Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2027
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2027, 610 aa
1>>>pF1KE2027 610 - 610 aa - 610 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3985+/-0.000639; mu= 9.2325+/- 0.039
mean_var=242.3661+/-46.898, 0's: 0 Z-trim(113.1): 347 B-trim: 124 in 1/52
Lambda= 0.082383
statistics sampled from 21852 (22311) to 21852 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16
Scan time: 10.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000441 (OMIM: 131210,145500) E-selectin precurs ( 610) 4346 531.1 4.3e-150
XP_005245497 (OMIM: 147050,173610) PREDICTED: P-se ( 768) 1917 242.5 4e-63
XP_005245496 (OMIM: 147050,173610) PREDICTED: P-se ( 790) 1878 237.9 1e-61
XP_005245495 (OMIM: 147050,173610) PREDICTED: P-se ( 790) 1878 237.9 1e-61
XP_005245492 (OMIM: 147050,173610) PREDICTED: P-se ( 830) 1878 237.9 1e-61
NP_002996 (OMIM: 147050,173610) P-selectin precurs ( 830) 1878 237.9 1e-61
XP_005245493 (OMIM: 147050,173610) PREDICTED: P-se ( 830) 1878 237.9 1e-61
NP_000646 (OMIM: 153240) L-selectin precursor [Hom ( 385) 1148 150.7 8.5e-36
NP_001868 (OMIM: 120650,240500,610927,614699) comp (1033) 608 87.1 3.3e-16
NP_001006659 (OMIM: 120650,240500,610927,614699) c (1092) 608 87.1 3.4e-16
XP_011507508 (OMIM: 120650,240500,610927,614699) P ( 969) 583 84.1 2.5e-15
XP_016855679 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3362) 577 84.1 8.6e-15
XP_016855678 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3506) 577 84.1 8.8e-15
XP_016855683 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3566) 577 84.1 8.9e-15
XP_016855677 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3567) 577 84.1 8.9e-15
XP_016855676 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3606) 577 84.1 9e-15
XP_016855675 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3607) 577 84.1 9e-15
XP_016855674 (OMIM: 608398) PREDICTED: CUB and sus (3607) 577 84.1 9e-15
NP_001268885 (OMIM: 608398) CUB and sushi domain-c (3631) 577 84.1 9e-15
XP_011533056 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (2238) 564 82.3 2e-14
NP_783641 (OMIM: 605886) complement component rece ( 569) 553 80.2 2.1e-14
XP_011533055 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (2595) 564 82.4 2.1e-14
XP_016869220 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (3327) 564 82.5 2.5e-14
XP_011533054 (OMIM: 608397) PREDICTED: CUB and sus (3549) 564 82.6 2.6e-14
NP_150094 (OMIM: 608397) CUB and sushi domain-cont (3564) 564 82.6 2.6e-14
XP_011515117 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (2173) 510 75.9 1.6e-12
NP_000564 (OMIM: 120620,607486,611162) complement (2039) 509 75.7 1.7e-12
XP_006711229 (OMIM: 120620,607486,611162) PREDICTE (2459) 509 75.8 1.9e-12
NP_000642 (OMIM: 120620,607486,611162) complement (2489) 509 75.8 1.9e-12
XP_011507507 (OMIM: 120620,607486,611162) PREDICTE (2554) 509 75.8 2e-12
XP_016868501 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3463) 510 76.1 2.2e-12
XP_016868500 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3507) 510 76.1 2.2e-12
NP_443132 (OMIM: 608399) CUB and sushi domain-cont (3538) 510 76.1 2.2e-12
XP_016868499 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3577) 510 76.1 2.2e-12
XP_011515118 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3603) 510 76.2 2.2e-12
XP_016868498 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3637) 510 76.2 2.2e-12
NP_937757 (OMIM: 608399) CUB and sushi domain-cont (3667) 510 76.2 2.3e-12
XP_016868497 (OMIM: 608399) PREDICTED: CUB and sus (3681) 510 76.2 2.3e-12
NP_937756 (OMIM: 608399) CUB and sushi domain-cont (3707) 510 76.2 2.3e-12
NP_000706 (OMIM: 120830) C4b-binding protein alpha ( 597) 432 65.9 4.6e-10
XP_005273308 (OMIM: 120830) PREDICTED: C4b-binding ( 597) 432 65.9 4.6e-10
XP_005273309 (OMIM: 120830) PREDICTED: C4b-binding ( 597) 432 65.9 4.6e-10
NP_000033 (OMIM: 138700) beta-2-glycoprotein 1 pre ( 345) 427 65.0 5e-10
XP_011507586 (OMIM: 134580,613235) PREDICTED: coag ( 675) 401 62.3 6.4e-09
XP_011507588 (OMIM: 134580,613235) PREDICTED: coag ( 628) 399 62.0 7.2e-09
NP_110414 (OMIM: 608593,614809) complement factor ( 569) 398 61.8 7.4e-09
XP_011508322 (OMIM: 608593,614809) PREDICTED: comp ( 572) 398 61.8 7.4e-09
NP_001985 (OMIM: 134580,613235) coagulation factor ( 661) 399 62.0 7.4e-09
XP_011507585 (OMIM: 134580,613235) PREDICTED: coag ( 676) 399 62.0 7.5e-09
XP_016856798 (OMIM: 120920,612922) PREDICTED: memb ( 363) 362 57.3 1.1e-07
>>NP_000441 (OMIM: 131210,145500) E-selectin precursor [ (610 aa)
initn: 4346 init1: 4346 opt: 4346 Z-score: 2815.7 bits: 531.1 E(85289): 4.3e-150
Smith-Waterman score: 4346; 99.8% identity (100.0% similar) in 610 aa overlap (1-610:1-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MIASQFLSALTLVLLIKESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYCQQRYTHLVAIQNKEEIEYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MIASQFLSALTLVLLIKESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYCQQRYTHLVAIQNKEEIEYLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPGEPNNRQKDEDCVEIYIKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPGEPNNRQKDEDCVEIYIKREK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 DVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSGLKCEQIVNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPGFSGLKCEQIVNC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWSAPIPACNVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCMSSGEWSAPIPACNVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 AVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 VCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFSCEEGFELYGSTQLECTSQGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
NP_000 EKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFSCEEGFELHGSTQLECTSQGQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 WTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCSGEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCSGEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 SGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESD
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE2 GSYQKPSYIL
::::::::::
NP_000 GSYQKPSYIL
610
>>XP_005245497 (OMIM: 147050,173610) PREDICTED: P-select (768 aa)
initn: 1419 init1: 1210 opt: 1917 Z-score: 1254.3 bits: 242.5 E(85289): 4e-63
Smith-Waterman score: 1917; 46.2% identity (71.1% similar) in 561 aa overlap (4-558:21-578)
10 20 30 40
pF1KE2 MIASQFL--SALTLVLLI-KESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYC
::.: ::: : :: .::.:. ::.:.... . ::
XP_005 MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKAYSWNISRKYC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 QQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPG
:.::: :::::::.::.:::..: : ::::::::: :..:.::::.: ::.::.::: .
XP_005 QNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 EPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINN
::::....::::::::: . : ::::.: ::: ::::::.: . ::: .:::.:::.:
XP_005 EPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 YTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSME
:::.: ::: : .:: . .: :: :.: . :::::::::.::.::. : :: ..
XP_005 YTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 TMQCMSSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMG
..:..:: :. : : ...: . : : . :... .: ...:.:.::::: :.:
XP_005 KLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 AQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFM
. .:::.:: : :.:::..:. ...: .::. :: : : . ..:.: : ::::
XP_005 PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAISCEPLESPVHGSMDCSPS-LRAFQYDTNCSFRCAEGFM
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 LQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCEFSCEQ
:.: :.: . :::: :::.:.:: : :... .:: :.::: : : :.:..
XP_005 LRGADIVRCDNLGQWTAPAPVCQALQCQDLPVPNEARVNC-SHPFGAFRYQSVCSFTCNE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 GFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCAFS
:..: :.. ::: ::.:.. : :.:. : . .: .: . :.. :.: .:::.: :
XP_005 GLLLVGASVLQCLATGNWNSVPPECQAIPCTPLLSPQNGTMTCVQ-PLGSSSYKSTCQFI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE2 CEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCS---GEPVFGTVCK
:.::. : : .:.:: .:.::. : :...:: : .: . ...:: :: :..:.
XP_005 CDEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDCSDTRGEFNVGSTCH
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 FACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEAPTESNIPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLW
:.: .:. :.: : ..:.::. :::.. . : :
XP_005 FSCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHP
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610
pF1KE2 LRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL
XP_005 GTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSN
600 610 620 630 640 650
>--
initn: 319 init1: 212 opt: 435 Z-score: 302.4 bits: 66.4 E(85289): 4.2e-10
Smith-Waterman score: 435; 39.5% identity (63.0% similar) in 162 aa overlap (429-584:579-739)
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 EQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEAVRCDAVHQPPKGLVRCAHSPIGEFTYKSSCA
.: :. : .: . : : : : : ....:
XP_005 PNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHP-GTFGFNTTCY
550 560 570 580 590 600
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 FSCEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCS---GEPVFGTV
:.:. :: : :.. : : .:::: .:.:..:::: : : : :.:: :. .:..
XP_005 FGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCSNLWGNFSYGSI
610 620 630 640 650 660
520 530 540 550 560 570
pF1KE2 CKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEA-PT--ESNIPLVAGLSAAGLSLLTLA
:.: : :: ::::: .: .:::: .:::.: : . . .: :. ..:. .
XP_005 CSFHCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGAVASTIGLIMGG
670 680 690 700 710 720
580 590 600 610
pF1KE2 PFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL
.: ::: .:.
XP_005 TLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAFDPSP
730 740 750 760
>>XP_005245496 (OMIM: 147050,173610) PREDICTED: P-select (790 aa)
initn: 1620 init1: 1206 opt: 1878 Z-score: 1229.1 bits: 237.9 E(85289): 1e-61
Smith-Waterman score: 1878; 44.7% identity (70.7% similar) in 552 aa overlap (4-549:21-569)
10 20 30 40
pF1KE2 MIASQFL--SALTLVLLI-KESGAWSYNTSTEAMTYDEASAYC
::.: ::: : :: .::.:. ::.:.... . ::
XP_005 MANCQIAILYQRFQRVVFGISQLLCFSALISELTNQKEVAAWTYHYSTKAYSWNISRKYC
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 QQRYTHLVAIQNKEEIEYLNSILSYSPSYYWIGIRKVNNVWVWVGTQKPLTEEAKNWAPG
:.::: :::::::.::.:::..: : ::::::::: :..:.::::.: ::.::.::: .
XP_005 QNRYTDLVAIQNKNEIDYLNKVLPYYSSYYWIGIRKNNKTWTWVGTKKALTNEAENWADN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 EPNNRQKDEDCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAACTNTSCSGHGECVETINN
::::....::::::::: . : ::::.: ::: ::::::.: . ::: .:::.:::.:
XP_005 EPNNKRNNEDCVEIYIKSPSAPGKWNDEHCLKKKHALCYTASCQDMSCSKQGECLETIGN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 YTCKCDPGFSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSME
:::.: ::: : .:: . .: :: :.: . :::::::::.::.::. : :: ..
XP_005 YTCSCYPGFYGPECEYVRECGELELPQHVLMNCSHPLGNFSFNSQCSFHCTDGYQVNGPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 TMQCMSSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMG
..:..:: :. : : ...: . : : . :... .: ...:.:.::::: :.:
XP_005 KLECLASGIWTNKPPQCLAAQCPPLKIPERGNMTCLHSAKAFQHQSSCSFSCEEGFALVG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 AQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTCEEGFM
. .:::.:: : :.:::: :. .. :..:.. : : : :.. :::.: :. :.
XP_005 PEVVQCTASGVWTAPAPVCKAVQCQHLEAPSEGTMDCVH-PLTAFAYGSSCKFECQPGYR
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340 350 360 370 380 390
pF1KE2 EEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCE
.: : ::.: ..: .. : : ::.:.
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:::..:: :.: . ..: .:.:. :::.. :.: :. : .: . : : :
NP_002 FSCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHP
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: : ....: :.:. :: : :.. : : .:::: .:.:..:::: : : : :.::
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:. .:..:.: : :: ::::: .: .:::: .:::.: : . . .:
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:. ..:. . .: ::: .:.
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10 20 30 40
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::.: ::: : :: .::.:. ::.:.... . ::
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:.::: :::::::.::.:::..: : ::::::::: :..:.::::.: ::.::.::: .
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::::....::::::::: . : ::::.: ::: ::::::.: . ::: .:::.:::.:
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:::.: ::: : .:: . .: :: :.: . :::::::::.::.::. : :: ..
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. .:::.:: : :.:::: :. .. :..:.. : : : :.. :::.: :. :.
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..: ...: .:.:. .:.:::..: : .: .: :.: :: .:.: ..: : : .
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::.:.:. ..: :.: :.:.:..:. . : .. : :.: :.: : :.: :.:.
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: : ::..:.: : .:.:. : :::
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>--
initn: 640 init1: 212 opt: 613 Z-score: 416.3 bits: 87.6 E(85289): 1.9e-16
Smith-Waterman score: 613; 38.2% identity (62.7% similar) in 233 aa overlap (366-584:571-801)
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 EEGFMLQGPAQVECTTQGQWTQQIPVCEAFQCTALSNPERGYMNCLPSASGSFRYGSSCE
.: : ::.: ..: .. : : ::.:.
XP_005 DEGYSLSGPERLDCTRSGRWTDSPPMCEAIKCPELFAPEQGSLDC-SDTRGEFNVGSTCH
550 560 570 580 590
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pF1KE2 FSCEQGFVLKGSKRLQCGPTGEWDNEKPTCEA--------VRCDAVHQPPKGLVRCAHSP
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XP_005 FSCDNGFKLEGPNNVECTTSGRWSATPPTCKGIASLPTPGVQCPALTTPGQGTMYCRHHP
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pF1KE2 IGEFTYKSSCAFSCEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVPGKINMSCS
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XP_005 -GTFGFNTTCYFGCNAGFTLIGDSTLSCRPSGQWTAVTPACRAVKCSELHVNKPIAMNCS
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pF1KE2 ---GEPVFGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEA-PT--ESNIPLVAGL
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XP_005 NLWGNFSYGSICSFHCLEGQLLNGSAQTACQENGHWSTTVPTCQAGPLTIQEALTYFGGA
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:. ..:. . .: ::: .:.
XP_005 VASTIGLIMGGTLLALLRKRFRQKDDGKCPLNPHSHLGTYGVFTNAAFDPSP
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>>NP_000646 (OMIM: 153240) L-selectin precursor [Homo sa (385 aa)
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10 20 30 40 50
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:: :::::.. : .: :::::::::....:.::::.: :::::.::. :::::... :::
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240 250 260 270 280 290
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.: :.:.:..:. .. : :...: . .:: ....::: : :: ::.: .. : :::
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:.: .: :.
NP_000 WSNPSPICQKLDKSFSMIKEGDYNPLFIPVAVMVTAFSGLAFIIWLARRLKKGKKSKRSM
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:::.::: :.:. ..: .. :: : ..: . ..: .: :.::..:.: : .
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:. .:. : .. :.:. . : . :: : . .. .. : ..:: :::
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:.: : . ..::...: :. : :: : :: .:. :: : . . .
NP_001 VNFILIGESTLRCTVDSQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQCP---HPQILRGRM--VSGQKD
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. :... :.: ::.:::::...:. : :. :.:: .:.: ::. : .
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. .: .: .::. :. : : ...:::.: :: ::.:.:. : . :. ..
NP_001 RHMVRFDPGTSIKYSCNPGYVLVGEESIQCTSEGVWTPPVPQCKVAACEAT---GRQLLT
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. . .: ::. :.::. . : .: : . :. : :.. . . .:
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::
NP_001 SSLEDFPYGTTVTYTCNPGPERGVEFSLIGESTIRCTSNDQERGTWSGPAPLCKLSLLAV
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>--
initn: 337 init1: 157 opt: 547 Z-score: 372.9 bits: 79.8 E(85289): 4.9e-14
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pF1KE2 FSGLKCEQIVNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCD----RGYLPSSM--ETM
.: :... . .:. :: : . :.
NP_001 WFMEIRLCKEITCPPPPVIYNGAHTGSSLEDFPYGTTVTYTCNPGPERGVEFSLIGESTI
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.: :. : ::.: : :.. :.:. : . :::. .. : .: : :: :
NP_001 RCTSNDQERGTWSGPAPLCKLSLLAVQCSHV-HIANGYKISGKEAPYF-YNDTVTFKCYS
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pF1KE2 GFELMGAQSLQCTSSGNWDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFT
:: : :.....: ....:: : :.:. ::. ::: :.. . ::: . : .
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:..:..: : : : . .: : ..::.:....: . ... . :.: . .:
NP_001 CQDGYQLTGHAYQMCQDAENGIWFKKIPLCKVIHCHPPPVIVNGKHTGMM------AENF
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::. . :.::: : : :.::: : :.. .: :
NP_001 LYGNEVSYECDQGFYLLGEKKLQCRSDSKGHGSWSGPSPQCLRSPPVTRCPNPEVKHGYK
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pF1KE2 ---------------------------EAVRC--DAVHQP--P----KGLVRCAHSP---
...:: : . : : :... : :
NP_001 LNKTHSAYSHNDIVYVDCNPGFIMNGSRVIRCHTDNTWVPGVPTCIKKAFIGCPPPPKTP
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pF1KE2 --------IGEFTYKSSCAFSCEEGFELYGSTQLECTSQGQWTEEVPSCQVVKCSSLAVP
:..:. : .::..:. : : . : :: .: :.. .: :. :.::: :
NP_001 NGNHTGGNIARFSPGMSILYSCDQGYLLVGEALLLCTHEGTWSQPAPHCKEVNCSS---P
860 870 880 890 900 910
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pF1KE2 GKINMSCSG-EPV----FGTVCKFACPEGWTLNGSAARTCGATGHWSGLLPTCEAPTESN
. .. .: :: .:.: . : .:. :.:: : . .:. : .:. ..:
NP_001 ADMDGIQKGLEPRKMYQYGAVVTLECEDGYMLEGSPQSQCQSDHQWNPPLAVCR--SRSL
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pF1KE2 IPLVAGLSAAGLSLLTLAPFLLWLRKCLRKAKKFVPASSCQSLESDGSYQKPSYIL
:.. :. :::: :::.
NP_001 APVLCGI-AAGLILLTFLIVITLYVISKHRARNYYTDTSQKEAFHLEAREVYSVDPYNPA
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>>NP_001006659 (OMIM: 120650,240500,610927,614699) compl (1092 aa)
initn: 364 init1: 159 opt: 608 Z-score: 411.8 bits: 87.1 E(85289): 3.4e-16
Smith-Waterman score: 620; 29.4% identity (55.6% similar) in 453 aa overlap (140-568:115-543)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 DCVEIYIKREKDVGMWNDERCSKKKLALCYTAAC-TNTSCSGHGECVETINNYTCKCDPG
: :: :: : .:. ::. :
NP_001 FNKYSSCPEPIVPGGYKIRGSTPYRHGDSVTFACKTNFSMNGNKSVWCQANNMW-----G
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pF1KE2 FSGLK-CEQI--VNCTALESPEHGSLVCSHPLGNFSYNSSCSISCDRGYLPSSMETMQCM
. : : .. ..: :: ..: . :. .:... . : . ::. ::: . . ..:.
NP_001 PTRLPTCVSVFPLECPALPMIHNGHHT-SENVGSIAPGLSVTYSCESGYLLVGEKIINCL
140 150 160 170 180 190
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pF1KE2 SSGEWSAPIPACNVVECDAVTNPANGFVECFQNPGSFPWNTTCTFDCEEGFELMGAQSLQ
:::.::: :.:. ..: .. :: : ..: . ..: .: :.::..:.: : .
NP_001 SSGKWSAVPPTCEEARCKSLGRFPNGKV---KEPPILRVGVTANFFCDEGYRLQGPPSSR
200 210 220 230 240 250
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pF1KE2 CTSSGN---WDNEKPTCKAVTCRAVRQPQNGSVRCSHSPAGEFTFKSSCNFTC----EEG
:. .:. : .. :.:. . : . :: : . .. .. : ..:: :::
NP_001 CVIAGQGVAW-TKMPVCEEIFCPSPPPILNG--RHIGNSLANVSYGSIVTYTCDPDPEEG
260 270 280 290 300 310
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pF1KE2 --FMLQGPAQVECTTQGQ----WTQQIPVCE----AFQCTALSNPE--RGYMNCLPSASG
:.: : . ..::...: :. : :: : :: .:. :: : . . .
NP_001 VNFILIGESTLRCTVDSQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQCP---HPQILRGRM--VSGQKD
320 330 340 350 360
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