Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1939
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1939, 481 aa
1>>>pF1KE1939 481 - 481 aa - 481 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5809+/-0.000978; mu= 15.9266+/- 0.059
mean_var=60.9596+/-12.059, 0's: 0 Z-trim(103.5): 25 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.164268
statistics sampled from 7443 (7454) to 7443 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13304.1 LBP gene_id:3929|Hs108|chr20 ( 481) 3090 741.1 5.9e-214
CCDS13303.1 BPI gene_id:671|Hs108|chr20 ( 487) 1419 345.1 9.8e-95
CCDS13906.1 BPIFC gene_id:254240|Hs108|chr22 ( 507) 588 148.2 1.9e-35
CCDS13386.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 493) 532 134.9 1.9e-31
CCDS56196.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 405) 410 106.0 7.9e-23
CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 493) 343 90.1 5.7e-18
CCDS13387.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 441) 313 83.0 7.1e-16
CCDS56197.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 ( 398) 306 81.3 2e-15
CCDS13212.1 BPIFB3 gene_id:359710|Hs108|chr20 ( 476) 264 71.4 2.4e-12
CCDS13211.1 BPIFB6 gene_id:128859|Hs108|chr20 ( 453) 263 71.2 2.7e-12
CCDS67032.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 ( 433) 262 70.9 3e-12
>>CCDS13304.1 LBP gene_id:3929|Hs108|chr20 (481 aa)
initn: 3090 init1: 3090 opt: 3090 Z-score: 3954.6 bits: 741.1 E(32554): 5.9e-214
Smith-Waterman score: 3090; 99.8% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP
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CCDS13 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
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CCDS13 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
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CCDS13 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
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CCDS13 AELLEALLNYYILNTFYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 V
:
CCDS13 V
>>CCDS13303.1 BPI gene_id:671|Hs108|chr20 (487 aa)
initn: 1328 init1: 920 opt: 1419 Z-score: 1814.3 bits: 345.1 E(32554): 9.8e-95
Smith-Waterman score: 1419; 44.8% identity (79.5% similar) in 469 aa overlap (12-478:18-486)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSEL
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CCDS13 MRENMARGPCNAPRWASLMVLVAIGTAVTAAVNPGVVVRISQKGLDYASQQGTAALQKEL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LRITLPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQG
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CCDS13 KRIKIPDYSDSFKIKHLGKGHYSFYSMDIREFQLPSSQISMVPNVGLKFSISNANIKISG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 RWKVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSE-SSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMS-G
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CCDS13 KWKAQKRFLKMSGNFDLSIEGMSISADLKLGSNPTSGKPTITCSSCSSHINSVHVHISKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DLGWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSL
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CCDS13 KVGWLIQLFHKKIESALRNKMNSQVCEKVTNSVSSELQPYFQTLPVMTKIDSVAGINYGL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLV
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CCDS13 VAPPATTAETLDVQMKGEFYSENHHNPPPFAPPVMEFPAAHDRMVYLGLSDYFFNTAGLV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFS
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CCDS13 YQEAGVLKMTLRDDMIPKESKFRLTTKFFGTFLPEVAKKFPNMKIQIHVSASTPPHLSVQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
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CCDS13 PTGLTFYPAVDVQAFAVLPNSSLASLFLIGMHTTGSMEVSAESNRLVGELKLDRLLLELK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
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CCDS13 HSNIGPFPVELLQDIMNYIVPILVLPRVNEKLQKGFPLPTPARVQLYNVVLQPHQNFLLF
430 440 450 460 470 480
480
pF1KE1 GANVQYMRV
::.: :
CCDS13 GADVVYK
>>CCDS13906.1 BPIFC gene_id:254240|Hs108|chr22 (507 aa)
initn: 348 init1: 184 opt: 588 Z-score: 749.7 bits: 148.2 E(32554): 1.9e-35
Smith-Waterman score: 588; 24.7% identity (65.5% similar) in 473 aa overlap (12-478:14-478)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
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CCDS13 MCTKTIPVLWGCFLLWNLYVSSSQTI--YPGIKARITQRALDYGVQAGMKMIEQMLKEKK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGD--LRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRW
:::..:. :.. .: :.: ...: . . ...: ::: :.. . .. .. :
CCDS13 LPDLSGSESLEFLKVDYVNYNFSNIKISAFSFPNTSLAFVPGVGIKALTNHGTANISTDW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGW
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CCDS13 GFESPLFQDTGGADLFLSGVYFTGIIILTRNDFGHPTLKLQDCYAQLSHAHVSFSGELSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 LLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAP
: : : . .:. . : :. .: .: . :.. :. :.:: : :.::... .::::. .:
CCDS13 LYNSFAEPMEKPILKNLNEMLCPIIASEVKA-LNANLSTLEVLTKIDNYTLLDYSLISSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEE
. : ..:.. .:: .. .. . . . . :::. :.:.:..:..: :..::...
CCDS13 EITENYLDLNLKGVFYPLENLTDPPFSPVPFVLPERSNSMLYIGIAEYFFKSASFAHFTA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLY----PNMNLELQGSVPSAPLLNFS
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CCDS13 GVFNVTLSTEEI--SNHFVQNSQGLGNVLSRIAEIYILSQPFM-VRIMATEP--PIINLQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
:::...: : .. .:. : . .. ....:. :.. .... :. .. .. :
CCDS13 PGNFTLDIPASIMMLTQPKNSTVETIVSMDFVASTSVGLVILGQRLVCSLSLNRFRLALP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFL
::. . ... .: .:. . . : : :: .:::: .. . . ... . ::..
CCDS13 ESNRSNIEVLRFENILSSILHFGVLPLANAKLQQGFPLSNPHKFLFVNSDIEVLEGFLLI
420 430 440 450 460 470
480
pF1KE1 GANVQYMRV
.....:
CCDS13 STDLKYETSSKQQPSFHVWEGLNLISRQWRGKSAP
480 490 500
>>CCDS13386.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (493 aa)
initn: 408 init1: 274 opt: 532 Z-score: 678.2 bits: 134.9 E(32554): 1.9e-31
Smith-Waterman score: 532; 24.6% identity (60.0% similar) in 467 aa overlap (14-480:6-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGANPGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRITLP
::.:. : . :: :.:.:.:. . :::: :..:: ::.:
CCDS13 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
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CCDS13 DLRG-----KEGHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNL
:: : ...:..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . ..
CCDS13 WFFYDGGYINASAEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
. . : : .. .:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :..
CCDS13 LSTFITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVAST
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLN
. :.. :.: .: ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.
CCDS13 SNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
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CCDS13 LLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISV
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
. .. :.. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . .
CCDS13 TASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLA
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
:.: :. .. ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... .
CCDS13 LIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAK
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 V
CCDS13 GLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
470 480 490
>>CCDS56196.1 PLTP gene_id:5360|Hs108|chr20 (405 aa)
initn: 306 init1: 274 opt: 410 Z-score: 523.3 bits: 106.0 E(32554): 7.9e-23
Smith-Waterman score: 410; 22.5% identity (60.8% similar) in 378 aa overlap (103-480:2-378)
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 RGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRKSFFKLQGSFDVS
:.:...:. .. : .. :: : ...:
CCDS56 MLQITNASLGLRFRRQLLYWFFYDGGYINAS
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 VKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDLGWLLNLFHNQIESKFQKV
..:.:: ..: :. . .:: :. ::..... ... ..: . . ... . : : .. .
CCDS56 AEGVSIRTGLELSRDPAGRMKVSNVSCQASVSRMHAAFGGTFKKVYDFLSTFITSGMRFL
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATAQMLEVMFKGEIF
:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :... :.. :.: .:
CCDS56 LNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFF
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 HRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLNFSITDDMIPPDS
..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.. .. : .: :
CCDS56 PLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 NIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDPYMEIDAFVLLPS
.. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ... . .. :.
CCDS56 DMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPD
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 SSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFNAELLEALLNYYI
. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . . :.: :. ..
CCDS56 QPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTML
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480
pF1KE1 LNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMRV
..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... .
CCDS56 QIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPA
340 350 360 370 380 390
CCDS56 DVRASTAPTPSTAAV
400
>>CCDS10772.1 CETP gene_id:1071|Hs108|chr16 (493 aa)
initn: 174 init1: 70 opt: 343 Z-score: 436.1 bits: 90.1 E(32554): 5.7e-18
Smith-Waterman score: 343; 23.2% identity (55.5% similar) in 461 aa overlap (11-461:7-460)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGALARALPSILLALLLTSTPEALGAN--PGLVARITDKGLQYAAQEGLLALQSELLRIT
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CCDS10 MLAATVLTLALLGNAHACSKGTSHEAGIVCRITKPALLVLNHETAKVIQTAFQRAS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPDFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKV
::.::. . .:. .: .:...: . : .. : ......::.. :. .: :
CCDS10 YPDITGEKAMMLLGQVKYGLHNIQISHLSIASSQVELVEAKSIDVSIQNVSVVFKGTLKY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 RKS---FFKLQGSFDVSV-KGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIADVEVDMSGDL
. .. .. :.: . ..:....: : . .::: . : .: .. . . ..:.
CCDS10 GYTTAWWLGIDQSIDFEIDSAIDLQINTQL-TCDSGRVRTDAPDCYLSFHKLLLHLQGER
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 --GWLLNLFHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSL
::. .:: : : .. ::...::. :. .:. . ..:: .. :. .: ::
CCDS10 EPGWIKQLFTNFISFTLKLVLKGQICKEIN-VISNIMADFVQTRAASILSDGDIGVDISL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VEAPRATAQMLEVMFKGEIFHRNHRSPVTLLAAVMSLPEEHNKMVYFAISDYVFNTASLV
. : ::..:: ::.....: . : . .: . ..:.:: .:. ::.. . :
CCDS10 TGDPVITASYLESHHKGHFIYKNVSEDLPLPTFSPTLLGD-SRMLYFWFSERVFHSLAKV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFS
..: : .:. : . . : : .: . .. .. . : .: . ..:
CCDS10 AFQDGRLMLSLMGD----EFKAVLETWGFNTNQEIFQEVVGGFPSQAQVTVHCLKMPKIS
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PGNLSVDPYMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELK
: .: . . :.: ... . .. .:. . :: ::. .. :
CCDS10 CQNKGVVVNSSVMVKFLFPRPDQQHSVAYTFEEDIVTTVQASYSKKKLFLSLLDFQITPK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 E-SKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFP-LPLLKRVQLYDLGLQIHKDFL
:.. ..: ....:. .: . :. ..: : : : :.:.:.
CCDS10 TVSNLTESSSESVQSFLQSMITAVGIPEVMSRLEVVFTALMNSKGVSLFDIINPEIITRD
410 420 430 440 450 460
480
pF1KE1 FLGANVQYMRV
CCDS10 GFLLLQMDFGFPEHLLVDFLQSLS
470 480 490
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::.:. : . :: :.:.:.:. . :::: :..:: ::.:
CCDS13 MALFGALFLALLAGAHAEFPGCKIRVTSKALELVKQEGLRFLEQELETITIP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DFTGDLRIPHVGRGRYEFHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSISDSSIRVQGRWKVRK
:. : . :. :.. ... .: : : : : : :.:...:. .. : ..
CCDS13 DLRG-----KEGHFYYNISEVKVTELQLTSSELDFQPQQELMLQITNASLGLRFRRQLLY
60 70 80 90 100
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:.:. .: .:.
CCDS13 WFLKV---YD----------------------------------------------FLST
110
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FHNQIESKFQKVLESRICEMIQKSVSSDLQPYLQTLPVTTEIDSFADIDYSLVEAPRATA
: : : .. .:...:: .. .. . :. :.:.:: . .: .. :::::.. : :..
CCDS13 F---ITSGMRFLLNQQICPVLYHAGTVLLNSLLDTVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVAST
120 130 140 150 160 170
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. :.. :.: .: ..:. :: .:...::: :.:.. :..: : . : :.
CCDS13 SNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEERMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQ
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPNMNLELQGSVPSAPLLNFSPGNLSVDP
. .. : .: : .. : . : .: :. . :.:. : . : ...:.. ...
CCDS13 LLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVIDSPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISV
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 YMEIDAFVLLPSSSKEPVFRLSVATNVSATLTFNTSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFN
. .. :.. . . ... . .:: ... . . : . .. ..: . .
CCDS13 TASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALRGKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLA
300 310 320 330 340 350
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pF1KE1 AELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLKRVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMR
:.: :. .. ..: .:.. .: .:: . ... . : :: .::.... .
CCDS13 LIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPEGINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAK
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 V
CCDS13 GLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
420 430 440
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: : .. .:...:: .. .. . :. :.
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:.:: . .: .. :::::.. : :... :.. :.: .: ..:. :: .:..
CCDS56 TVPVRSSVDELVGIDYSLMKDPVASTSNLDMDFRGAFFPLTERNWSLPNRAVEPQLQEEE
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pF1KE1 KMVYFAISDYVFNTASLVYHEEGYLNFSITDDMIPPDSNIRLTTKSFRPFVPRLARLYPN
.::: :.:.. :..: : . : :.. .. : .: : .. : . : .: :. .
CCDS56 RMVYVAFSEFFFDSAMESYFRAGALQLLLVGDKVPHDLDMLLRATYFGSIV-LLSPAVID
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:.:. : . : ...:.. ... . .. :.. . . ... . .:: ...
CCDS56 SPLKLELRVLAPPRCTIKPSGTTISVTASVTIALVPPDQPEVQLSSMTMDARLSAKMALR
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 TSKITGFLKPGKVKVELKESKVGLFNAELLEALLNYYILNTLYPKFNDKLAEGFPLPLLK
. . : . .. ..: . . :.: :. .. ..: .:.. .: .:: .
CCDS56 GKALRTQLDLRRFRIYSNHSALESLALIPLQAPLKTMLQIGVMPMLNERTWRGVQIPLPE
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pF1KE1 RVQLYDLGLQIHKDFLFLGANVQYMRV
... . : :: .::.... .
CCDS56 GINFVHEVVTNHAGFLTIGADLHFAKGLREVIEKNRPADVRASTAPTPSTAAV
350 360 370 380 390
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: . :: :.:: :.. . : . : .::: : : :..:.. ::. : .
CCDS13 MQPVMLALWSLLLLWGLATPCQELLETVGTLARIDKDELGKAIQNSLVGEPILQNVLGSV
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pF1KE1 TLPD---------FTGDLRIPHVGR-GRYE-FHSLNIHSCELLHSALRPVPGQGLSLSI-
: . . : . : : : : . .:.:. : . :. .:: :..::.
CCDS13 TAVNRGLLGSGGLLGGGGLLGHGGVFGVVEELSGLKIEELTLPKVLLKLLPGFGVQLSLH
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110 120 130 140 150 160
pF1KE1 SDSSIRVQGRWKVRKSFFKLQGSFDVSVKGISISVNLLLGSESSGRPTVTASSCSSDIAD
. ... .: : : ...... .... . :. : : : . . ::. ..
CCDS13 TKVGMHCSG---------PLGGLLQLAAE-VNVTSRVALAVSSRGTPILILKRCSTLLGH
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. . .:: : :: . .:. . ::: . .: ... :: . .. : .. . . ..
CCDS13 ISL-FSGLLP--TPLF-GVVEQMLFKVLPGLLCPVVD-SVLGVVNELLGAVLGLVSLGAL
180 190 200 210 220
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.....::. : . :..:. . : :.: : .. :.:. ..: ....
CCDS13 GSVEFSLATLPLISNQYIELDINPIVKSVAGDIIDFPKS-RAPA-------KVPPKKDHT
230 240 250 260 270
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. :.:::. . . .: :...:: ...: :.. ::: .. ..:. :..: ..
CCDS13 SQVMVPLYLFNTTFGLLQTNGALDMDITPELVP--SDVPLTTTDLAALLPEALGKLPLHQ
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.: : : :: ... . :. .: .. .:... : .:.:. . .: : :. ..
CCDS13 QLLLFLRVREAPTVTLHNKKALVSLPANIHVLFYVPKGTPESLFELNSVMTVRAQLAPSA
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.:. :. ...:.. : . :.. :: :.. . . ::.: : :.::: .
CCDS13 TKLHISLSLERLSVKVASSFTHAFDGSRLEEWLSHVVGAVYAPKLNVALDVGIPLPKVLN
400 410 420 430 440 450
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... . :.: .. . :
CCDS13 INFSNSVLEIVENAVVLTVAS
460 470
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.: : : : . :.:: . :. :.. : .:..:. .
CCDS13 MLRILCLALCSLLTGTRADPGALLRL---GMDIMNQVQSAMDESHILE-KMA
10 20 30 40
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.: . : . . . .:.... .: .: ::: :. .: ... : : :
CCDS13 AEAGK-KQPGM-KPIKGITNLKVKDVQLPVITLNFVPGVGIFQCVS-TGMTVTG-----K
50 60 70 80 90 100
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:: . :.... : ..: :: .: .: :. . .: ...:.... ... : ..
CCDS13 SF--MGGNMEIIVALNITATNRLLRDEETGLPVFKSEGCEVILVNVKTNLPSNM--LPKM
110 120 130 140 150
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.. ..: ..::: . .: :. .: .. .: . ... . : :. :: .::
CCDS13 VNKFLDSTLHKVLPGLMCPAID-AVLVYVNRKWTNLSDPMPVGQMGTVKYVLMSAPATTA
160 170 180 190 200 210
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CCDS13 SYIQLDFSPVVQQQKGKT-IKLADAGEALTFPEGYAKGSSQLLLPATFLSAELALLQKSF
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CCDS13 -HVNIQDTMIGELPPQ-----TTKTLARFIPEVAVAYPKSKPLTTQIKIKKPPKVTMKTG
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. . . .. :. : : :. : : : :... . . ... . .. ..
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CCDS13 KSSSIGNFNERELTGFITSYLEEAYIPVVNDVLQVGLPLPDFLAMNYNLAELDIVENALM
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CCDS13 LDLKLG
450
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]