Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1973
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1973, 541 aa
1>>>pF1KE1973 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4195+/-0.00123; mu= 17.8448+/- 0.074
mean_var=67.3653+/-13.346, 0's: 0 Z-trim(101.0): 54 B-trim: 76 in 1/49
Lambda= 0.156263
statistics sampled from 6287 (6332) to 6287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 ( 541) 3587 818.3 0
CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX ( 686) 655 157.4 5.2e-38
CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX ( 696) 625 150.6 5.7e-36
CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 569) 597 144.2 3.8e-34
CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 570) 578 140.0 7.4e-33
CCDS2061.1 IL18RAP gene_id:8807|Hs108|chr2 ( 599) 561 136.1 1.1e-31
CCDS54696.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 ( 687) 544 132.3 1.8e-30
CCDS2056.1 IL1RL2 gene_id:8808|Hs108|chr2 ( 575) 542 131.8 2.1e-30
CCDS2057.1 IL1RL1 gene_id:9173|Hs108|chr2 ( 556) 458 112.9 1e-24
CCDS74547.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 ( 538) 307 78.9 1.7e-14
CCDS31325.1 SIGIRR gene_id:59307|Hs108|chr11 ( 410) 264 69.1 1.1e-11
>>CCDS2060.1 IL18R1 gene_id:8809|Hs108|chr2 (541 aa)
initn: 3587 init1: 3587 opt: 3587 Z-score: 4369.8 bits: 818.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3587; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSS
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CCDS20 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKNYTQKWKLNVIRRNKHSCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKNYTQKWKLNVIRRNKHSCF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TERQVTSKIVEVKKFFQITCENSYYQTLVNSTSLYKNCKKLLLENNKNPTIKKNAEFEDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 TERQVTSKIVEVKKFFQITCENSYYQTLVNSTSLYKNCKKLLLENNKNPTIKKNAEFEDQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVAVELGKNVRLNCSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 GYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVAVELGKNVRLNCSAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LNEEDVIYWMFGEENGSDPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 LNEEDVIYWMFGEENGSDPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 ASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 HLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLKECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 HLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLKECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 PGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 PGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSYMSNEVRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 DFTFLPQSLKLLKSHRVLKWKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS20 DFTFLPQSLKLLKSHRVLKWKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSE
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 S
:
CCDS20 S
>>CCDS14517.1 IL1RAPL2 gene_id:26280|Hs108|chrX (686 aa)
initn: 557 init1: 223 opt: 655 Z-score: 795.9 bits: 157.4 E(32554): 5.2e-38
Smith-Waterman score: 720; 32.4% identity (59.7% similar) in 534 aa overlap (33-523:46-559)
10 20 30 40 50
pF1KE1 CRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSC--SLAHEIETTTKS-----
::: .: :. : . .:..:
CCDS14 STNLKMVSKRNSVDGCIDWSVDLKTYMALAGEPVRVK-CALFYSYIRTNYSTAQSTGLRL
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 -WYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKNYTQKWK----LN
:::..:. : : : :.. .. . : .: .:.: : ..: : : :.
CCDS14 MWYKNKGDLE--EPIIFSEVRMSKEEDSIWFHSAEAQDSGFYTCVLRNSTYCMKVSMSLT
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KE1 VIRRNKHSCFTERQVTSKIVEVKKFFQITCEN--SYYQTLVNSTSL-YKNCK----KLLL
: . .. :.. : . :: : .:.: . .. .. . . ::.:: . ..
CCDS14 VAENESGLCYNSRIRYLEKSEVTKRKEISCPDMDDFKKSDQEPDVVWYKECKPKMWRSII
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 ENNKNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNIT-IVEDRSNIVPVLLGPKL
.. : . .... :: : :.: :...::: : ...: .. :. : : :
CCDS14 IQKGNALLIQEVQEEDGGNYTC--ELKYEGKLVRRTTELKVTALLTDKP---PKPLFPME
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KE1 NH---VAVELGKNVRLNCSALLNEED----VIYWMFGEENGSDPNIH-EEKEMRIMTPE-
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CCDS14 NQPSVIDVQLGKPLNIPCKAFFGFSGESGPMIYWMKGEKFIEELAGHIREGEIRLLKEHL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 GKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMII
:. .. .: .... :..: . :.: : . .: : .:.:: :. .. : .
CCDS14 GEKEVELALIFDSVVEADL-ANYTCHVENRNGRKHAS-VLLRKKDLIY---KIELAGGLG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KE1 AVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLK------ECRP
:...:.... .. : : ..:.::::. ::: :.: :::..:: : .:
CCDS14 AIFLLLVLLVVIYKC--YNIELMLFYRQHFGADETNDDNKEYDAYLSYTKVDQDTLDC--
370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 ENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSKSY
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CCDS14 DNPEEEQFALEVLPDVLEKHYGYKLFIPERDLIPSGTYMEDLTRYVEQSRRLIIVLTPDY
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KE1 MSNE--VRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT------DFTFLPQSLKLLKSHRVLK
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CCDS14 ILRRGWSIFELESRLHNMLVSGEIKVILIECTELKGKVNCQEVESLKRSIKLLS---LIK
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KE1 WKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES
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CCDS14 WKGSKSSKLNSKFWKHLVYEMPIKKKEMLPRCHVLDSAEQGLFGELQPIPSIAMTSTSAT
540 550 560 570 580 590
>>CCDS14218.1 IL1RAPL1 gene_id:11141|Hs108|chrX (696 aa)
initn: 558 init1: 222 opt: 625 Z-score: 759.3 bits: 150.6 E(32554): 5.7e-36
Smith-Waterman score: 726; 30.4% identity (58.3% similar) in 566 aa overlap (9-527:18-566)
10 20 30 40
pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRP----HITVVEGEPFYLKHCSCSLAH
.: :. . ..:..::. . :. ::: .: :.: .
CCDS14 MKAPIPHLILLYATFTQSLKVVTKRGSADGCTDWSIDIKKYQVLVGEPVRIK---CALFY
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KE1 EIETTTKS----------WYKSSGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYF
:. : :::::: . : ..::.. .. . : :. :.:.: :
CCDS14 GYIRTNYSLAQSAGLSLMWYKSSGPGDFEEPIAFDGSRMSKEEDSIWFRPTLLQDSGLYA
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 FQMKNYTQKWKLNV---IRRNKHS-CFTERQVTSKIVEVKKFFQITC---ENSYYQTLVN
..: : :... . .: . :.. .. . .:..: .:.: :. :
CCDS14 CVIRNSTYCMKVSISLTVGENDTGLCYNSKMKYFEKAELSKSKEISCRDIEDFLLPTREP
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE1 STSLYKNCKKLLLENN----KNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITI
::.:. . . .. . .... .: : :.: :...: : . .: ..:.
CCDS14 EILWYKECRTKTWRPSIVFKRDTLLIREVREDDIGNYTC--ELKYGG--FVVRRTTELTV
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KE1 VEDRSNIVPVLLGP---KLNHVAVELGKNVRLNCSALLNEE-DV---IYWMFGEE--NGS
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CCDS14 TAPLTDKPPKLLYPMESKLTIQETQLGDSANLTCRAFFGYSGDVSPLIYWMKGEKFIEDL
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 DPNIHEEKEMRIMTPE-GKWHASKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTKSFILVRK
: : :...::. . :. ..: : .... :..:. :.: : . .: : .: ..
CCDS14 DENRVWESDIRILKEHLGEQEVSISLIVDSVEEGDLGN-YSCYVENGNGRRHASVLLHKR
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 ADMADIPGHVFTRGMIIAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYD
: . : . :.:.: .:::::. :.....::::. .: :.: ::
CCDS14 ELMYTVE----LAGGLGAILLL--LVCLVTIYKCYKIEIMLFYRNHFGAEELDGDNKDYD
360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 AFVSYLK----ECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSL
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CCDS14 AYLSYTKVDPDQWNQETGEEERFALEILPDMLEKHYGYKLFIPDRDLIPTGTYIEDVARC
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KE1 IEKSRRLIIVLSKSYMSNE--VRYELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVT------DFTF
...:.:::::.. .:. . .:::. :.. :: .::.:::: . . .
CCDS14 VDQSKRLIIVMTPNYVVRRGWSIFELETRLRNMLVTGEIKVILIECSELRGIMNYQEVEA
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 LPQSLKLLKSHRVLKWKADKSLSYNSRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES
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CCDS14 LKHTIKLLT---VIKWHGPKCNKLNSKFWKRLQYEMPFKRIEPITHEQALDVSEQGPFGE
530 540 550 560 570 580
CCDS14 LQTVSAISMAAATSTALATAHPDLRSTFHNTYHSQMRQKHYYRSYEYDVPPTGTLPLTSI
590 600 610 620 630 640
>>CCDS2055.1 IL1R1 gene_id:3554|Hs108|chr2 (569 aa)
initn: 487 init1: 141 opt: 597 Z-score: 726.5 bits: 144.2 E(32554): 3.8e-34
Smith-Waterman score: 693; 27.0% identity (58.0% similar) in 559 aa overlap (12-540:13-558)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHCSCSLAHEIETTTKSWYKS
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CCDS20 MKVLLRLICFIALLISSLEADKCKEREEKIILVSSANEIDVRPCPLNPNEHKGTITWYKD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SGSQEHVELNPRSSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKN--YTQKWKLNV--IRRN
.. .. .. ...::: : : : :....:.: :. ..: : . :... .. .
CCDS20 DS---KTPVSTEQASRIHQHKEKLWFVPAKVEDSGHYYCVVRNSSYCLRIKISAKFVENE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE1 KHSCFTERQVTSKIVEVKKFFQITCEN-SYYQTLVN---STSLYKNCKKLLLENN-----
. :.. . . .. . : ..: .... : . . ::.:: :::.:
CCDS20 PNLCYNAQAIFKQKLPVAGDGGLVCPYMEFFKNENNELPKLQWYKDCKPLLLDNIHFSGV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KNPTIKKNAEFEDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRSNIVPVLLGPKLNHVA
:. : :. . .: :.: . :: . ::..... .:. . ::...: . .
CCDS20 KDRLIVMNVAEKHRGNYTCHASYTYLGKQYPITRVIEFITLEENKPTRPVIVSPANETME
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VELGKNVRLNCSALLNEEDVIYWMF-GEENGSDPNIHEEKEMRIMTPEGKWHASKVLRIE
:.::....: :.. . :. :: . : : . : . . .: .: . : .. .
CCDS20 VDLGSQIQLICNVTGQLSDIAYWKWNGSVIDEDDPVLGEDYYSVENPANK-RRSTLITVL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 NIGESNLNVL---YNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPGHVFTRGMI-IAVLILVAV
::.: . ..: . .: : :. . :. : : . :: : : . : .
CCDS20 NISEIESRFYKHPFTCFAKNTHGIDAAYIQLIY-------PVTNFQKHMIGICVTLTVII
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KE1 VCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETL--TDGKTYDAFVSYLKEC-RPENGEEHTFAVE
:: : . :...:.::.:: . .:::::::.. : : . ... :. .
CCDS20 VCSVFIYKIFKIDIVLWYRDSCYDFLPIKASDGKTYDAYILYPKTVGEGSTSDCDIFVFK
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 ILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSK-----SYMSNEVR
.::.::::. :::: :. :: : .:. :. ..:::::::.: . :.... .
CCDS20 VLPEVLEKQCGYKLFIYGRDDYVGEDIVEVINENVKKSRRLIIILVRETSGFSWLGGSSE
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KE1 YELESGLHEALVERKIKIILIEFTPVTDFTFLPQSLKLLKS-HRVLKWKADKSL---SYN
.. ....:::. ::..:.:. . :. .:.:.:..:. : ...:..: . : .
CCDS20 EQI--AMYNALVQDGIKVVLLELEKIQDYEKMPESIKFIKQKHGAIRWSGDFTQGPQSAK
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540
pF1KE1 SRFWKNLLYLMPAKTVKPGRDEPEVLPVLSES
.:::::. : ::.. .:. . . :. .:
CCDS20 TRFWKNVRYHMPVQRRSPSSKHQLLSPATKEKLQREAHVPLG
530 540 550 560
>>CCDS3298.1 IL1RAP gene_id:3556|Hs108|chr3 (570 aa)
initn: 504 init1: 229 opt: 578 Z-score: 703.3 bits: 140.0 E(32554): 7.4e-33
Smith-Waterman score: 693; 31.3% identity (59.6% similar) in 540 aa overlap (27-529:34-554)
10 20 30 40
pF1KE1 MNCRELPLTLWVLISVSTAESCTSRPHITVVEGEPFYLKHC---------SCSLAH
.: : : :: .: : . : ::
CCDS32 LWCVVSLYFYGILQSDASERCDDWGLDTMRQIQVFEDEPARIK-CPLFEHFLKFNYSTAH
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 EIETTTKSWYKSSGSQEHVE-LNPR-SSSRIALHDCVLEFWPVELNDTGSYFFQMKN--Y
: :: . ... : .: : .::. . :: : :. :::::.: ...: :
CCDS32 SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTY
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KE1 TQK--WKLNVIRRNKHSCF-TERQVTSKIVEVKKFFQ-ITCEN--SYYQTLVNST-SLYK
.: . :.:.... ::: . .. . . .. .: ::: : .:. . :. : . :
CCDS32 CSKVAFPLEVVQKD--SCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYM
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 NCKKLLLENNKNPTIKKNAEF-----EDQGYYSCVHFLHHNGKLFNITKTFNITIVEDRS
.: :. :: : : : ..: :.:: .::. :..:.:... .: . .
CCDS32 GCYKIQNFNNVIPE-GMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KE1 NIVPVLLGPKLNHVAVEL--GKNVRLNCSA----LLNEEDVIYWMFGEENGSDPNIHEEK
: :: .. .::. : :... . :.. :.. .. ..: . .. .: .:
CCDS32 NAVPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTI
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 EMRIMTPEGKWHA-SKVLRIENIGESNLNVLYNCTVASTGGTDTKSFILVRKADMADIPG
. : . . .. ...: :... .:. : : . :. : .:. . .: .:.
CCDS32 NESISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQK-----VPA
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 HVFTRGMI--IAVLILVAVVCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYDAFVSYL
.: . ... .:..:. :..: .: ...::::: :::. ::: :: .:::
CCDS32 PRYTVELACGFGATVLLVVI-LIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYA
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 KECRPENGEEHTFAVEILPRVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIV
. :.::. :.. : :::..::::::::.:: .::: :.:: :.:.:::::..:
CCDS32 R-----NAEEEEFVLLTLRGVLENEFGYKLCIFDRDSLPGGIVTDETLSFIQKSRRLLVV
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450 460 470 480 490
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:: .:. .... ::..::.. . .:..::... : . . :: :. :.:
CCDS32 LSPNYVLQGTQALLELKAGLENMASRGNINVILVQYKAVKETKV--KELKRAKTVLTVIK
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
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CCDS32 WKGEKSKYPQGRFWKQLQVAMPVKK-SPRRSSSDEQGLSYSSLKNV
530 540 550 560 570
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::.. .. . .: .: .: :.:.:
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90 100 110 120 130
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CCDS20 LTPGVNNSGSYICRPKMIKSPYDVACCVKMILEVKPQTNASC--EYSASHKQDLLLGSTG
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140 150 160 170 180 190
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... . .. . ... : .: : . . ::::: . ..:.: .. : :: :.
CCDS20 SWTVRAVVQVRTIVGDTKLKPDILDPVEDTLEVELGKPLTISCKARFGFERVFNPVIKWY
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260 270 280 290 300
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. . . . .. : : .. . . . .: :.. . .: . : : .. :. :.
CCDS20 IKDSDLEWEVSVPEAKSIKSTLKDEIIERNIIL--EKVTQRDLRRKFVCFVQNSIGNTTQ
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: : .: : :. .. .. :::: :.. ..:: ...::.:: .:.
CCDS20 SVQLKEKR------GVVLLYILLGTIGTLVAV--LAASALLYRHWIEIVLLYRTYQSKDQ
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:: : : .:::::: : : .::: .:. ..: :::...::.::..::::.:
CCDS20 TLGDKKDFDAFVSYAKWSSFPSEATSSLSEEH-LALSLFPDVLENKYGYSLCLLERDVAP
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::. ...: :.:..::: :..:: .:... .::..... :: .. .:.:::.: .
CCDS20 GGVYAEDIVSIIKRSRRGIFILSPNYVNGPSIFELQAAVNLALDDQTLKLILIKFCYFQE
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490 500 510 520 530
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::. .: :. ::: :.. ::. ::::: .. : ::.:
CCDS20 PESLPHLVK--KALRVLPTVTWRGLKSVPPNSRFWAKMRYHMPVKNSQGFTWNQLRITSR
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540
pF1KE1 SES
CCDS20 IFQWKGLSRTETTGRSSQPKEW
580 590
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CCDS54 SAGLTLI-WYWTRQDRDLEEPINFRLPENRISKEKDVLWFRPTLLNDTGNYTCMLRNTTY
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.: . :.:.... ::: . .. . . .. .: ::: : .:. . :. : . :
CCDS54 CSKVAFPLEVVQKD--SCFNSPMKLPVHKLYIEYGIQRITCPNVDGYFPSSVKPTITWYM
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.: :. :: : : : ..: :.:: .::. :..:.:... .: . .
CCDS54 GCYKIQNFNNVIPE-GMNLSFLIALISNNGNYTCVVTYPENGRTFHLTRTLTVKVVGSPK
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: :: .. .::. : :... . :.. :.. .. ..: . .. .: .:
CCDS54 NAVPPVIHSPNDHVVYEKEPGEELLIPCTVYFSFLMDSRNEVWWTIDGKKPDDITIDVTI
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270 280 290 300 310 320
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. : . . .. ...: :... .:. : : . :. : .:. . .: .:.
CCDS54 NESISHSRTEDETRTQILSIKKVTSEDLKRSYVCHARSAKGEVAKAAKVKQK-----VPA
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.: . ... .:..:. :..: .: ...::::: :::. ::: :: .:::
CCDS54 PRYTVELACGFGATVLLVVI-LIVVYHVYWLEMVLFYRAHFGTDETILDGKEYDIYVSYA
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. :.::. :.. : :::..::::::::.:: .::: .:. . ..:..:::.:.:
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:: .:.... :: : .. . .: :.:..:. :. : :.: .: ..:
CCDS54 LSPDYVTEKSISMLEFKLG-VMCQNSIATKLIVVEYRPLEHPH--PGILQLKESVSFVSW
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:..:: .:.::: : .: ...
CCDS54 KGEKSKHSGSKFWKALRLALPLRSLSASSGWNESCSSQSDISLDHVQRRRSRLKEPPELQ
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CCDS20 KNSSK---IPVSKIIQSRIHQDETWILFLPMEWGDSGVYQCVIKGRDSCHRIHVNLTVFE
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:: : : . ..:... : ..::. . .. : . . ::.:... :
CCDS20 KHWCDTSIGGLPNLSDEYKQILHLGKDDSLTCHLHFPKSCVLGPIKWYKDCNEIKGERFT
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.. . .:. ::.: :.: .: :.:: ... . ....:.: .. :: .. ::
CCDS20 VLETRLLVSNVSAEDRGNYACQAILTHSGKQYEVLNGITVSITERAGYGGSVPKIIYPKN
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. . :.:: .. ..:.. ..... . .: : : :..: :: . :.:
CCDS20 HSIEVQLGTTLIVDCNVTDTKDNTNLRCWRVNNTLVDDYYDESKRIR----EGVETHVS-
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.: .:. :.. : :. .:..: .:: ..:. : .: .
CCDS20 -FREHNLYTVNITFLEVKMEDYGLPFMCHAGVSTAYIIL-------QLPAPDFRAYLIGG
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.. :::: : .: . :...:.::.:: . ::..::: :::.: : : . ....:
CCDS20 LIALVAVAVSVVYIYNIFKIDIVLWYRSAFHSTETIVDGKLYDAYVLYPKPHK--ESQRH
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. ....:::.:::.. :::: :: :: :: ::.. : .. :::: ::. .:
CCDS20 AVDALVLNILPEVLERQCGYKLFIFGRDEFPGQAVANVIDENVKLCRRLIVIVVPESLGF
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. .. : . ... ::.. .:.::::. . :.: .:.:.. .:. : ...:..:
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CCDS20 QSQCMKTKFWKTVRYHMPPRRCRPFPPVQLLQHTPCYRTAGPELGSRRKKCTLTTG
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CCDS20 NYSVTATRSFTVKDEQGFSLFPVIGAPAQNEIKEVEIGKNANLTCSACFGKGTQFLAAVL
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:... . .: : :..:. . .: . :::: .. : .: . :.: . . :
CCDS20 WQLNGTKITDFGEPRIQQEEGQNQSFSNGLACLDMVLRIADVKEEDLLLQYDCLALNLHG
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.. : :: : : . . . ..:. . :: . .. .. .:..: ...
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.: .::: :::.: : .. . .: :: :. .::: :::.. :: :::. ::..:
CCDS20 YKTRNDGKLYDAYVVYPRNYKSSTDGASRVEH-FVHQILPDVLENKCGYTLCIYGRDMLP
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: :: ... :.:::: :..:. . : : :: : .:: ::.. :.::::. ..
CCDS20 GEDVVTAVETNIRKSRRHIFILTPQITHNKEFAYEQEVALHCALIQNDAKVILIEMEALS
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.. .: .::. :.: . ..::. :. . : ::.:::.. : ::. . : :
CCDS20 ELDMLQAEALQDSLQHLMKVQGTIKWREDHIANKRSLNSKFWKHVRYQMPVPSKIP-RKA
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. :. ..
CCDS20 SSLTPLAAQKQ
550
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CCDS74 MKVLLRLICFIALLISSLEADKCKEREEKIILVSSANEIDVRPCPLNPNEHKGTITWYKD
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.. .. .. ...::: : : : :....:.: :. ..: : . :... .. .
CCDS74 DS---KTPVSTEQASRIHQHKEKLWFVPAKVEDSGHYYCVVRNSSYCLRIKISAKFVENE
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. :.. . . .. . : ..: .... : . . ::.:: :::.:
CCDS74 PNLCYNAQAIFKQKLPVAGDGGLVCPYMEFFKNENNELPKLQWYKDCKPLLLDNIHFSGV
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:. : :. . .: :.: . :: . ::..... .:. . ::...: . .
CCDS74 KDRLIVMNVAEKHRGNYTCHASYTYLGKQYPITRVIEFITLEENKPTRPVIVSPANETME
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:.::....: :.. . :. :: . : : . : . . .: .: . : .. .
CCDS74 VDLGSQIQLICNVTGQLSDIAYWKWNGSVIDEDDPVLGEDYYSVENPANK-RRSTLITVL
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::.: . ..: . .: : :. . :. : : . :: : : . : .
CCDS74 NISEIESRFYKHPFTCFAKNTHGIDAAYIQLIY-------PVTNFQKHMIGICVTLTVII
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pF1KE1 VCLVTVCVIYRVDLVLFYRHLTRRDETLTDGKTYDAFVSYLKECRPENGEEHTFAVEILP
:: : . :...:.::.:: :. ..: : ...::
CCDS74 VCSVFIYKIFKIDIVLWYR---------------DSCYDFL----P---------IKVLP
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pF1KE1 RVLEKHFGYKLCIFERDVVPGGAVVDEIHSLIEKSRRLIIVLSK-----SYMSNEVRYEL
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CCDS74 EVLEKQCGYKLFIYGRDDYVGEDIVEVINENVKKSRRLIIILVRETSGFSWLGGSSEEQI
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CCDS74 --AMYNALVQDGIKVVLLELEKIQDYEKMPESIKFIKQKHGAIRWSGDFTQGPQSAKTRF
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CCDS74 WKNVRYHMPVQRRSPSSKHQLLSPATKEKLQREAHVPLG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]