Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2012
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2012, 557 aa
1>>>pF1KE2012 557 - 557 aa - 557 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7752+/-0.000894; mu= -5.7938+/- 0.054
mean_var=279.1865+/-60.867, 0's: 0 Z-trim(115.3): 108 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.076759
statistics sampled from 15790 (15898) to 15790 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.488), width: 16
Scan time: 4.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 557) 3929 448.3 1.1e-125
CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 424) 3031 348.8 7.8e-96
CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 605) 2105 246.3 7.7e-65
CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 591) 2104 246.2 8.2e-65
CCDS7969.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 386) 1529 182.4 8.4e-46
CCDS53635.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 391) 1529 182.4 8.5e-46
CCDS76407.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 366) 1509 180.2 3.7e-45
CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 444) 1374 165.3 1.4e-40
CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 461) 1374 165.3 1.4e-40
CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 727) 613 81.2 4.9e-15
CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 617) 585 78.0 3.7e-14
CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 732) 585 78.1 4.2e-14
CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 271) 517 70.3 3.4e-12
CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 596) 521 70.9 4.8e-12
CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 487) 517 70.4 5.6e-12
CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 625) 517 70.5 6.8e-12
CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 483) 503 68.9 1.6e-11
>>CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (557 aa)
initn: 3929 init1: 3929 opt: 3929 Z-score: 2369.7 bits: 448.3 E(32554): 1.1e-125
Smith-Waterman score: 3929; 99.8% identity (100.0% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TILDPLDQWQPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 DSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 NFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 FHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 FEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFK
490 500 510 520 530 540
550
pF1KE2 EQNDKPYCQNCFLKLFC
:::::::::::::::::
CCDS44 EQNDKPYCQNCFLKLFC
550
>>CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (424 aa)
initn: 3031 init1: 3031 opt: 3031 Z-score: 1834.0 bits: 348.8 E(32554): 7.8e-96
Smith-Waterman score: 3031; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (134-557:1-424)
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 VGSPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFP
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 ADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDE
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGK
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 TGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTW
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 HPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWH
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 PEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHP
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 ECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPE
340 350 360 370 380 390
530 540 550
pF1KE2 HFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
400 410 420
>>CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (605 aa)
initn: 2695 init1: 2105 opt: 2105 Z-score: 1277.6 bits: 246.3 E(32554): 7.7e-65
Smith-Waterman score: 3728; 91.7% identity (91.9% similar) in 589 aa overlap (17-557:17-605)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TILDPLDQWQPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE2 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFK-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKGSWPLEEVVLLVSISSSVQEGEK
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KE2 -------------------------FMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YPHPCAARHRTPSLRSPDQPPPCPQFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLN
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 KLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCE
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 KDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRK
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 DYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVH
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 YHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCF
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 LKLFC
:::::
CCDS58 LKLFC
>>CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 (591 aa)
initn: 3915 init1: 2103 opt: 2104 Z-score: 1277.1 bits: 246.2 E(32554): 8.2e-65
Smith-Waterman score: 3836; 94.1% identity (94.2% similar) in 589 aa overlap (3-557:3-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TILDPLDQWQPSSSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNKQKSAEPSPTVMSTSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGALSPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE2 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFK-----------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKIQGLEQRADGERCWAAGWPRDGG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320
pF1KE2 -----------FMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RSSPGGQDEGGFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGA
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 CKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYC
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 NGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCA
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 RAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQK
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550
pF1KE2 PITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
550 560 570 580 590
>>CCDS7969.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 (386 aa)
initn: 1502 init1: 1460 opt: 1529 Z-score: 935.7 bits: 182.4 E(32554): 8.4e-46
Smith-Waterman score: 1529; 60.8% identity (81.6% similar) in 332 aa overlap (230-556:54-384)
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 EKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPA---ITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTR
::.:: :.: :.. ... ...
CCDS79 NPAPLPLDQHSRKETNLDETSEILSIQDNTSPLPAQLVYTTNIQELNVYSEAQEPKESPP
30 40 50 60 70 80
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 ISASSATRELDELMASLSDF--KFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKL
: .::. .:::::: :... : ... .:.. : . .: ::::::.:...:. :
CCDS79 PSKTSAAAQLDELMAHLTEMQAKVAVRADAGKKHLPDKQDHKAS-LDSMLGGLEQELQDL
90 100 110 120 130 140
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKD
:.::: :: :..:.:::::.:. :.:..:::::::::::.::::: ::::.: :: .:
CCDS79 GIATVPKGHCASCQKPIAGKVIHALGQSWHPEHFVCTHCKEEIGSSPFFERSGLAYCPND
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 YHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDY
::.:::::: :: .::::::.::...:::::::::..:: :: ::::::: : :::::.
CCDS79 YHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMNQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDF
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 FDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYH
. ::.:::::: : .::::.::..:.:::::::: .::: : .::::: ::.:.::.:::
CCDS79 LAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDTVWHPECFVCGDCFTSFSTGSFFELDGRPFCELHYH
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 ERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLK
.:::.:: :: .:::::::.::. ::::::::::::: ::.:: :.::::: ::: :: :
CCDS79 HRRGTLCHGCGQPITGRCISAMGYKFHPEHFVCAFCLTQLSKGIFREQNDKTYCQPCFNK
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 LFC
::
CCDS79 LFPL
>>CCDS53635.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 1502 init1: 1460 opt: 1529 Z-score: 935.6 bits: 182.4 E(32554): 8.5e-46
Smith-Waterman score: 1529; 60.8% identity (81.6% similar) in 332 aa overlap (230-556:59-389)
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 EKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPA---ITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTR
::.:: :.: :.. ... ...
CCDS53 NPAPLPLDQHSRKETNLDETSEILSIQDNTSPLPAQLVYTTNIQELNVYSEAQEPKESPP
30 40 50 60 70 80
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 ISASSATRELDELMASLSDF--KFMAQGKTGSSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKL
: .::. .:::::: :... : ... .:.. : . .: ::::::.:...:. :
CCDS53 PSKTSAAAQLDELMAHLTEMQAKVAVRADAGKKHLPDKQDHKAS-LDSMLGGLEQELQDL
90 100 110 120 130 140
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKD
:.::: :: :..:.:::::.:. :.:..:::::::::::.::::: ::::.: :: .:
CCDS53 GIATVPKGHCASCQKPIAGKVIHALGQSWHPEHFVCTHCKEEIGSSPFFERSGLAYCPND
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 YHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDY
::.:::::: :: .::::::.::...:::::::::..:: :: ::::::: : :::::.
CCDS53 YHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMNQTWHPEHFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDF
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 FDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYH
. ::.:::::: : .::::.::..:.:::::::: .::: : .::::: ::.:.::.:::
CCDS53 LAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDTVWHPECFVCGDCFTSFSTGSFFELDGRPFCELHYH
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 ERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLK
.:::.:: :: .:::::::.::. ::::::::::::: ::.:: :.::::: ::: :: :
CCDS53 HRRGTLCHGCGQPITGRCISAMGYKFHPEHFVCAFCLTQLSKGIFREQNDKTYCQPCFNK
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 LFC
::
CCDS53 LFPL
390
>>CCDS76407.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 (366 aa)
initn: 1502 init1: 1460 opt: 1509 Z-score: 924.1 bits: 180.2 E(32554): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 1509; 64.8% identity (84.4% similar) in 301 aa overlap (258-556:65-364)
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 VPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDF--KFMAQGKTG
: .::. .:::::: :... : ... .:
CCDS76 TLMRLRRSFLFRITQVPCREAQEPKESPPPSKTSAAAQLDELMAHLTEMQAKVAVRADAG
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 SSSPPGGPPKPGSQLDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHP
.. : . .: ::::::.:...:. ::.::: :: :..:.:::::.:. :.:..:::
CCDS76 KKHLPDKQDHKAS-LDSMLGGLEQELQDLGIATVPKGHCASCQKPIAGKVIHALGQSWHP
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPE
::::::::.::::: ::::.: :: .:::.:::::: :: .::::::.::...:::::
CCDS76 EHFVCTHCKEEIGSSPFFERSGLAYCPNDYHQLFSPRCAYCAAPILDKVLTAMNQTWHPE
160 170 180 190 200 210
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 HFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWHPEC
::::..:: :: ::::::: : :::::.. ::.:::::: : .::::.::..:.:::::
CCDS76 HFFCSHCGEVFGAEGFHEKDKKPYCRKDFLAMFSPKCGGCNRPVLENYLSAMDTVWHPEC
220 230 240 250 260 270
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 FVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHF
::: .::: : .::::: ::.:.::.:::.:::.:: :: .:::::::.::. :::::::
CCDS76 FVCGDCFTSFSTGSFFELDGRPFCELHYHHRRGTLCHGCGQPITGRCISAMGYKFHPEHF
280 290 300 310 320 330
530 540 550
pF1KE2 VCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
:::::: ::.:: :.::::: ::: :: :::
CCDS76 VCAFCLTQLSKGIFREQNDKTYCQPCFNKLFPL
340 350 360
>>CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 (444 aa)
initn: 1506 init1: 1350 opt: 1374 Z-score: 842.1 bits: 165.3 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1498; 46.7% identity (65.9% similar) in 495 aa overlap (80-556:13-443)
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 PPPPSSEALNGTILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCS
.: . : :: . :: . : .
CCDS10 MPRSGAPKERPAEPLTPPPSYGHQ--------PQTGSGESSG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 RVGEEEHVYSFPNKQKSAEPS----PTVMSTS--LGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFP
:...:.:: : .: .:. : :.: ::..: :::::: ::::.: :
CCDS10 ASGDKDHLYSTVCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNI----
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 ADEANSSPPLPGALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDE
.:: :. : ... .:. .: :: ::. :
CCDS10 TDEIMSQFP-------------SSKVASGEQKEDQSEDKKR----------PSLPS----
100 110 120
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 LESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQ-G
:: :.. : . ::.::: :::.::::::::. . .
CCDS10 ------SPSPGL---------P----------KASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLP
130 140 150
290 300 310 320 330
pF1KE2 KTGSSSPP-------GGP--PKPGSQ--LDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPI
.: ..:: :.: :.: .. ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.:::
CCDS10 ASGPTQPPVVSSTNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPI
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 AGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPIL
:::::::.:..:::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .:: ::
CCDS10 AGQVVTALGRAWHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIR
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 DKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILE
:.:::: :::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: :: ::.
CCDS10 HKMVTALGTHWHPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILD
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KE2 NYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGR
::::::..::::.::::::::.:: .::::::.:.: :: :.: ::::::. : :.:::
CCDS10 NYISALSALWHPDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGR
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550
pF1KE2 CITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
:..:....:::.::.:.:::. :.::.:.:. ::::: ::::::
CCDS10 CVSALGRRFHPDHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
400 410 420 430 440
>>CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 (461 aa)
initn: 1588 init1: 1350 opt: 1374 Z-score: 841.8 bits: 165.3 E(32554): 1.4e-40
Smith-Waterman score: 1510; 44.1% identity (62.0% similar) in 574 aa overlap (1-556:1-460)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MDDLDALLADLESTTSHISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNG
:.::::::.:::.::::. . . : :. :. ::::
CCDS42 MEDLDALLSDLETTTSHMPRSGA------PKERPA-----------EPLTPPPS------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 TILDPLDQWQPSGSRFIHQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSVGSPCSRVGEEEHVYSF
. :: ::..: : :. .: :...:.::
CCDS42 ---------------YGHQ-PQTGS---GESSGAS----------------GDKDHLYST
40 50 60
130 140 150 160 170
pF1KE2 PNKQKSAEPS----PTVMSTS--LGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLP
: .: .:. : :.: ::..: :::::: ::::.: : .:: :. :
CCDS42 VCKPRSPKPAAPAAPPFSSSSGVLGTGLCELDRLLQELNATQFNI----TDEIMSQFP--
70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 GALSPLYGVPETNSPLGGKAGPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPA
... .:. .: :: ::. : :: :.
CCDS42 -----------SSKVASGEQKEDQSEDKKR----------PSLPS----------SPSPG
120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ITVNQGEMSSPQRVTSTQQQTRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQ-GKTGSSSPP---
. : . ::.::: :::.::::::::. . . .: ..::
CCDS42 L---------P----------KASATSATLELDRLMASLSDFRVQNHLPASGPTQPPVVS
150 160 170 180
300 310 320 330 340
pF1KE2 ----GGP--PKPGSQ--LDSMLGSLQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKT
:.: :.: .. ::.::: :::::.. :: : :::.::.:.::::::::::.:..
CCDS42 STNEGSPSPPEPTGKGSLDTMLGLLQSDLSRRGVPTQAKGLCGSCNKPIAGQVVTALGRA
190 200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 WHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERDGQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTW
:::::::: :. .:. .:::.:: :.: . : . ::::: .:: :: :.:::: :
CCDS42 WHPEHFVCGGCSTALGGSSFFEKDGAPFCPECYFERFSPRCGFCNQPIRHKMVTALGTHW
250 260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 HPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDGKAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAILENYISALNTLWH
::::: :..:: :: :::::..:. :::.:....:::.: :: ::.::::::..:::
CCDS42 HPEHFCCVSCGEPFGDEGFHEREGRPYCRRDFLQLFAPRCQGCQGPILDNYISALSALWH
310 320 330 340 350 360
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 PECFVCRECFTPFVNGSFFEHDGQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHP
:.::::::::.:: .::::::.:.: :: :.: ::::::. : :.::::..:....:::
CCDS42 PDCFVCRECFAPFSGGSFFEHEGRPLCENHFHARRGSLCATCGLPVTGRCVSALGRRFHP
370 380 390 400 410 420
530 540 550
pF1KE2 EHFVCAFCLKQLNKGTFKEQNDKPYCQNCFLKLFC
.::.:.:::. :.::.:.:. ::::: ::::::
CCDS42 DHFTCTFCLRPLTKGSFQERAGKPYCQPCFLKLFG
430 440 450 460
>>CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 (727 aa)
initn: 826 init1: 438 opt: 613 Z-score: 383.4 bits: 81.2 E(32554): 4.9e-15
Smith-Waterman score: 622; 28.7% identity (51.7% similar) in 460 aa overlap (48-494:301-723)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 ISKRPVFLSEETPYSYPTGNHTYQEIAVPPPVPPPPSSEALNGTILDPLDQWQPSGSRFI
:. : . : : : . :...
CCDS73 QSRSFRILAQMTGTEFMQDPDEEALRRSSTPIEHAPVCTSQATTPLLPASAQPPAAA---
280 290 300 310 320
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 HQQPQSSSPVYGSSAKTSSVSNPQDSV--GSPCSRVGEEEHVYSFPNKQKSAEPSPTVMS
.:...:: ...: ..... . .. .:: . . :: : :. :. : :
CCDS73 --SPSAASPPLATAAAHTAIASASTTAPASSPADSPRPQASSYS-PAVAASSAPA-THTS
330 340 350 360 370 380
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 TSLGSNLSELDRLLLELNAVQHNPPGFPADEANSSPPLPGA-LSPLYGVPETNSPLGGKA
: : .. ... : . :.. : ::: :: .: : ::
CCDS73 YSEGPAAPAPKPRVVTTASIR--PSVYQPVPASTYSPSPGANYSP---TPYTPSP-----
390 400 410 420 430
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 GPLTKEKPKRNGGRGLEDVRPSVESLLDELESSVPSPVPAITVNQGEMSSPQRVTSTQQQ
.: .: :: . . .:::.:: : . . .: .. .
CCDS73 APAYTPSPA-------PAYTPS------PVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNPAPSVAYSGG
440 450 460 470 480
260 270 280 290 300
pF1KE2 TRISASSATRELDELMASLSDFKFMAQGKTGSSS-----PPGGPP-KP-GSQLDSML-GS
:: :. :.:. :: : ::. .: : ::: : : :. . :.
CCDS73 PAEPASRPPWVTDD---SFSQ-KF-APGKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGT
490 500 510 520 530
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 LQSDLNKLGVATVAKGVCGACKKPIAGQVVTAMGKTWHPEHFVCTHCQEEIGSRNFFERD
.: . :. .:: :.. : : ..:::..::::.:.:..:. ... : :..
CCDS73 VQR--AERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQ
540 550 560 570 580 590
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 GQPYCEKDYHNLFSPRCYYCNGPILDKVVTALDRTWHPEHFFCAQCGAFFGPEGFHEKDG
.. :::. :...:.: : :: :. .:. :: .::: : :: : :: :: .::
CCDS73 NNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDG
600 610 620 630 640 650
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KAYCRKDYFDMFAPKCGGCARAIL--ENYISALNTLWHPECFVCRECFTPFVNGSFFEHD
. ::.:::...:. :: :: . ...: ::. :: ::.: : . . . :. .
CCDS73 EPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKK
660 670 680 690 700 710
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GQPYCEVHYHERRGSLCSGCQKPITGRCITAMAKKFHPEHFVCAFCLKQLNKGTFKEQND
.: :. : :
CCDS73 DRPLCKKHAHTINL
720
557 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:42:17 2016 done: Sun Nov 6 21:42:18 2016
Total Scan time: 4.120 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]