Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2056
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2056, 692 aa
1>>>pF1KE2056 692 - 692 aa - 692 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5452+/-0.000863; mu= 12.6124+/- 0.052
mean_var=192.6964+/-39.774, 0's: 0 Z-trim(113.9): 14 B-trim: 671 in 1/51
Lambda= 0.092393
statistics sampled from 14533 (14542) to 14533 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.447), width: 16
Scan time: 4.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12329.1 AKAP8 gene_id:10270|Hs108|chr19 ( 692) 4757 646.7 3.3e-185
CCDS46005.1 AKAP8L gene_id:26993|Hs108|chr19 ( 646) 819 121.7 3.3e-27
CCDS77249.1 AKAP8L gene_id:26993|Hs108|chr19 ( 585) 713 107.6 5.5e-23
CCDS727.1 ZNF326 gene_id:284695|Hs108|chr1 ( 582) 511 80.6 6.9e-15
CCDS81351.1 ZNF326 gene_id:284695|Hs108|chr1 ( 493) 495 78.4 2.7e-14
>>CCDS12329.1 AKAP8 gene_id:10270|Hs108|chr19 (692 aa)
initn: 4757 init1: 4757 opt: 4757 Z-score: 3438.5 bits: 646.7 E(32554): 3.3e-185
Smith-Waterman score: 4757; 100.0% identity (100.0% similar) in 692 aa overlap (1-692:1-692)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDQGYGGYGAWSAGPANTQGAYGTGVASWQGYENYNYYGAQNTSVTTGATYSYGPASWEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDQGYGGYGAWSAGPANTQGAYGTGVASWQGYENYNYYGAQNTSVTTGATYSYGPASWEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AKANDGGLAAGAPAMHMASYGPEPCTDNSDSLIAKINQRLDMMSKEGGRGGSGGGGEGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AKANDGGLAAGAPAMHMASYGPEPCTDNSDSLIAKINQRLDMMSKEGGRGGSGGGGEGIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DRESSFRFQPFESYDSRPCLPEHNPYRPSYSYDYEFDLGSDRNGSFGGQYSECRDPARER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DRESSFRFQPFESYDSRPCLPEHNPYRPSYSYDYEFDLGSDRNGSFGGQYSECRDPARER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 GSLDGFMRGRGQGRFQDRSNPGTFMRSDPFVPPAASSEPLSTPWNELNYVGGRGLGGPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GSLDGFMRGRGQGRFQDRSNPGTFMRSDPFVPPAASSEPLSTPWNELNYVGGRGLGGPSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SRPPPSLFSQSMAPDYGVMGMQGAGGYDSTMPYGCGRSQPRMRDRDRPKRRGFDRFGPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRPPPSLFSQSMAPDYGVMGMQGAGGYDSTMPYGCGRSQPRMRDRDRPKRRGFDRFGPDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 TGRKRKQFQLYEEPDTKLARVDSEGDFSENDDAAGDFRSGDEEFKGEDELCDSGRQRGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGRKRKQFQLYEEPDTKLARVDSEGDFSENDDAAGDFRSGDEEFKGEDELCDSGRQRGEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 EDEDEDVKKRREKQRRRDRTRDRAADRIQFACSVCKFRSFDDEEIQKHLQSKFHKETLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EDEDEDVKKRREKQRRRDRTRDRAADRIQFACSVCKFRSFDDEEIQKHLQSKFHKETLRF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ISTKLPDKTVEFLQEYIVNRNKKIEKRRQELMEKETAKPKPDPFKGIGQEHFFKKIEAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISTKLPDKTVEFLQEYIVNRNKKIEKRRQELMEKETAKPKPDPFKGIGQEHFFKKIEAAH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 CLACDMLIPAQPQLLQRHLHSVDHNHNRRLAAEQFKKTSLHVAKSVLNNRHIVKMLEKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CLACDMLIPAQPQLLQRHLHSVDHNHNRRLAAEQFKKTSLHVAKSVLNNRHIVKMLEKYL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 KGEDPFTSETVDPEMEGDDNLGGEDKKETPEEVAADVLAEVITAAVRAVDGEGAPAPESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KGEDPFTSETVDPEMEGDDNLGGEDKKETPEEVAADVLAEVITAAVRAVDGEGAPAPESS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 GEPAEDEGPTDTAEAGSDPQAEQLLEEQVPCGTAHEKGVPKARSEAAEAGNGAETMAAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GEPAEDEGPTDTAEAGSDPQAEQLLEEQVPCGTAHEKGVPKARSEAAEAGNGAETMAAEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 ESAQTRVAPAPAAADAEVEQTDAESKDAVPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ESAQTRVAPAPAAADAEVEQTDAESKDAVPTE
670 680 690
>>CCDS46005.1 AKAP8L gene_id:26993|Hs108|chr19 (646 aa)
initn: 890 init1: 365 opt: 819 Z-score: 602.0 bits: 121.7 E(32554): 3.3e-27
Smith-Waterman score: 1064; 35.4% identity (59.4% similar) in 692 aa overlap (8-652:18-643)
10 20 30 40
pF1KE2 MDQGYGGYGAWSAGPANTQGAYGT-GVASWQGYENYNY---YGAQNTSVT
:. :: :. : ::: . .. .:::.:.: :: .::.
CCDS46 MSYTGFVQGSETTLQSTYSDTSAQPTCDYG-YGTWNSGTNRGYEGYGYGYGYGQDNTT--
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 TGATYSYGPA---SWEAAKANDGGLAAGAPAMHMASYGPEPCTDNSDSLIAKINQRLDM-
.:.:: : ::: ... . :.. : :: .::....:::::::
CCDS46 ---NYGYGMATSHSWEMPSSDTN---ANTSASGSAS---------ADSVLSRINQRLDMV
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150
pF1KE2 --MSKEGGRGGS-GGGGEGIQDRESSFRFQPFESYDSRPCLPEHNPYRPSYSYDYEFDLG
. . .:: :.::: :.. .:: ::: : :.. :: .:.:. .:
CCDS46 PHLETDMMQGGVYGSGGE---------RYDSYESCDSRAVLSERDLYRSGYDYS---ELD
110 120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 SDRNGSFGGQYSECRDPARERGSLDGFMRGRGQGRFQDRSNPGTFMRSDPFVPPAASSEP
. . .. :::. :: : ::. : : :.:: .: : :..:
CCDS46 PEMEMAYEGQYDAYRDQFRMRGN-DTFG-PRAQGWARD----------------ARSGRP
160 170 180 190
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 LSTPWNEL--NYVGGRGLGGPSPSRPPPSLFSQSMAPDYGVM-GMQGAGGYD--STMPYG
... .... . .:.:: . :: : :::::.. :.::.. ::.:.:.. : . .:
CCDS46 MASGYGRMWEDPMGARGQCMSGASRLP-SLFSQNIIPEYGMFQGMRGGGAFPGGSRFGFG
200 210 220 230 240 250
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 CGRSQPRMRDRDRPKRRGFDRFGPDGTGRKRKQFQLYEEPDTKLARVD-SEGDFSENDDA
: .. .:: : : : .:::: .:::.: .:.: :... :.::..
CCDS46 FGNGMKQMR-RTWKTWTTAD-FRTKK--KKRKQGGSPDEPDSKATRTDCSDNSDSDNDEG
260 270 280 290 300
340 350 360 370
pF1KE2 A-GDFRSGDE---------EFKGEDELC-DSGRQRGEKEDE-------DEDVKKRREKQ-
. :. : : . :::: ..::..:... : ::. . .:. :
CCDS46 TEGEATEGLEGTEAVEKGSRVDGEDEEGKEDGREEGKEDPEKGALTTQDENGQTKRKLQA
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KE2 ------RRRDRTRDRAADRIQFACSVCKFRSFDDEEIQKHLQSKFHKETLRFISTKLPDK
... : ::: ..::::.::.::.:.: ..:. .::.:::::: .....:::: .
CCDS46 GKKSQDKQKKRQRDRMVERIQFVCSLCKYRTFYEDEMASHLDSKFHKEHFKYVGTKLPKQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 TVEFLQEYIVNRNKKIEKRRQELMEKETAKPK----PDPFKGIGQEHFFKKIEAAHCLAC
:..:::::..:..:: :. :. . . . . : . :..::: ::.::::: ::
CCDS46 TADFLQEYVTNKTKKTEELRKTVEDLDGLIQQIYRDQDLTQEIAMEHFVKKVEAAHCAAC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 DMLIPAQPQLLQRHLHSVDHNHNRRLAAEQFKKTSLHVAKSVLNNRHIVKMLEKYLKGED
:..:: : ..:.::...:::.:::: :: ::.:: ::.:.:::. : : ::.:::::.
CCDS46 DLFIPMQFGIIQKHLKTMDHNRNRRLMMEQSKKSSLMVARSILNNKLISKKLERYLKGEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 PFTSETVDPEMEGDDNLGGE-DKKETPEEVAADVLAEVITAAVRAVDGEGAPAPESSGEP
::: .. . : : .. :: :. : .. . :: . : : : ::. : :
CCDS46 PFT-DSPEEEKEQEEAEGGALDEGAQGEAAGISEGAEGVPAQP-PVPPEPAPGAVSPPPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AEDEGPTDTAEAGSDPQAEQLLEEQVPCGTAHEKGVPKARSEAAEAGNGAETMAAEAESA
: . : :. : :..:. .:.: : : :.:
CCDS46 P----PPEEEEEGAVPLLGGALQRQI-------RGIPGLDVEDDEEGGGGAP
610 620 630 640
670 680 690
pF1KE2 QTRVAPAPAAADAEVEQTDAESKDAVPTE
>>CCDS77249.1 AKAP8L gene_id:26993|Hs108|chr19 (585 aa)
initn: 909 init1: 365 opt: 713 Z-score: 526.2 bits: 107.6 E(32554): 5.5e-23
Smith-Waterman score: 982; 35.6% identity (60.7% similar) in 585 aa overlap (104-652:38-582)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 AMHMASYGPEPCTDNSDSLIAKINQRLDMMSKEGGRGGSGGGGEGIQDRESSFRFQPFES
...: .: . : : : :: ... .. .::
CCDS77 QGSETTLQSTYSDTSAQPTCDYGYGTWNSGTNRGYEGYGYGYGYG-QDNTTNYGYDSYES
10 20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 YDSRPCLPEHNPYRPSYSYDYEFDLGSDRNGSFGGQYSECRDPARERGSLDGFMRGRGQG
::: : :.. :: .:.:. .: . . .. :::. :: : ::. : : :.::
CCDS77 CDSRAVLSERDLYRSGYDYS---ELDPEMEMAYEGQYDAYRDQFRMRGN-DTFG-PRAQG
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 RFQDRSNPGTFMRSDPFVPPAASSEPLSTPWNEL--NYVGGRGLGGPSPSRPPPSLFSQS
.: : :..:... .... . .:.:: . :: : :::::.
CCDS77 WARD----------------ARSGRPMASGYGRMWEDPMGARGQCMSGASRLP-SLFSQN
130 140 150 160
260 270 280 290 300
pF1KE2 MAPDYGVM-GMQGAGGYD--STMPYGCGRSQPRMRDRDRPKRRGFDRFGPDGTGRKRKQF
. :.::.. ::.:.:.. : . .: : .. .:: : : : .::::
CCDS77 IIPEYGMFQGMRGGGAFPGGSRFGFGFGNGMKQMR-RTWKTWTTAD-FRTK--KKKRKQG
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350
pF1KE2 QLYEEPDTKLARVD-SEGDFSENDDAA-GDFRSGDE---------EFKGEDELC-DSGRQ
.:::.: .:.: :... :.::... :. : : . :::: ..::.
CCDS77 GSPDEPDSKATRTDCSDNSDSDNDEGTEGEATEGLEGTEAVEKGSRVDGEDEEGKEDGRE
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400
pF1KE2 RGEKEDE-------DEDVKKRREKQ-------RRRDRTRDRAADRIQFACSVCKFRSFDD
.:... : ::. . .:. : ... : ::: ..::::.::.::.:.: .
CCDS77 EGKEDPEKGALTTQDENGQTKRKLQAGKKSQDKQKKRQRDRMVERIQFVCSLCKYRTFYE
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 EEIQKHLQSKFHKETLRFISTKLPDKTVEFLQEYIVNRNKKIEKRRQELMEKETAKPK--
.:. .::.:::::: .....:::: .:..:::::..:..:: :. :. . . . .
CCDS77 DEMASHLDSKFHKEHFKYVGTKLPKQTADFLQEYVTNKTKKTEELRKTVEDLDGLIQQIY
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510
pF1KE2 --PDPFKGIGQEHFFKKIEAAHCLACDMLIPAQPQLLQRHLHSVDHNHNRRLAAEQFKKT
: . :..::: ::.::::: :::..:: : ..:.::...:::.:::: :: ::.
CCDS77 RDQDLTQEIAMEHFVKKVEAAHCAACDLFIPMQFGIIQKHLKTMDHNRNRRLMMEQSKKS
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 SLHVAKSVLNNRHIVKMLEKYLKGEDPFTSETVDPEMEGDDNLGGE-DKKETPEEVAADV
:: ::.:.:::. : : ::.:::::.::: .. . : : .. :: :. : .. .
CCDS77 SLMVARSILNNKLISKKLERYLKGENPFT-DSPEEEKEQEEAEGGALDEGAQGEAAGISE
470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 LAEVITAAVRAVDGEGAPAPESSGEPAEDEGPTDTAEAGSDPQAEQLLEEQVPCGTAHEK
:: . : : : ::. : : : . : :. : :..:. .
CCDS77 GAEGVPAQP-PVPPEPAPGAVSPPPPP----PPEEEEEGAVPLLGGALQRQI-------R
520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 GVPKARSEAAEAGNGAETMAAEAESAQTRVAPAPAAADAEVEQTDAESKDAVPTE
:.: : : :.:
CCDS77 GIPGLDVEDDEEGGGGAP
570 580
>>CCDS727.1 ZNF326 gene_id:284695|Hs108|chr1 (582 aa)
initn: 501 init1: 207 opt: 511 Z-score: 380.7 bits: 80.6 E(32554): 6.9e-15
Smith-Waterman score: 642; 30.7% identity (55.7% similar) in 636 aa overlap (33-627:5-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 QGYGGYGAWSAGPANTQGAYGTGVASWQGYENYNYYGAQNT-SVTTGATYSYGPASWEAA
..:.. . .:: . .: .:::.:.
CCDS72 MDFEDDYTHSACRNTYQGFNGMDRDYGPGSY---
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KANDGGLAAGAPAMHMASYGPEPCTDNSDSLIAKINQRLDMMSKEGGRGGSGGGGEGIQD
::. . .::: . :. .:: : .. :: :::
CCDS72 ----GGMDRD---YGHGSYGGQRSMDSY------LNQSYGMDNHSGGGGGS---------
40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RESSFRFQPFESYDSRPCLPEHNPYRPSYSYDYEFDLGSDRNGSFGGQYSECRDPARERG
:: :.:::::: : .. :: .:... . : .::.::.. . :.
CCDS72 -----RFGPYESYDSRSSLGGRDLYRSGYGFNEPEQ--SRFGGSYGGRF-----ESSYRN
70 80 90 100 110
190 200 210 220 230
pF1KE2 SLDGFMRGRGQGRFQ-----DRSN--PGTFMRSDPFVPPAASSEPLSTPWNELNYVGGRG
:::.: ::.:: . .::. :: ::. : .: .:.: . ::.::
CCDS72 SLDSFG-GRNQGGSSWEAPYSRSKLRPG-FME-DRGRENYSSYSSFSSPHMKPAPVGSRG
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 LGGPSPSRPPPSLFSQSMAPDYGVMGMQGAGGYDSTMPYGCGRSQPRMRDRDRPKRRG--
: :. : : : : .... :: :: : ::.. .: : .: :
CCDS72 RGTPAY---PESTF--------GSRNYDAFGG-PST---GRGRGRGHMGDFGSIHRPGIV
180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KE2 --FDRFGPDGT-----GRKRKQFQLYEEPDTKLARVDSEGDFSENDDAAGDFRSGDEEFK
.. . . : : :::..: ...:. : : .. : . :...
CCDS72 VDYQNKSTNVTVAAARGIKRKMMQPFNKPS---------GTFIKKPKLAKPM----EKIS
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 GEDELCDSGRQRGEKEDEDED--VKKRREKQRRR-DRTRDRAAD--RIQFACSVCKFRSF
: : . :..:.: .. :::::::: ... .. .: :. :.:: ::::.:
CCDS72 ----LSKSPTKTDPKNEEEEKRRIEARREKQRRRREKNSEKYGDGYRMAFTCSFCKFRTF
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450
pF1KE2 DDEEIQKHLQSKFHKETLRFISTKLP-DKTV-EFLQEYIVNRNKKIEKRRQELMEK-ETA
....:. ::.:. :.::: :. . ::.: :::.: .::. :: :.:. .. :..
CCDS72 EEKDIELHLESSSHQETLDHIQKQTKFDKVVMEFLHECMVNKFKKTSIRKQQTNNQTEVV
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 KP-KPDPFKGIGQEHFFKKIEAAHCLACDMLIPAQPQLLQRHLHSVDHNHNRRLAAEQFK
: . : ..:. . . :.:..:: ::.. ::: . .:.::.: :: .... ::.:
CCDS72 KIIEKDVMEGVTVDDHMMKVETVHCSACSVYIPALHSSVQQHLKSPDHIKGKQAYKEQIK
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560
pF1KE2 KTSLHVAKSVLNNRHIVKMLEKYLKGEDPFT--SETVDPEMEGDDN-----------LGG
. :. .: :.::: . :...:::.:: ... : ..:::..
CCDS72 RESVLTATSILNNPIVKARYERFVKGENPFEIQDHSQDQQIEGDEEDEEKIDEPIEEEED
450 460 470 480 490 500
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 EDKKETPEEVA-ADVLAEVITAAVRAVDGEGAPAPESSGEPAEDEGPTDTAEA-GSDPQA
::..: :::. .. . :: . ...::: .. :: .: : . .:. : ..
CCDS72 EDEEEEAEEVGEVEEVEEVEEVREGGIEGEGNI--QGVGEGGE-VGVVGEVEGVGEVEEV
510 520 530 540 550
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 EQLLEEQVPCGTAHEKGVPKARSEAAEAGNGAETMAAEAESAQTRVAPAPAAADAEVEQT
:.: ::
CCDS72 EELEEETAKEEPADFPVEQPEEN
560 570 580
>>CCDS81351.1 ZNF326 gene_id:284695|Hs108|chr1 (493 aa)
initn: 458 init1: 207 opt: 495 Z-score: 370.1 bits: 78.4 E(32554): 2.7e-14
Smith-Waterman score: 522; 30.3% identity (58.7% similar) in 446 aa overlap (234-627:39-476)
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FMRSDPFVPPAASSEPLSTPWNELNYVGGRGLGGPSPSRPPPSLFSQSMAPDYGVMGMQG
: :. . .: : ..:: ::. . .:
CCDS81 HSACRNTYQGFNGMDRDYGPGSYGGMDRDYGHGSYGGQRSMDSYLNQS----YGMDNHSG
10 20 30 40 50 60
270 280 290 300 310
pF1KE2 AGGYDS-------TMPYGC-GRSQPRMRDRDRPKRRGFDRFGPDGTGRKRKQFQL-----
.:: .: : : ::. : . . .: ..: :: .::: : . ..
CCDS81 GGGGSSFSSPHMKPAPVGSRGRGTPAYPESTFGSR-NYDAFGGPSTGRGRGRGHMGDFGS
70 80 90 100 110 120
320 330 340 350
pF1KE2 ---------YEEPDTKLARVDSEGD----FSENDDAAGDFRSGDEEFKGEDE--LCDSGR
:.. .:... . ..: .. . .: : . . : .. : :
CCDS81 IHRPGIVVDYQNKSTNVTVAAARGIKRKMMQPFNKPSGTFIKKPKLAKPMEKISLSKSPT
130 140 150 160 170 180
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 QRGEKEDEDED--VKKRREKQRRR-DRTRDRAAD--RIQFACSVCKFRSFDDEEIQKHLQ
. :..:.: .. :::::::: ... .. .: :. :.:: ::::.:....:. ::.
CCDS81 KTDPKNEEEEKRRIEARREKQRRRREKNSEKYGDGYRMAFTCSFCKFRTFEEKDIELHLE
190 200 210 220 230 240
420 430 440 450 460
pF1KE2 SKFHKETLRFISTKLP-DKTV-EFLQEYIVNRNKKIEKRRQELMEK-ETAKP-KPDPFKG
:. :.::: :. . ::.: :::.: .::. :: :.:. .. :..: . : ..:
CCDS81 SSSHQETLDHIQKQTKFDKVVMEFLHECMVNKFKKTSIRKQQTNNQTEVVKIIEKDVMEG
250 260 270 280 290 300
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 IGQEHFFKKIEAAHCLACDMLIPAQPQLLQRHLHSVDHNHNRRLAAEQFKKTSLHVAKSV
. . . :.:..:: ::.. ::: . .:.::.: :: .... ::.:. :. .: :.
CCDS81 VTVDDHMMKVETVHCSACSVYIPALHSSVQQHLKSPDHIKGKQAYKEQIKRESVLTATSI
310 320 330 340 350 360
530 540 550 560 570
pF1KE2 LNNRHIVKMLEKYLKGEDPFT--SETVDPEMEGDDN-----------LGGEDKKETPEEV
::: . :...:::.:: ... : ..:::.. ::..: :::
CCDS81 LNNPIVKARYERFVKGENPFEIQDHSQDQQIEGDEEDEEKIDEPIEEEEDEDEEEEAEEV
370 380 390 400 410 420
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 A-ADVLAEVITAAVRAVDGEGAPAPESSGEPAEDEGPTDTAEA-GSDPQAEQLLEEQVPC
. .. . :: . ...::: .. :: .: : . .:. : ..:.: ::
CCDS81 GEVEEVEEVEEVREGGIEGEGNI--QGVGEGGE-VGVVGEVEGVGEVEEVEELEEETAKE
430 440 450 460 470 480
640 650 660 670 680 690
pF1KE2 GTAHEKGVPKARSEAAEAGNGAETMAAEAESAQTRVAPAPAAADAEVEQTDAESKDAVPT
CCDS81 EPADFPVEQPEEN
490
692 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 16:09:31 2016 done: Mon Nov 7 16:09:31 2016
Total Scan time: 4.340 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]