::::::::: ::.:
XP_006 RFLLRRDMPVVTA----------EPEPKIPDVAPIVSDQKPSVSKSGRKIKGRGTIRYHT
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE2 PSRSRS---RDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDK------SELNEIKEN
: :::: : :::::::..:::: . .: :::.: :::: :. .: . .
XP_006 PPRSRSCSESDDDDSSETPPHWKEEMQRLRAYRPPSGEKWSKGDKLSDPCSSRWDERSLS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 QRSPVRVKERKITDHRNVSESPN-RKNEKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVK
::: . .: .. .: . .: .:::::: .:...:.. :: .:. :
XP_006 QRSRSWSYNGYYSDLSTARHSGHHKKRRKEKKVKHKKKGKKQKHCRR-------HKQTKK
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pF1KE2 KRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRNEEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQER
.: : . :.:::. : : . ..:. :: : . .:.. :. ..:: :: .
XP_006 RRILIPS---DIESSKSSTRRMKSSCDRERSSRSSSLS-SHHSSKRDWSKSD---KDVQS
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pF1KE2 SRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDRRAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRS-
: .. . . .::: ::.: :..:::: : .: : .::.: .::: ..:
XP_006 SLTHSSRDSYRSKS----HSQSYS---RGSSRSR----TASKSSSHSRSRSKSRSSSKSG
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pF1KE2 RRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRRRGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSE
.: :. : . . .. . : : ..... . : ... . :.
XP_006 HRKRASKSPRKTASQLSENKPVKTEPLRATMAQNENVVVQPVVAENIPVIPLSDSPPPSR
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680
pF1KE2 REESQSRNKDKY-RNQE--SKSSHRKENSESEKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPF
. .:. : .: : :: .:..: . . . : .:: ..:::... ::: .
XP_006 WKPGQKPWKPSYERIQEMKAKTTHLLPIQSTYSLANIKETGSSSSYHKREKNSESDQSTY
620 630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 SKIK----QSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRS-SVEKENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHES
:: . .:: .. .:: .. :: :. . ...:.. ... : .:: ::
XP_006 SKYSDRSSESSPRSRSRSSRSRSYSRSYTRSRSLASSHSRSRSP-SSRSHSRNKYSDHSQ
680 690 700 710 720 730
750
pF1KE2 SPGTDEDKSG
XP_006 CSRSSSYTSISSDDGRRAKRRLRSSGKKNSVSHKKHSSSSEKTLHSKYVKGRDRSSCVRK
740 750 760 770 780 790
>>NP_005376 (OMIM: 161565) NK-tumor recognition protein (1462 aa)
initn: 1500 init1: 1038 opt: 1460 Z-score: 670.3 bits: 135.7 E(85289): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 1612; 41.5% identity (64.8% similar) in 778 aa overlap (1-742:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
:: . .::.: ::: :: .:.::..:.::::.:::::.:: :::.:::: ::.: : : :
NP_005 MGAQ-DRPQCHFDIEINREPVGRIMFQLFSDICPKTCKNFLCLCSGEKGLGKTTGKKLCY
10 20 30 40 50
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pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
:. ::::::.::.::::::::::.::::::::.:.::.: .::.. :::::::::: ::
NP_005 KGSTFHRVVKNFMIQGGDFSEGNGKGGESIYGGYFKDENFILKHDRAFLLSMANRGKHTN
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pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::.::::: ::::: :::: ::...::: ::::::.:.:.::...:: : :
NP_005 GSQFFITTKPAPHLDGVHVVFGLVISGFEVIEQIENLKTDAASRPYADVRVIDCGVLATK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATE-EKSKKRKKKHR---K
: ::::.: . : .: ::::.:.:::.:: ::: : :.:..::.:.: :
NP_005 SIKDVFEKKRKKPTHSEGS-----DSSSNSSSSSESS-SESELEHERSRRRKHKRRPKVK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 NSRKHKKE----KKKRKK--------SKKSASSESEAENLEAQ-PQSTVRPEEIPPIPEN
:.:..:: .. :.: :..: ..:... . :. . .::::::::.:::
NP_005 RSKKRRKEASSSEEPRNKHAMNPKGHSERSDTNEKRSVDSSAKREKPVVRPEEIPPVPEN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RFLMRKSPPKADEKERKNRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRT
:::.:.. : . : : . :. : ... :..::::::::: ::.:
NP_005 RFLLRRDMPVVTA----------EPEPKIPDVAPIVSDQKPSVSKSGRKIKGRGTIRYHT
300 310 320 330 340
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pF1KE2 PSRSRS---RDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDK------SELNEIKEN
: :::: : :::::::..:::: . .: :::.: :::: :. .: . .
NP_005 PPRSRSCSESDDDDSSETPPHWKEEMQRLRAYRPPSGEKWSKGDKLSDPCSSRWDERSLS
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 QRSPVRVKERKITDHRNVSESPN-RKNEKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVK
::: . .: .. .: . .: .:::::: .:...:.. :: .:. :
NP_005 QRSRSWSYNGYYSDLSTARHSGHHKKRRKEKKVKHKKKGKKQKHCRR-------HKQTKK
410 420 430 440 450
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pF1KE2 KRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRNEEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQER
.: : . :.:::. : : . ..:. :: : . .:.. :. ..:: :: .
NP_005 RRILIPS---DIESSKSSTRRMKSSCDRERSSRSSSLS-SHHSSKRDWSKSD---KDVQS
460 470 480 490 500
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pF1KE2 SRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDRRAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRS-
: .. . . .::: ::.: :..:::: : .: : .::.: .::: ..:
NP_005 SLTHSSRDSYRSKS----HSQSYS---RGSSRSR----TASKSSSHSRSRSKSRSSSKSG
510 520 530 540 550
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pF1KE2 RRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRRRGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSE
.: :. : . . .. . : : ..... . : ... . :.
NP_005 HRKRASKSPRKTASQLSENKPVKTEPLRATMAQNENVVVQPVVAENIPVIPLSDSPPPSR
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680
pF1KE2 REESQSRNKDKY-RNQE--SKSSHRKENSESEKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPF
. .:. : .: : :: .:..: . . . : .:: ..:::... ::: .
NP_005 WKPGQKPWKPSYERIQEMKAKTTHLLPIQSTYSLANIKETGSSSSYHKREKNSESDQSTY
620 630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 SKIK----QSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRS-SVEKENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHES
:: . .:: .. .:: .. :: :. . ...:.. ... : .:: ::
NP_005 SKYSDRSSESSPRSRSRSSRSRSYSRSYTRSRSLASSHSRSRSP-SSRSHSRNKYSDHSQ
680 690 700 710 720 730
750
pF1KE2 SPGTDEDKSG
NP_005 CSRSSSYTSISSDDGRRAKRRLRSSGKKNSVSHKKHSSSSEKTLHSKYVKGRDRSSCVRK
740 750 760 770 780 790
>>XP_005265230 (OMIM: 161565) PREDICTED: NK-tumor recogn (1463 aa)
initn: 1435 init1: 1038 opt: 1460 Z-score: 670.3 bits: 135.7 E(85289): 1.4e-30
Smith-Waterman score: 1612; 41.5% identity (64.8% similar) in 778 aa overlap (1-742:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
:: . .::.: ::: :: .:.::..:.::::.:::::.:: :::.:::: ::.: : : :
XP_005 MGAQ-DRPQCHFDIEINREPVGRIMFQLFSDICPKTCKNFLCLCSGEKGLGKTTGKKLCY
10 20 30 40 50
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pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
:. ::::::.::.::::::::::.::::::::.:.::.: .::.. :::::::::: ::
XP_005 KGSTFHRVVKNFMIQGGDFSEGNGKGGESIYGGYFKDENFILKHDRAFLLSMANRGKHTN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::.::::: ::::: :::: ::...::: ::::::.:.:.::...:: : :
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: ::::.: . : .: ::::.:.:::.:: ::: : :.:..::.:.: :
XP_005 SIKDVFEKKRKKPTHSEGS-----DSSSNSSSSSESS-SESELEHERSRRRKHKRRPKVK
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:.:..:: .. :.: :..: ..:... . :. . .::::::::.:::
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:::.:.. : . : : . :. : ... :..::::::::: ::.:
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: :::: : :::::::..:::: . .: :::.: :::: :. .: . .
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::: . .: .. .: . .: .:::::: .:...:.. :: .:. :
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.: : . :.:::. : : . ..:. :: : . .:.. :. ..:: :: .
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: .. . . .::: ::.: :..:::: : .: : .::.: .::: ..:
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.: :. : . . .. . : : ..... . : ... . :.
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. .:. : .: : :: .:..: . . . : .:: ..:::... ::: .
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:: . .:: .. .:: .. :: :. . ...:.. ... : .:: ::
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: :::: ::...::: ::::::.:.:.::...:: : :: ::::.: . : .
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:::::.:.:::.:: ::: : :.:..::.:.: : :.:..:: .. :.:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]