Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1936
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1936, 475 aa
1>>>pF1KE1936 475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8013+/-0.000807; mu= 16.0428+/- 0.049
mean_var=94.4520+/-19.047, 0's: 0 Z-trim(109.5): 134 B-trim: 619 in 1/53
Lambda= 0.131968
statistics sampled from 10752 (10901) to 10752 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 3197 619.0 3.4e-177
CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 535) 728 149.0 1.2e-35
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 720 147.5 3.6e-35
CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 720 147.6 4.5e-35
CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 466) 696 142.8 7.2e-34
CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 ( 527) 696 142.9 7.9e-34
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 688 141.3 2.2e-33
CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 407) 660 135.9 7.5e-32
CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 523) 660 136.0 9.1e-32
CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 461) 658 135.6 1.1e-31
CCDS4608.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 ( 513) 658 135.6 1.2e-31
CCDS4614.1 BTN1A1 gene_id:696|Hs108|chr6 ( 526) 658 135.6 1.2e-31
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 657 135.4 1.3e-31
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 651 134.3 2.8e-31
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 651 134.3 3e-31
CCDS56403.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 ( 313) 643 132.6 5.8e-31
CCDS4460.2 BTNL9 gene_id:153579|Hs108|chr5 ( 535) 644 133.0 7.7e-31
CCDS1636.1 TRIM58 gene_id:25893|Hs108|chr1 ( 486) 628 129.9 5.9e-30
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 621 128.6 1.5e-29
CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 586 121.7 1e-27
CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 586 121.8 1.1e-27
CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 586 121.9 1.5e-27
CCDS76746.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 279) 581 120.8 1.9e-27
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 581 120.9 2.8e-27
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 581 120.9 2.8e-27
CCDS76745.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 263) 576 119.8 3.5e-27
CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 354) 527 110.6 2.8e-24
CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 527 110.7 3.6e-24
CCDS54959.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 316) 509 107.1 2.8e-23
CCDS54958.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 375) 509 107.2 3.2e-23
CCDS54957.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 384) 509 107.2 3.3e-23
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 510 107.4 3.3e-23
CCDS43413.1 BTNL8 gene_id:79908|Hs108|chr5 ( 500) 509 107.3 4e-23
CCDS47358.1 BTNL3 gene_id:10917|Hs108|chr5 ( 466) 503 106.1 8.3e-23
CCDS46201.1 RFPL4A gene_id:342931|Hs108|chr19 ( 287) 461 97.9 1.5e-20
CCDS4463.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 303) 459 97.6 2e-20
CCDS43414.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 329) 459 97.6 2.1e-20
CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 459 97.7 3e-20
CCDS59425.1 RFPL4AL1 gene_id:729974|Hs108|chr19 ( 287) 452 96.2 4.8e-20
CCDS13904.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 288) 450 95.8 6.3e-20
CCDS43011.1 RFPL3 gene_id:10738|Hs108|chr22 ( 317) 450 95.9 6.8e-20
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 450 96.0 9.4e-20
CCDS46694.1 RFPL2 gene_id:10739|Hs108|chr22 ( 317) 447 95.3 1e-19
CCDS43009.2 RFPL2 gene_id:10739|Hs108|chr22 ( 378) 447 95.4 1.1e-19
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 441 94.3 3e-19
CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 441 94.3 3e-19
CCDS13857.2 RFPL1 gene_id:5988|Hs108|chr22 ( 317) 424 90.9 2.1e-18
CCDS3850.2 TRIML2 gene_id:205860|Hs108|chr4 ( 437) 420 90.3 4.5e-18
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 410 88.4 1.8e-17
CCDS4677.1 TRIM15 gene_id:89870|Hs108|chr6 ( 465) 400 86.5 6.7e-17
>>CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 (475 aa)
initn: 3197 init1: 3197 opt: 3197 Z-score: 3294.8 bits: 619.0 E(32554): 3.4e-177
Smith-Waterman score: 3197; 99.8% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEMASSAGSWLSGCLIPLVFLRLSVYVSGHAGDAGKFHVALLGGTAELLCPLSLWPGTVP
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEMASSAGSWLSGCLIPLVFLRLSVHVSGHAGDAGKFHVALLGGTAELLCPLSLWPGTVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 KEVRWLRSPFPQRSQAVHIFRDGKDQDEDLMPEYKGRTVLVRDAQEGSVTLQILDVRLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEVRWLRSPFPQRSQAVHIFRDGKDQDEDLMPEYKGRTVLVRDAQEGSVTLQILDVRLED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVAAPSVGSLSPSAVALAVILPVLVLLIMVCLCLIWKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVAAPSVGSLSPSAVALAVILPVLVLLIMVCLCLIWKQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAKEKLLYEHVTEVDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RAKEKLLYEHVTEVDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TLDPDTAHPKLILSEDQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLDPDTAHPKLILSEDQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DKTKWILGVCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DKTKWILGVCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FLDYEAGVISFYNVTNKSHIFTFTHNFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLDYEAGVISFYNVTNKSHIFTFTHNFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE1 SIVPRPEGKGHANGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SIVPRPEGKGHANGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
430 440 450 460 470
>>CCDS4612.2 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 (535 aa)
initn: 700 init1: 303 opt: 728 Z-score: 753.6 bits: 149.0 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 739; 39.8% identity (64.8% similar) in 347 aa overlap (116-446:168-508)
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 QDEDLMPEYKGRTVLVRDAQEGSVTLQILDVRLEDQGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVAA
.: . :. :.:. . :. : :. ...:
CCDS46 SDTKGENIPAVEAPVVADGVGLYAVAASVIMRGSSGGGVSCIIRNSLLGLEKTASISIAD
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 PSVGSLSPSAVALAVILPVLVLLIMVCLCLIWKQRRAKEKLLYEHVTEVDNLLSDH---A
: : .: .::: ::. .::. ..:.:. :::. . :: . ... :
CCDS46 PFFRSAQPWIAALAGTLPISLLLLAGASYFLWRQQ--KEKIALSRETEREREMKEMGYAA
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 KEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAVTLDPDTAHPKLILSEDQRCVRL
:. . .:.. . ... : :. : .. . : ::::::. :..::::: :.
CCDS46 TEQEISLREWRKIQYMARGEKSLAYHEWKMALFKPADVILDPDTANAILLVSEDQRSVQR
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 GDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTKWILGVCSESVSRK-GKVT
... . .::::.::.. .:: : ::.: ::::: :::. .: .::::..: :: : :
CCDS46 AEEPRDLPDNPERFEWRYCVLGCENFTSGRHYWEVEVGDRKEWHIGVCSKNVERKKGWVK
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 ASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDYEAGVISFYNVTNKSHIF
.: ::.: . . ::.:.::: :.:...: :::: ::::::::.: :::::.:. :::.
CCDS46 MTPENGYWTMGLTDGNKYRALTEPRTNLKLPEPPRKVGIFLDYETGEISFYNATDGSHIY
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE1 TFTH-NFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVIC---SELHKSEE-SIVP-----RPEGKGH
:: : .:: :: : :. . :: :.:: .:...: . ..:: : :
CCDS46 TFPHASFSEPLYPVFRILTLE---PTA-LTICPIPKEVESSPDPDLVPDHSLETPLTPGL
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470
pF1KE1 AN--GDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
:: :. . .:.: :::
CCDS46 ANESGEPQAEVTSLLLPAHPGAEVSPSATTNQNHKLQARTEALY
500 510 520 530
>>CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 (584 aa)
initn: 700 init1: 303 opt: 720 Z-score: 744.8 bits: 147.5 E(32554): 3.6e-35
Smith-Waterman score: 734; 39.5% identity (64.4% similar) in 354 aa overlap (116-446:210-557)
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 QDEDLMPEYKGRTVLVRDAQEGSVTLQILDVRLEDQGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVAA
.: . :. :.:. . :. : :. ...:
CCDS46 SDTKGENIPAVEAPVVADGVGLYAVAASVIMRGSSGGGVSCIIRNSLLGLEKTASISIAD
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 PSVGSLSPSAVALAVILPVLVLLIMVCLCLIWKQRRAKEKLLYEHVTEVDNLLSDHAKEK
: : .: .::: ::. .::. ..:.:. :::. . :: . ... .
CCDS46 PFFRSAQPWIAALAGTLPISLLLLAGASYFLWRQQ--KEKIALSRETEREREMKEMGYAA
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250
pF1KE1 GKLHKAVK-KLRSELKLKR---------AAANSGWRRARLHFVAVTLDPDTAHPKLILSE
. . ... ::. ::: .. . : :. : .. . : ::::::. :..::
CCDS46 TEQEISLREKLQEELKWRKIQYMARGEKSLAYHEWKMALFKPADVILDPDTANAILLVSE
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 DQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTKWILGVCSESVS
::: :. ... . .::::.::.. .:: : ::.: ::::: :::. .: .::::..:
CCDS46 DQRSVQRAEEPRDLPDNPERFEWRYCVLGCENFTSGRHYWEVEVGDRKEWHIGVCSKNVE
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 RK-GKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDYEAGVISFYNV
:: : : .: ::.: . . ::.:.::: :.:...: :::: ::::::::.: :::::.
CCDS46 RKKGWVKMTPENGYWTMGLTDGNKYRALTEPRTNLKLPEPPRKVGIFLDYETGEISFYNA
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410 420
pF1KE1 TNKSHIFTFTH-NFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVIC---SELHKSEE-SIVP-----
:. :::.:: : .:: :: : :. . :: :.:: .:...: . ..::
CCDS46 TDGSHIYTFPHASFSEPLYPVFRILTLE---PTA-LTICPIPKEVESSPDPDLVPDHSLE
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470
pF1KE1 RPEGKGHAN--GDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
: : :: :. . .:.: :::
CCDS46 TPLTPGLANESGEPQAEVTSLLLPAHPGAEVSPSATTNQNHKLQARTEALY
540 550 560 570 580
>>CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 (781 aa)
initn: 711 init1: 584 opt: 720 Z-score: 743.1 bits: 147.6 E(32554): 4.5e-35
Smith-Waterman score: 720; 53.8% identity (76.9% similar) in 199 aa overlap (215-412:578-773)
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KLLYEHVTEVDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAVTLDP
::::... . : :. : : : ::
CCDS10 TTPQEIKQKIQLLHQKSEFVEKSTKYFSETLRSEMEMFNVPELIG---AQAHAVNVILDA
550 560 570 580 590 600
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 DTAHPKLILSEDQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTK
.::.:.::.:.: . ::::.. . .::.::::: . .::: : .: .:::: :::::
CCDS10 ETAYPNLIFSDDLKSVRLGNKWERLPDGPQRFDSCIIVLGSPSFLSGRRYWEVEVGDKTA
610 620 630 640 650 660
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 WILGVCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDY
::::.:. :.::::..: :: ::.:.. . . :::.: . : : . .::::. ::::.::
CCDS10 WILGACKTSISRKGNMTLSPENGYWVVIMMKENEYQASSVPPTRLLIKEPPKRVGIFVDY
670 680 690 700 710 720
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 EAGVISFYNVTNKSHIFTFTH-NFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEESIV
..: ::::::: .:::.::. .:::::.:.: : .:::::::::.::
CCDS10 RVGSISFYNVTARSHIYTFASCSFSGPLQPIFSPGTRDGGKNTAPLTICPVGGQGPD
730 740 750 760 770 780
430 440 450 460 470
pF1KE1 PRPEGKGHANGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
>>CCDS56405.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 (466 aa)
initn: 512 init1: 265 opt: 696 Z-score: 721.5 bits: 142.8 E(32554): 7.2e-34
Smith-Waterman score: 702; 34.2% identity (52.9% similar) in 465 aa overlap (62-428:2-454)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 GDAGKFHVALLGGTAELLCPLSLWPGTVPKEVRWLRSPFPQRSQAVHIFRDGKDQDEDLM
::::.:: : : :: ... :... :. :
CCDS56 MEVRWFRSQF---SPAVFVYKGGRERTEEQM
10 20
100 110 120 130 140
pF1KE1 PEYKGRTVLV-RDAQEGSVTLQILDVRLEDQGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVA------
::.:::..: .: ..:::.: : .. ...:.::: .: : : . : ::
CCDS56 EEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKP
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 ------------------------------------AP----------------------
::
CCDS56 LISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVII
90 100 110 120 130 140
150 160 170
pF1KE1 ---SVGSLS-----------------------PSAVALAVILPVLVLLIMV--CLCLIWK
:: ..: ::. :: ::..:...:. .:. :
CCDS56 RDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWI
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QRRAKEKLLYEHVTEVDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLK-RAAANSGWRRARLHF
.. ::: . : . . : . .:.: . . ::..: . . :::. ::
CCDS56 NKLQKEKKILSGEKEFERETREIALK--ELEKERVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHA
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VAVTLDPDTAHPKLILSEDQRCVRLGDRR---QPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHY
: :.:::::::: :.::::.: :: : . :::::.::: .:: : :..: ::
CCDS56 VDVVLDPDTAHPDLFLSEDRRSVRRCPFRHLGESVPDNPERFDSQPCVLGRESFASGKHY
270 280 290 300 310 320
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 WEVYVGDKTKWILGVCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEP
::: : . .: .::: .:: :::.: : :: : :.. .: .:.:..::. . :::
CCDS56 WEVEVENVIEWTVGVCRDSVERKGEVLLIPQNGFWTLEMHKG-QYRAVSSPDRILPLKES
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PRCVGIFLDYEAGVISFYNVTNKSHIFTFTHN-FSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICS
::.::::::: .::::. ..:::.: .. :: :.::::. : . .:. ::
CCDS56 LCRVGVFLDYEAGDVSFYNMRDRSHIYTCPRSAFSVPVRPFFRL-----GCEDSPIFICP
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ELHKSEESIVPRPEGKGHANGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAP
: .. ::. ::
CCDS56 ALTGANGVTVPE-EGLTLHRVGTHQSL
450 460
>>CCDS4613.1 BTN2A1 gene_id:11120|Hs108|chr6 (527 aa)
initn: 512 init1: 265 opt: 696 Z-score: 720.8 bits: 142.9 E(32554): 7.9e-34
Smith-Waterman score: 702; 34.2% identity (52.9% similar) in 465 aa overlap (62-428:63-515)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 GDAGKFHVALLGGTAELLCPLSLWPGTVPKEVRWLRSPFPQRSQAVHIFRDGKDQDEDLM
::::.:: : : :: ... :... :. :
CCDS46 VGPTDPILATVGENTTLRCHLSPEKNAEDMEVRWFRSQF---SPAVFVYKGGRERTEEQM
40 50 60 70 80
100 110 120 130 140
pF1KE1 PEYKGRTVLV-RDAQEGSVTLQILDVRLEDQGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVA------
::.:::..: .: ..:::.: : .. ...:.::: .: : : . : ::
CCDS46 EEYRGRTTFVSKDISRGSVALVIHNITAQENGTYRCYFQEGRSYDEAILHLVVAGLGSKP
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 ------------------------------------AP----------------------
::
CCDS46 LISMRGHEDGGIRLECISRGWYPKPLTVWRDPYGGVAPALKEVSMPDADGLFMVTTAVII
150 160 170 180 190 200
150 160 170
pF1KE1 ---SVGSLS-----------------------PSAVALAVILPVLVLLIMV--CLCLIWK
:: ..: ::. :: ::..:...:. .:. :
CCDS46 RDKSVRNMSCSINNTLLGQKKESVIFIPESFMPSVSPCAVALPIIVVILMIPIAVCIYWI
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QRRAKEKLLYEHVTEVDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLK-RAAANSGWRRARLHF
.. ::: . : . . : . .:.: . . ::..: . . :::. ::
CCDS46 NKLQKEKKILSGEKEFERETREIALK--ELEKERVQKEEELQVKEKLQEELRWRRTFLHA
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VAVTLDPDTAHPKLILSEDQRCVRLGDRR---QPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHY
: :.:::::::: :.::::.: :: : . :::::.::: .:: : :..: ::
CCDS46 VDVVLDPDTAHPDLFLSEDRRSVRRCPFRHLGESVPDNPERFDSQPCVLGRESFASGKHY
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 WEVYVGDKTKWILGVCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEP
::: : . .: .::: .:: :::.: : :: : :.. .: .:.:..::. . :::
CCDS46 WEVEVENVIEWTVGVCRDSVERKGEVLLIPQNGFWTLEMHKG-QYRAVSSPDRILPLKES
390 400 410 420 430 440
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 PRCVGIFLDYEAGVISFYNVTNKSHIFTFTHN-FSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICS
::.::::::: .::::. ..:::.: .. :: :.::::. : . .:. ::
CCDS46 LCRVGVFLDYEAGDVSFYNMRDRSHIYTCPRSAFSVPVRPFFRL-----GCEDSPIFICP
450 460 470 480 490 500
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ELHKSEESIVPRPEGKGHANGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAP
: .. ::. ::
CCDS46 ALTGANGVTVPE-EGLTLHRVGTHQSL
510 520
>>CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 656 init1: 633 opt: 688 Z-score: 712.7 bits: 141.3 E(32554): 2.2e-33
Smith-Waterman score: 688; 55.7% identity (77.6% similar) in 183 aa overlap (231-412:309-490)
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 HAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAVTLDPDTAHPKLILSEDQRCV
:.:.:. : ::::::::.:.::::.. : :
CCDS46 IFAQKCLFLTESLKQFTEKMQSDMEKIQELREAQLYSVDVTLDPDTAYPSLILSDNLRQV
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 RLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTKWILGVCSESVSRKGKV
: . .: .::::.::.. .::: : .: ::::: ::::.:: .::: .:: ::: :
CCDS46 RYSYLQQDLPDNPERFNLFPCVLGSPCFIAGRHYWEVEVGDKAKWTIGVCEDSVCRKGGV
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 TASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDYEAGVISFYNVTNKSHI
:..: :: : . :.:: :::::.:.. :. : . :::::::.:: .::::::.. :
CCDS46 TSAPQNGFWAVSLWYGKEYWALTSPMTALPLRTPLQRVGIFLDYDAGEVSFYNVTERCHT
400 410 420 430 440 450
390 400 410 420 430
pF1KE1 FTFTH-NFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEESIVPRPEGKGHANGDVSLK
:::.: .: ::.::.: ..:::..:::.::
CCDS46 FTFSHATFCGPVRPYFS-LSYSGGKSAAPLIICPMSGIDGFSGHVGNHGHSMETSP
460 470 480 490 500 510
440 450 460 470
pF1KE1 VNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
>>CCDS4607.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 (407 aa)
initn: 679 init1: 403 opt: 660 Z-score: 685.3 bits: 135.9 E(32554): 7.5e-32
Smith-Waterman score: 724; 34.8% identity (59.7% similar) in 422 aa overlap (15-434:18-402)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEMASSAGSWLSGCLIPLVFLRLSVYVSGHAGDAGKFHV-ALLGGTAELLCPLSLWP
:. :..: : . ::: :. ... : :. : : . :
CCDS46 MEPAAALHFSLPASLLLLLLLLLLSLCALVSG-LGSKPLIEIKAQEDGSIWLECISGGW-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GTVPKEVRWLRSPFPQRSQAVHIFRDGKDQDEDLMPEYKGRTVLVRDAQEGSVTLQILDV
:. . :.:. ...: ... . : : . . .:..:: .:. .. ..
CCDS46 --YPEPLTVWRDPY---GEVVPALKEVSIADADGL-FMVTTAVIIRDKYVRNVSCSVNNT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 RLEDQGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVAAPSVGSLSPSAVALAVILPVLVLLIMVCLCLI
: .. .: . . . . .. .:. . . :: :...::: :..... : .: :
CCDS46 LLGQEKETVIFIPESFMPSASPWMVALAV--ILTASPWMVSMTVILAVFIIFMAVSICCI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 WKQRRAKEKLLYEHVTEVDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLH
: .: :. .:: . : . . .. ...:. ::. :::. ::
CCDS46 KKLQREKK------------ILSGEKKVEQEEKEIAQQLQEELR---------WRRTFLH
180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 FVAVTLDPDTAHPKLILSEDQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWE
. :.::::::::.:.::::.: :: : :: :::::.::: .:: : :..: ::::
CCDS46 AADVVLDPDTAHPELFLSEDRRSVRRGPYRQRVPDNPERFDSQPCVLGWESFASGKHYWE
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VYVGDKTKWILGVCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPR
: : . : .::: .:: :::.: : :: : : . ::.:.::.::. . :::
CCDS46 VEVENVMVWTVGVCRHSVERKGEVLLIPQNGFWTL-EMFGNQYRALSSPERILPLKESLC
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 CVGIFLDYEAGVISFYNVTNKSHIFTFTHN-FSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSEL
::.::::::: .::::. ..:::.: .. :. :.::::. :.. .:. :: :
CCDS46 RVGVFLDYEAGDVSFYNMRDRSHIYTCPRSAFTVPVRPFFRL-----GSDDSPIFICPAL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 HKSEESIVPRPEGKGHANGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
. .::. : : :
CCDS46 TGASGVMVPEEGLKLHRVGTHQSL
390 400
>>CCDS4606.1 BTN2A2 gene_id:10385|Hs108|chr6 (523 aa)
initn: 796 init1: 403 opt: 660 Z-score: 683.8 bits: 136.0 E(32554): 9.1e-32
Smith-Waterman score: 710; 35.2% identity (59.9% similar) in 392 aa overlap (44-434:163-518)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 CLIPLVFLRLSVYVSGHAGDAGKFHVALLGGTAELLCPLSLWPGTVPKEVRWLRSPFPQR
:. : : . : :. . :.:.
CCDS46 EGRSYDEAILRLVVAGLGSKPLIEIKAQEDGSIWLECISGGW---YPEPLTVWRDPY---
140 150 160 170 180
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 SQAVHIFRDGKDQDEDLMPEYKGRTVLVRDAQEGSVTLQILDVRLEDQGSYRCLIQVGNL
...: ... . : : . . .:..:: .:. .. .. : .. .: . .
CCDS46 GEVVPALKEVSIADADGL-FMVTTAVIIRDKYVRNVSCSVNNTLLGQEKETVIFIPESFM
190 200 210 220 230 240
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 SKEDTVILQVAAPSVGSLSPSAVALAVILPVLVLLIMVCLCLIWKQRRAKEKLLYEHVTE
. . .. .:. . . :: :...::: :..... : .: : : .: :.
CCDS46 PSASPWMVALAV--ILTASPWMVSMTVILAVFIIFMAVSICCIKKLQREKK---------
250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 VDNLLSDHAKEKGKLHKAVKKLRSELKLKRAAANSGWRRARLHFVAVTLDPDTAHPKLIL
.:: . : . . .. ...:. ::. :::. :: . :.::::::::.:.:
CCDS46 ---ILSGEKKVEQEEKEIAQQLQEELR---------WRRTFLHAADVVLDPDTAHPELFL
300 310 320 330 340
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 SEDQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTKWILGVCSES
:::.: :: : :: :::::.::: .:: : :..: ::::: : . : .::: .:
CCDS46 SEDRRSVRRGPYRQRVPDNPERFDSQPCVLGWESFASGKHYWEVEVENVMVWTVGVCRHS
350 360 370 380 390 400
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 VSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDYEAGVISFYN
: :::.: : :: : : . ::.:.::.::. . ::: ::.::::::: .::::
CCDS46 VERKGEVLLIPQNGFWTL-EMFGNQYRALSSPERILPLKESLCRVGVFLDYEAGDVSFYN
410 420 430 440 450 460
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 VTNKSHIFTFTHN-FSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEESIVPRPEGKGHA
. ..:::.: .. :. :.::::. :.. .:. :: : . .::. : :
CCDS46 MRDRSHIYTCPRSAFTVPVRPFFRL-----GSDDSPIFICPALTGASGVMVPEEGLKLHR
470 480 490 500 510
440 450 460 470
pF1KE1 NGDVSLKVNSSLLPPKAPELKDIILSLPPDLGPALQELKAPSF
:
CCDS46 VGTHQSL
520
>>CCDS47388.1 BTN3A1 gene_id:11119|Hs108|chr6 (461 aa)
initn: 669 init1: 547 opt: 658 Z-score: 682.5 bits: 135.6 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 733; 35.4% identity (59.6% similar) in 418 aa overlap (32-395:35-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 EMASSAGSWLSGCLIPLVFLRLSVYVSGHAGDAGKFHVALLGGTAELLCPLSLWPGTVPK
: .: . .:..: :.: : : ..
CCDS47 SFLAFLLLNFRVCLLLLQLLMPHSAQFSVLGPSGPI-LAMVGEDADLPCHLFPTMSAETM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EVRWLRSPFPQRSQAVHIFRDGKDQDEDLMPEYKGRTVLVRDA-QEGSVTLQILDVRLED
:..:. : . :.:... :::. .. :.::: ..::. :...:.: .: :
CCDS47 ELKWVSSSL---RQVVNVYADGKEVEDRQSAPYRGRTSILRDGITAGKAALRIHNVTASD
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KE1 QGSYRCLIQVGNLSKEDTVILQVA--------APSV---GS---------------LSPS
.:.: : .: :.. .. : :.:: : :: :: : .
CCDS47 SGKYLCYFQDGDFYEKALVELKVADGVGLYAVAASVIMRGSSGEGVSCTIRSSLLGLEKT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KE1 A----------------VALAVILPVLVLLIMVCLCLIWKQRRAKEKLLYEHVTEVDNLL
: .::: ::::.::. ..:.:.. :. . .. : . :
CCDS47 ASISIADPFFRSAQRWIAALAGTLPVLLLLLGGAGYFLWQQQEEKKTQFRKKKREQE--L
190 200 210 220 230
200 210 220 230 240
pF1KE1 SDHAKEKGKLHKAVK-KLRSELKLK---------RAAANSGWRRARLHFVAVTLDPDTAH
. : : ..... :: ::. . : .: . :..: .. . : ::: ::.
CCDS47 REMAWSTMKQEQSTRVKLLEELRWRSIQYASRGERHSAYNEWKKALFKPADVILDPKTAN
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PKLILSEDQRCVRLGDRRQPVPDNPQRFDFVVSILGSEYFTTGCHYWEVYVGDKTKWILG
: :..::::: :. . . : .::::.::.. .:: : : .: ::::: :::. .: .:
CCDS47 PILLVSEDQRSVQRAKEPQDLPDNPERFNWHYCVLGCESFISGRHYWEVEVGDRKEWHIG
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VCSESVSRKGKVTASPANGHWLLRQSRGNEYEALTSPQTSFRLKEPPRCVGIFLDYEAGV
:::..:.::: : .: :: : . . ::.:..:: :.:...: .::. ::.:::::.:
CCDS47 VCSKNVQRKGWVKMTPENGFWTMGLTDGNKYRTLTEPRTNLKLPKPPKKVGVFLDYETGD
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 ISFYNVTNKSHIFTFTH-NFSGPLRPFFEPCLHDGGKNTAPLVICSELHKSEESIVPRPE
:::::... ::: :: .:: : : :
CCDS47 ISFYNAVDGSHIHTFLDVSFSEALYPVFRILTLEPTALTICPA
420 430 440 450 460
475 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 19:20:58 2016 done: Sun Nov 6 19:20:59 2016
Total Scan time: 3.460 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]