Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1939
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1939, 481 aa
1>>>pF1KE1939 481 - 481 aa - 481 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6129+/-0.00042; mu= 16.0139+/- 0.026
mean_var=65.2066+/-12.938, 0's: 0 Z-trim(110.6): 30 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.158829
statistics sampled from 19028 (19049) to 19028 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 9.550
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004130 (OMIM: 151990) lipopolysaccharide-bindin ( 481) 3090 717.2 2.4e-206
NP_001716 (OMIM: 109195) bactericidal permeability ( 487) 1419 334.4 4.5e-91
XP_011528391 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 588 143.9 9.7e-34
XP_011528390 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 588 143.9 9.7e-34
XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 507) 588 143.9 9.7e-34
NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing famil ( 507) 588 143.9 9.7e-34
NP_006218 (OMIM: 172425) phospholipid transfer pro ( 493) 532 131.1 6.9e-30
XP_016884229 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 450) 453 113.0 1.8e-24
NP_001229850 (OMIM: 172425) phospholipid transfer ( 405) 410 103.1 1.5e-21
XP_011528393 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-co ( 455) 362 92.1 3.4e-18
NP_000069 (OMIM: 118470,143470) cholesteryl ester ( 493) 343 87.8 7.5e-17
NP_872617 (OMIM: 172425) phospholipid transfer pro ( 441) 313 80.9 8e-15
NP_001229849 (OMIM: 172425) phospholipid transfer ( 398) 306 79.3 2.2e-14
XP_006721187 (OMIM: 118470,143470) PREDICTED: chol ( 266) 262 69.1 1.7e-11
NP_872599 (OMIM: 615717) BPI fold-containing famil ( 476) 264 69.7 2e-11
NP_777557 (OMIM: 614110) BPI fold-containing famil ( 453) 263 69.5 2.3e-11
XP_016883152 (OMIM: 614110) PREDICTED: BPI fold-co ( 469) 263 69.5 2.4e-11
NP_001273014 (OMIM: 118470,143470) cholesteryl est ( 433) 262 69.2 2.6e-11
>>NP_004130 (OMIM: 151990) lipopolysaccharide-binding pr (481 aa)
initn: 3090 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3825.5 bits: 717.2 E(85289): 2.4e-206
Smith-Waterman score: 3090; 99.8% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP
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NP_004 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AELLEALLNYYILNTFYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 V
:
NP_004 V
>>NP_001716 (OMIM: 109195) bactericidal permeability-inc (487 aa)
initn: 1328 init1: 920 opt: 1419 Z-score: 1756.1 bits: 334.4 E(85289): 4.5e-91
Smith-Waterman score: 1419; 44.8% identity (79.5% similar) in 469 aa overlap (12-478:18-486)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSEL
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NP_001 MRENMARGPCNAPRWASLMVLVAIGTAVTAAVNPGVVVRISQKGLDYASQQGTAALQKEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LRITLPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQG
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NP_001 KRIKIPDYSDSFKIKHLGKGHYSFYSMDIREFQLPSSQISMVPNVGLKFSISNANIKISG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 RWKVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSE-SSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMS-G
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NP_001 KWKAQKRFLKMSGNFDLSIEGMSISADLKLGSNPTSGKPTITCSSCSSHINSVHVHISKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DLGWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSL
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NP_001 KVGWLIQLFHKKIESALRNKMNSQVCEKVTNSVSSELQPYFQTLPVMTKIDSVAGINYGL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLV
: : .::. :.:..:::.. .::..: . :: .: :..:::...::: ::::.::
NP_001 VAPPATTAETLDVQMKGEFYSENHHNPPPFAPPVMEFPAAHDRMVYLGLSDYFFNTAGLV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFS
:.: : :.... ::::: .:..::::: : :.:..:. .:::..... :. . : :. .
NP_001 YQEAGVLKMTLRDDMIPKESKFRLTTKFFGTFLPEVAKKFPNMKIQIHVSASTPPHLSVQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
: .:. : ....::..::.:: .: ... :. : .. ......: :: .. .:::
NP_001 PTGLTFYPAVDVQAFAVLPNSSLASLFLIGMHTTGSMEVSAESNRLVGELKLDRLLLELK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
.:..: : .:::. ..:: . . :. :.:: .::::: :::::.. :: :..::..
NP_001 HSNIGPFPVELLQDIMNYIVPILVLPRVNEKLQKGFPLPTPARVQLYNVVLQPHQNFLLF
430 440 450 460 470 480
480
pF1KE1 GANVQYMRV
::.: :
NP_001 GADVVYK
>>XP_011528391 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (507 aa)
initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 726.7 bits: 143.9 E(85289): 9.7e-34
Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
:: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : .
XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW
:::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. :
XP_011 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW
.. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:.
XP_011 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP
: : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .:
XP_011 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE
. : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::...
XP_011 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS
: .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:..
XP_011 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
:::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. :
XP_011 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::..
XP_011 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI
420 430 440 450 460 470
480
pF1KE1 GANVQYMRV
.....:
XP_011 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>XP_011528390 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (507 aa)
initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 726.7 bits: 143.9 E(85289): 9.7e-34
Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
:: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : .
XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW
:::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. :
XP_011 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW
.. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:.
XP_011 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP
: : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .:
XP_011 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE
. : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::...
XP_011 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS
: .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:..
XP_011 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
:::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. :
XP_011 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP
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pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::..
XP_011 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI
420 430 440 450 460 470
480
pF1KE1 GANVQYMRV
.....:
XP_011 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>XP_011528392 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (507 aa)
initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 726.7 bits: 143.9 E(85289): 9.7e-34
Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
:: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : .
XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW
:::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. :
XP_011 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW
.. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:.
XP_011 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP
: : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .:
XP_011 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE
. : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::...
XP_011 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA
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pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS
: .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:..
XP_011 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ
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360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
:::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. :
XP_011 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP
360 370 380 390 400 410
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pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
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XP_011 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI
420 430 440 450 460 470
480
pF1KE1 GANVQYMRV
.....:
XP_011 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>NP_777592 (OMIM: 614109) BPI fold-containing family C (507 aa)
initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 726.7 bits: 143.9 E(85289): 9.7e-34
Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
:: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : .
NP_777 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW
:::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. :
NP_777 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW
.. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:.
NP_777 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP
: : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .:
NP_777 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE
. : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::...
NP_777 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS
: .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:..
NP_777 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
:::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. :
NP_777 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::..
NP_777 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI
420 430 440 450 460 470
480
pF1KE1 GANVQYMRV
.....:
NP_777 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>NP_006218 (OMIM: 172425) phospholipid transfer protein (493 aa)
initn: 408 init1: 274 opt: 532 Z-score: 657.6 bits: 131.1 E(85289): 6.9e-30
Smith-Waterman score: 532; 24.6% identity (60.0% similar) in 467 aa overlap (14-480:6-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP
::.:. : . :: :.:.:.:. . :::: :..:: ::.:
NP_006 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
:. : . :. :.. ... .: : : : : : :.:...:. .. : ..
NP_006 DLRG-----KEGHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL
:: : ...:..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . ..
NP_006 WFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
. . : : .. .:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :..
NP_006 LSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVAST
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN
. :.. :.: .: ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.
NP_006 SNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
. .. : .: : .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ...
NP_006 LLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISV
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
. .. :.. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . .
NP_006 TASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
:.: :. .. ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... .
NP_006 LIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAK
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 V
NP_006 GLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
470 480 490
>>XP_016884229 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (450 aa)
initn: 348 init1: 184 opt: 453 Z-score: 560.4 bits: 113.0 E(85289): 1.8e-24
Smith-Waterman score: 453; 27.8% identity (67.2% similar) in 299 aa overlap (12-308:14-309)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
:: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : .
XP_016 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW
:::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. :
XP_016 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW
.. .:. :. :. ..:. .. ..: .. :.::. ..: .... ..:..::.:.
XP_016 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP
: : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .:
XP_016 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE
. : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::...
XP_016 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNL
: .: ... . :
XP_016 GVFNVTLSTEEISNHFVQNSQGLGNVLSRVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALPES
300 310 320 330 340 350
>>NP_001229850 (OMIM: 172425) phospholipid transfer prot (405 aa)
initn: 306 init1: 274 opt: 410 Z-score: 507.9 bits: 103.1 E(85289): 1.5e-21
Smith-Waterman score: 410; 22.5% identity (60.8% similar) in 378 aa overlap (103-480:2-378)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 RGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRKSFFKLQGSFDVS
:.:...:. .. : .. :: : ...:
NP_001 MLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINAS
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 VKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNLFHNQIESKFQKV
..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . ... . : : .. .
NP_001 AEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFL
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATAQMLEVMFKGEIF
:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :... :.. :.: .:
NP_001 LNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFF
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 HRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLNFSITDDMIPPDS
..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.. .. : .: :
NP_001 PLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 NIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDPYMEIDAFVLLPS
.. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ... . .. :.
NP_001 DMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPD
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 SSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFNAELLEALLNYYI
. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . . :.: :. ..
NP_001 QPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTML
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480
pF1KE1 LNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMRV
..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... .
NP_001 QIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPA
340 350 360 370 380 390
NP_001 DVRASTAPTPSTAAV
400
>>XP_011528393 (OMIM: 614109) PREDICTED: BPI fold-contai (455 aa)
initn: 348 init1: 184 opt: 362 Z-score: 447.6 bits: 92.1 E(85289): 3.4e-18
Smith-Waterman score: 401; 22.4% identity (58.1% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-426)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
:: : .:. ... ::. ::::...:.:..: :. ... : .
XP_011 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW
:::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. :
XP_011 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW
.. .: : .:: ..:
XP_011 GFESPLFVLYNSF--------------------AEP------------------------
120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP
.:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .:
XP_011 --------MEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP
140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE
. : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::...
XP_011 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS
: .: ... . : .... ..... . :.:..: : : ...... : :..:..
XP_011 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
:::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. :
XP_011 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::..
XP_011 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI
370 380 390 400 410 420
480
pF1KE1 GANVQYMRV
.....:
XP_011 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
430 440 450
481 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]