Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2059
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2059, 701 aa
1>>>pF1KE2059 701 - 701 aa - 701 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2993+/-0.000891; mu= 20.0438+/- 0.054
mean_var=66.6201+/-13.567, 0's: 0 Z-trim(105.2): 17 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.157135
statistics sampled from 8265 (8278) to 8265 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 3.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11129.1 ALOX12B gene_id:242|Hs108|chr17 ( 701) 4840 1106.5 0
CCDS11130.1 ALOXE3 gene_id:59344|Hs108|chr17 ( 711) 2143 495.1 1.5e-139
CCDS54084.1 ALOXE3 gene_id:59344|Hs108|chr17 ( 843) 2143 495.2 1.7e-139
CCDS11128.1 ALOX15B gene_id:247|Hs108|chr17 ( 676) 2005 463.8 3.7e-130
CCDS7212.1 ALOX5 gene_id:240|Hs108|chr10 ( 674) 1509 351.4 2.6e-96
CCDS11084.1 ALOX12 gene_id:239|Hs108|chr17 ( 663) 1375 321.0 3.6e-87
CCDS11049.1 ALOX15 gene_id:246|Hs108|chr17 ( 662) 1227 287.4 4.5e-77
CCDS58078.1 ALOX5 gene_id:240|Hs108|chr10 ( 617) 1195 280.2 6.4e-75
CCDS32558.1 ALOX15B gene_id:247|Hs108|chr17 ( 647) 983 232.1 2e-60
CCDS32559.1 ALOX15B gene_id:247|Hs108|chr17 ( 602) 628 151.6 3.1e-36
>>CCDS11129.1 ALOX12B gene_id:242|Hs108|chr17 (701 aa)
initn: 4840 init1: 4840 opt: 4840 Z-score: 5923.4 bits: 1106.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4840; 100.0% identity (100.0% similar) in 701 aa overlap (1-701:1-701)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQD
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CCDS11 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LGELIIIRLHKERYAFFPKDPWYCNYVQICAPNGRIYHFPAYQWMDGYETLALREATGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGELIIIRLHKERYAFFPKDPWYCNYVQICAPNGRIYHFPAYQWMDGYETLALREATGKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHRNPNRPEWNGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHRNPNRPEWNGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 IPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCKHSWKRLKDIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCKHSWKRLKDIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 KIFPGKKSVVSEYVAEHWAEDTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVTDDMVAPFLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KIFPGKKSVVSEYVAEHWAEDTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVTDDMVAPFLGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 GTCLQAELEKGNIYLADYRIMEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPEGKMMPIAIQLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GTCLQAELEKGNIYLADYRIMEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPEGKMMPIAIQLSQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 TPGPDCPIFLPSDSEWDWLLAKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFCLALLRNLPMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPGPDCPIFLPSDSEWDWLLAKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFCLALLRNLPMC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 HPLYKLLIPHTRYTVQINSIGRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRALSELTYDSLY
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CCDS11 HPLYKLLIPHTRYTVQINSIGRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRALSELTYDSLY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 LPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGDPELQSWVQEI
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CCDS11 LPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGDPELQSWVQEI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 FKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPNFPASMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPNFPASMR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 NPPIQTKGLTTLETFMDTLPDVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFVEEAPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NPPIQTKGLTTLETFMDTLPDVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFVEEAPRR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE2 SIEAFRQRLNQISHDIRQRNKCLPIPYYYLDPVLIENSISI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SIEAFRQRLNQISHDIRQRNKCLPIPYYYLDPVLIENSISI
670 680 690 700
>>CCDS11130.1 ALOXE3 gene_id:59344|Hs108|chr17 (711 aa)
initn: 2757 init1: 2143 opt: 2143 Z-score: 2619.0 bits: 495.1 E(32554): 1.5e-139
Smith-Waterman score: 2728; 54.1% identity (79.2% similar) in 711 aa overlap (1-701:1-711)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQD
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CCDS11 MAVYRLCVTTGPYLRAGTLDNISVTLVGTCGESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LGELIIIRLHKERYAFFPKDPWYCNYVQICAPNGRIYHFPAYQWMDGYETLALREATGKT
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CCDS11 LGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVTEPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTART
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE2 TADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHR----------
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CCDS11 ICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYAPGFPCMVDVNSFQEMESDKKFALTKTTTCV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 NPNRPEWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCK
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CCDS11 DQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNVRYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLDRK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 HSWKRLKDIRKIFPGKKSVVSEYVAEHWAEDTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVT
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CCDS11 GSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCEDHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 DDMVAPFLGEGTCLQAELEKGNIYLADYRIMEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPEGK
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CCDS11 NDMVAPLLGQDTCLQTELERGNIFLADYWILAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 MMPIAIQLSQTPGPDCPIFLPSDSEWDWLLAKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFC
..:.::::::::::: :::::.:::::::::::::: .:: :: .:.: :::. :::
CCDS11 LVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEWDWLLAKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LALLRNLPMCHPLYKLLIPHTRYTVQINSIGRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRA
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CCDS11 MATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEGLVDQVTSIGRQGLIYLMSTG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LSELTYDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGD
:...:: .. ::... ::: .:.:.::::.: .: :.:..:.::. :::::::.:. :
CCDS11 LAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSDASVQQD
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 PELQSWVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTA
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CCDS11 SELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTPGEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQHDFGA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 WMPNFPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLPDVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPD
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CCDS11 WMPNAPSSMRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLPEVNISCNNLLLFWLVSQEPKDQRPLGTYPD
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700
pF1KE2 IHFVEEAPRRSIEAFRQRLNQISHDIRQRNKCLPIPYYYLDPVLIENSISI
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CCDS11 EHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQISRDIQERNQGLALPYTYLDPPLIENSVSI
670 680 690 700 710
>>CCDS54084.1 ALOXE3 gene_id:59344|Hs108|chr17 (843 aa)
initn: 2757 init1: 2143 opt: 2143 Z-score: 2617.9 bits: 495.2 E(32554): 1.7e-139
Smith-Waterman score: 2728; 54.1% identity (79.2% similar) in 711 aa overlap (1-701:133-843)
10 20 30
pF1KE2 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQ
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CCDS54 TQPCPACRSSPPGRLLLRPALPGHPFLLPIMAVYRLCVTTGPYLRAGTLDNISVTLVGTC
110 120 130 140 150 160
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 GESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQDLGELIIIRLHKERYAFFPKDPWYCNYVQIC
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CCDS54 GESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAELGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVT
170 180 190 200 210 220
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 APNGRIYHFPAYQWMDGYETLALREATGKTTADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFL
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CCDS54 EPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTARTICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYA
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200
pF1KE2 PGLPSYVHIPSYRPPVRRHR----------NPNRPEWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNL
::.: .: . :.. .. . . : :.::::. :.. . ... :.
CCDS54 PGFPCMVDVNSFQEMESDKKFALTKTTTCVDQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNV
290 300 310 320 330 340
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 RYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCKHSWKRLKDIRKIFPGKKSVVSEYVAEHWAE
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CCDS54 RYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLDRKGSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCE
350 360 370 380 390 400
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 DTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVTDDMVAPFLGEGTCLQAELEKGNIYLADYRI
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CCDS54 DHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVTNDMVAPLLGQDTCLQTELERGNIFLADYWI
410 420 430 440 450 460
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 MEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPEGKMMPIAIQLSQTPGPDCPIFLPSDSEWDWLL
. :: :.::.:. :::::: ..:.: ..:.::::::::::: :::::.::::::::
CCDS54 LAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGALVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEWDWLL
470 480 490 500 510 520
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 AKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFCLALLRNLPMCHPLYKLLIPHTRYTVQINSI
:::::: .:: :: .:.: :::. ::: .: ::.::.:::.::::.::::::.:.:.:
CCDS54 AKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTI
530 540 550 560 570 580
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 GRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRALSELTYDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRD
.::.::: :: . :.: .:. .: .:...:: .. ::... ::: .:.:.:::
CCDS54 ARATLLNPEGLVDQVTSIGRQGLIYLMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRD
590 600 610 620 630 640
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 DSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGDPELQSWVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTV
:.: .: :.:..:.::. :::::::.:. : :::.:. ::: . .::::::::: : :
CCDS54 DGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSDASVQQDSELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTP
650 660 670 680 690 700
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 PELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPNFPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLP
:.....: .:..:::.:::::.:: .: ::::: :.:::.:: :::: :::.:..::::
CCDS54 GEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQHDFGAWMPNAPSSMRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLP
710 720 730 740 750 760
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 DVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFVEEAPRRSIEAFRQRLNQISHDIRQRN
.:. .: .::..: .:.:: :.:::: .:: ::.:::::::: ::..:: :::.::..::
CCDS54 EVNISCNNLLLFWLVSQEPKDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQISRDIQERN
770 780 790 800 810 820
690 700
pF1KE2 KCLPIPYYYLDPVLIENSISI
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CCDS54 QGLALPYTYLDPPLIENSVSI
830 840
>>CCDS11128.1 ALOX15B gene_id:247|Hs108|chr17 (676 aa)
initn: 2202 init1: 1473 opt: 2005 Z-score: 2450.3 bits: 463.8 E(32554): 3.7e-130
Smith-Waterman score: 2329; 48.4% identity (75.2% similar) in 707 aa overlap (1-701:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQD
:: ..:::.:: . .:: :..:..::::.::: :...:..:..:: .. : :.:
CCDS11 MAEFRVRVSTGEAFGAGTWDKVSVSIVGTRGESPPLPLDNLGKEFTAGAEEDFQVTLPED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 LGELIIIRLHKERYAF-----FPKDPWYCNYVQICAPNGRIYHFPAYQWMDGYETLALRE
.:.....:.:: .. . : :.: . :. : : :: :::..: ::.:.:
CCDS11 VGRVLLLRVHKAPPVLPLLGPLAPDAWFCRWFQLTPPRGGHLLFPCYQWLEGAGTLVLQE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ATGKTTADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHRNPNRP
.:.:.. : ::: ..:.::..:.:..:.:..
CCDS11 GTAKVSWADHHPVLQQQRQEELQARQEMYQWKA---------------------------
130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 EWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCKHSWKR
: ::.: .. :... :.::..:: :.:.:... : .:..:::: : :.
CCDS11 ----YNPGWPHCLDEKTVEDLELNIKYSTAKNANFYLQAGSAFAEMKIKGLLDRKGLWRS
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LKDIRKIFPGKKSVVSEYVAEHWAEDTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVTDDMVA
:.....:: ... ..:.. ::: ::.::. :.:::.:: ::::: .: .::::: :::
CCDS11 LNEMKRIFNFRRTPAAEHAFEHWQEDAFFASQFLNGLNPVLIRRCHYLPKNFPVTDAMVA
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PFLGEGTCLQAELEKGNIYLADYRIMEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPE-GKMMPI
:: :: ::::::::...:.:. :. :: : ..:. : ::. ::. .: : ..:.
CCDS11 SVLGPGTSLQAELEKGSLFLVDHGILSGIQTNVINGKPQFSAAPMTLLYQSPGCGPLLPL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 AIQLSQTPGPDCPIFLPSDSEWDWLLAKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFCLALL
::::::::::. :::::.:..::::::::::: ::: :::..:::..::. :.: :: :
CCDS11 AIQLSQTPGPNSPIFLPTDDKWDWLLAKTWVRNAEFSFHEALTHLLHSHLLPEVFTLATL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RNLPMCHPLYKLLIPHTRYTVQINSIGRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRALSEL
:.:: ::::.::::::::::..::...: .:. : . .. ..:.:::. .. : ...:
CCDS11 RQLPHCHPLFKLLIPHTRYTLHINTLARELLIVPGQVVDRSTGIGIEGFSELIQRNMKQL
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 TYDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGDPELQ
.:. : ::.:. :::.:.::::::::.. .:.:.:..:.::: ::::: .:. : :::
CCDS11 NYSLLCLPEDIRTRGVEDIPGYYYRDDGMQIWGAVERFVSEIIGIYYPSDESVQDDRELQ
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 SWVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPN
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CCDS11 AWVREIFSKGFLNQESSGIPSSLETREALVQYVTMVIFTCSAKHAAVSAGQFDSCAWMPN
510 520 530 540 550 560
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pF1KE2 FPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLPDVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFV
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CCDS58 DFVNDVYVYGMRGRKSSGFPKSVKSREQLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFGQL-F------
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CCDS58 --------------------------------------------------LGMYPEEHFI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]