Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2023
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2023, 599 aa
1>>>pF1KE2023 599 - 599 aa - 599 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9434+/-0.000888; mu= 5.5774+/- 0.054
mean_var=274.0185+/-56.613, 0's: 0 Z-trim(116.0): 13 B-trim: 429 in 1/53
Lambda= 0.077479
statistics sampled from 16547 (16558) to 16547 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.808), E-opt: 0.2 (0.509), width: 16
Scan time: 4.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS417.1 ZC3H12A gene_id:80149|Hs108|chr1 ( 599) 4173 479.7 4.6e-135
CCDS44727.1 ZC3H12C gene_id:85463|Hs108|chr11 ( 883) 1395 169.3 1.8e-41
CCDS48131.2 ZC3H12B gene_id:340554|Hs108|chrX ( 836) 1384 168.1 4.1e-41
CCDS47500.2 ZC3H12D gene_id:340152|Hs108|chr6 ( 527) 1263 154.4 3.5e-37
CCDS32058.1 KHNYN gene_id:23351|Hs108|chr14 ( 678) 625 83.2 1.2e-15
CCDS45479.1 N4BP1 gene_id:9683|Hs108|chr16 ( 896) 577 77.9 6.1e-14
CCDS45090.1 NYNRIN gene_id:57523|Hs108|chr14 (1898) 521 72.0 7.9e-12
>>CCDS417.1 ZC3H12A gene_id:80149|Hs108|chr1 (599 aa)
initn: 4173 init1: 4173 opt: 4173 Z-score: 2538.3 bits: 479.7 E(32554): 4.6e-135
Smith-Waterman score: 4173; 100.0% identity (100.0% similar) in 599 aa overlap (1-599:1-599)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSGPCGEKPVLEASPTMSLWEFEDSHSRQGTPRPGQELAAEEASALELQMKVDFFRKLGY
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CCDS41 MSGPCGEKPVLEASPTMSLWEFEDSHSRQGTPRPGQELAAEEASALELQMKVDFFRKLGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SSTEIHSVLQKLGVQADTNTVLGELVKHGTATERERQTSPDPCPQLPLVPRGGGTPKAPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSTEIHSVLQKLGVQADTNTVLGELVKHGTATERERQTSPDPCPQLPLVPRGGGTPKAPN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LEPPLPEEEKEGSDLRPVVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGILLAVNWFLERGHTDITVFVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LEPPLPEEEKEGSDLRPVVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGILLAVNWFLERGHTDITVFVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 SWRKEQPRPDVPITDQHILRELEKKKILVFTPSRRVGGKRVVCYDDRFIVKLAYESDGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SWRKEQPRPDVPITDQHILRELEKKKILVFTPSRRVGGKRVVCYDDRFIVKLAYESDGIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VSNDTYRDLQGERQEWKRFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPLTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VSNDTYRDLQGERQEWKRFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPLTLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 HRKQPCPYGRKCTYGIKCRFFHPERPSCPQRSVADELRANALLSPPRAPSKDKNGRRPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HRKQPCPYGRKCTYGIKCRFFHPERPSCPQRSVADELRANALLSPPRAPSKDKNGRRPSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SSQSSSLLTESEQCSLDGKKLGAQASPGSRQEGLTQTYAPSGRSLAPSGGSGSSFGPTDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSQSSSLLTESEQCSLDGKKLGAQASPGSRQEGLTQTYAPSGRSLAPSGGSGSSFGPTDW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 LPQTLDSLPYVSQDCLDSGIGSLESQMSELWGVRGGGPGEPGPPRAPYTGYSPYGSELPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LPQTLDSLPYVSQDCLDSGIGSLESQMSELWGVRGGGPGEPGPPRAPYTGYSPYGSELPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TAAFSAFGRAMGAGHFSVPADYPPAPPAFPPREYWSEPYPLPPPTSVLQEPPVQSPGAGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TAAFSAFGRAMGAGHFSVPADYPPAPPAFPPREYWSEPYPLPPPTSVLQEPPVQSPGAGR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 SPWGRAGSLAKEQASVYTKLCGVFPPHLVEAVMGRFPQLLDPQQLAAEILSYKSQHPSE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SPWGRAGSLAKEQASVYTKLCGVFPPHLVEAVMGRFPQLLDPQQLAAEILSYKSQHPSE
550 560 570 580 590
>>CCDS44727.1 ZC3H12C gene_id:85463|Hs108|chr11 (883 aa)
initn: 1534 init1: 1247 opt: 1395 Z-score: 858.0 bits: 169.3 E(32554): 1.8e-41
Smith-Waterman score: 1423; 53.0% identity (71.5% similar) in 445 aa overlap (4-423:124-556)
10 20 30
pF1KE2 MSGPCGEKPVLEASPTMSLWEFEDSHSRQGTPR
:: : .:. . .. .. :.:.. . .
CCDS44 TNSDHESEQLGSISVEPGLITKTHRQLCRSPCLEPHILKRNEILQDFKPEESQTTSKEAK
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 PGQELAAEEASALELQMKVDFFRKLGYSSTEIHSVLQKLGVQADTNTVLGELVKHGTATE
... : : :..: ::::: ... ::.:::..: : .:::::: :. .:
CCDS44 KPPDVVRE------YQTKLEFALKLGYSEEQVQLVLNKLGTDALINDILGELVKLGNKSE
160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RERQTSPDPCPQLPLVPRGGGTPKAPNLEPPLPE-EEKEGSDLRPVVIDGSNVAMSHGNK
.. .: . . : .. .. : :. : .: .:::.::::::::::::::
CCDS44 ADQTVST-----INTITRETSSLESQRSESPMQEIVTDDGENLRPIVIDGSNVAMSHGNK
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 EVFSCRGILLAVNWFLERGHTDITVFVPSWRKEQPRPDVPITDQHILRELEKKKILVFTP
:::::::: :::.::::::: :::::::.::::: :::. ::::.:::.:::.:::::::
CCDS44 EVFSCRGIKLAVDWFLERGHKDITVFVPAWRKEQSRPDALITDQEILRKLEKEKILVFTP
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 SRRVGGKRVVCYDDRFIVKLAYESDGIVVSNDTYRDLQGERQEWKRFIEERLLMYSFVND
:::: :.::::::::::::::.:::::.::::.:::: .:. :::.::.:::::::::::
CCDS44 SRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFESDGIIVSNDNYRDLANEKPEWKKFIDERLLMYSFVND
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 KFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPLTLEHRKQPCPYGRKCTYGIKCRFFHPERPSCPQRS
::::::::::::::::::::::::.. ::.:::::::.::::: ::...:::: : ::::
CCDS44 KFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPIVPEHKKQPCPYGKKCTYGHKCKYYHPERGSQPQRS
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370
pF1KE2 VADELRA------------NALLSPPRAPSKDKNG-----RRPSPSSQSS-SLLTESEQC
::::::: ..:.. .: . : .: .:. ::. :. :. :
CCDS44 VADELRAMSRNTAAKTANEGGLVKSNSVPCSTKADSTSDVKRGAPKRQSDPSIRTQVYQ-
450 460 470 480 490 500
380 390 400 410 420
pF1KE2 SLDGK-----KLGAQASPGSRQEGLTQTYAP-SGRSLAPSGGSGSSFGPTDWLPQTLDSL
.:. : :: ... :. . :.: : : ::. . :: : : : ::
CCDS44 DLEEKLPTKNKLETRSVPSLVSIPATSTAKPQSTTSLSNGLPSGVHFPPQDQRPQGQYPS
510 520 530 540 550 560
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 PYVSQDCLDSGIGSLESQMSELWGVRGGGPGEPGPPRAPYTGYSPYGSELPATAAFSAFG
CCDS44 MMMATKNHGTPMPYEQYPKCDSPVDIGYYSMLNAYSNLSLSGPRSPERRFSLDTDYRISS
570 580 590 600 610 620
>>CCDS48131.2 ZC3H12B gene_id:340554|Hs108|chrX (836 aa)
initn: 1501 init1: 1274 opt: 1384 Z-score: 851.6 bits: 168.1 E(32554): 4.1e-41
Smith-Waterman score: 1384; 59.2% identity (78.0% similar) in 368 aa overlap (47-408:107-464)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 MSLWEFEDSHSRQGTPRPGQELAAEEASALELQMKVDFFRKLGYSSTEIHSVLQKLGVQA
: : :..: ::::. .:.:::.::: ..
CCDS48 HRQLCRSPCLDRPSFSQSSILQDGKLDLEKEYQAKMEFALKLGYAEEQIQSVLNKLGPES
80 90 100 110 120 130
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 DTNTVLGELVKHGTATERERQTSPDPCPQLPLVPRGGGTPKAPNLEPPLPEEEKEGSDLR
: ::.:::. :. . : : . . ::::: .. . . : : .: ....::
CCDS48 LINDVLAELVRLGNKGDSEGQINLSL-----LVPRGPSSREIASPELSLEDEIDNSDNLR
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 PVVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGILLAVNWFLERGHTDITVFVPSWRKEQPRPDVPITDQ
::::::::::::::::: :::::: :::.:::..:: :::::::.::::: :::.:::::
CCDS48 PVVIDGSNVAMSHGNKEEFSCRGIQLAVDWFLDKGHKDITVFVPAWRKEQSRPDAPITDQ
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 HILRELEKKKILVFTPSRRVGGKRVVCYDDRFIVKLAYESDGIVVSNDTYRDLQGERQEW
:::.:::.::::::::::: :.::::::::::::::..::::.::::.::::: :. ::
CCDS48 DILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFDSDGIIVSNDNYRDLQVEKPEW
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 KRFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPLTLEHRKQPCPYGRKCTYGI
:.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:.. ::.:::::::.:::::
CCDS48 KKFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLENFLRKRPIVPEHKKQPCPYGKKCTYGH
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 KCRFFHPERPSCPQRSVADELRANALLSPPRAPSKDKNGRRPSPSSQSSSLLTESEQCSL
::...:::: . :::::::::: .: :: .. :. .. . :.... .: :: .
CCDS48 KCKYYHPERANQPQRSVADELRISAKLSTVKTMSEGTLAKCGTGMSSAKGEIT-SEVKRV
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 DGKKLGAQASPGSR------QEGLTQTYAPSGRSLAPSGGSGSSFGPTDWLPQTLDSLPY
:. :..:. : .: :. . : . :. ::
CCDS48 APKR---QSDPSIRSVAMEPEEWLSIARKPEASSV-PSLVTALSVPTIPPPKSHAVGALN
440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 VSQDCLDSGIGSLESQMSELWGVRGGGPGEPGPPRAPYTGYSPYGSELPATAAFSAFGRA
CCDS48 TRSASSPVPGSSHFPHQKASLEHMASMQYPPILVTNSHGTPISYAEQYPKFESMGDHGYY
490 500 510 520 530 540
>>CCDS47500.2 ZC3H12D gene_id:340152|Hs108|chr6 (527 aa)
initn: 1321 init1: 1122 opt: 1263 Z-score: 781.0 bits: 154.4 E(32554): 3.5e-37
Smith-Waterman score: 1346; 45.4% identity (62.9% similar) in 555 aa overlap (46-585:1-510)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 TMSLWEFEDSHSRQGTPRPGQELAAEEASALELQMKVDFFRKLGYSSTEIHSVLQKLGVQ
.: :..::.::::. .. :: :::
CCDS47 MEHPSKMEFFQKLGYDREDVLRVLGKLGEG
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 ADTNTVLGELVKHGTATERERQTSPDPCPQLPLVPRGG-GTPKAPNLEPPLPEEEKE---
: .: :: ::.. :. : :. :::::. :.: . . : ::
CCDS47 ALVNDVLQELIRTGS---RPGALEHPAAPR--LVPRGSCGVPDSAQRGPGTALEEDFRTL
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 GSDLRPVVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGILLAVNWFLERGHTDITVFVPSWRKEQPRPDV
.:.:::.:::::::::::::::.:::::: :::.:: .:::: : ::::::::. :: :.
CCDS47 ASSLRPIVIDGSNVAMSHGNKETFSCRGIKLAVDWFRDRGHTYIKVFVPSWRKDPPRADT
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 PITDQHILRELEKKKILVFTPSRRVGGKRVVCYDDRFIVKLAYESDGIVVSNDTYRDLQG
:: .::.: :::.. .::.::::.: :::.::::::.:::.:::.::..::::.:::::.
CCDS47 PIREQHVLAELERQAVLVYTPSRKVHGKRLVCYDDRYIVKVAYEQDGVIVSNDNYRDLQS
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 ERQEWKRFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPLTLEHRKQPCPYGRK
: ::: :::.::::.:::::.:::::::::::::::.::: .:: : : ::::.:
CCDS47 ENPEWKWFIEQRLLMFSFVNDRFMPPDDPLGRHGPSLSNFLSRKPKPPEPSWQHCPYGKK
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 CTYGIKCRFFHPERPSCPQRSVADELRANALLSPPRAPSKDKNGRRPSPSSQSSSLLTES
:::::::.:.::::: : .::::::: :.: ::. ... :.
CCDS47 CTYGIKCKFYHPERPHHAQLAVADELRA-------------KTGARPGAGAE------EQ
270 280 290 300
380 390 400 410 420
pF1KE2 EQCSLDGKKLGAQASPGSRQEGLTQTYAPSGRS--LAPSGGSGSSFGPTDWLPQTLDSLP
. : . ::.:.: .: .... :. : :: :: : .. .: : ::
CCDS47 RPPRAPGGSAGARAAP---REPFAHSLPPARGSPDLAALRGSFSRLAFSDDLGPLGPPLP
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 YVSQDCLDSGIGSLESQMSELWGVRGGG--PGEPGPPRAPYTGYSPYGSELPATAAFSAF
: : .:. . : : .:: :: . : .: . .:: ..:: ...
CCDS47 -VPACSLTPRLGGPD------W-VSAGGRVPGPLSLP-SPESQFSP--GDLPPPPGLQLQ
370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GRAMGA-----GHFSVPADYPPAPPAFPPREYWSEPYPLPPPTSVLQEPPVQSPGA--GR
:. : . : : : : ::: :. .: :: :: . . :: :
CCDS47 PRGEHRPRDLHGDLLSPRRPPDDPWARPPR---SDRFP---GRSVWAEP-AWGDGATGGL
420 430 440 450 460
550 560 570 580 590
pF1KE2 SPWGRAGSLAKEQASVYTKLCGVFPPHLVEAVMGRFPQLLDPQQLAAEILSYKSQHPSE
: .. . . .: . : .::: :. ::. ::.: : .:
CCDS47 SVYATEDDEGDARARARIALYSVFPRDQVDRVMAAFPELSDLARLILLVQRCQSAGAPLG
470 480 490 500 510 520
CCDS47 KP
>>CCDS32058.1 KHNYN gene_id:23351|Hs108|chr14 (678 aa)
initn: 599 init1: 379 opt: 625 Z-score: 394.2 bits: 83.2 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 625; 49.5% identity (69.3% similar) in 212 aa overlap (104-307:398-606)
80 90 100 110 120
pF1KE2 VQADTNTVLGELVKHGTATERERQTSPDPCPQLPLVPRGG----GTPK-APNLEPP--LP
:: ::: :: . :. : :
CCDS32 WHCGDRGDCGDRGDVGDRGDKQQGMARGRGPQWKRGARGGNLVTGTQRFKEALQDPFTLC
370 380 390 400 410 420
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EEEKEGS-DLRPVVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGILLAVNWFLERGHTDITVFVPSWRKE
. :. ::: .::::::::: :: .. :: ::: .::..: .::: :::::::.::
CCDS32 LANVPGQPDLRHIVIDGSNVAMVHGLQHYFSSRGIAIAVQYFWDRGHRDITVFVPQWRFS
430 440 450 460 470 480
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 QPRPDVPITDQHILRELEKKKILVFTPSRRVGGKRVVCYDDRFIVKLAYESDGIVVSNDT
. :. . ..:.:..: . ..: .:::: . :::. :::::.:::: :.:::.::::
CCDS32 K---DAKVRESHFLQKLYSLSLLSLTPSRVMDGKRISSYDDRFMVKLAEETDGIIVSNDQ
490 500 510 520 530 540
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 YRDLQGERQEWKRFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLDNFLRKKPLTLEHRKQP
.::: : ..: .:.:::: ..::.. :: :::::::.::.::.::.: : :
CCDS32 FRDLAEESEKWMAIIRERLLPFTFVGNLFMVPDDPLGRNGPTLDEFLKKPARTQGSSKAQ
550 560 570 580 590 600
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 CPYGRKCTYGIKCRFFHPERPSCPQRSVADELRANALLSPPRAPSKDKNGRRPSPSSQSS
:
CCDS32 HPSRGFAEHGKQQQGREEEKGSGGIRKTRETERLRRQLLEVFWGQDHKVDFILQREPYCR
610 620 630 640 650 660
>>CCDS45479.1 N4BP1 gene_id:9683|Hs108|chr16 (896 aa)
initn: 618 init1: 363 opt: 577 Z-score: 363.7 bits: 77.9 E(32554): 6.1e-14
Smith-Waterman score: 577; 50.9% identity (80.4% similar) in 163 aa overlap (133-295:615-774)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 CPQLPLVPRGGGTPKAPNLEPPLPEEEKEGSDLRPVVIDGSNVAMSHGNKEVFSCRGILL
.::. .::::::::..:: :. :::::: .
CCDS45 HIDSSVTGVQRFRDTLKIPYKLELKNEPGRTDLKHIVIDGSNVAITHGLKKFFSCRGIAI
590 600 610 620 630 640
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 AVNWFLERGHTDITVFVPSWRKEQPRPDVPITDQHILRELEKKKILVFTPSRRVGGKRVV
::..: . :. .::::::.:: : : .:.::.: .:.. :: .::.: : :.:..
CCDS45 AVEYFWKLGNRNITVFVPQWRT---RRDPNVTEQHFLTQLQELGILSLTPARMVFGERIA
650 660 670 680 690 700
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 CYDDRFIVKLAYESDGIVVSNDTYRDLQGERQEWKRFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLG
.::::...:: .. ::.:.::..:.. .: :...: .:::.:.::.: :: ::::::
CCDS45 SHDDRFLLHLADKTGGIIVTNDNFREFVNESVSWREIITKRLLQYTFVGDIFMVPDDPLG
710 720 730 740 750 760
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 RHGPSLDNFLRKKPLTLEHRKQPCPYGRKCTYGIKCRFFHPERPSCPQRSVADELRANAL
: :: :..::.:.
CCDS45 RSGPRLEEFLQKEVCLRDMQPLLSALPNVGMFDPSFRVPGTQAASTSHQPPTRIQGAPSS
770 780 790 800 810 820
>>CCDS45090.1 NYNRIN gene_id:57523|Hs108|chr14 (1898 aa)
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