Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2053, 688 aa
1>>>pF1KE2053 688 - 688 aa - 688 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7461+/-0.00109; mu= 17.5540+/- 0.065
mean_var=128.5566+/-25.272, 0's: 0 Z-trim(106.7): 224 B-trim: 2 in 1/48
Lambda= 0.113117
statistics sampled from 8862 (9118) to 8862 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31735.1 C1S gene_id:716|Hs108|chr12 ( 688) 4868 807.0 0
CCDS123.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1 ( 686) 1656 282.8 1.2e-75
CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 699) 1466 251.8 2.5e-66
CCDS33908.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 728) 1280 221.4 3.6e-57
CCDS33909.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 380) 996 174.8 2.1e-43
CCDS124.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1 ( 185) 479 90.0 3.3e-18
CCDS45524.1 HP gene_id:3240|Hs108|chr16 ( 406) 480 90.6 4.9e-18
CCDS45525.1 HP gene_id:3240|Hs108|chr16 ( 347) 476 89.9 6.9e-18
CCDS82010.1 HP gene_id:3240|Hs108|chr16 ( 347) 475 89.7 7.7e-18
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 476 90.0 7.8e-18
CCDS42193.1 HPR gene_id:3250|Hs108|chr16 ( 348) 460 87.3 4.2e-17
CCDS31476.1 F2 gene_id:2147|Hs108|chr11 ( 622) 456 86.9 9.7e-17
CCDS2145.1 PROC gene_id:5624|Hs108|chr2 ( 461) 451 85.9 1.4e-16
CCDS9529.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 444) 425 81.7 2.6e-15
CCDS9528.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 466) 425 81.7 2.7e-15
CCDS73602.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 382) 422 81.1 3.3e-15
CCDS156.1 CTRC gene_id:11330|Hs108|chr1 ( 268) 419 80.4 3.7e-15
CCDS47145.1 PRSS48 gene_id:345062|Hs108|chr4 ( 328) 411 79.2 1e-14
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 414 80.3 1.5e-14
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 400 77.8 6.1e-14
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 400 78.0 7.4e-14
CCDS45469.1 PRSS8 gene_id:5652|Hs108|chr16 ( 343) 387 75.3 1.6e-13
CCDS10476.1 PRSS27 gene_id:83886|Hs108|chr16 ( 290) 383 74.6 2.3e-13
CCDS83291.1 PLAT gene_id:5327|Hs108|chr8 ( 473) 383 74.8 3.1e-13
CCDS9530.1 F10 gene_id:2159|Hs108|chr13 ( 488) 382 74.7 3.6e-13
CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs108|chr16 ( 275) 376 73.4 4.8e-13
CCDS58452.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 752) 381 74.8 5.3e-13
CCDS58453.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 850) 381 74.8 5.7e-13
CCDS32436.1 PRSS36 gene_id:146547|Hs108|chr16 ( 855) 381 74.8 5.8e-13
CCDS6127.1 PLAT gene_id:5327|Hs108|chr8 ( 516) 374 73.4 9.2e-13
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 371 72.9 1.2e-12
CCDS34302.1 F12 gene_id:2161|Hs108|chr5 ( 615) 372 73.2 1.3e-12
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 371 72.9 1.3e-12
CCDS6126.1 PLAT gene_id:5327|Hs108|chr8 ( 562) 371 73.0 1.4e-12
CCDS73251.1 OVCH2 gene_id:341277|Hs108|chr11 ( 565) 370 72.8 1.5e-12
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 372 73.4 1.6e-12
CCDS10478.1 PRSS21 gene_id:10942|Hs108|chr16 ( 314) 362 71.2 2.6e-12
CCDS42110.1 PRSS33 gene_id:260429|Hs108|chr16 ( 280) 357 70.3 4.2e-12
CCDS3369.1 HGFAC gene_id:3083|Hs108|chr4 ( 655) 352 69.9 1.3e-11
CCDS75098.1 HGFAC gene_id:3083|Hs108|chr4 ( 662) 352 70.0 1.3e-11
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 347 69.1 2.1e-11
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 346 68.9 2.2e-11
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 343 68.1 2.2e-11
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 346 68.9 2.3e-11
CCDS14101.1 ACR gene_id:49|Hs108|chr22 ( 421) 338 67.4 4.7e-11
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 336 67.0 4.9e-11
>>CCDS31735.1 C1S gene_id:716|Hs108|chr12 (688 aa)
initn: 4868 init1: 4868 opt: 4868 Z-score: 4304.7 bits: 807.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4868; 100.0% identity (100.0% similar) in 688 aa overlap (1-688:1-688)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPMPCPKEDTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWSNSKLKCQPVDCG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IPESIENGKVEDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAGNGSWVNEVLGPELPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDNPWAGGALINEYWVLTAAHVVEGN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 REPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 EKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQCG
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KE2 TYGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TYGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
670 680
>>CCDS123.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1 (686 aa)
initn: 825 init1: 370 opt: 1656 Z-score: 1471.9 bits: 282.8 E(32554): 1.2e-75
Smith-Waterman score: 1656; 38.2% identity (65.2% similar) in 701 aa overlap (1-681:9-685)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHL
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CCDS12 MRLLTLLGLLCGSVATPLGPKWPEP-VFGRLASPGFPGEYANDQERRWTLTAPPGYRLRL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 YFTHLDIELSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKS
::::.:.:::. : :: :.. :: . ::::.:... ..: . : ..:.. :.:
CCDS12 YFTHFDLELSHLCEYDFVKLSSGAKVLATLCGQESTDTERAPGKDTFYSLGSSLDITFRS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DFSNEERFTGFAAYYVATDINEC-TDFVDVP-CSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKN
:.:::. :::: :.:.: ::.:: . ..: :.: :.: .::..::: : :: . ..
CCDS12 DYSNEKPFTGFEAFYAAEDIDECQVAPGEAPTCDHHCHNHLGGFYCSCRAGYVLHRNKRT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CGVNCSGDVFTALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADS
:.. :::.::: ::..::.::.:::. : : :.: ::.::.:.. . :.::::.
CCDS12 CSALCSGQVFTQRSGELSSPEYPRPYPKLSSCTYSISLEEGFSVILDFV-ESFDVETHPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 AGNCLDSLVFVAGDRQ-FGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHG
. : ... . ::. ::.::. .: ::::::.. : : :: .:.. :::..: .
CCDS12 TL-CPYDFLKIQTDREEHGPFCGKTLPH--RIETKSNTVTITFVTDESGDHTGWKIHYTS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 DPMPCPKE-DTPNSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWS
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CCDS12 TAQPCPYPMAPPNGHVSPVQAKYILKDSFSIFCETGYELLQGHLPLKSFTAVCQKDGSWD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 NSKLKCQPVDCGIPESIENGKVE---DPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAG
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CCDS12 RPMPACSIVDCGPPDDLPSGRVEYITGPGVTTYKAVIQYSCEETFYTMKVNDG-KYVCEA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 NGSWVNEVLGPELPKCVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVF-FDNPWAGGAL
.: :.. :: : ::::. . :: ::. : .:::::. . . :.:::
CCDS12 DGFWTSSKGEKSLPVCEPVCGLSAR--TTGGRIYGGQKAKPGDFPWQVLILGGTTAAGAL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 INEYWVLTAAHVVEGNREPTMYVGSTSVQTSRLAKSKMLTP-------EHVFIHPGWKLL
. . :::::::.: ... ..:. :.. : :.: : :::: :.
CCDS12 LYDNWVLTAAHAVYEQKH------DASALDIRMGTLKRLSPHYTQAWSEAVFIHEGY---
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 EVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVKMGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGRTEKRD
..:::::::..:.. : .. ...::::: .. . :.: :::: :..
CCDS12 ---THDAGFDNDIALIKLNNKVVINSNITPICLPRKEAESFMRTDDIGTASGWGLTQRGF
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 RAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKVEKPTADAEAYVFTPNMICAGGEKG-MDSCKGDSGGAF
: : . .:.. .:: . ::: . : ::.::: :.: :::.::::::.
CCDS12 LARNLMYVDIPIVDHQKCT-AAYEKPPYPRGSV--TANMLCAGLESGGKDSCRGDSGGAL
590 600 610 620 630
640 650 660 670 680
pF1KE2 AVQDPNDKTKFYAAGLVSWGPQ-CGT---YGLYTRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED
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CCDS12 VFLD-SETERWFVGGIVSWGSMNCGEAGQYGVYTKVINYIPWIENIISDF
640 650 660 670 680
>>CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 (699 aa)
initn: 836 init1: 424 opt: 1466 Z-score: 1304.2 bits: 251.8 E(32554): 2.5e-66
Smith-Waterman score: 1599; 36.8% identity (64.4% similar) in 699 aa overlap (3-677:11-693)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHL
:. : . : . .:.:.: ::.::..:::. : .:.: ::.:. :.:
CCDS33 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 YFTHLDIELSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKS
:: :...: : : :: :.. . : . .::...... ..: : : . ... :.:
CCDS33 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 DFSNEERFTGFAAYYVATDINECTDFVD--VPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKN
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CCDS33 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KE2 CGVNCSGDVFTALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRRED-FDVEAAD
: :.:: ..:: : :.::..:.:::..:.: : :.::.:: .:.:. :: ::.:
CCDS33 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGF--MVNLQFEDIFDIEDHP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 SAGNCLDSLVFVAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHG
. : . . .: . .::.::. : : : :.:... :.:..: .:...::.: :..
CCDS33 EVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEP--ISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 DPMPCPKEDTP-NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWS
::. . : .. ::..::: :.: : ..: :..:.. : .: : ..: ::
CCDS33 AGNECPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 NSKLKCQPVDCGIPESIENGKVE---DPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAG
:. :. ::: : .:.: . . : . : :.:.:.:::: : :.. : : :..
CCDS33 NKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 NGSWVNEVLGPELPKCVPVCGVPREPFEEKQRIIGGSDADIKNFPWQVFFDN----PWAG
.: :.:.::: :: :.::::.:. . ::..: :. . :: ..... :. :
CCDS33 QGVWMNKVLGRSLPTCLPVCGLPKFSRKLMARIFNGRPAQKGTTPWIAMLSHLNGQPFCG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 GALINEYWVLTAAHVVEGN---REPTMY---VGSTSVQTSRLAKSKMLTPEHVFIHPGWK
:.:.. :..:::: .. . ..::. . : : :.: : .. : : :
CCDS33 GSLLGSSWIVTAAHCLHQSLDPEDPTLRDSDLLSPSDFKIILGKHWRLRSDENEQHLGVK
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 LLEV-PEGRTN-FDNDIALVRL-KDPVKMGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGDLGLISGWGR
. :. : :.::.:::.: ..:: .. : ::::: . ..: . ..::::.
CCDS33 HTTLHPQYDPNTFENDVALVELLESPV-LNAFVMPICLP----EGPQQEGAMVIVSGWGK
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE2 TEKRDRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKVEKPTADAEAYVFTPNMICAG-GEKGMDSCKGD
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CCDS33 QFLQRFPETLMEIEIPIVDHSTCQ-----KAYAPLKKKV-TRDMICAGEKEGGKDACAGD
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.. : : :::.. :.::::::....:. : :.:.: .:. . : ..
CCDS33 NDKWFGSGALLSASWILTAAHVLRSQRRDTTVIPVSKEHVTVYLGLHDVRDKSGAVNS--
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CCDS33 LGLVAGWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECK-TSYESRSGN---YS
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CCDS33 VTENMFCAGYYEGGKDTCLGDSGGAFVIFD-DLSQRWVVQGLVSWGGPEECGSKQVYGVY
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670 680
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:.:.:::::. . :
CCDS33 TKVSNYVDWVWEQMGLPQSVVEPQVER
710 720
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CCDS33 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGF--MVNLQFEDIFDIEDHP
190 200 210 220 230
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pF1KE2 SAGNCLDSLVFVAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHG
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CCDS33 EVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEP--ISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRA
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CCDS33 NKIPTCKKNEIDLESELKSEQVTE
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:
CCDS12 CSEQSL
180
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680
pF1KE2 VDWIMKTMQENSTPRED
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CCDS45 QDWVQKTIAEN
340
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:.: .::... . ::.:..::. :... : ::::: :.:: . :
CCDS82 EIEKVVLHPNYSQV-----------DIGLIKLKQKVSVNERVMPICLP--SKDYAEV-GR
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CCDS82 VGYVSGWGRNANFKFTDHLKYVMLPVADQDQCIRHYEGSTVPEKKTPKSPVGVQP-ILNE
220 230 240 250 260 270
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CCDS82 HTFCAGMSKYQEDTCYGDAGSAFAVHDLEEDT-WYATGILSFDKSCAVAEYGVYVKVTSI
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680
pF1KE2 VDWIMKTMQENSTPRED
::..::. ::
CCDS82 QDWVQKTIAEN
340
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CCDS32 GRLPHTQRLLEVISVCDCPRGRFLAAICQDCGRRKLPVD---RIVGGRDTSLGRWPWQVS
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pF1KE2 FDNPWA---GGALINEYWVLTAAHVV-EGNREPT---MYVGSTSVQTSRLAKSKMLTPEH
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CCDS32 LRYDGAHLCGGSLLSGDWVLTAAHCFPERNRVLSRWRVFAGAVA-QAS--PHGLQLGVQA
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: : :. .. :... : .::::::.:..:. . ..:.::: .. :.:: . .
CCDS32 VVYHGGYLPFRDPNSEEN-SNDIALVHLSSPLPLTEYIQPVCLP--AAGQALVDGKICTV
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pF1KE2 SGWGRTEKR-DRAVRLKAARLPVAPLRKCKEVKVEKPTADAEAYVFTPNMICAG-GEKGM
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CCDS32 TGWGNTQYYGQQAGVLQEARVPIISNDVCN-------GADFYGNQIKPKMFCAGYPEGGI
300 310 320 330 340
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:.:.::::: :. .: ..: .. :.:::: :. :.::.:... .::.....
CCDS32 DACQGDSGGPFVCEDSISRTPRWRLCGIVSWGTGCALAQKPGVYTKVSDFREWIFQAIKT
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 NSTPRED
.:
CCDS32 HSEASGMVTQL
410
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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