Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2060
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2060, 705 aa
1>>>pF1KE2060 705 - 705 aa - 705 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1115+/-0.000481; mu= 15.6320+/- 0.029
mean_var=162.7832+/-33.068, 0's: 0 Z-trim(112.9): 432 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.100524
statistics sampled from 21532 (22076) to 21532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 9.340
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016875404 (OMIM: 216950,613785) PREDICTED: comp ( 719) 4991 737.5 4.4e-212
NP_001724 (OMIM: 216950,613785) complement C1r sub ( 705) 4990 737.3 4.8e-212
XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 668) 1430 221.0 1.2e-56
NP_001870 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 699) 1430 221.0 1.2e-56
XP_011511292 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 706) 1430 221.0 1.2e-56
NP_057630 (OMIM: 608974) complement C1r subcompone ( 487) 1320 204.9 6.3e-52
XP_016874886 (OMIM: 608974) PREDICTED: complement ( 504) 1320 204.9 6.4e-52
XP_016862361 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 615) 1298 201.8 6.6e-51
XP_016862358 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 702) 1298 201.9 7.2e-51
NP_624302 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 728) 1298 201.9 7.4e-51
XP_011511291 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 735) 1298 201.9 7.4e-51
NP_001284569 (OMIM: 608974) complement C1r subcomp ( 445) 1287 200.0 1.6e-50
XP_016874887 (OMIM: 608974) PREDICTED: complement ( 462) 1287 200.0 1.7e-50
NP_006601 (OMIM: 605102,613791) mannan-binding lec ( 686) 1028 162.7 4.4e-39
XP_016862360 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 660) 994 157.7 1.3e-37
XP_006713764 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 354) 757 123.0 2e-27
NP_001027019 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding ( 380) 757 123.1 2.1e-27
XP_011511293 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 387) 757 123.1 2.1e-27
XP_016855586 (OMIM: 605102,613791) PREDICTED: mann ( 332) 598 99.9 1.7e-20
NP_001275930 (OMIM: 206200,609862) transmembrane p ( 802) 502 86.5 4.4e-16
NP_705837 (OMIM: 206200,609862) transmembrane prot ( 811) 502 86.5 4.4e-16
XP_005262454 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) P ( 418) 473 81.9 5.4e-15
NP_001300842 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) c ( 423) 473 81.9 5.5e-15
NP_000124 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) coag ( 461) 473 82.0 5.8e-15
NP_114154 (OMIM: 608018) serine protease 27 isofor ( 290) 466 80.7 8.8e-15
NP_690851 (OMIM: 613797) serine protease 33 precur ( 280) 462 80.1 1.3e-14
XP_011520754 (OMIM: 613797) PREDICTED: serine prot ( 280) 462 80.1 1.3e-14
XP_011520753 (OMIM: 613797) PREDICTED: serine prot ( 280) 462 80.1 1.3e-14
XP_005262880 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 536) 454 79.3 4.3e-14
XP_006714200 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 610) 454 79.4 4.6e-14
NP_000119 (OMIM: 264900,612416) coagulation factor ( 625) 454 79.4 4.7e-14
XP_005262878 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 626) 454 79.4 4.7e-14
XP_016882221 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 393) 450 78.6 5.3e-14
XP_005258895 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 450 78.6 5.5e-14
NP_892028 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 450 78.6 5.5e-14
NP_002142 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 450 78.6 5.5e-14
XP_006723244 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 450 78.6 5.5e-14
XP_016882220 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 450 78.6 5.5e-14
NP_036599 (OMIM: 609341) tryptase gamma preproprot ( 321) 447 78.0 6.3e-14
NP_001119574 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 447 78.1 6.6e-14
NP_003285 (OMIM: 191080) tryptase alpha/beta-1 pre ( 275) 445 77.6 7e-14
NP_005134 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin isofor ( 406) 447 78.1 7.3e-14
NP_001305067 (OMIM: 140100,614081) haptoglobin iso ( 347) 446 77.9 7.3e-14
NP_002764 (OMIM: 600823) prostasin preproprotein [ ( 343) 444 77.6 8.9e-14
XP_016859994 (OMIM: 176860,612283,612304) PREDICTE ( 542) 446 78.2 9.6e-14
XP_011535778 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 364) 443 77.5 1e-13
NP_001254483 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulat ( 382) 443 77.5 1.1e-13
XP_006720026 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 412) 443 77.6 1.1e-13
XP_011535777 (OMIM: 227500,608446,613878) PREDICTE ( 433) 443 77.6 1.1e-13
NP_062562 (OMIM: 227500,608446,613878) coagulation ( 444) 443 77.6 1.2e-13
>>XP_016875404 (OMIM: 216950,613785) PREDICTED: compleme (719 aa)
initn: 4991 init1: 4991 opt: 4991 Z-score: 3928.6 bits: 737.5 E(85289): 4.4e-212
Smith-Waterman score: 4991; 100.0% identity (100.0% similar) in 704 aa overlap (2-705:16-719)
10 20 30 40
pF1KE2 MWLLYLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSVRFRVGREENAQWWLLYLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 VITVPTGYRVKLVFQQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VITVPTGYRVKLVFQQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 SQGNKMLLTFHTDFSNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQGNKMLLTFHTDFSNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCH
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 NYVGGYFCSCRPGYELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NYVGGYFCSCRPGYELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRV
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ERGLTLHLKFLEPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERGLTLHLKFLEPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 FFTDESGDSRGWKLRYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FFTDESGDSRGWKLRYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 GNQVLHSFTAVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GNQVLHSFTAVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYC
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 HEPYYKMQTRAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HEPYYKMQTRAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRIIG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 GQKAKMGNFPWQVFTNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQSNASLDVFLGHTNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GQKAKMGNFPWQVFTNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQSNASLDVFLGHTNV
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 EELMKLGNHPIRRVSVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDNDTFYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EELMKLGNHPIRRVSVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDNDTFYD
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 LGLMGYVSGFGVMEEKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAGHPSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGLMGYVSGFGVMEEKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAGHPSLK
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE2 QDACQGDSGGVFAVRDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QDACQGDSGGVFAVRDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED
670 680 690 700 710
>>NP_001724 (OMIM: 216950,613785) complement C1r subcomp (705 aa)
initn: 4990 init1: 4990 opt: 4990 Z-score: 3927.9 bits: 737.3 E(85289): 4.8e-212
Smith-Waterman score: 4990; 99.9% identity (99.9% similar) in 705 aa overlap (1-705:1-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWLLYLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTTVITVPTGYRVKLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWLLYLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTTVITVPTGYRVKLVF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE2 QQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSQGNKMLLTFHTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSQGNKMLLTFHTDF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCRPGY
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKLGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCRPGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFLEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFLEPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 DIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLLFFTDESGDSRGWKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLLFFTDESGDSRGWKL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFTAVCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFTAVCQD
310 320 330 340 350 360
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pF1KE2 DGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQTRAGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQTRAGSR
370 380 390 400 410 420
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pF1KE2 ESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRIIGGQKAKMGNFPWQVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRIIGGQKAKMGNFPWQVF
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 TNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQSNASLDVFLGHTNVEELMKLGNHPIRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQSNASLDVFLGHTNVEELMKLGNHPIRRV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDNDTFYDLGLMGYVSGFGVME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDNDTFYDLGLMGYVSGFGVME
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAGHPSLKQDACQGDSGGVFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAGHPSLKQDACQGDSGGVFAV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE2 RDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED
670 680 690 700
>>XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mannan-b (668 aa)
initn: 1344 init1: 567 opt: 1430 Z-score: 1137.9 bits: 221.0 E(85289): 1.2e-56
Smith-Waterman score: 1529; 36.4% identity (67.0% similar) in 645 aa overlap (77-699:48-662)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 VITVPTGYRVKLVFQQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFM
.. .. . :. :::. . . ::.. .
XP_016 SRTPHRARAHRQVKLGGPRPGSREHPRQENEVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVL
20 30 40 50 60 70
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 SQGNKMLLTFHTDFSNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCH
: :. : .::..:::::: . :: :.:.:::.::: : :: . .:.: ::
XP_016 SPGSFMSITFRSDFSNEER-----FTGFDAHYMAVDVDECKER-----EDEELSCDHYCH
80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 NYVGGYFCSCRPGYELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRV
::.:::.:::: :: :. : ..:..:::..:.:. .: :.: ..: :: . .: :.:..
XP_016 NYIGGYYCSCRFGYILHTDNRTCRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIEL
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 ERGLTLHLKFLEPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLL
:.:. ..:.: . :::.:: .: :::: ..: .. : .: :::.. : ..:.:..: .:
XP_016 EEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLIL
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 FFTDESGDSRGWKLRYTTEIIKCP--QPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQL
: .:.::..:::.: : . .:: :: . . :. : .: :.: ...: ::..
XP_016 FHSDNSGENRGWRLSYRAAGNECPELQPPVHGK---IEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKV
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 IEGNQVLHSFTAVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQY
.. : . .: : :::: .: ::: :: : .: .: . ..: ...:::..:.:
XP_016 LKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKY
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 YCHEPYYKMQTRAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQRI
:.:::::: . .. :.:::.:::.: :. :...: :::::: : . ::
XP_016 SCQEPYYKMLN------NNTGIYTCSAQGVWMNKVLGRSLPTCLPVCGLPKFSRKLMARI
370 380 390 400 410
470 480 490 500 510
pF1KE2 IGGQKAKMGNFPW-QVFTNIHGRG--GGALLGDRWILTAAHTLY----P-----KEHEAQ
..:. :. :. :: ......:. ::.:::. ::.:::: :. : .. .
XP_016 FNGRPAQKGTTPWIAMLSHLNGQPFCGGSLLGSSWIVTAAHCLHQSLDPEDPTLRDSDLL
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560
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:: ......:. ::.:::. ::.:::: :. : .. . : ... ..::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]