Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1959
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1959, 516 aa
1>>>pF1KE1959 516 - 516 aa - 516 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9254+/-0.000379; mu= 14.7974+/- 0.023
mean_var=79.1236+/-15.766, 0's: 0 Z-trim(113.6): 169 B-trim: 21 in 1/49
Lambda= 0.144185
statistics sampled from 22842 (23016) to 22842 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 8.700
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000752 (OMIM: 124060) cytochrome P450 1A2 [Homo ( 516) 3473 732.4 7.6e-211
NP_000490 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isofo ( 512) 2549 540.2 5.5e-153
NP_001306146 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 is ( 512) 2549 540.2 5.5e-153
NP_001306145 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 is ( 483) 1890 403.1 9.6e-112
NP_000095 (OMIM: 231300,600975,601771,604229) cyto ( 543) 1224 264.6 5.4e-70
XP_016877442 (OMIM: 108330) PREDICTED: cytochrome ( 484) 1164 252.1 2.8e-66
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 882 193.4 1.4e-48
NP_000093 (OMIM: 202110,609300) steroid 17-alpha-h ( 508) 849 186.6 1.5e-46
XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 831 182.8 2e-45
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 831 182.8 2e-45
XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 831 182.8 2e-45
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 773 170.8 8.7e-42
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 763 168.7 4.1e-41
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 704 156.4 1.8e-37
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 694 154.3 7.7e-37
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 671 149.5 2.1e-35
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 651 145.4 3.4e-34
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 651 145.4 3.5e-34
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 648 144.7 5.3e-34
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 646 144.3 7.7e-34
NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 ( 446) 618 138.5 4e-32
XP_011528272 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 451) 618 138.5 4e-32
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 613 137.5 9e-32
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 612 137.3 1e-31
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 612 137.3 1e-31
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 612 137.3 1.2e-31
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 610 136.8 1.4e-31
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 610 136.8 1.4e-31
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 594 133.5 1.4e-30
NP_000491 (OMIM: 201910,613815) steroid 21-hydroxy ( 495) 591 132.9 2.1e-30
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 589 132.4 2.3e-30
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 589 132.4 2.3e-30
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 589 132.4 2.3e-30
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 589 132.4 2.3e-30
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 589 132.4 2.3e-30
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 589 132.4 2.3e-30
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 589 132.4 2.3e-30
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 582 131.0 7.8e-30
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 575 129.5 2e-29
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 575 129.6 2.1e-29
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 554 125.2 4.4e-28
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 550 124.3 6.9e-28
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 550 124.3 6.9e-28
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 548 123.9 8.6e-28
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 517 117.4 5.9e-26
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 504 114.8 5.4e-25
XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 504 114.8 6.1e-25
XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 504 114.8 6.1e-25
XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 504 114.8 6.8e-25
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 488 111.5 5.7e-24
>>NP_000752 (OMIM: 124060) cytochrome P450 1A2 [Homo sap (516 aa)
initn: 3473 init1: 3473 opt: 3473 Z-score: 3906.3 bits: 732.4 E(85289): 7.6e-211
Smith-Waterman score: 3473; 100.0% identity (100.0% similar) in 516 aa overlap (1-516:1-516)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLLGHVLTLGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLLGHVLTLGKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLITDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLITDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQELM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQELM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASSGNPLDFFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASSGNPLDFFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFKHSKKGPRASGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFKHSKKGPRASGN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTVIGRERRPRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTVIGRERRPRLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVNQWQVNHDPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVNQWQVNHDPEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 WEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFLFLAILLQQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFLFLAILLQQLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE1 FSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
490 500 510
>>NP_000490 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isoform 1 (512 aa)
initn: 2549 init1: 1426 opt: 2549 Z-score: 2867.6 bits: 540.2 E(85289): 5.5e-153
Smith-Waterman score: 2549; 73.2% identity (90.7% similar) in 508 aa overlap (7-512:5-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLLGHVLTLGKN
. .::::.::::.::::::::... ::.::::::.:: ::::::.::.::::::
NP_000 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLIGHMLTLGKN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLITDG
::::::::::.::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::: :::..:
NP_000 PHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTFTLISNG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQELM
::..:: :::::::::::::::.:..::::::::::.::::::::::::..::: :::::
NP_000 QSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEVLISTLQELM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASSGNPLDFFP
::::::.:: :::::.::: :.:::... .. .:.::::. ...: :...:::: ::.:
NP_000 AGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNHQELLSLVNLNNNFGEVVGSGNPADFIP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 ILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFKHSK-KGPRASG
::::::::.:. :: .:..: :.:: :.:::. :.:. .:::: .:..: . : ..
NP_000 ILRYLPNPSLNAFKDLNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHIRDITDSLIEHCQEKQLDENA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NL-IPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTVIGRERRPR
:. . .:::.:.: :.:::::::::::::::::::: .:..:::::.:::::::: ::::
NP_000 NVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKIQEELDTVIGRSRRPR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVNQWQVNHDP
:::: .:::.:::::::::::::.::::::::::::.:.:::::: ::::::::.:::
NP_000 LSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHSTTRDTSLKGFYIPKGRCVFVNQWQINHDQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFLFLAILLQQ
.:: .:::: :::::: :: ::.: ::::...::::::.::::..:.::.:::::::::.
NP_000 KLWVNPSEFLPERFLTPDG-AIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIARWEVFLFLAILLQR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE1 LEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
.::::: :::::.::::::::::: ::: : .::
NP_000 VEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
480 490 500 510
>>NP_001306146 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isofor (512 aa)
initn: 2549 init1: 1426 opt: 2549 Z-score: 2867.6 bits: 540.2 E(85289): 5.5e-153
Smith-Waterman score: 2549; 73.2% identity (90.7% similar) in 508 aa overlap (7-512:5-511)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLLGHVLTLGKN
. .::::.::::.::::::::... ::.::::::.:: ::::::.::.::::::
NP_001 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLIGHMLTLGKN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLITDG
::::::::::.::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::: :::..:
NP_001 PHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTFTLISNG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQELM
::..:: :::::::::::::::.:..::::::::::.::::::::::::..::: :::::
NP_001 QSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEVLISTLQELM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASSGNPLDFFP
::::::.:: :::::.::: :.:::... .. .:.::::. ...: :...:::: ::.:
NP_001 AGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNHQELLSLVNLNNNFGEVVGSGNPADFIP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 ILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFKHSK-KGPRASG
::::::::.:. :: .:..: :.:: :.:::. :.:. .:::: .:..: . : ..
NP_001 ILRYLPNPSLNAFKDLNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHIRDITDSLIEHCQEKQLDENA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NL-IPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTVIGRERRPR
:. . .:::.:.: :.:::::::::::::::::::: .:..:::::.:::::::: ::::
NP_001 NVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKIQEELDTVIGRSRRPR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVNQWQVNHDP
:::: .:::.:::::::::::::.::::::::::::.:.:::::: ::::::::.:::
NP_001 LSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHSTTRDTSLKGFYIPKGRCVFVNQWQINHDQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFLFLAILLQQ
.:: .:::: :::::: :: ::.: ::::...::::::.::::..:.::.:::::::::.
NP_001 KLWVNPSEFLPERFLTPDG-AIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIARWEVFLFLAILLQR
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KE1 LEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
.::::: :::::.::::::::::: ::: : .::
NP_001 VEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
480 490 500 510
>>NP_001306145 (OMIM: 108330) cytochrome P450 1A1 isofor (483 aa)
initn: 2359 init1: 1426 opt: 1890 Z-score: 2127.2 bits: 403.1 E(85289): 9.6e-112
Smith-Waterman score: 2304; 68.5% identity (85.4% similar) in 508 aa overlap (7-512:5-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLLGHVLTLGKN
. .::::.::::.::::::::... ::.::::::.:: ::::::.::.::::::
NP_001 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLIGHMLTLGKN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLITDG
::::::::::.::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::: :::..:
NP_001 PHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTFTLISNG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQELM
::..:: :::::::::::::::.:..::::::::::.::::::::::::..::: :::::
NP_001 QSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEVLISTLQELM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASSGNPLDFFP
::::::.:: :::::.::: :.:::... .. .:.::::. ...: :...:::: ::.:
NP_001 AGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNHQELLSLVNLNNNFGEVVGSGNPADFIP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE1 ILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFKHSK-KGPRASG
::::::::.:. :: .:..: :.:: :.:::. :.:. .:::: .:..: . : ..
NP_001 ILRYLPNPSLNAFKDLNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHIRDITDSLIEHCQEKQLDENA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NL-IPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTVIGRERRPR
:. . .:::.:.: :.:::::::::::::::::::: .:..:::::.:::::::: ::::
NP_001 NVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKIQEELDTVIGRSRRPR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVNQWQVNHDP
:::: .:::.:::::::::::::.::::::
NP_001 LSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHR-----------------------------
360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFLFLAILLQQ
.:: .:::: :::::: :: ::.: ::::...::::::.::::..:.::.:::::::::.
NP_001 KLWVNPSEFLPERFLTPDG-AIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIARWEVFLFLAILLQR
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510
pF1KE1 LEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
.::::: :::::.::::::::::: ::: : .::
NP_001 VEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
450 460 470 480
>>NP_000095 (OMIM: 231300,600975,601771,604229) cytochro (543 aa)
initn: 1168 init1: 497 opt: 1224 Z-score: 1377.7 bits: 264.6 E(85289): 5.4e-70
Smith-Waterman score: 1224; 38.6% identity (69.9% similar) in 518 aa overlap (8-515:15-526)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MALSQSVPFSA--TELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLL
:.: : ::: ... : . :: : . ..:: :..:::.
NP_000 MGTSLSPNDPWPLNPLSIQQTTLLLLLSVLATVHVGQRLLRQRRRQLRSAPPGPFAWPLI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GHVLTLGKNPHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDL
:.. ..:. ::...:...:::::.:::.:: :..::. .:.::::.::. : :: .
NP_000 GNAAAVGQAAHLSFARLARRYGDVFQIRLGSCPIVVLNGERAIHQALVQQGSAFADRPAF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 YTSTLITDGQSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKA
. ... :.:..:. : : ..:: :.. . .: .. .: : . :: :: .::.
NP_000 ASFRVVSGGRSMAFGHYS-EHWKVQRRAAHSMMRNF-FTRQPRSRQ--VLEGHVLSEARE
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LISRLQELMAGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETAS
:.. : . : . .:: .::.::::..:.::: .. ... :. :.....:: .:..
NP_000 LVALLVRGSADGAFLDPRPLTVVAVANVMSAVCFGCRYSHDDPEFRELLSHNEEFGRTVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 SGNPLDFFPILRYLPNPALQRFKAF---NQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSV-RDITGAL
.:. .: .: :.:.:::. :. : :. : :. .: ... ... ::. :.
NP_000 AGSLVDVMPWLQYFPNPVRTVFREFEQLNRNFSNFILDKFLRHCESLRPGAAPRDMMDAF
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 FKHSKK----GPRASGNLIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKI
. ..: ...: . :.. ..:::::. ::..::..: :. .. :..: ..
NP_000 ILSAEKKAAGDSHGGGARLDLENVPATITDIFGASQDTLSTALQWLLLLFTRYPDVQTRV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 QKELDTVIGRERRPRLSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPK
: ::: :.::.: : ..:.:.:::. ::. :..: :::.: ::::.:: .:.. :..:::
NP_000 QAELDQVVGRDRLPCMGDQPNLPYVLAFLYEAMRFSSFVPVTIPHATTANTSVLGYHIPK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 KCCVFVNQWQVNHDPELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVL
::::::.::::: : .: .: : ::: :: ::: :. ..:.:..:::::::: :
NP_000 DTVVFVNQWSVNHDPLKWPNPENFDPARFLDKDGL-INKDLTSRVMIFSVGKRRCIGEEL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE1 AKWEIFLFLAILLQQLEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
.: ..:::..:: .: .: . :. . .. ::::.: . .:.. :: :.
NP_000 SKMQLFLFISILAHQCDFRANPNEPAKMNFSYGLTIK-PKSFKVNVTLRESMELLDSAVQ
480 490 500 510 520 530
NP_000 NLQAKETCQ
540
>>XP_016877442 (OMIM: 108330) PREDICTED: cytochrome P450 (484 aa)
initn: 2416 init1: 1162 opt: 1164 Z-score: 1311.0 bits: 252.1 E(85289): 2.8e-66
Smith-Waterman score: 2364; 69.9% identity (85.8% similar) in 508 aa overlap (7-512:5-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLLGHVLTLGKN
. .::::.::::.::::::::... ::.::::::.:: ::::::.::.::::::
XP_016 MLFPISMSATEFLLASVIFCLVFWVIRASRPQVPKGLKNPPGPWGWPLIGHMLTLGKN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLITDG
::::::::::.::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::: :::..:
XP_016 PHLALSRMSQQYGDVLQIRIGSTPVVVLSGLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTFTLISNG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQELM
::..:: :::::::::::::::.:..::::::::::.::::::::::::..::: :::::
XP_016 QSMSFSPDSGPVWAARRRLAQNGLKSFSIASDPASSTSCYLEEHVSKEAEVLISTLQELM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASSGNPLDFFP
::::::.:: :::::.::: :.:::... .. .:.::::.
XP_016 AGPGHFNPYRYVVVSVTNVICAICFGRRYDHNHQELLSLVN-------------------
180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KE1 ILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFKHSK-KGPRASG
:. :: .:..: :.:: :.:::. :.:. .:::: .:..: . : ..
XP_016 ---------LNAFKDLNEKFYSFMQKMVKEHYKTFEKGHIRDITDSLIEHCQEKQLDENA
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 NL-IPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTVIGRERRPR
:. . .:::.:.: :.:::::::::::::::::::: .:..:::::.:::::::: ::::
XP_016 NVQLSDEKIINIVLDLFGAGFDTVTTAISWSLMYLVMNPRVQRKIQEELDTVIGRSRRPR
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVNQWQVNHDP
:::: .:::.:::::::::::::.::::::::::::.:.:::::: ::::::::.:::
XP_016 LSDRSHLPYMEAFILETFRHSSFVPFTIPHSTTRDTSLKGFYIPKGRCVFVNQWQINHDQ
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFLFLAILLQQ
.:: .:::: :::::: :: ::.: ::::...::::::.::::..:.::.:::::::::.
XP_016 KLWVNPSEFLPERFLTPDG-AIDKVLSEKVIIFGMGKRKCIGETIARWEVFLFLAILLQR
400 410 420 430 440
480 490 500 510
pF1KE1 LEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
.::::: :::::.::::::::::: ::: : .::
XP_016 VEFSVPLGVKVDMTPIYGLTMKHACCEHFQMQLRS
450 460 470 480
>>NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U1 [H (544 aa)
initn: 767 init1: 407 opt: 882 Z-score: 993.2 bits: 193.4 E(85289): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 908; 31.2% identity (64.5% similar) in 513 aa overlap (15-499:37-532)
10 20 30 40
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPE
:: .. :. : . :: : .:. ::
NP_898 SQPPAEDPPWPARLLRAPLGLLRLDPSGGALLLCGLVALLGW--SWLRRRRARGI--PPG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KE1 PWGWPLLG---HVL----------------TLGKNP-----HLALSRMSQRYGDVLQIRI
: :::.: ::: . : .: .. :..... ::..... :
NP_898 PTPWPLVGNFGHVLLPPFLRRRSWLSSRTRAAGIDPSVIGPQVLLAHLARVYGSIFSFFI
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 GSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLITDGQSLTFSTDSGPVWAARRRLA
: :.::: . ..:.:::.:.. :. :: . ...: ....:. :::: .:...
NP_898 GHYLVVVLSDFHSVREALVQQAEVFSDRPRVPLISIVTKEKGVVFA-HYGPVWRQQRKFS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQELMAGPGHFDPYNQVVVSVANVI
...: :... . :: .. .: : . ...:. : : :.. . .:.:.:
NP_898 HSTLRHFGLG-------KLSLEPKIIEEFKYVKAEMQK--HGEDPFCPFSIISNAVSNII
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KE1 GAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASSGNPL--DFFPILRYLPNPALQRFKAFNQ
..::::.: ...:. ... . .: ... : .. : : ::: ..... ...
NP_898 CSLCFGQRFDYTNSEFKKMLGFMSRGLEICLNSQVLLVNICPWLYYLPFGPFKELRQIEK
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 RFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFKHSKKGPRASGNL-IPQEKIVNLVNDIFGA
. ::.: ...: ...:... .:. . : .. . ..: . .: . ...:.: :
NP_898 DITSFLKKIIKDHQESLDRENPQDFIDMYLLHMEEERKNNSNSSFDEEYLFYIIGDLFIA
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTVIGRERRPRLSDRPQLPYLEAFILETFR
: ::.:... : :.:. .:..:.:...:.. ::: .: : :.:. :.:: :: :.:. :
NP_898 GTDTTTNSLLWCLLYMSLNPDVQEKVHEEIERVIGANRAPSLTDKAQMPYTEATIMEVQR
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 HSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVNQWQVNHDPELWEDPSEFRPERFLTADG
. .:..::: :...:.:.:. ::: .. : :.:..:: .:: : .: :.::: .:
NP_898 LTVVVPLAIPHMTSENTVLQGYTIPKGTLILPNLWSVHRDPAIWEKPEDFYPNRFLDDQG
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 TAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFLFLAILLQQLEFSVPPGVKVDL-TPIYG
:.: : .. ::.::: :.:: ::: :.::... :.:.. :..: : : : .:
NP_898 QLIKK---ETFIPFGIGKRVCMGEQLAKMELFLMFVSLMQSFAFALPEDSKKPLLTGRFG
480 490 500 510 520
500 510
pF1KE1 LTMKHARCEHVQARLRFSIN
::.
NP_898 LTLAPHPFNITISRR
530 540
>>NP_000093 (OMIM: 202110,609300) steroid 17-alpha-hydro (508 aa)
initn: 759 init1: 402 opt: 849 Z-score: 956.5 bits: 186.6 E(85289): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 849; 30.3% identity (66.4% similar) in 482 aa overlap (14-484:7-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPKGLKSPPEPWGWPLLGHVLTLGKN
::: . . .:: . : : : : : . ::.: . : ..
NP_000 MWELVALLLLTLAY--LFWPKR----RCP-GAKYPKSLLSLPLVGSLPFLPRH
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE1 PHL--ALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLIT
:. . .....:: . ..:.:. ...... . ...:...: ::.:::.. : . .
NP_000 GHMHNNFFKLQKKYGPIYSVRMGTKTTVIVGHHQLAKEVLIKKGKDFSGRPQMATLDIAS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DGQSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRLQE
.... .::: : .:::: . ::.. .: .. ::. . .: :: : .
NP_000 NNRKGIAFADSGAHWQLHRRLA---MATFALFKDGDQK----LEKIICQE----ISTLCD
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LMAGP-GH-FDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHE-FVETASSGNP
..: :. .: : :.:.:::. .::. . ...: :....: .: .... :. .
NP_000 MLATHNGQSIDISFPVFVAVTNVISLICFNTSY-KNGDPELNVIQNYNEGIIDNLSKDSL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE1 LDFFPILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSVRDITGALFK------
.:. : :. .:: .:...:. . .:.: .... . : ..:. .. .:..
NP_000 VDLVPWLKIFPNKTLEKLKSHVKIRNDLLNKILENYKEKFRSDSITNMLDTLMQAKMNSD
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 HSKKGPRASGNLIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDT
... :: ...:. ...:.. ..:::::: .:.:....:.: .:. .:....:. .:.:
NP_000 NGNAGPDQDSELLSDNHILTTIGDIFGAGVETTTSVVKWTLAFLLHNPQVKKKLYEEIDQ
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VIGRERRPRLSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFV
.: : : .::: .: ::: : :..: :. :::... :.... : . : :..
NP_000 NVGFSRTPTISDRNRLLLLEATIREVLRLRPVAPMLIPHKANVDSSIGEFAVDKGTEVII
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 NQWQVNHDPELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIF
: : ..:. . :..:..: :::::. :: . .: : ... :: : : ::::.::. :.:
NP_000 NLWALHHNEKEWHQPDQFMPERFLNPAGTQLISP-SVSYLPFGAGPRSCIGEILARQELF
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KE1 LFLAILLQQLEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
:..: :::.... ::
NP_000 LIMAWLLQRFDLEVPDDGQLPSLEGIPKVVFLIDSFKVKIKVRQAWREAQAEGST
460 470 480 490 500
>>XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cytochro (491 aa)
initn: 604 init1: 358 opt: 831 Z-score: 936.5 bits: 182.8 E(85289): 2e-45
Smith-Waterman score: 831; 32.0% identity (65.9% similar) in 484 aa overlap (13-486:4-471)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPK-GLKSPPEPWGWPLLGHVLTLG-
: :. :.. .: .: : : . . . :: : : ::..: .
XP_011 MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KNPHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLIT
.: .... .:.:::...... :::.::. : ..:.::: .:.: :: . . ..
XP_011 QNTPYCFDQLRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DG--QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRL
: .. .: . ::.: .::.. ..: ...... ::. :..:: : . .
XP_011 FGPRSQGVFLARYGPAWREQRRFSVSTLRNLGLGKKS-------LEQWVTEEAACLCAAF
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QELMAGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASS--GN
. . : : : . . .:.:::... :..: .. ..: :. ..: .. :. .
XP_011 ANHSGRP--FRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLRE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PLDFFPILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSV-RDITGALF---KH
:. :.: ..: : . .. :.. :: :.. . :: . .: . ::.: :.. ..
XP_011 VLNAVPVLLHIPALAGKVLR-FQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SKKGPRASGNLIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTV
.: .:..: : .:.. .: :.:.::. :..:...:.:. .. .:..::..:.:.: :
XP_011 AKGNPESSFN---DENLRIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDV
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 IGRERRPRLSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVN
::. :::...:. ..:: : : :. : ....:. . : :.:: ..:: ::: ...:
XP_011 IGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 QWQVNHDPELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFL
.: .: .:: : .:.::.:: :.: . :: : .. :. :.: :.:: ::. :.::
XP_011 LSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGHFV-KP--EAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510
pF1KE1 FLAILLQQLEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
:.. :::.. :::: :
XP_011 FFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGVFAFLGCCCTDP
460 470 480 490
>>NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D6 is (497 aa)
initn: 604 init1: 358 opt: 831 Z-score: 936.4 bits: 182.8 E(85289): 2e-45
Smith-Waterman score: 831; 32.0% identity (65.9% similar) in 484 aa overlap (13-486:4-471)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MALSQSVPFSATELLLASAIFCLVFWVLKGLRPRVPK-GLKSPPEPWGWPLLGHVLTLG-
: :. :.. .: .: : : . . . :: : : ::..: .
NP_000 MGLEALVPLAVIVAIFLLLVDLMHRRQRWAARYPPGPLPLPGLGNLLHVDF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KNPHLALSRMSQRYGDVLQIRIGSTPVLVLSRLDTIRQALVRQGDDFKGRPDLYTSTLIT
.: .... .:.:::...... :::.::. : ..:.::: .:.: :: . . ..
NP_000 QNTPYCFDQLRRRFGDVFSLQLAWTPVVVLNGLAAVREALVTHGEDTADRPPVPITQILG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DG--QSLTFSTDSGPVWAARRRLAQNALNTFSIASDPASSSSCYLEEHVSKEAKALISRL
: .. .: . ::.: .::.. ..: ...... ::. :..:: : . .
NP_000 FGPRSQGVFLARYGPAWREQRRFSVSTLRNLGLGKKS-------LEQWVTEEAACLCAAF
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QELMAGPGHFDPYNQVVVSVANVIGAMCFGQHFPESSDEMLSLVKNTHEFVETASS--GN
. . : : : . . .:.:::... :..: .. ..: :. ..: .. :. .
NP_000 ANHSGRP--FRPNGLLDKAVSNVIASLTCGRRFEYDDPRFLRLLDLAQEGLKEESGFLRE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 PLDFFPILRYLPNPALQRFKAFNQRFLWFLQKTVQEHYQDFDKNSV-RDITGALF---KH
:. :.: ..: : . .. :.. :: :.. . :: . .: . ::.: :.. ..
NP_000 VLNAVPVLLHIPALAGKVLR-FQKAFLTQLDELLTEHRMTWDPAQPPRDLTEAFLAEMEK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 SKKGPRASGNLIPQEKIVNLVNDIFGAGFDTVTTAISWSLMYLVTKPEIQRKIQKELDTV
.: .:..: : .:.. .: :.:.::. :..:...:.:. .. .:..::..:.:.: :
NP_000 AKGNPESSFN---DENLRIVVADLFSAGMVTTSTTLAWGLLLMILHPDVQRRVQQEIDDV
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 IGRERRPRLSDRPQLPYLEAFILETFRHSSFLPFTIPHSTTRDTTLNGFYIPKKCCVFVN
::. :::...:. ..:: : : :. : ....:. . : :.:: ..:: ::: ...:
NP_000 IGQVRRPEMGDQAHMPYTTAVIHEVQRFGDIVPLGVTHMTSRDIEVQGFRIPKGTTLITN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 QWQVNHDPELWEDPSEFRPERFLTADGTAINKPLSEKMMLFGMGKRRCIGEVLAKWEIFL
.: .: .:: : .:.::.:: :.: . :: : .. :. :.: :.:: ::. :.::
NP_000 LSSVLKDEAVWEKPFRFHPEHFLDAQGHFV-KP--EAFLPFSAGRRACLGEPLARMELFL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510
pF1KE1 FLAILLQQLEFSVPPGVKVDLTPIYGLTMKHARCEHVQARLRFSIN
:.. :::.. :::: :
NP_000 FFTSLLQHFSFSVPTGQPRPSHHGVFAFLVSPSPYELCAVPR
460 470 480 490
516 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 19:01:55 2016 done: Mon Nov 7 19:01:57 2016
Total Scan time: 8.700 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]