FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2037, 634 aa
1>>>pF1KE2037 634 - 634 aa - 634 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6543+/-0.000833; mu= 10.7881+/- 0.051
mean_var=176.7497+/-35.437, 0's: 0 Z-trim(113.7): 20 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.096471
statistics sampled from 14274 (14289) to 14274 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.439), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 637) 4266 606.0 5e-173
CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 636) 4249 603.6 2.6e-172
CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX ( 628) 3674 523.6 3.1e-148
CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 499) 3362 480.1 3.1e-135
CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 642) 1162 174.0 5.6e-43
CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 684) 1162 174.0 5.8e-43
CCDS4980.1 EEF1A1 gene_id:1915|Hs108|chr6 ( 462) 707 110.5 5e-24
CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 ( 463) 704 110.1 6.8e-24
>>CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (637 aa)
initn: 4252 init1: 4252 opt: 4266 Z-score: 3219.9 bits: 606.0 E(32554): 5e-173
Smith-Waterman score: 4266; 99.2% identity (99.4% similar) in 637 aa overlap (1-634:1-637)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDPGSGGGGGGGG---SSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDPGSGGGGGGGGGGGSSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRCPAAPPPPAGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::
CCDS45 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPAAPPPPVGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KE2 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
610 620 630
>>CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (636 aa)
initn: 3385 init1: 3385 opt: 4249 Z-score: 3207.1 bits: 603.6 E(32554): 2.6e-172
Smith-Waterman score: 4249; 99.1% identity (99.2% similar) in 637 aa overlap (1-634:1-636)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MDPGSGGGGGGGG---SSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MDPGSGGGGGGGGGGGSSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQREN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRCPAAPPPPAGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::
CCDS45 LSAAFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPAAPPPPVGGAANNHGAGSGAGGRAAPV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPI-ENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMVD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPGH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINKM
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIGL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPNKHNVE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQIVIIEH
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARLRTAGT
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630
pF1KE2 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
600 610 620 630
>>CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX (628 aa)
initn: 3523 init1: 3198 opt: 3674 Z-score: 2774.7 bits: 523.6 E(32554): 3.1e-148
Smith-Waterman score: 3674; 88.5% identity (94.4% similar) in 627 aa overlap (16-634:3-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDPGSGGGGGGGGSSSGSSSSDSAPDCWDQADMEAPGPGPCGGGGSLAAAAEAQRENLSA
:::::::::::::::.:::.:: .: : : : .:.:::::: ::.
CCDS14 MDSGSSSSDSAPDCWDQVDMESPGSAPSGDGVS-SAVAEAQREPLSS
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE2 AFSRQLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRCPAAPPP-PAGGAANNH---GAGSGAG---GR
::::.::::::::::::::::::::::: :. :: :::...:.. ::: : ::
CCDS14 AFSRKLNVNAKPFVPNVHAAEFVPSFLRGPTQPPTLPAGSGSNDETCTGAGYPQGKRMGR
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 AAPVESSQEEQSLC-EGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSL
.:::: :.:: . :::::::.::::::.:::::.::. ::::::..:.:::::::::
CCDS14 GAPVEPSREEPLVSLEGSNSAVTMELSEPVVENGEVEMALEESWEHSKEVSEAEPGGGSS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GDGRPPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYL
::. :::::..:::::.::: : :::..: ::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS14 GDSGPPEESGQEMMEEKEEIRKSKSVIVPSGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMFL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS14 TGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETERKHFTIL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 DAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCP
::::::::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::
CCDS14 LINKMDDPTVNWSIERYEECKEKLVPFLKKVGFSPKKDIHFMPCSGLTGANIKEQSDFCP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 WYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQQLVMMPN
:: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS14 WYTGLPFIPYLDNLPNFNRSIDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSIFKGQQLVMMPN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 KHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDAQI
:::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::
CCDS14 KHNVEVLGILSDDTETDFVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPSNLCHSGRTFDVQI
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 VIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARL
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALISLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIARL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630
pF1KE2 RTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
590 600 610 620
>>CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (499 aa)
initn: 3362 init1: 3362 opt: 3362 Z-score: 2541.4 bits: 480.1 E(32554): 3.1e-135
Smith-Waterman score: 3362; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (136-634:1-499)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 AGSGAGGRAAPVESSQEEQSLCEGSNSAVSMELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MELSEPIVENGETEMSPEESWEHKEEISEA
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 EPGGGSLGDGRPPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EPGGGSLGDGRPPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTI
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 GGQIMYLTGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GGQIMYLTGMVDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETE
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 KKHFTILDAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KKHFTILDAPGHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTA
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 GVKHLIVLINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVKHLIVLINKMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLK
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 EQSDFCPWYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EQSDFCPWYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGTVVLGKLESGSICKGQ
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 QLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QLVMMPNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSG
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 RTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RTFDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQD
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630
pF1KE2 QVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QVCIARLRTAGTICLETFKDFPQMGRFTLRDEGKTIAIGKVLKLVPEKD
460 470 480 490
>>CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 (642 aa)
initn: 926 init1: 637 opt: 1162 Z-score: 885.1 bits: 174.0 E(32554): 5.6e-43
Smith-Waterman score: 1170; 37.3% identity (66.5% similar) in 549 aa overlap (107-629:97-640)
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 VHAAEFVPSFLRCPAAPPPPAGGAANNHGAGSGAGGRAAPVESSQEEQSLCEG------S
:. : :. . ..:. :. . :
CCDS47 KFDVQKALSGVLEQDRVQSLKDKNEATVSTGKIAKGKPVDSQTSRSESEIVPKVAKMTVS
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180
pF1KE2 NSAVSMELSEPIV---ENGETEMSPEESWEHKEEISEAEPGGGSLGDGRPPEESAHEMME
.. .: . : : :::.. .:... .. :. .. . .. ::. . :
CCDS47 GKKQTMGFEVPGVSSEENGHSFHTPQKGPPIEDAIASSDVLETASKSANPPHTI--QASE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE2 EEEEIPKP--------KSVVAPPGAPK----KEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGM
:. : : ... . : :. .:.: ::::::::::. :...:: :
CCDS47 EQSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 VDKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAP
..:::..:::.:.:. .. .. .:.:: . :::..: :..:: . ::: : .:..:::
CCDS47 INKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 GHKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLIN
:::.:.:::: ::.:::.::::..: .::::.::: :::::::..:... :: .: : .:
CCDS47 GHKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 KMDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANL---KEQSDFCP
:::. :::..::..: :: :::..::. ..:. :.: :::.: :: ...:..
CCDS47 KMDQ--VNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFK-ESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 WYIGLPFIPYLDNLPNFNRSVDGPIRLPIVDKYKDMGT--VVLGKLESGSICKGQQLVMM
:: :: .. .:.. .::.: :.:: . : .::.:. . ::.:.: : :..:. :
CCDS47 WYKGLCLLEQIDSFKPPQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGDRLLAM
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 PNKHNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRTFDA
: ... : :: : .: .: :..... : :.. .: : :.: :. .. : :
CCDS47 PPNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 QIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQVCIA
.:.:.. . : :. ..:: .: : . : :: ...:..:: .: .:.:. . : ..
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140 150 160 170 180
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CCDS51 RILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLTKGQNALV
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600 610 620 630
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CCDS51 ELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE
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CCDS13 IDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAP
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CCDS13 GHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGVN
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CCDS13 KMDSTEPAYSEKRYDEIVKEVSAYIKKIGYNPAT-VPFVPISGWHGDNMLEPSPNMPWFK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]