FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1969, 534 aa
1>>>pF1KE1969 534 - 534 aa - 534 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3830+/-0.00087; mu= 18.0005+/- 0.052
mean_var=68.5416+/-14.270, 0's: 0 Z-trim(106.4): 79 B-trim: 477 in 1/49
Lambda= 0.154916
statistics sampled from 8884 (8965) to 8884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 3.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 534) 3607 815.4 0
CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 466) 3158 715.0 4.7e-206
CCDS5856.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 460) 3088 699.4 2.4e-201
CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 ( 580) 2612 593.0 3e-169
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 627 149.4 9.6e-36
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 612 146.0 9.8e-35
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 612 146.0 1e-34
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 576 137.9 2.1e-32
CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 420) 531 127.9 2.4e-29
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 531 127.9 2.8e-29
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 531 127.9 2.8e-29
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 529 127.5 3.8e-29
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 466 113.4 6.7e-25
CCDS74303.1 CYP4F8 gene_id:11283|Hs108|chr19 ( 520) 426 104.4 3.3e-22
CCDS42517.1 CYP4F12 gene_id:66002|Hs108|chr19 ( 524) 410 100.9 3.9e-21
CCDS544.1 CYP4X1 gene_id:260293|Hs108|chr1 ( 509) 408 100.4 5.3e-21
CCDS12336.1 CYP4F2 gene_id:8529|Hs108|chr19 ( 520) 404 99.5 9.9e-21
CCDS59362.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 397 98.0 2.9e-20
CCDS12332.1 CYP4F3 gene_id:4051|Hs108|chr19 ( 520) 397 98.0 2.9e-20
CCDS12337.1 CYP4F11 gene_id:57834|Hs108|chr19 ( 524) 396 97.7 3.5e-20
CCDS12331.1 CYP4F22 gene_id:126410|Hs108|chr19 ( 531) 390 96.4 8.8e-20
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 379 93.9 4.6e-19
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 379 93.9 4.7e-19
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 379 93.9 4.7e-19
CCDS8954.1 CYP27B1 gene_id:1594|Hs108|chr12 ( 508) 377 93.5 6.4e-19
CCDS545.1 CYP4Z1 gene_id:199974|Hs108|chr1 ( 505) 369 91.7 2.2e-18
CCDS543.1 CYP4A11 gene_id:1579|Hs108|chr1 ( 519) 369 91.7 2.2e-18
CCDS30707.1 CYP4A22 gene_id:284541|Hs108|chr1 ( 519) 353 88.1 2.7e-17
CCDS613.1 CYP2J2 gene_id:1573|Hs108|chr1 ( 502) 334 83.9 4.9e-16
CCDS2423.1 CYP27A1 gene_id:1593|Hs108|chr2 ( 531) 333 83.7 6e-16
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 331 83.1 6.1e-16
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 332 83.4 6.7e-16
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 324 81.6 2.4e-15
CCDS32293.1 CYP1A2 gene_id:1544|Hs108|chr15 ( 516) 319 80.5 5.2e-15
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 311 78.7 1.9e-14
CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 ( 490) 291 74.3 3.8e-13
CCDS6392.1 CYP11B1 gene_id:1584|Hs108|chr8 ( 503) 291 74.3 3.9e-13
CCDS6393.1 CYP11B2 gene_id:1585|Hs108|chr8 ( 503) 287 73.4 7.2e-13
CCDS7541.1 CYP17A1 gene_id:1586|Hs108|chr10 ( 508) 282 72.2 1.6e-12
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 280 71.8 2.1e-12
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 280 71.8 2.1e-12
CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 ( 490) 278 71.3 2.8e-12
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 275 70.7 4.5e-12
CCDS55123.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 404) 273 70.2 5.2e-12
CCDS5623.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 509) 273 70.2 6.4e-12
CCDS45303.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 363) 271 69.7 6.5e-12
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 271 69.8 7.8e-12
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 271 69.8 8.5e-12
CCDS32291.1 CYP11A1 gene_id:1583|Hs108|chr15 ( 521) 271 69.8 8.8e-12
CCDS1793.1 CYP1B1 gene_id:1545|Hs108|chr2 ( 543) 270 69.6 1.1e-11
>>CCDS5855.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 (534 aa)
initn: 3607 init1: 3607 opt: 3607 Z-score: 4354.3 bits: 815.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3607; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLVENFSNFTNRMASGLEFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLVENFSNFTNRMASGLEFKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ARILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ARILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGPRSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGPRSC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE1 LGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
490 500 510 520 530
>>CCDS55175.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 (466 aa)
initn: 3158 init1: 3158 opt: 3158 Z-score: 3812.8 bits: 715.0 E(32554): 4.7e-206
Smith-Waterman score: 3158; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (69-534:1-466)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 RLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFFRQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIK
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 QVLVENFSNFTNRMASGLEFKSVADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QVLVENFSNFTNRMASGLEFKSVADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQ
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 ACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFF
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 EFCIPRPILVLLLSFPSIMVPLARILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EFCIPRPILVLLLSFPSIMVPLARILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 FLQMVLDARHSASPMGVQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLQMVLDARHSASPMGVQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFI
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 FLIAGYEIITNTLSFATYLLATNPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLIAGYEIITNTLSFATYLLATNPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVI
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 AETLRMYPPAFRFTREAAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AETLRMYPPAFRFTREAAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFT
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 AEARQQHRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEARQQHRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESK
400 410 420 430 440 450
520 530
pF1KE1 SALGPKNGVYIKIVSR
::::::::::::::::
CCDS55 SALGPKNGVYIKIVSR
460
>>CCDS5856.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 (460 aa)
initn: 3114 init1: 3088 opt: 3088 Z-score: 3728.4 bits: 699.4 E(32554): 2.4e-201
Smith-Waterman score: 3088; 99.8% identity (100.0% similar) in 457 aa overlap (1-457:1-457)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLVENFSNFTNRMASGLEFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLVENFSNFTNRMASGLEFKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ARILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ARILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGPRSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 VLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERYRCS
430 440 450 460
490 500 510 520 530
pF1KE1 LGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
>>CCDS55174.1 TBXAS1 gene_id:6916|Hs108|chr7 (580 aa)
initn: 2612 init1: 2612 opt: 2612 Z-score: 3151.9 bits: 593.0 E(32554): 3e-169
Smith-Waterman score: 3417; 91.9% identity (91.9% similar) in 566 aa overlap (15-534:15-580)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLVENFSNFTNRMASGLEFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLVENFSNFTNRMASGLEFKS
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KE1 VADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNE-----------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNELGLLIMQERIKGHMGGQQAPQRIPPTRLS
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KE1 -----------------MVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQRCYCNYTTDVVASV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KPSGIYVNLHYATLPFCMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDIQRCYCNYTTDVVASV
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 AFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPLARILPNKNRDELNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVPLARILPNKNRDELNG
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 FFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDIVRDVFSSTGCKPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQDFDIVRDVFSSTGCKPNP
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 SRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLATNPDCQEKLLREVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYLLATNPDCQEKLLREVDV
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 FKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCEVLGQRIPAGAVLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQDCEVLGQRIPAGAVLEM
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 AVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTL
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530
pF1KE1 LHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
550 560 570 580
>>CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 (503 aa)
initn: 1078 init1: 477 opt: 627 Z-score: 755.2 bits: 149.4 E(32554): 9.6e-36
Smith-Waterman score: 1105; 36.0% identity (66.9% similar) in 522 aa overlap (16-534:9-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
: : : .. :.:: :.: . . ..:::. : : ::.::. .
CCDS56 MALIPDLAMETWLLLAVSLVLLYLYGTHSHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNILSY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLV-ENFSNFTNRMASG-LEF
..:: .:: .: :: . :.: :.. ..:..::::: ::: : .: :::: : . :
CCDS56 HKGFCMFDMECHKKYGKVWGFYDGQQPVLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFGPVGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KSVADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFD
. : :. .:..:...:. : .:. ::.::::.:.: :.:. .:.: ::.:
CCDS56 MKSAISI--AEDEEWKRLRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IQRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMV
.. . :. ::..:..::. .:: . :.::::.. :....: . :... . :: ...
CCDS56 LKDVFGAYSMDVITSTSFGVNIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFDFLDPFFLSITVFP-FLI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PLARILPNKNRD-ELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMGVQD
:. ..: :...:. : .. . : . ....: ::::...:...:
CCDS56 PILEVLNICVFPREVTNFLRKSVKRMKESR-LEDTQKHRVDFLQLMIDSQNS--------
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFATYL
. ...: . :. :.:.:..::..:::: ...::: :
CCDS56 ---------------KETESH------KALSDLELVAQSIIFIFAGYETTSSVLSFIMYE
290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LATNPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTREAAQ
:::.:: :.:: .:.:. .. : . .. . . :::::. ::::..: :.:. : .
CCDS56 LATHPDVQQKLQEEIDAVLPNKAPPTYDTVLQ-MEYLDMVVNETLRLFPIAMRLERVCKK
330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 DCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFGAGP
: :. :. :: :.:. . :::.::..: :: : ::::. . ... :. : :::.::
CCDS56 DVEINGMFIPKGVVVMIPSYALHRDPKYWTEPEKFLPERFSKKNKDNIDPYIYTPFGSGP
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 RSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
:.:.:.:..:...::.:..::..: :. : :::.::.: . : :.. : .:. ::
CCDS56 RNCIGMRFALMNMKLALIRVLQNFSFKPCKETQIPLKLSLGGLLQPEKPVVLKVESRDGT
440 450 460 470 480 490
CCDS56 VSGA
500
>>CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 (503 aa)
initn: 1061 init1: 463 opt: 612 Z-score: 737.1 bits: 146.0 E(32554): 9.8e-35
Smith-Waterman score: 1080; 35.2% identity (66.5% similar) in 520 aa overlap (21-534:15-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
:.:.:. :: :.: . . ..:::. : : ::.:: :
CCDS56 MDLIPNLAVETWLLLAVSLI-LLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLV-ENFSNFTNRMASGLEFK
:.:.: .:: : : . : : .. ...:..::::: ::: : .: :::: :
CCDS56 RKGYWTFDMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFG-PVG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SVADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDI
. ... . .:..:...:. : .:. ::.::::.:.: :.:. .:.: ::.: .
CCDS56 FMKNAISIAEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVP
.. . :. ::..:..::. .:: . :.::::.. :....: :... . :: ...:
CCDS56 KHVFGAYSMDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFP-FLTP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LAR-----ILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMG
. . ..: : . .:..: .... : ... ...: ::::...:...:
CCDS56 ILEALNITVFPRK----VISFLTKSVKQIKEGRLKET-QKHRVDFLQLMIDSQNS-----
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFA
.: :. : . :. :...:..::..:::: ...:::
CCDS56 -------KD-----------SETH------KALSDLELMAQSIIFIFAGYETTSSVLSFI
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 TYLLATNPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTRE
: :::.:: :.:. .:.:. .. : . .. . : :::::. ::::..: :.:. :
CCDS56 IYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQ-LEYLDMVVNETLRLFPVAMRLERV
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 AAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFG
.: :. :. :: :.:. . .:::::..: :: : ::::. . ... :. : :::
CCDS56 CKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFSKKNKDNIDPYIYTPFG
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 AGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
.:::.:.:.:..:...::.:..::..: :. : :::.::.:. . : .. . .: ::
CCDS56 SGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFGGLLLTEKPIVLKAESR
440 450 460 470 480 490
CCDS56 DETVSGA
500
>>CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 (535 aa)
initn: 1025 init1: 463 opt: 612 Z-score: 736.7 bits: 146.0 E(32554): 1e-34
Smith-Waterman score: 1080; 35.2% identity (66.5% similar) in 520 aa overlap (21-534:15-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
:.:.:. :: :.: . . ..:::. : : ::.:: :
CCDS75 MDLIPNLAVETWLLLAVSLI-LLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTPLPFLGNALSF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLV-ENFSNFTNRMASGLEFK
:.:.: .:: : : . : : .. ...:..::::: ::: : .: :::: :
CCDS75 RKGYWTFDMECYKKYRKVWGIYDCQQPMLAITDPDMIKTVLVKECYSVFTNRRPFG-PVG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SVADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFDI
. ... . .:..:...:. : .:. ::.::::.:.: :.:. .:.: ::.: .
CCDS75 FMKNAISIAEDEEWKRIRSLLSPTFTSGKLKEMVPIIAQYGDVLVRNLRREAETGKPVTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMVP
.. . :. ::..:..::. .:: . :.::::.. :....: :... . :: ...:
CCDS75 KHVFGAYSMDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPLDPFVLSIKVFP-FLTP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LAR-----ILPNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPMG
. . ..: : . .:..: .... : ... ...: ::::...:...:
CCDS75 ILEALNITVFPRK----VISFLTKSVKQIKEGRLKET-QKHRVDFLQLMIDSQNS-----
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSFA
.: :. : . :. :...:..::..:::: ...:::
CCDS75 -------KD-----------SETH------KALSDLELMAQSIIFIFAGYETTSSVLSFI
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 TYLLATNPDCQEKLLREVDVFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFTRE
: :::.:: :.:. .:.:. .. : . .. . : :::::. ::::..: :.:. :
CCDS75 IYELATHPDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQ-LEYLDMVVNETLRLFPVAMRLERV
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 AAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLPFG
.: :. :. :: :.:. . .:::::..: :: : ::::. . ... :. : :::
CCDS75 CKKDVEINGMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFSKKNKDNIDPYIYTPFG
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 AGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIVSR
.:::.:.:.:..:...::.:..::..: :. : :::.::.:. . : .. . .: ::
CCDS75 SGPRNCIGMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFGGLLLTEKPIVLKAESR
440 450 460 470 480 490
CCDS75 DETFVDMEPIHMDFLRSLAFQGPHLCFFWELLCPTIRSR
500 510 520 530
>>CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (393 aa)
initn: 629 init1: 436 opt: 576 Z-score: 695.2 bits: 137.9 E(32554): 2.1e-32
Smith-Waterman score: 576; 39.4% identity (70.6% similar) in 218 aa overlap (315-531:168-383)
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 DARHSASPMGVQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGY
:.. . . . :. :.:.:..:...:.:
CCDS64 FLKNSIERMKESRLKDKQKHRVDFFQQMIDSQNSKETKSHKALSDLELVAQSIIIIFAAY
140 150 160 170 180 190
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 EIITNTLSFATYLLATNPDCQEKLLREVD-VFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLR
. ..:: : : :::.:: :.:: .:.: :. .: :: . . :::::. ::::
CCDS64 DTTSTTLPFIMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNK--APVTYDALVQMEYLDMVVNETLR
200 210 220 230 240 250
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 MYPPAFRFTREAAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQ
..: . : :: .: :. : :: : .. . . ::::::..: :: : ::::. . ..
CCDS64 LFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERFSKKNKD
260 270 280 290 300 310
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 QHRPFTYLPFGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGP
. . :.:::::::.:.:.:..: ..::.....:..: :. : :::.::.:.. : :
CCDS64 SIDLYRYIPFGAGPRNCIGMRFALTNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNLPILQP
320 330 340 350 360 370
530
pF1KE1 KNGVYIKIVSR
.. . .:.
CCDS64 EKPIVLKVHLRDGITSGP
380 390
>>CCDS5677.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (420 aa)
initn: 786 init1: 453 opt: 531 Z-score: 640.4 bits: 127.9 E(32554): 2.4e-29
Smith-Waterman score: 808; 34.5% identity (63.7% similar) in 452 aa overlap (13-456:6-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
: : : .: .. :.:: :.: . . ..:::. : : ::.:.. :.
CCDS56 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLV-ENFSNFTNRMASG-LEF
.:.:. . : . :: . : : :.. ..:: .::::: ::: : .: :::.: : . :
CCDS56 LRGLWNFDRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KSVADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFD
. : : : .:..:...: : ::. :..::::.::: :.:. :.. ::.. ...
CCDS56 LKSALS--FAEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IQRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMV
.. . :: ::.... ::. .:: . :.:::.:. :..... . :.:.:. :: ...
CCDS56 LKDFFGAYTMDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLDPFLLLISLFP-FLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PLARIL-----PNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPM
:. . : :. :.. .... .. :.:.: ..: ::.:...:...:
CCDS56 PVFEALNIGLFPKDVTHFLKNSIERMKES--RLKDKQ---KHRVDFFQQMIDSQNS----
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GVQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSF
. ...: . :. :.:.:..:...:.:. ..:: :
CCDS56 -------------------KETKSH------KALSDLELVAQSIIIIFAAYDTTSTTLPF
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ATYLLATNPDCQEKLLREVD-VFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFT
: :::.:: :.:: .:.: :. .: :: . . :::::. ::::..: . : :
CCDS56 IMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNK--APVTYDALVQMEYLDMVVNETLRLFPVVSRVT
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 REAAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLP
: .: :. : :: : .. . . ::::::..: :: : :::
CCDS56 RVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERSH
380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIV
>>CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (503 aa)
initn: 997 init1: 457 opt: 531 Z-score: 639.2 bits: 127.9 E(32554): 2.8e-29
Smith-Waterman score: 1037; 34.9% identity (65.8% similar) in 527 aa overlap (13-531:6-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMEALGFLKLEVNGPMVTVALSVALLALLKWYSTSAFSRLEKLGLRHPKPSPFIGNLTFF
: : : .: .. :.:: :.: . . ..:::. : : ::.:.. :.
CCDS56 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTPLPFLGTILFY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 RQGFWESQMELRKLYGPLCGYYLGRRMFIVISEPDMIKQVLV-ENFSNFTNRMASG-LEF
.:.:. . : . :: . : : :.. ..:: .::::: ::: : .: :::.: : . :
CCDS56 LRGLWNFDRECNEKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECYSVFTNQMPLGPMGF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KSVADSVLFLRDKRWEEVRGALMSAFSPEKLNEMVPLISQACDLLLAHLKRYAESGDAFD
. : : : .:..:...: : ::. :..::::.::: :.:. :.. ::.. ...
CCDS56 LKSALS--FAEDEEWKRIRTLLSPAFTSVKFKEMVPIISQCGDMLVRSLRQEAENSKSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IQRCYCNYTTDVVASVAFGTPVDSWQAPEDPFVKHCKRFFEFCIPRPILVLLLSFPSIMV
.. . :: ::.... ::. .:: . :.:::.:. :..... . :.:.:. :: ...
CCDS56 LKDFFGAYTMDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLDPFLLLISLFP-FLT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PLARIL-----PNKNRDELNGFFNKLIRNVIALRDQQAAEERRRDFLQMVLDARHSASPM
:. . : :. :.. .... .. :.:.: ..: ::.:...:...:
CCDS56 PVFEALNIGLFPKDVTHFLKNSIERMKES--RLKDKQ---KHRVDFFQQMIDSQNS----
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GVQDFDIVRDVFSSTGCKPNPSRQHQPSPMARPLTVDEIVGQAFIFLIAGYEIITNTLSF
. ...: . :. :.:.:..:...:.:. ..:: :
CCDS56 -------------------KETKSH------KALSDLELVAQSIIIIFAAYDTTSTTLPF
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ATYLLATNPDCQEKLLREVD-VFKEKHMAPEFCSLEEGLPYLDMVIAETLRMYPPAFRFT
: :::.:: :.:: .:.: :. .: :: . . :::::. ::::..: . : :
CCDS56 IMYELATHPDVQQKLQEEIDAVLPNK--APVTYDALVQMEYLDMVVNETLRLFPVVSRVT
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 REAAQDCEVLGQRIPAGAVLEMAVGALHHDPEHWPSPETFNPERFTAEARQQHRPFTYLP
: .: :. : :: : .. . . ::::::..: :: : ::::. . ... . :.:
CCDS56 RVCKKDIEINGVFIPKGLAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPERFSKKNKDSIDLYRYIP
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 FGAGPRSCLGVRLGLLEVKLTLLHVLHKFRFQACPETQVPLQLESKSALGPKNGVYIKIV
::::::.:.:.:..: ..::.....:..: :. : :::.::.:.. : :.. . .:.
CCDS56 FGAGPRNCIGMRFALTNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNLPILQPEKPIVLKVH
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 SR
CCDS56 LRDGITSGP
500
534 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 16:15:01 2016 done: Sun Nov 6 16:15:02 2016
Total Scan time: 3.310 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]