FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2013, 591 aa
1>>>pF1KE2013 591 - 591 aa - 591 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8481+/-0.000963; mu= 17.1033+/- 0.057
mean_var=117.0782+/-22.682, 0's: 0 Z-trim(108.1): 86 B-trim: 47 in 2/52
Lambda= 0.118532
statistics sampled from 9890 (9976) to 9890 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 3.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 591) 4134 718.6 5.5e-207
CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 539) 3772 656.6 2.2e-188
CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 ( 529) 3542 617.3 1.5e-176
CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5 ( 934) 1075 195.7 2.2e-49
CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1 ( 584) 853 157.5 4.3e-38
CCDS47201.1 C7 gene_id:730|Hs108|chr5 ( 843) 785 146.0 1.8e-34
CCDS3929.1 C9 gene_id:735|Hs108|chr5 ( 559) 488 95.1 2.6e-19
>>CCDS30730.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (591 aa)
initn: 4134 init1: 4134 opt: 4134 Z-score: 3829.5 bits: 718.6 E(32554): 5.5e-207
Smith-Waterman score: 4134; 99.8% identity (99.8% similar) in 591 aa overlap (1-591:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKNSRTWAWRAPVELFLLCAALGCLSLPGSRGERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKNSRTWAWRAPVELFLLCAALGCLSLPGSRGERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 MPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCRSQV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS30 MPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCGSQV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 RCEGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQSDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RCEGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQSDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 LFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTRFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTRFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 ERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSVFLHARSDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSVFLHARSDLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 VAHYKLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VAHYKLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EDLVVLVRGGASEHITTLAYQELPTADLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EDLVVLVRGGASEHITTLAYQELPTADLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 YSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 NTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
550 560 570 580 590
>>CCDS60152.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (539 aa)
initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 3495.5 bits: 656.6 E(32554): 2.2e-188
Smith-Waterman score: 3772; 99.8% identity (99.8% similar) in 539 aa overlap (53-591:1-539)
30 40 50 60 70 80
pF1KE2 GCLSLPGSRGERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKK
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 RYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCRSQVRCEGFVCAQTGRCVNRRLLCNG
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCGSQVRCEGFVCAQTGRCVNRRLLCNG
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 DNDCGDQSDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DNDCGDQSDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSP
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 HYILNTRFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HYILNTRFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSVFLHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSVFLHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQRVK
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 RLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKND
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 FKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 FKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQE
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 LPTADLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LPTADLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSS
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 CHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRK
460 470 480 490 500 510
570 580 590
pF1KE2 TRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
520 530
>>CCDS60151.1 C8B gene_id:732|Hs108|chr1 (529 aa)
initn: 3542 init1: 3542 opt: 3542 Z-score: 3283.0 bits: 617.3 E(32554): 1.5e-176
Smith-Waterman score: 3542; 99.6% identity (99.8% similar) in 509 aa overlap (83-591:21-529)
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 MRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCVT
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MDTCMTLAFTLSGRFFMLLSQYRYAYLLQPSQFHGEPCNFSDKEVEDCVT
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 NRPCRSQVRCEGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQSDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGI
:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NRPCGSQVRCEGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQSDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGI
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTRFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTRFRKPYNVESYTPQTQGKYEFILK
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 EYESYSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EYESYSDFERNVTEKMASKSGFSFGFKIPGIFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSVF
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 LHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGG
240 250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 IYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKD
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 RNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQELPTADLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RNKRDTMVEDLVVLVRGGASEHITTLAYQELPTADLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYE
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 LVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGL
420 430 440 450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 ACEVSYRKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ACEVSYRKNTPIDGKWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
480 490 500 510 520
>>CCDS3936.1 C6 gene_id:729|Hs108|chr5 (934 aa)
initn: 968 init1: 208 opt: 1075 Z-score: 1000.0 bits: 195.7 E(32554): 2.2e-49
Smith-Waterman score: 1075; 31.0% identity (64.8% similar) in 549 aa overlap (62-591:79-612)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 GERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQ
::.: :.... :. :::: .:. . .:.
CCDS39 QIVVDKYYQENFCEQICSKQETRECNWQRCPINCLLGDFGPWSDCDPCIEKQSKVRSVLR
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KE2 PSQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCR-SQVRCEG-FVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQ
:::: :.::. . :. .. :. .. :.. : : ..:::. :.: :::.:::::.
CCDS39 PSQFGGQPCTAPLVAFQPCIPSKLCKIEEADCKNKFRC-DSGRCIARKLECNGENDCGDN
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 SDEANCRRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNTR
::: .: : : .... .. ...:...... .: :::. . .: :. . ..:
CCDS39 SDERDCGRTKAVCTRKYNPIPSVQLMGNGFHFLAGEPRGEVLDNSFTGGICKT--VKSSR
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 FRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDFERNVT---EKMASKSGFSF----GFKIPG
.:: : . .. : .: : . .:: ...: .. ....:: .:..:
CCDS39 TSNPYRVPANL-ENVG-FEVQTAEDDLKTDFYKDLTSLGHNENQQGSFSSQGGSSFSVP-
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 IFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTK-SVFLHARSDLEVAHYKLKPRSLMLHYEFLQRV
:: . :.. . .... . :: : : :.. .. ..: .. : ..: : ::. .
CCDS39 IFYSSKRSENINHNSAFKQAIQASHKKDSSFIRIHKVMKVLNFTTKAKDLHLSDVFLKAL
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 KRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAMERGDYTLNNVHACAKN
..:::::. . : .: ::::::.: . :::.:. ...: .. . : .... :..
CCDS39 NHLPLEYNSALYSRIFDDFGTHYFTSGSLGGVYDLLYQFSSEELKNSGLTEEEAKHCVRI
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KE2 DFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTM--VEDLVVLVRGGASEHITTLA
. : ..: . ..: . : :....... . . .: . :.::: ::. ..::
CCDS39 ETK-----KRVLFAKKTKV-EHRCTTNKLSEKHEGSFIQGAEKSISLIRGGRSEYGAALA
410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 YQELPTA---DLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVRQNMKQALEEF
... .. ..:: ..:. :::.: .. :. .:: : .. :.:...::.:.
CCDS39 WEKGSSGLEEKTFSEWLESVKENPAVIDFELAPIVDLVRNIPCAVTK--RNNLRKALQEY
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 QKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVS---YRKNTPIDGKWNCWSN
. . :.:::: .:: :.:.:..: :.: :. : :: . :..:. .::.:.:::.
CCDS39 AAKFDPCQCAPCPNNGRPTLSGTECLCVCQSGTYGENCEKQSPDYKSNA-VDGQWGCWSS
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590
pF1KE2 WSSCSGR-RKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
::.:.. ...: :.:::: :: ::. : : . ::.
CCDS39 WSTCDATYKRSRTRECNNPAPQRGGKRCEGEKRQEEDCTFSIMENNGQPCINDDEEMKEV
580 590 600 610 620 630
CCDS39 DLPEIEADSGCPQPVPPENGFIRNEKQLYLVGEDVEISCLTGFETVGYQYFRCLPDGTWR
640 650 660 670 680 690
>>CCDS606.1 C8A gene_id:731|Hs108|chr1 (584 aa)
initn: 1156 init1: 486 opt: 853 Z-score: 797.3 bits: 157.5 E(32554): 4.3e-38
Smith-Waterman score: 1198; 33.6% identity (62.1% similar) in 554 aa overlap (63-590:37-584)
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 ERPHSFGSNAVNKSFAKSRQMRSVDVTLMPIDCELSSWSSWTTCDPCQKKRYRYAYLLQP
. :.::.:: :: : ::: :.::. ::::
CCDS60 FILSLMTCQPGVTAQEKVNQRVRRAATPAAVTCQLSNWSEWTDCFPCQDKKYRHRSLLQP
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 SQFHGEPCNFSDKEVEDCVTNRPCRSQVRC-EGFVCAQTGRCVNRRLLCNGDNDCGDQSD
..: : :. . . .: .. : :..: . : : .::::..:.:.::::.:: : ::
CCDS60 NKFGGTICSGDIWDQASCSSSTTCVRQAQCGQDFQCKETGRCLKRHLVCNGDQDCLDGSD
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200
pF1KE2 EANC---RRIYKKCQHEMDQYWGIGSLASGINLFTNSFEGPVLDHRYYAGGCSPHYILNT
: .: : : . :. ... : . : : :..:. : : ::.: : : .
CCDS60 EDDCEDVRAIDEDCS-QYEPIPGSQKAALGYNILTQEDAQSVYDASYYGGQCETVYNGEW
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240
pF1KE2 R-------------------FRKPYNVESYTPQTQGKYEFILKEYESYSDFERNVTEKMA
: :::::: .: .. . . . :.. .:. .: . .
CCDS60 RELRYDSTCERLYYGDDEKYFRKPYNFLKYHFEALADTGISSEFYDNANDLLSKVKKDKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 SKSGFSFGFKIPG---IFELGISSQSDRGKHYIRRTKRFSHTKSVFLHARSDLEVAHYKL
.. : ..:. : . .:.: ..: . .. . ..... : .: . . ...::.:.
CCDS60 DSFGVTIGIGPAGSPLLVGVGVSHSQDTS--FLNELNKYNEKKFIFTRIFTKVQTAHFKM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 KPRSLMLHYEFLQRVKRLPLEYSYGEYRDLFRDFGTHYITEAVLGGIYEYTLVMNKEAME
. ..:: .:: . .:: .:.:: : .. :.:::::: . .:::::: ::..: ::
CCDS60 RKDDIMLDEGMLQSLMELPDQYNYGMYAKFINDYGTHYITSGSMGGIYEYILVIDKAKME
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 RGDYTLNNVHACAKNDFKIGGAIEEVYVSLGVSVGKCRGILNEIKDRNKRDTMVEDLVVL
: .. .: ... : ... :. :.: .:. . . .: .. :::..
CCDS60 SLGITSRDITTCFGGSLGIQYE-DKINVGGGLSGDHCKKFGGGKTERARKAMAVEDIISR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 VRGGASEHITTLAYQELPTADLMQEWGDAVQYNPAIIKVKVEPLYELVTATDFAYSSTVR
::::.: :: :. : .. :: ...:::..: ...:..:.. :... . :
CCDS60 VRGGSSGWSGGLA-QNRSTIT-YRSWGRSLKYNPVVIDFEMQPIHEVLRHTSLGPLEAKR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 QNMKQALEEFQKEVSSCHCAPCQGNGVPVLKGSRCDCICPVGSQGLACEVSYRKNTPIDG
::...::... : ..:.:.:: .::::.:.:. : : : .:: : ::: . ... ::
CCDS60 QNLRRALDQYLMEFNACRCGPCFNNGVPILEGTSCRCQCRLGSLGAACEQTQTEGAKADG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE2 KWNCWSNWSSCSGRRKTRQRQCNNPPPQNGGSPCSGPASETLDCS
.:.:::.:: : . . :.:.:.:: :::::. : : .: :
CCDS60 SWSCWSSWSVCRAGIQERRRECDNPAPQNGGASCPGRKVQTQAC
550 560 570 580
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]