Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1961
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1961, 524 aa
1>>>pF1KE1961 524 - 524 aa - 524 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8687+/-0.000419; mu= 15.8788+/- 0.026
mean_var=84.6634+/-16.807, 0's: 0 Z-trim(111.5): 15 B-trim: 24 in 1/50
Lambda= 0.139388
statistics sampled from 20165 (20175) to 20165 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 9.210
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_620409 (OMIM: 182940,600145,610132) vang-like p ( 524) 3413 696.7 4.3e-200
NP_001165883 (OMIM: 182940,600145,610132) vang-lik ( 524) 3413 696.7 4.3e-200
NP_001165882 (OMIM: 182940,600145,610132) vang-lik ( 522) 3387 691.5 1.6e-198
NP_065068 (OMIM: 182940,600533) vang-like protein ( 521) 2544 522.0 1.7e-147
XP_011508106 (OMIM: 182940,600533) PREDICTED: vang ( 521) 2544 522.0 1.7e-147
XP_005245414 (OMIM: 182940,600533) PREDICTED: vang ( 521) 2544 522.0 1.7e-147
XP_011508107 (OMIM: 182940,600533) PREDICTED: vang ( 282) 1324 276.5 7.4e-74
>>NP_620409 (OMIM: 182940,600145,610132) vang-like prote (524 aa)
initn: 3413 init1: 3413 opt: 3413 Z-score: 3713.3 bits: 696.7 E(85289): 4.3e-200
Smith-Waterman score: 3413; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RAAKHMAGLKVYNVDGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 RAAKHMAGLKVYNVDGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRKAR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYHSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 LVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYHSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 ESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDGIV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE1 FVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_620 FVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
490 500 510 520
>>NP_001165883 (OMIM: 182940,600145,610132) vang-like pr (524 aa)
initn: 3413 init1: 3413 opt: 3413 Z-score: 3713.3 bits: 696.7 E(85289): 4.3e-200
Smith-Waterman score: 3413; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RAAKHMAGLKVYNVDGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAAKHMAGLKVYNVDGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRKAR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYHSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYHSM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDGIV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE1 FVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
490 500 510 520
>>NP_001165882 (OMIM: 182940,600145,610132) vang-like pr (522 aa)
initn: 2964 init1: 2964 opt: 3387 Z-score: 3685.1 bits: 691.5 E(85289): 1.6e-198
Smith-Waterman score: 3387; 99.6% identity (99.6% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STRTEE--DDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RAAKHMAGLKVYNVDGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAAKHMAGLKVYNVDGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRKAR
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 LVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYHSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYHSM
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDGIV
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KE1 FVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
480 490 500 510 520
>>NP_065068 (OMIM: 182940,600533) vang-like protein 2 [H (521 aa)
initn: 1741 init1: 1271 opt: 2544 Z-score: 2768.9 bits: 522.0 E(85289): 1.7e-147
Smith-Waterman score: 2544; 72.8% identity (90.7% similar) in 526 aa overlap (1-524:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
::::: :::::: :.::..:... .: :.::.: ::: .:::::: : ::::: :.
NP_065 MDTESQYSGYSYKSGHSRSSRKHRDR-RDRHRSKSRDGGRG-DKSVTIQAP-GEPLLDNE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
::: .: .:::::::::..:::::::::..:..::.::::::: :::.:.::..... :.
NP_065 STRGDE-RDDNWGETTTVVTGTSEHSISHDDLTRIAKDMEDSVPLDCSRHLGVAAGATLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
:: ::::.::.::::.:::.::::::: :::::::.::::::::.:.::::::. .:..:
NP_065 LLSFLTPLAFLLLPPLLWREELEPCGTACEGLFISVAFKLLILLLGSWALFFRRPKASLP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
::::.::::.::.::.::::::::::::::.:.:.:::.::.::::::::::.::::.::
NP_065 RVFVLRALLMVLVFLLVVSYWLFYGVRILDARERSYQGVVQFAVSLVDALLFVHYLAVVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
::::::::.:::.::::::: ::::..:::::::.:. .::.::.:: .::: ::. :
NP_065 LELRQLQPQFTLKVVRSTDGASRFYNVGHLSIQRVAVWILEKYYHDFPVYNPALLNLPKS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE1 RAAKHMAGLKVYNV--DGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRK
::...:.:::.. .. .::.::::::.:::::::::.:::: :::::::::::.::.
NP_065 VLAKKVSGFKVYSLGEENSTNNSTGQSRAVIAAAARRRDNSHNEYYYEEAEHERRVRKRR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ARLVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYH
::::::::::: ::.::: ::.:: : ::::::::::::: :::::.::::: :.:: ::
NP_065 ARLVVAVEEAFTHIKRLQ-EEEQKNPREVMDPREAAQAIFASMARAMQKYLRTTKQQPYH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 SMESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDG
.:::::::: ::::. :::::::::::.::::.:: :.:::. :: :::.: :::::.::
NP_065 TMESILQHLEFCITHDMTPKAFLERYLAAGPTIQYHKERWLAKQWTLVSEEPVTNGLKDG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE1 IVFVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
:::.:: ::::::..::.::. :::::.::::::::.::::::::
NP_065 IVFLLKRQDFSLVVSTKKVPFFKLSEEFVDPKSHKFVMRLQSETSV
480 490 500 510 520
>>XP_011508106 (OMIM: 182940,600533) PREDICTED: vang-lik (521 aa)
initn: 1741 init1: 1271 opt: 2544 Z-score: 2768.9 bits: 522.0 E(85289): 1.7e-147
Smith-Waterman score: 2544; 72.8% identity (90.7% similar) in 526 aa overlap (1-524:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
::::: :::::: :.::..:... .: :.::.: ::: .:::::: : ::::: :.
XP_011 MDTESQYSGYSYKSGHSRSSRKHRDR-RDRHRSKSRDGGRG-DKSVTIQAP-GEPLLDNE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
::: .: .:::::::::..:::::::::..:..::.::::::: :::.:.::..... :.
XP_011 STRGDE-RDDNWGETTTVVTGTSEHSISHDDLTRIAKDMEDSVPLDCSRHLGVAAGATLA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LLVFLTPIAFILLPPILWRDELEPCGTICEGLFISMAFKLLILLIGTWALFFRKRRADMP
:: ::::.::.::::.:::.::::::: :::::::.::::::::.:.::::::. .:..:
XP_011 LLSFLTPLAFLLLPPLLWREELEPCGTACEGLFISVAFKLLILLLGSWALFFRRPKASLP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RVFVFRALLLVLIFLFVVSYWLFYGVRILDSRDRNYQGIVQYAVSLVDALLFIHYLAIVL
::::.::::.::.::.::::::::::::::.:.:.:::.::.::::::::::.::::.::
XP_011 RVFVLRALLMVLVFLLVVSYWLFYGVRILDARERSYQGVVQFAVSLVDALLFVHYLAVVL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LELRQLQPMFTLQVVRSTDGESRFYSLGHLSIQRAALVVLENYYKDFTIYNPNLLTASKF
::::::::.:::.::::::: ::::..:::::::.:. .::.::.:: .::: ::. :
XP_011 LELRQLQPQFTLKVVRSTDGASRFYNVGHLSIQRVAVWILEKYYHDFPVYNPALLNLPKS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE1 RAAKHMAGLKVYNV--DGPSNNATGQSRAMIAAAARRRDSSHNELYYEEAEHERRVKKRK
::...:.:::.. .. .::.::::::.:::::::::.:::: :::::::::::.::.
XP_011 VLAKKVSGFKVYSLGEENSTNNSTGQSRAVIAAAARRRDNSHNEYYYEEAEHERRVRKRR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ARLVVAVEEAFIHIQRLQAEEQQKAPGEVMDPREAAQAIFPSMARALQKYLRITRQQNYH
::::::::::: ::.::: ::.:: : ::::::::::::: :::::.::::: :.:: ::
XP_011 ARLVVAVEEAFTHIKRLQ-EEEQKNPREVMDPREAAQAIFASMARAMQKYLRTTKQQPYH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 SMESILQHLAFCITNGMTPKAFLERYLSAGPTLQYDKDRWLSTQWRLVSDEAVTNGLRDG
.:::::::: ::::. :::::::::::.::::.:: :.:::. :: :::.: :::::.::
XP_011 TMESILQHLEFCITHDMTPKAFLERYLAAGPTIQYHKERWLAKQWTLVSEEPVTNGLKDG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE1 IVFVLKCLDFSLVVNVKKIPFIILSEEFIDPKSHKFVLRLQSETSV
:::.:: ::::::..::.::. :::::.::::::::.::::::::
XP_011 IVFLLKRQDFSLVVSTKKVPFFKLSEEFVDPKSHKFVMRLQSETSV
480 490 500 510 520
>>XP_005245414 (OMIM: 182940,600533) PREDICTED: vang-lik (521 aa)
initn: 1741 init1: 1271 opt: 2544 Z-score: 2768.9 bits: 522.0 E(85289): 1.7e-147
Smith-Waterman score: 2544; 72.8% identity (90.7% similar) in 526 aa overlap (1-524:1-521)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MDTESTYSGYSYYSSHSKKSHRQGERTRERHKSPRNKDGRGSEKSVTIQPPTGEPLLGND
::::: :::::: :.::..:... .: :.::.: ::: .:::::: : ::::: :.
XP_005 MDTESQYSGYSYKSGHSRSSRKHRDR-RDRHRSKSRDGGRG-DKSVTIQAP-GEPLLDNE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 STRTEEVQDDNWGETTTAITGTSEHSISQEDIARISKDMEDSVGLDCKRYLGLTVASFLG
::: .: .:::::::::..:::::::::..:..::.::::::: :::.:.::..... :.
XP_005 STRGDE-RDDNWGETTTVVTGTSEHSISHDDLTRIAKDMEDSVPLDCSRHLGVAAGATLA
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::::: :::::: :.::..:... .: :.::.: ::: .:::::: : ::::: :.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]