Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2080
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2080, 753 aa
1>>>pF1KE2080 753 - 753 aa - 753 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2385+/-0.000402; mu= 16.2063+/- 0.025
mean_var=94.8178+/-19.234, 0's: 0 Z-trim(113.4): 44 B-trim: 378 in 1/52
Lambda= 0.131713
statistics sampled from 22634 (22675) to 22634 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16
Scan time: 10.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000430 (OMIM: 162150,600955,612362) neuroendocr ( 753) 5140 987.6 0
NP_001171346 (OMIM: 162150,600955,612362) neuroend ( 706) 4734 910.5 0
NP_002561 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 969) 2045 399.6 3.2e-110
NP_612192 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 956) 2039 398.4 7e-110
NP_612196 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 623) 1979 386.9 1.3e-106
NP_612197 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 652) 1979 386.9 1.4e-106
NP_612198 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 664) 1979 386.9 1.4e-106
NP_006191 (OMIM: 600488) proprotein convertase sub ( 913) 1968 384.9 7.8e-106
NP_001177411 (OMIM: 600488) proprotein convertase (1860) 1968 385.1 1.4e-105
XP_011517071 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1886) 1968 385.1 1.4e-105
XP_005252096 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1887) 1968 385.1 1.4e-105
NP_001276753 (OMIM: 136950) furin preproprotein [H ( 794) 1804 353.7 1.7e-96
NP_002560 (OMIM: 136950) furin preproprotein [Homo ( 794) 1804 353.7 1.7e-96
NP_001276752 (OMIM: 136950) furin preproprotein [H ( 794) 1804 353.7 1.7e-96
NP_002585 (OMIM: 162151) neuroendocrine convertase ( 638) 1800 352.9 2.4e-96
XP_011526393 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 658) 1799 352.7 2.8e-96
XP_011526390 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 720) 1799 352.8 3e-96
NP_060043 (OMIM: 600487) proprotein convertase sub ( 755) 1799 352.8 3.1e-96
XP_011526387 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 782) 1799 352.8 3.2e-96
NP_001188457 (OMIM: 162151) neuroendocrine convert ( 619) 1789 350.8 9.8e-96
XP_011526394 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 644) 1777 348.6 4.9e-95
NP_001188458 (OMIM: 162151) neuroendocrine convert ( 603) 1705 334.9 6.1e-91
XP_011526395 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 593) 1618 318.3 5.7e-86
NP_612195 (OMIM: 167405) proprotein convertase sub ( 487) 1616 317.9 6.3e-86
XP_011526389 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 724) 1618 318.4 6.7e-86
NP_001278238 (OMIM: 167405) proprotein convertase ( 895) 1504 296.8 2.7e-79
XP_011526388 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 773) 1458 288.0 1e-76
NP_004707 (OMIM: 604872) proprotein convertase sub ( 785) 1435 283.6 2.1e-75
XP_005259643 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 567) 1309 259.6 2.6e-68
XP_011526396 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 567) 1309 259.6 2.6e-68
XP_016882386 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 377) 1128 225.1 4.2e-58
XP_016874035 (OMIM: 604872) PREDICTED: proprotein ( 426) 567 118.5 5.7e-26
XP_006719003 (OMIM: 604872) PREDICTED: proprotein ( 426) 567 118.5 5.7e-26
XP_011526398 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 533) 548 115.0 8.4e-25
XP_011526392 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 661) 548 115.0 1e-24
XP_011526391 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 688) 548 115.0 1e-24
XP_016870289 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1450) 424 91.7 2.4e-17
XP_011517072 (OMIM: 600488) PREDICTED: proprotein (1441) 391 85.4 1.8e-15
XP_011526397 (OMIM: 600487) PREDICTED: proprotein ( 537) 343 76.0 4.5e-13
>>NP_000430 (OMIM: 162150,600955,612362) neuroendocrine (753 aa)
initn: 5140 init1: 5140 opt: 5140 Z-score: 5279.8 bits: 987.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5140; 100.0% identity (100.0% similar) in 753 aa overlap (1-753:1-753)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQFVNEWAAEIPGGPEAASAIAEELGYDLLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQFVNEWAAEIPGGPEAASAIAEELGYDLLGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 IGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRDSALNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRDSALNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 FNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECVVKDNDFEPRALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECVVKDNDFEPRALK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 ANGEVIIEIPTRACEGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAGTSTVLLAERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ANGEVIIEIPTRACEGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAGTSTVLLAERE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 RDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQNEGRIVNWKLILHGTSSQPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQNEGRIVNWKLILHGTSSQPEH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 MKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEKMVDPGEEQPTQENPKENTLVSKSPSSSSVGGRRDELEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEKMVDPGEEQPTQENPKENTLVSKSPSSSSVGGRRDELEE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 GAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPKQSPKKSPSAKLNIPYENFYEALEKLNKPSQLKDSEDSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPKQSPKKSPSAKLNIPYENFYEALEKLNKPSQLKDSEDSL
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KE2 YNDYVDVFYNTKPYKHRDDRLLQALVDILNEEN
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YNDYVDVFYNTKPYKHRDDRLLQALVDILNEEN
730 740 750
>>NP_001171346 (OMIM: 162150,600955,612362) neuroendocri (706 aa)
initn: 4734 init1: 4734 opt: 4734 Z-score: 4863.3 bits: 910.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4734; 99.0% identity (99.9% similar) in 701 aa overlap (53-753:6-706)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 NSAKAKRQFVNEWAAEIPGGPEAASAIAEELGYDLLGQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRS
... ...:::::::::::::::::::::::
NP_001 MGKGSISFLFFSQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 AFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRDSALNLFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFHITKRLSDDDRVIWAEQQYEKERSKRSALRDSALNLFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALP
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 KLDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLDLHVIPVWQKGITGKGVVITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDP
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 TNENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNENKHGTRCAGEIAMQANNHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVD
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IYSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IYSASWGPNDDGKTVEGPGRLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGY
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 TDSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDSIYTISISSASQQGLSPWYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTS
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 ASAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASAPLAAGIFALALEANPNLTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFG
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 LLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECVVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEGQENAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLNAKALVDLADPRTWRSVPEKKECVVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRACEGQENAIK
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 SLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAGTSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLEHVQFEATIEYSRRGDLHVTLTSAAGTSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGEN
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 PIGTWTLRITDMSGRIQNEGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PIGTWTLRITDMSGRIQNEGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVEK
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 MVDPGEEQPTQENPKENTLVSKSPSSSSVGGRRDELEEGAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVDPGEEQPTQENPKENTLVSKSPSSSSVGGRRDELEEGAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPK
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 QSPKKSPSAKLNIPYENFYEALEKLNKPSQLKDSEDSLYNDYVDVFYNTKPYKHRDDRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPKKSPSAKLNIPYENFYEALEKLNKPSQLKDSEDSLYNDYVDVFYNTKPYKHRDDRLL
640 650 660 670 680 690
750
pF1KE2 QALVDILNEEN
:::::::::::
NP_001 QALVDILNEEN
700
>>NP_002561 (OMIM: 167405) proprotein convertase subtili (969 aa)
initn: 1869 init1: 1332 opt: 2045 Z-score: 2099.8 bits: 399.6 E(85289): 3.2e-110
Smith-Waterman score: 2045; 48.5% identity (73.6% similar) in 652 aa overlap (13-651:51-689)
10 20 30 40
pF1KE2 MERRAWSLQCTAFVLFCAWCALNSAKAKRQ-FVNEWAAEIPG
..:. : : :: : ..:.::... :
NP_002 TDTAAGAGGAGGAGGAGGPGFRPLAPRPWRWLLLLALPAACSAPPPRPVYTNHWAVQVLG
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 GPEAASAIAEELGYDLLGQIGSLENHYLFKHKNHPRRSRRSAFHITKRLSDDDRVIWAEQ
:: :. .: :: :::::.::..: : :.. .:: :. : : .: : .:
NP_002 GPAEADRVAAAHGYLNLGQIGNLEDYYHFYHSKTFKRSTLSSRGPHTFLRMDPQVKWLQQ
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 QYEKERSKRSALRDSALNLFNDPMWNQQWYLQDTRMTAALPKLDLHVIPVWQKGITGKGV
: :.: ::.. : ::::.:...:::. .. . ...: .:..: :::.:
NP_002 QEVKRRVKRQVRSDPQALYFNDPIWSNMWYLHCGDKNSRC-RSEMNVQAAWKRGYTGKNV
150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 VITVLDDGLEWNHTDIYANYDPEASYDFNDNDHDPFPRYDPTNENKHGTRCAGEIAMQAN
:.:.::::.: :: :. ::: :::: : ::.:: :::: .::::::::::::.: .::
NP_002 VVTILDDGIERNHPDLAPNYDSYASYDVNGNDYDPSPRYDASNENKHGTRCAGEVAASAN
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 NHKCGVGVAYNSKVGGIRMLDGIVTDAIEASSIGFNPGHVDIYSASWGPNDDGKTVEGPG
: : ::.:::.:.:::::::: :::..::.:.:. :...:::::::::.::::::.:::
NP_002 NSYCIVGIAYNAKIGGIRMLDGDVTDVVEAKSLGIRPNYIDIYSASWGPDDDGKTVDGPG
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RLAQKAFEYGVKQGRQGKGSIFVWASGNGGRQGDNCDCDGYTDSIYTISISSASQQGLSP
:::..:::::.:.:::: :::::::::::::.:: :.:::::.::::::.:::...: .:
NP_002 RLAKQAFEYGIKKGRQGLGSIFVWASGNGGREGDYCSCDGYTNSIYTISVSSATENGYKP
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 WYAEKCSSTLATSYSSGDYTDQRITSADLHNDCTETHTGTSASAPLAAGIFALALEANPN
:: :.:.:::::.:::: . ...:...::.. ::. :::::.:::..:::.::::::: .
NP_002 WYLEECASTLATTYSSGAFYERKIVTTDLRQRCTDGHTGTSVSAPMVAGIIALALEANSQ
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 LTWRDMQHLVVWTSEYDPLANNPGWKKNGAGLMVNSRFGFGLLNAKALVDLADPRTWRSV
:::::.:::.: ::. : . :: :::: :. .::::..:.::: .. . : .:
NP_002 LTWRDVQHLLVKTSRPAHLKASD-WKVNGAGHKVSHFYGFGLVDAEALV--VEAKKWTAV
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 PEKKECVVKDNDFEPRALKANGEVIIEIPTRAC-EGQENAIKSLEHVQFEATIEYSRRGD
: .. ::. .: .::.. . : :: : ... . :::: ...: . ::::
NP_002 PSQHMCVAA-SDKRPRSIPLVQVLRTTALTSACAEHSDQRVVYLEHVVVRTSISHPRRGD
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 LHVTLTSAAGTSTVLLAERERDTSPNGFKNWDFMSVHTWGENPIGTWTLRITDMSGRIQN
:.. :.: .::.. :::.: : : .:: ::.::.:: :::. : :::.: :. ....:
NP_002 LQIYLVSPSGTKSQLLAKRLLDLSNEGFTNWEFMTVHCWGEKAEGQWTLEIQDLPSQVRN
560 570 580 590 600 610
590 600 610 620 630
pF1KE2 ---EGRIVNWKLILHGTSSQPEHMKQPRVYTSYNTVQNDRRGVE---KMVDPGEE--QPT
.:.. .:.:::.::. .: : .... :. : .: ..: . .:.
NP_002 PEKQGKLKEWSLILYGTAEHPYH--------TFSAHQSRSRMLELSAPELEPPKAALSPS
620 630 640 650 660
640 650 660 670 680
pF1KE2 Q-ENPK--ENTLVSKSPSSSSVGGRRDELEEGAPSQAMLRLLQSAFSKNSPPKQSPKKSP
: : :. :. ....:.:...
NP_002 QVEVPEDEEDYTAQSTPGSANILQTSVCHPECGDKGCDGPNADQCLNCVHFSLGSVKTSR
670 680 690 700 710 720
>>NP_612192 (OMIM: 167405) proprotein convertase subtili (956 aa)
initn: 1869 init1: 1332 opt: 2039 Z-score: 2093.7 bits: 398.4 E(85289): 7e-110
Smith-Waterman score: 2039; 51.4% identity (75.5% similar) in 593 aa overlap (13-600:51-638)
10 20 30 40
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.: . .... :. : . .: . : .. :::: . :: . ::::: . ::: .:
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590 600 610 620 630 640
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]