Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1938
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1938, 480 aa
1>>>pF1KE1938 480 - 480 aa - 480 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3318+/-0.000419; mu= 17.6834+/- 0.026
mean_var=67.6180+/-13.851, 0's: 0 Z-trim(110.8): 29 B-trim: 21 in 1/52
Lambda= 0.155971
statistics sampled from 19225 (19253) to 19225 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 9.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003356 (OMIM: 191328) cytochrome b-c1 complex s ( 480) 3190 727.2 2.4e-209
NP_004270 (OMIM: 603131) mitochondrial-processing ( 489) 1811 416.9 6.3e-116
XP_006716244 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondri ( 506) 1711 394.4 3.8e-109
XP_005250774 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondri ( 508) 1711 394.4 3.8e-109
NP_055975 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-proc ( 525) 415 102.8 2.4e-21
XP_005266116 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mito ( 563) 415 102.8 2.6e-21
NP_003357 (OMIM: 191329,615160) cytochrome b-c1 co ( 453) 370 92.7 2.4e-18
NP_001269875 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-p ( 425) 247 65.0 4.9e-10
NP_001269873 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-p ( 394) 180 49.9 1.6e-05
XP_016870032 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mito ( 343) 165 46.5 0.00015
XP_011516719 (OMIM: 213200,613036) PREDICTED: mito ( 381) 165 46.5 0.00016
XP_016856864 (OMIM: 602651) PREDICTED: nardilysin (1019) 157 44.9 0.0013
XP_011539825 (OMIM: 602651) PREDICTED: nardilysin (1019) 157 44.9 0.0013
NP_001095132 (OMIM: 602651) nardilysin isoform b p (1151) 157 44.9 0.0014
XP_016871676 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978) 153 44.0 0.0023
XP_016871678 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978) 153 44.0 0.0023
XP_016871677 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978) 153 44.0 0.0023
XP_016871679 (OMIM: 146680) PREDICTED: insulin-deg ( 978) 153 44.0 0.0023
NP_001309725 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzy ( 978) 153 44.0 0.0023
NP_001309724 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzy ( 978) 153 44.0 0.0023
NP_001309722 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzy (1019) 153 44.0 0.0023
NP_004960 (OMIM: 146680) insulin-degrading enzyme (1019) 153 44.0 0.0023
NP_001229290 (OMIM: 602651) nardilysin isoform c [ (1087) 151 43.6 0.0034
XP_011539824 (OMIM: 602651) PREDICTED: nardilysin (1109) 151 43.6 0.0034
NP_002516 (OMIM: 602651) nardilysin isoform a [Hom (1219) 151 43.6 0.0037
>>NP_003356 (OMIM: 191328) cytochrome b-c1 complex subun (480 aa)
initn: 3190 init1: 3190 opt: 3190 Z-score: 3879.4 bits: 727.2 E(85289): 2.4e-209
Smith-Waterman score: 3190; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MAASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SEQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NAYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DVVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DVVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QLLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NVALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
430 440 450 460 470 480
>>NP_004270 (OMIM: 603131) mitochondrial-processing pept (489 aa)
initn: 1816 init1: 922 opt: 1811 Z-score: 2202.3 bits: 416.9 E(85289): 6.3e-116
Smith-Waterman score: 1811; 57.6% identity (86.4% similar) in 448 aa overlap (32-479:42-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 AASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVAS
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NP_004 SAARRRLWGFSESLLIRGAAGRSLYFGENRLRSTQAATQVVLNVPETRVTCLESGLRVAS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLN
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NP_004 EDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD
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NP_004 AYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQE
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQ
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NP_004 VVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSISRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDE
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDN
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NP_004 LLDLAKFHFGDSLCTH-KGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDT
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVCD
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NP_004 ICLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSKLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCE
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYG
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NP_004 SSTVADMLHVVQKEWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGSTPICEDIGRQMLCYN
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 RRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
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NP_004 RRIPIPELEARIDAVNAETIREVCTKYIYNRSPAIAAVGPIKQLPDFKQIRSNMCWLRD
440 450 460 470 480
>>XP_006716244 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondrial-p (506 aa)
initn: 1698 init1: 922 opt: 1711 Z-score: 2080.5 bits: 394.4 E(85289): 3.8e-109
Smith-Waterman score: 1711; 57.1% identity (86.0% similar) in 429 aa overlap (32-460:42-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 AASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVAS
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XP_006 SAARRRLWGFSESLLIRGAAGRSLYFGENRLRSTQAATQVVLNVPETRVTCLESGLRVAS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLN
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XP_006 EDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD
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XP_006 AYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQE
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQ
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XP_006 VVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSISRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDE
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDN
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XP_006 LLDLAKFHFGDSLCTH-KGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDT
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVCD
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XP_006 ICLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSKLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCE
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYG
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XP_006 SSTVADMLHVVQKEWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGSTPICEDIGRQMLCYN
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 RRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
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XP_006 RRIPIPELEARIDAVNAETIREVCTKYIYNRSPAIAAVGYNHRSELHEWKWNKLFSKRQT
440 450 460 470 480 490
XP_006 ISYSYVNILLPQPQPQ
500
>>XP_005250774 (OMIM: 603131) PREDICTED: mitochondrial-p (508 aa)
initn: 1698 init1: 922 opt: 1711 Z-score: 2080.4 bits: 394.4 E(85289): 3.8e-109
Smith-Waterman score: 1711; 57.1% identity (86.0% similar) in 429 aa overlap (32-460:42-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 AASVVCRAATAGAQVLLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVAS
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XP_005 SAARRRLWGFSESLLIRGAAGRSLYFGENRLRSTQAATQVVLNVPETRVTCLESGLRVAS
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQSSQPTCTVGVWIDVGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEKEVESMGAHLN
:.:. :::::.:::.:::.:.:::::...::::.::::::.: :: :.:.::::::
XP_005 EDSGLSTCTVGLWIDAGSRYENEKNNGTAHFLEHMAFKGTKKRSQLDLELEIENMGAHLN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AYSTREHTAYYIKALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD
::..::.:.:: ::.:::::.:::.:.::.:: .: ...::.:: :::::::: ......
XP_005 AYTSREQTVYYAKAFSKDLPRAVEILADIIQNSTLGEAEIERERGVILREMQEVETNLQE
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VVFNYLHATAFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQ
:::.::::::.:.: :.... ::.::....:: ::..:..::::.::.:::::::: :..
XP_005 VVFDYLHATAYQNTALGRTILGPTENIKSISRKDLVDYITTHYKGPRIVLAAAGGVSHDE
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LLDLAQKHLGGIPWTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIRHRDDALPFAHVAIAVEGPGWASPDN
:::::. :.: :. . .:.: ::.::::::: ::: .:.::.:::::. ::: ::.
XP_005 LLDLAKFHFGDSLCTH-KGEIPALPPCKFTGSEIRVRDDKMPLAHLAIAVEAVGWAHPDT
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VALQVANAIIGHYDCTYGGGVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVCD
. :.:::..::..: ..:::..::: ::. . ..::.:::.:. :..::: : ..::.
XP_005 ICLMVANTLIGNWDRSFGGGMNLSSKLAQLTCHGNLCHSFQSFNTSYTDTGLWGLYMVCE
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIGRSLLTYG
. ::. :.: .:::::::.:::::::..:.:.. .. .:::.::.::::::..: :.
XP_005 SSTVADMLHVVQKEWMRLCTSVTESEVARARNLLKTNMLLQLDGSTPICEDIGRQMLCYN
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 RRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRSGMFWLRF
::::. : :.:: :.: ..::.:.::::.. ::.:. :
XP_005 RRIPIPELEARIDAVNAETIREVCTKYIYNRSPAIAAVGYNHRSELHEWKWNKLFSKRQT
440 450 460 470 480 490
XP_005 ISYSYVNILLPQPQPQYV
500
>>NP_055975 (OMIM: 213200,613036) mitochondrial-processi (525 aa)
initn: 374 init1: 183 opt: 415 Z-score: 504.2 bits: 102.8 E(85289): 2.4e-21
Smith-Waterman score: 597; 31.0% identity (60.6% similar) in 452 aa overlap (47-475:66-510)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 LLRARRSPALLRTPALRSTATFAQALQFVPETQVSLLDNGLRVASEQSSQPTCTVGVWID
::.:. :::::::::... ::::. :.
NP_055 GGAYPNIPLSSPLPGVPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILIN
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 VGSRFETEKNNGAGYFLEHLAFKGTKNRPGSALEK--EVESMGAHLNAYSTREHTAYYIK
:::.:.. .: ..:::.:::..: : : : .:. :. . ..:. : : ..
NP_055 SGSRYEAKYLSGIAHFLEKLAFSSTA-RFDSKDEILLTLEKHGGICDCQTSRDTTMYAVS
100 110 120 130 140 150
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 ALSKDLPKAVELLGDIVQNCSLEDSQIEKERDVILREMQENDASMRD----VVFNYLHAT
: :: : .: ::.:.: . : : ..: : .. :.. : ..: .. ...: .
NP_055 ADSKGLDTVVALLADVVLQPRLTDEEVEMTRMAVQFELE--DLNLRPDPEPLLTEMIHEA
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 AFQGTPLAQAVEGPSENVRKLSRADLTEYLSTHYKAPRMVLAAAGGVEHQQLLDLAQKHL
:.. . .. :.::: :..: : :: ..: :::::..: :::..:.: :.:.:
NP_055 AYRENTVGLHRFCPTENVAKINREVLHSYLRNYYTPDRMVLAGVG-VEHEHLVDCARKYL
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290
pF1KE1 GGI-P-WTYAEDAVPTLTPCRFTGSEIR-HRD--------DALP-FAHVAIAVEGPGWAS
:. : : :: . . ..::. . .:: .: ..:. ...:. ..
NP_055 LGVQPAWGSAEAVDIDRSVAQYTGGIAKLERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVGLESCSFLE
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PDNVALQVANAIIGHYDC-TYGG-GVHLSSPLASGAVANKLCQSFQTFSI--CYAETGLL
: . . : : ..: . :: : . : : . : :. ... : : .::::
NP_055 EDFIPFAVLNMMMGGGGSFSAGGPGKGMFSRLYLN-VLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLL
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 GAHFVCDRMKIDDMMFVLQGQWMRLCTSATESEVARGKNILRNALVSHLDGTTPVCEDIG
: : .. .:. .. ... . .. :. :.:. : . :. .:.. . ::.:
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420 430 440 450 460 470
pF1KE1 RSLL-TYGRRIPLAEWESRIAEVDASVVREICSKYIYDQCPAVAGYGPIEQLPDYNRIRS
:..: : .:..: : . : .: :... ::.. . ::::. : . .:: :..:..
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480
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..
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510 520
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:::.:.. .: ..:::.:::..: : : : .:. :. . ..:. : : ..
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:. : : :: . . ..::. . .:: .: ..:. ...:. ..
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: : .. .:. .. ... . .. :. :.:. : . :. .:.. . ::.:
XP_005 CIHASADPRQVREMVEIITKEFILMGGTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESRPVIFEDVG
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420 430 440 450 460 470
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:..: : .:..:
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.:: .. .:. .:..: .:::.: .: :. ..:. . ::. . . . .:..:
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..:.. .:::. :: .. : :. .:.: ... .. . :.. .. : ..
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. : . :.. :::.:.... ::. . :. . :.. .: ....:. . ::.
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.:...:. .: . :..: . ..: . :. . .: : . :::. : :.. :
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... :..: . :. : .: . ..: : . . . .:.. : ..:. : .
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. :
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450
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:: . . ..::. . .:: .: ..:. ...:. .. : . . :
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: ..: . :: : . : : . : :. ... : : .:::: : :
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.. .:. .. ... . .. :. :.:. : . :. .:.. . ::.::..: : .:
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. ...: .:.. . .. :.::: :..: : :: ..: :::::..: :::..:
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.:. .. : . . : : ..: . :: : . : : . : :. ... :
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240 250 260 270 280 290
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480 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Sun Nov 6 17:48:17 2016 done: Sun Nov 6 17:48:19 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]