Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1955
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1955, 513 aa
1>>>pF1KE1955 513 - 513 aa - 513 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3906+/-0.000768; mu= 6.4858+/- 0.047
mean_var=197.9787+/-39.921, 0's: 0 Z-trim(116.5): 47 B-trim: 85 in 1/50
Lambda= 0.091152
statistics sampled from 17067 (17114) to 17067 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.809), E-opt: 0.2 (0.526), width: 16
Scan time: 4.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 3570 481.5 9.7e-136
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 1643 228.0 1.7e-59
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 1591 221.2 1.9e-57
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 1153 163.6 3.9e-40
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 1152 163.4 4.2e-40
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 497 77.3 3.6e-14
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 497 77.4 4.3e-14
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 492 76.6 5.7e-14
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 444 70.3 4.2e-12
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 438 69.6 8.5e-12
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 437 69.5 9.4e-12
>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 3570 init1: 3570 opt: 3570 Z-score: 2550.4 bits: 481.5 E(32554): 9.7e-136
Smith-Waterman score: 3570; 99.8% identity (100.0% similar) in 513 aa overlap (1-513:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPGLGRRAQWLCWWWGLLCSCCGPPPLQPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSP
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MPGLGRRAQWLCWWWGLLCSCCGPPPLRPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 AFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 FQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE1 TKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
490 500 510
>>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 (454 aa)
initn: 1074 init1: 810 opt: 1643 Z-score: 1181.6 bits: 228.0 E(32554): 1.7e-59
Smith-Waterman score: 1742; 59.4% identity (79.6% similar) in 451 aa overlap (64-513:36-454)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 AAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRP
:.:.::::...:.::.:.::::.:::::::
CCDS49 FLLKGIVGFLWSCWVLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILGLPHRP
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRL-KSAPLFMLDLYNALSADNDEDGA
::. ::. .::::::::::::.. ... .
CCDS49 RPFS----------------------------PGKQASSAPLFMLDLYNAMTNEENPE-E
70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 SEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDA
:: . : .:. .... : ..: : .: . . ::.: .:. :::::
CCDS49 SEYSVRASLAEET-RGARKGYPASPNGYP-RRIQLSRTTPLTTQSPPLASLHDTNFLNDA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 DMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTF
::::::::::: ::.:: ..::.:::.:.:.:::.::.::::::::::: . :.:.:.
CCDS49 DMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFRIYKDRSNNRFENETI
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVV
:::::...:. .::.:::::::: . : . ::: ::::.::: ::..::.:.:::: .
CCDS49 KISIYQIIKEYTNRDADLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWVINPQNNLGLQLCAE
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 TRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQ
: :: .. ..::::::.:: .::::::::::.::: .:..: :...:..:.::.:.. :
CCDS49 TGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPFMVAFFKASEVLLRSVR-AANKRKNQNRNKSSSHQ
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 DVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAH
: .:.::..:::.:: : ::.::::::::.:::::::::::.:::: :::::::::::::
CCDS49 DSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAFYCDGECSFPLNAH
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 MNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGC
:::::::::::::::: :..:::::::::::::::::::::.::::::::::::::.:::
CCDS49 MNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRSCGC
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 H
:
CCDS49 H
>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa)
initn: 1829 init1: 1591 opt: 1591 Z-score: 1145.0 bits: 221.2 E(32554): 1.9e-57
Smith-Waterman score: 1772; 60.2% identity (78.9% similar) in 450 aa overlap (64-513:39-431)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 AAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKTQEKREMQKEILSVLGLPHRP
:.:..:::..::.::::.::::.:::::::
CCDS13 AAPHSFVALWAPLFLLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRP
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 RPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAPLFMLDLYNALSADNDEDGAS
:: : :: :. .:::.::::::::... :.:..
CCDS13 RP-H-LQ--------------------------GKHNSAPMFMLDLYNAMAV---EEGGG
70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 EGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASPLTSAQDSAFLNDAD
: . :.:..:. :.: .: ::.: ::: ::.:::
CCDS13 PGGQGFSYPYKAVFSTQ------------------GP--------PLASLQDSHFLTDAD
100 110 120 130
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 MVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIYKDCVMGSFKNQTFL
::::::::::.:::: . ::.::.:.::.:::::.::::::::::: . : :.::
CCDS13 MVMSFVNLVEHDKEFFHPRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDNETFR
140 150 160 170 180 190
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 ISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVT
::.::::::: :.:::::::.:..:::::::: :::::::: :::.:.::.:::::: :
CCDS13 ISVYQVLQEHLGRESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVET
200 210 220 230 240 250
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 RDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQD
:: ..:. :::.:: :: .::::::::::..::: :. ::..:..:.:.:... ..:.
CCDS13 LDGQSINPKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQE
260 270 280 290 300 310
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 VARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHM
. :...... .::. . ::.::::::::.:::::::::::.:::: ::.:::.::::..:
CCDS13 ALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYM
320 330 340 350 360 370
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 NATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
:::::::::::::..::: :::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS13 NATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRACGCH
380 390 400 410 420 430
>>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 1376 init1: 948 opt: 1153 Z-score: 834.1 bits: 163.6 E(32554): 3.9e-40
Smith-Waterman score: 1282; 46.5% identity (68.4% similar) in 471 aa overlap (44-513:18-402)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 WWGLLCSCCGPPPLQPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKT
:: ::.:: . :: :: ::: .
CCDS44 MTALPGPLWLLGLALCALG-GGGPG-LRPPPGCPQ-------RRLGA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 QEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAP
.:.:..:.:::.::::: :::: ::: ..:: :::
CCDS44 RERRDVQREILAVLGLPGRPRP------RAPPA---------ASRLP---------ASAP
40 50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 LFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSG
:::::::.:...:.::::: : : ::
CCDS44 LFMLDLYHAMAGDDDEDGA---------PAE------RR---------------------
80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 SGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTA
:. ::.::::::.:: :. .. .. : :::.:.:.::: ::.:::
CCDS44 ---------------LGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTA
100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 AEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITAT
::::::: . . :.:. .:..::.::...:.::::.:: ... :..:::: .:.::.
CCDS44 AEFRIYKVPSI-HLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAA
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 SNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTT
:. :.. ....::.: : :.:: : : :::.:. .: ..:::.:.::..: .::
CCDS44 SDCWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTP
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 RSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSA-SDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIA
:.. ::.: . .:.. .. :. . .: ..:. . .::.:::::::::::: ::.::
CCDS44 RAVRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIA
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 PKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFD
:.::.: ::.:::::::.. ::::::::.:.::::: :. ::: :::::::.: ::::.:
CCDS44 PQGYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYD
330 340 350 360 370 380
500 510
pF1KE1 DNSNVILKKYRNMVVRACGCH
...::::.:.:::::.:::::
CCDS44 SSNNVILRKHRNMVVKACGCH
390 400
>>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 1374 init1: 946 opt: 1152 Z-score: 833.4 bits: 163.4 E(32554): 4.2e-40
Smith-Waterman score: 1280; 46.5% identity (68.4% similar) in 471 aa overlap (44-513:18-402)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 WWGLLCSCCGPPPLQPPLPAAAAAAAGGQLLGDGGSPGRTEQPPPSPQSSSGFLYRRLKT
:: ::.:: . :: :: ::: .
CCDS43 MAARPGPLWLLGLTLCALG-GGGPG-LRPPPGCPQ-------RRLGA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 QEKREMQKEILSVLGLPHRPRPLHGLQQPQPPALRQQEEQQQQQQLPRGEPPPGRLKSAP
.:.:..:.:::.::::: :::: ::: ..:: :::
CCDS43 RERRDVQREILAVLGLPGRPRP------RAPPA---------ASRLP---------ASAP
40 50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 LFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSG
:::::::.:...:.::::: : : ::
CCDS43 LFMLDLYHAMAGDDDEDGA---------PAE-----QR----------------------
80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 SGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTA
:. ::.::::::.:: :. .. .. : :::.:.:.::: ::.:::
CCDS43 ---------------LGRADLVMSFVNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTA
100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 AEFRIYKDCVMGSFKNQTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITAT
::::::: . . :.:. .:..::.::...:.::::.:: ... :..:::: .:.::.
CCDS43 AEFRIYKVPSI-HLLNRTLHVSMFQVVQEQSNRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAA
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 SNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPFMVAFFKVSEVHVRTT
:. :.. ....::.: : :.:: : : :::.:. .: ..:::.:.::..: .::
CCDS43 SDCWLLKRHKDLGLRLYVETEDGHSVDPGLAGLLGQRAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTP
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 RSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSA-SDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLGWQDWIIA
:.. ::.: . .:.. .. :. . .: .:. . .::.:::::::::::: ::.::
CCDS43 RAVRPLRRRQPK-KSNELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIA
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 PKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNAISVLYFD
:.::.: ::.:::::::.. ::::::::.:.:::::.:. ::: :::::::.: ::::.:
CCDS43 PQGYSAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPKACCAPTKLSATSVLYYD
330 340 350 360 370 380
500 510
pF1KE1 DNSNVILKKYRNMVVRACGCH
...::::.:.:::::.:::::
CCDS43 SSNNVILRKHRNMVVKACGCH
390 400
>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa)
initn: 703 init1: 313 opt: 497 Z-score: 368.0 bits: 77.3 E(32554): 3.6e-14
Smith-Waterman score: 637; 34.5% identity (59.9% similar) in 357 aa overlap (170-512:65-395)
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 YNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASP
:: : :. : .: ::. : ::
CCDS13 AASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPG-SP
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIY
. . . :. : :: . .. . ..: ::::.:: : .:.::....
CCDS13 APDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVF
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 KDCVMGSFKNQTFL---ISIYQVLQEHQHRDS--DLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATS
.. .. .. :.. . :.::.... .. :::::.: . : ::.: .
CCDS13 REQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAV
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360
pF1KE1 NLWVVTPQHNMGLQLSVV---TRDGV-HVHPRAAGLVGRDGPYDKQ--PFMVAFF---KV
:.. . : :. . :. ..:: . : : . . .: .: :..:.: :
CCDS13 MRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLG
.: : :.:. ..:.. ::..:..: :::.:.:.:
CCDS13 HPLHKREKRQAKHKQRKR------------------------LKSSCKRHPLYVDFSDVG
280 290 300
430 440 450 460 470 480
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:.:::.:: :: : :: ::: ::: :.:.::::::::::. .: . .:: ::.::.:.:
CCDS13 WNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSK-IPKACCVPTELSA
310 320 330 340 350 360
490 500 510
pF1KE1 ISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
::.::.:.: .:.::.:..:::..:::
CCDS13 ISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
370 380 390
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10 20 30
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.: : : : : .:. : : : : : :. : : :
CCDS13 MRLPKLLTFLLWYLAWLDLEFICTVLGAPDLGQRPQGTRPGLAKAEAKERPPLARNVFRP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
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::. : :.. . .. . :. : : :: :.. :.. : :. :.: :
CCDS13 GGHSYGGGATNANARAKGGTGQT--GGL-----TQPKKDEPKKLPPRPGGPE-PKPGH--
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100 110 120 130 140 150
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:: :: . . ::: :. :: . :.: .: : .: :
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. . :.: .. .::: . : :. :. .. .:: : :.. : : :. .
CCDS13 EPGPPREP---KEPFRPPPITPHEYMLSLYRTLSDADRKGGNS---SVKLEAGL--ANTI
160 170 180 190 200
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::.. . :. .: :... . :..: . : . . .::.:: . . : . .
CCDS13 TSFIDKGQDDR--GPVVRKQR-YVFDISAL-EKDGLLGAELRILRKKPSDTAKPAAPGGG
210 220 230 240 250
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:. :. . :::.: : . . :: ::: .: : . . ..
CCDS13 RAAQLKLSSCPSGRQPAALLDVRSVPGLDGSGWEVFDIWKLFRNFKNSAQLCLELEAWER
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. ...: . : . .:: .: :: :: : :: .:...:. .. ..
CCDS13 GRAVDLRGLGFDRAARQVHEKALFLVFGRTKKRD------LFF--NEIKARSGQDDKTVY
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. .: . .: . . :..::. : .. :.:.:.:.::.:::::: : : .
CCDS13 EYLFSQRRKRRAPLA--TRQGKRPSKNLKARCSRKALHVNFKDMGWDDWIIAPLEYEAFH
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:.: : ::: .:.. ::::..:::.. :.:: .: ::.::.:. ::.:..:. .::. :
CCDS13 CEGLCEFPLRSHLEPTNHAVIQTLMNSMDPESTPPTCCVPTRLSPISILFIDSANNVVYK
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510
pF1KE1 KYRNMVVRACGCH
.:..:::..:::
CCDS13 QYEDMVVESCGCR
490 500
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CCDS97 IHSTGLEYPERPASRANTVRSFHH--EEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEVISSA
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CCDS97 ELRLFREQVDQGPDWERGFHRINIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFD
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.. . :. : :.:: . :. :..: ::. . : . . .:..:.:
CCDS97 VSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFG
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
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. .. : : .:::. .:. . .:: : :.. ::.: :::.:.:
CCDS97 HDGRGH------ALTRRRRAKRSPKHHSQ------RARKKNKN-----CRRHSLYVDFSD
280 290 300 310
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.::.:::.:: :: : :: :.: ::: :.:.::::::::::. .: .:: ::.::.:
CCDS97 VGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSS-IPKACCVPTEL
320 330 340 350 360 370
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.:::.::.:. ..:.::.:..:::..:::
CCDS97 SAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
380 390 400
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CCDS85 PDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREAA--AT
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CCDS85 TGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKEREQLT
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CCDS85 LAQLGL--DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRS-VPWP--QGA
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CCDS85 VHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKED------------RDSGVNFQPEDTCARLR
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: .:. . . . . . ::.: . . : ..: :. :..:.:...:.:
CCDS85 CS-LHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRA-AIPVPKLSC---------KNLCHRHQLFINFRD
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CCDS85 LGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKL
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CCDS85 SPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]