Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2081
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2081, 754 aa
1>>>pF1KE2081 754 - 754 aa - 754 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2840+/-0.00134; mu= -10.4524+/- 0.081
mean_var=439.9019+/-88.367, 0's: 0 Z-trim(113.0): 171 B-trim: 247 in 1/52
Lambda= 0.061150
statistics sampled from 13476 (13641) to 13476 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.419), width: 16
Scan time: 4.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2235.1 PPIG gene_id:9360|Hs108|chr2 ( 754) 4981 454.4 3.1e-127
CCDS2702.1 NKTR gene_id:4820|Hs108|chr3 (1462) 1460 144.0 1.6e-33
CCDS3801.1 PPID gene_id:5481|Hs108|chr4 ( 370) 735 79.5 1e-14
CCDS10191.1 PPIB gene_id:5479|Hs108|chr15 ( 216) 604 67.8 2.1e-11
CCDS469.1 PPIH gene_id:10465|Hs108|chr1 ( 177) 579 65.5 8.3e-11
>>CCDS2235.1 PPIG gene_id:9360|Hs108|chr2 (754 aa)
initn: 4981 init1: 4981 opt: 4981 Z-score: 2397.8 bits: 454.4 E(32554): 3.1e-127
Smith-Waterman score: 4981; 99.9% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (1-754:1-754)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
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CCDS22 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKNSRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 HKKEKKKRKKSKKSASSESEAENLEAQPQSTVRPEEIPPIPENRFLMRKSPPKADEKERK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 NRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRTPSRSRSRDRFRRSETPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 HWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDKSELNEIKENQRSPVRVKERKITDHRNVSESPNRKN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKDDKYKNKVKKRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQERSRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRSRRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 RGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSEREESQSRNKDKYRNQESKSSHRKENSES
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 EKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPFSKIKQSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRSSVEK
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 ENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHESSPGTDEDKSG
730 740 750
>>CCDS2702.1 NKTR gene_id:4820|Hs108|chr3 (1462 aa)
initn: 1500 init1: 1038 opt: 1460 Z-score: 715.2 bits: 144.0 E(32554): 1.6e-33
Smith-Waterman score: 1612; 41.5% identity (64.8% similar) in 778 aa overlap (1-742:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHY
:: . .::.: ::: :: .:.::..:.::::.:::::.:: :::.:::: ::.: : : :
CCDS27 MGAQ-DRPQCHFDIEINREPVGRIMFQLFSDICPKTCKNFLCLCSGEKGLGKTTGKKLCY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGKDTN
:. ::::::.::.::::::::::.::::::::.:.::.: .::.. :::::::::: ::
CCDS27 KGSTFHRVVKNFMIQGGDFSEGNGKGGESIYGGYFKDENFILKHDRAFLLSMANRGKHTN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 GSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGELIPK
::::::::::.::::: ::::: :::: ::...::: ::::::.:.:.::...:: : :
CCDS27 GSQFFITTKPAPHLDGVHVVFGLVISGFEVIEQIENLKTDAASRPYADVRVIDCGVLATK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE2 SKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATE-EKSKKRKKKHR---K
: ::::.: . : .: ::::.:.:::.:: ::: : :.:..::.:.: :
CCDS27 SIKDVFEKKRKKPTHSEGS-----DSSSNSSSSSESS-SESELEHERSRRRKHKRRPKVK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 NSRKHKKE----KKKRKK--------SKKSASSESEAENLEAQ-PQSTVRPEEIPPIPEN
:.:..:: .. :.: :..: ..:... . :. . .::::::::.:::
CCDS27 RSKKRRKEASSSEEPRNKHAMNPKGHSERSDTNEKRSVDSSAKREKPVVRPEEIPPVPEN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RFLMRKSPPKADEKERKNRERERERECNPPNSQPASYQRRLLVTRSGRKIKGRGPRRYRT
:::.:.. : . : : . :. : ... :..::::::::: ::.:
CCDS27 RFLLRRDMPVVTA----------EPEPKIPDVAPIVSDQKPSVSKSGRKIKGRGTIRYHT
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE2 PSRSRS---RDRFRRSETPPHWRQEMQRAQRMRVSSGERWIKGDK------SELNEIKEN
: :::: : :::::::..:::: . .: :::.: :::: :. .: . .
CCDS27 PPRSRSCSESDDDDSSETPPHWKEEMQRLRAYRPPSGEKWSKGDKLSDPCSSRWDERSLS
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 QRSPVRVKERKITDHRNVSESPN-RKNEKEKKVKDHKSNSKERDIRRNSEKEDKYKNKVK
::: . .: .. .: . .: .:::::: .:...:.. :: .:. :
CCDS27 QRSRSWSYNGYYSDLSTARHSGHHKKRRKEKKVKHKKKGKKQKHCRR-------HKQTKK
410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 KRAKSKSRSKSKEKSKSKERDSKHNRNEEKRMRSRSKGRDHENVKEKEKQSDSKGKDQER
.: : . :.:::. : : . ..:. :: : . .:.. :. ..:: :: .
CCDS27 RRILIPS---DIESSKSSTRRMKSSCDRERSSRSSSLS-SHHSSKRDWSKSD---KDVQS
460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 SRSKEKSKQLESKSNEHDHSKSKEKDRRAQSRSRECDITKGKHSYNSRTRERSRSRDRS-
: .. . . .::: ::.: :..:::: : .: : .::.: .::: ..:
CCDS27 SLTHSSRDSYRSKS----HSQSYS---RGSSRSR----TASKSSSHSRSRSKSRSSSKSG
510 520 530 540 550
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 RRVRSRTHDRDRSRSKEYHRYREQEYRRRGRSRSRERRTPPGRSRSKDRRRRRRDSRSSE
.: :. : . . .. . : : ..... . : ... . :.
CCDS27 HRKRASKSPRKTASQLSENKPVKTEPLRATMAQNENVVVQPVVAENIPVIPLSDSPPPSR
560 570 580 590 600 610
640 650 660 670 680
pF1KE2 REESQSRNKDKY-RNQE--SKSSHRKENSESEKRMYSKSRDHNSSNNSREKKADRDQSPF
. .:. : .: : :: .:..: . . . : .:: ..:::... ::: .
CCDS27 WKPGQKPWKPSYERIQEMKAKTTHLLPIQSTYSLANIKETGSSSSYHKREKNSESDQSTY
620 630 640 650 660 670
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 SKIK----QSSQDNELKSSMLKNKEDEKIRS-SVEKENQKSKGQENDHVHEKNKKFDHES
:: . .:: .. .:: .. :: :. . ...:.. ... : .:: ::
CCDS27 SKYSDRSSESSPRSRSRSSRSRSYSRSYTRSRSLASSHSRSRSP-SSRSHSRNKYSDHSQ
680 690 700 710 720 730
750
pF1KE2 SPGTDEDKSG
CCDS27 CSRSSSYTSISSDDGRRAKRRLRSSGKKNSVSHKKHSSSSEKTLHSKYVKGRDRSSCVRK
740 750 760 770 780 790
>>CCDS3801.1 PPID gene_id:5481|Hs108|chr4 (370 aa)
initn: 773 init1: 712 opt: 735 Z-score: 377.6 bits: 79.5 E(32554): 1e-14
Smith-Waterman score: 735; 63.5% identity (80.6% similar) in 170 aa overlap (8-177:16-184)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGK
:: :::. :... .::.:.:::.:. ::: :::: ::::::: :.
CCDS38 MSHPSPQAKPSNPSNPRVFFDVDIGGERVGRIVLELFADIVPKTAENFRALCTGEKGIGH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 STQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSM
.: ::::.:.: :::..: ::.::::::. :: ::::::: ::::.: ::..: ::::
CCDS38 TTGKPLHFKGCPFHRIIKKFMIQGGDFSNQNGTGGESIYGEKFEDENFHYKHDREGLLSM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRIL
:: :..:::::::::: :::::::.::::::::.: :.: .:: .. . :: :
CCDS38 ANAGRNTNGSQFFITTVPTPHLDGKHVVFGQVIKGIGVARILENVEVKGE-KPAKLCVIA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 SCGELIPKSKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKK
::::
CCDS38 ECGELKEGDDGGIFPKDGSGDSHPDFPEDADIDLKDVDKILLITEDLKNIGNTFFKSQNW
180 190 200 210 220 230
>>CCDS10191.1 PPIB gene_id:5479|Hs108|chr15 (216 aa)
initn: 614 init1: 484 opt: 604 Z-score: 318.3 bits: 67.8 E(32554): 2.1e-11
Smith-Waterman score: 604; 54.4% identity (75.1% similar) in 169 aa overlap (9-177:45-205)
10 20 30
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCE
. .::. :... .:::.: ::. . ::: .
CCDS10 AALIAGSVFFLLLPGPSAADEKKKGPKVTVKVYFDLRIGDEDVGRVIFGLFGKTVPKTVD
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 NFRCLCTGEKGTGKSTQKPLHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDE
:: : ::::: : ::. ::::.::::.:::::..:.: ::.:::: : ::
CCDS10 NFVALATGEKGFG--------YKNSKFHRVIKDFMIQGGDFTRGDGTGGKSIYGERFPDE
80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SFAVKHNKEFLLSMANRGKDTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQK
.: .:: .:::: ::::::::::::: : :::.:::::.:. :.::::..:. :
CCDS10 NFKLKHYGPGWVSMANAGKDTNGSQFFITTVKTAWLDGKHVVFGKVLEGMEVVRKVESTK
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 TDAASKPFAEVRILSCGELIPKSKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSD
::. .::. .: : .::..
CCDS10 TDSRDKPLKDVIIADCGKIEVEKPFAIAKE
190 200 210
>>CCDS469.1 PPIH gene_id:10465|Hs108|chr1 (177 aa)
initn: 603 init1: 423 opt: 579 Z-score: 307.5 bits: 65.5 E(32554): 8.3e-11
Smith-Waterman score: 579; 52.9% identity (71.8% similar) in 170 aa overlap (8-177:11-177)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGIKVQRPRCFFDIAINNQPAGRVVFELFSDVCPKTCENFRCLCTGEKGTGKSTQKP
: :::..:..: .::. .:::.:: ::: :::: .:::: .. :
CCDS46 MAVANSSPVNPVVFFDVSIGGQEVGRMKIELFADVVPKTAENFRQFCTGEF---RKDGVP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LHYKSCLFHRVVKDFMVQGGDFSEGNGRGGESIYGGFFEDESFAVKHNKEFLLSMANRGK
. ::. ::::.::::.::::: .:.: : ::: : : ::.: ..:. :::::: :
CCDS46 IGYKGSTFHRVIKDFMIQGGDFVNGDGTGVASIYRGPFADENFKLRHSAPGLLSMANSGP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DTNGSQFFITTKPTPHLDGHHVVFGQVISGQEVVREIENQKTDAASKPFAEVRILSCGEL
.::: ::::: . :::.:::::..:.: :.:.::: : .:: : : .:::.
CCDS46 STNGCQFFITCSKCDWLDGKHVVFGKIIDGLLVMRKIENVPTGPNNKPKLPVVISQCGEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 IPKSKVKKEEKKRHKSSSSSSSSSSDSDSSSDSQSSSDSSDSESATEEKSKKRKKKHRKN
754 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 18:13:11 2016 done: Sun Nov 6 18:13:11 2016
Total Scan time: 4.590 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]