Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1916
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1916, 453 aa
1>>>pF1KE1916 453 - 453 aa - 453 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7353+/-0.000841; mu= 15.2837+/- 0.051
mean_var=67.1294+/-13.593, 0's: 0 Z-trim(106.0): 26 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.156537
statistics sampled from 8734 (8755) to 8734 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 2.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73224.1 PPP2R2D gene_id:55844|Hs108|chr10 ( 453) 3066 701.4 4.8e-202
CCDS34867.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 ( 447) 2739 627.6 8e-180
CCDS55213.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 ( 457) 2728 625.1 4.6e-179
CCDS64282.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 449) 2646 606.6 1.7e-173
CCDS4283.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 446) 2573 590.1 1.5e-168
CCDS64281.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 501) 2573 590.1 1.7e-168
CCDS4284.2 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 509) 2573 590.1 1.7e-168
CCDS43380.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 ( 432) 2569 589.2 2.8e-168
CCDS3387.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 447) 2515 577.0 1.4e-164
CCDS56304.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 430) 2504 574.5 7.3e-164
CCDS56305.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 440) 2504 574.5 7.5e-164
CCDS3388.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 ( 447) 2504 574.5 7.6e-164
>>CCDS73224.1 PPP2R2D gene_id:55844|Hs108|chr10 (453 aa)
initn: 3066 init1: 3066 opt: 3066 Z-score: 3740.9 bits: 701.4 E(32554): 4.8e-202
Smith-Waterman score: 3066; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 FQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 FNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
430 440 450
>>CCDS34867.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 (447 aa)
initn: 2814 init1: 2728 opt: 2739 Z-score: 3341.9 bits: 627.6 E(32554): 8e-180
Smith-Waterman score: 2739; 87.9% identity (96.9% similar) in 453 aa overlap (1-453:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVI
::::::: ::.::::::::::.:.::::::::::::::.::.:::::::::::::
CCDS34 MAGAGGG------NDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGGRVVI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 FQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLST
::.::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::
CCDS34 FQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQFLLST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFAN
:::::::::::::::: ::::::.:::: ::: .:.::::...::::::::::::::::
CCDS34 NDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRRIFAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFS
::..::.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::::::::
CCDS34 HPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
:::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLD
:..::::::::::::::.:.::.:::::::..:::. :::::::..:::.::::::::::
CCDS34 SVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISVDSLD
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KE1 FNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::::::::::: .:.::::.::::::::::.:
CCDS34 FNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
420 430 440
>>CCDS55213.1 PPP2R2A gene_id:5520|Hs108|chr8 (457 aa)
initn: 2802 init1: 2728 opt: 2728 Z-score: 3328.3 bits: 625.1 E(32554): 4.6e-179
Smith-Waterman score: 2728; 88.9% identity (98.2% similar) in 442 aa overlap (12-453:16-457)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGG
::::.::::::::::.:.::::::::::::::.::.:::::::::
CCDS55 MFPKFSLRSMFHGAGGGNDIQWCFSQVKGAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDKGG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 RVVIFQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHF
::::::.::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:
CCDS55 RVVIFQQEQENKIQSHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQKNAAQF
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LLSTNDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRR
:::::::::::::::::::: ::::::.:::: ::: .:.::::...::::::::::::
CCDS55 LLSTNDKTIKLWKISERDKRPEGYNLKEEDGRYRDPTTVTTLRVPVFRPMDLMVEASPRR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IFANAHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVIT
::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IFANAHTYHINSISINSDYETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVIT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 AAEFHPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISD
::::::..::.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::::
CCDS55 AAEFHPNSCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSISD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VKFSHSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCW
:::::::::::::::::::.::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKFSHSGRYMMTRDYLSVKIWDLNMENRPVETYQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCW
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 NGSDSAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISV
:::::..::::::::::::::.:.::.:::::::..:::. :::::::..:::.::::::
CCDS55 NGSDSVVMTGSYNNFFRMFDRNTKRDITLEASRENNKPRTVLKPRKVCASGKRKKDEISV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE1 DSLDFNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::::::::::::::: .:.::::.::::::::::.:
CCDS55 DSLDFNKKILHTAWHPKENIIAVATTNNLYIFQDKVN
430 440 450
>>CCDS64282.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (449 aa)
initn: 2669 init1: 2642 opt: 2646 Z-score: 3228.3 bits: 606.6 E(32554): 1.7e-173
Smith-Waterman score: 2646; 87.0% identity (97.3% similar) in 439 aa overlap (15-453:11-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVI
: ::::::::.:. ..:::::::::::..:.:::::::::::::
CCDS64 MIPGIGTLTQDTLWCFSQVKGTIEIGTTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 FQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLST
::::::.:.. : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS64 FQREQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFAN
::::.::::.:::::: ::::::::.:::::: ::.::::.:.::::::::.:::.:::
CCDS64 NDKTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
::::::::::::::.:::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AHTYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFS
:::.::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS64 HPHHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
:::::.::::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: :::::
CCDS64 HSGRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLD
:.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::: :::::::.:::::::::::::::
CCDS64 SVIMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLD
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KE1 FNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:.:::::::::: .:.:::::::::::::::.:
CCDS64 FSKKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
420 430 440
>>CCDS4283.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (446 aa)
initn: 2600 init1: 2573 opt: 2573 Z-score: 3139.3 bits: 590.1 E(32554): 1.5e-168
Smith-Waterman score: 2573; 88.4% identity (98.1% similar) in 421 aa overlap (33-453:26-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 GAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVIFQ
:::::::::::..:.:::::::::::::::
CCDS42 MKCFSRYLPYIFRPPNTILSSSCHTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 REQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLSTND
::::.:.. : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS42 REQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTND
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFANAH
::.::::.:::::: ::::::::.:::::: ::.::::.:.::::::::.:::.:::::
CCDS42 KTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
::::::::::::.:::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFSHS
:.::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS42 HHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSA
:::.::::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS42 GRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 IMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLDFN
:::::::::::::::.:.::::::::::.::::: :::::::.::::::::::::::::.
CCDS42 IMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFS
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KE1 KKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::::::::: .:.:::::::::::::::.:
CCDS42 KKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
420 430 440
>>CCDS64281.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (501 aa)
initn: 2600 init1: 2573 opt: 2573 Z-score: 3138.5 bits: 590.1 E(32554): 1.7e-168
Smith-Waterman score: 2573; 88.4% identity (98.1% similar) in 421 aa overlap (33-453:81-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 GAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVIFQ
:::::::::::..:.:::::::::::::::
CCDS64 PTQVSLLSMEEDIDTRKINNSFLRDHSYATEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQ
60 70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 REQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLSTND
::::.:.. : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS64 REQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTND
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFANAH
::.::::.:::::: ::::::::.:::::: ::.::::.:.::::::::.:::.:::::
CCDS64 KTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAH
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
::::::::::::.:::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFSHS
:.::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS64 HHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSA
:::.::::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS64 GRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSV
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 IMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLDFN
:::::::::::::::.:.::::::::::.::::: :::::::.::::::::::::::::.
CCDS64 IMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFS
420 430 440 450 460 470
430 440 450
pF1KE1 KKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::::::::: .:.:::::::::::::::.:
CCDS64 KKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
480 490 500
>>CCDS4284.2 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (509 aa)
initn: 2600 init1: 2573 opt: 2573 Z-score: 3138.3 bits: 590.1 E(32554): 1.7e-168
Smith-Waterman score: 2573; 88.4% identity (98.1% similar) in 421 aa overlap (33-453:89-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 GAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVIFQ
:::::::::::..:.:::::::::::::::
CCDS42 PTQVSLLSMEEDIDTRKINNSFLRDHSYATEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQ
60 70 80 90 100 110
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 REQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLSTND
::::.:.. : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS42 REQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLLSTND
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 KTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFANAH
::.::::.:::::: ::::::::.:::::: ::.::::.:.::::::::.:::.:::::
CCDS42 KTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVFANAH
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
::::::::::::.:::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHP
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFSHS
:.::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS42 HHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVKFSHS
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSA
:::.::::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.
CCDS42 GRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNGSDSV
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 IMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLDFN
:::::::::::::::.:.::::::::::.::::: :::::::.::::::::::::::::.
CCDS42 IMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDSLDFS
420 430 440 450 460 470
430 440 450
pF1KE1 KKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::::::::: .:.:::::::::::::::.:
CCDS42 KKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
480 490 500
>>CCDS43380.1 PPP2R2B gene_id:5521|Hs108|chr5 (432 aa)
initn: 2594 init1: 2567 opt: 2569 Z-score: 3134.6 bits: 589.2 E(32554): 2.8e-168
Smith-Waterman score: 2569; 87.1% identity (97.4% similar) in 428 aa overlap (28-453:5-432)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDV--AEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRV
::.. .::::::::::..:.:::::::::::
CCDS43 MNYPDENTYGNKADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRV
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 VIFQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLL
::::::::.:.. : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS43 VIFQREQESKNQVHRRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAYFLL
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 STNDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIF
::::::.::::.:::::: ::::::::.:::::: ::.::::.:.::::::::.:::.:
CCDS43 STNDKTVKLWKVSERDKRPEGYNLKDEEGRLRDPATITTLRVPVLRPMDLMVEATPRRVF
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 ANAHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAA
::::::::::::::::.:::.::::::::::..:::..::::::::::::::::::::::
CCDS43 ANAHTYHINSISVNSDYETYMSADDLRINLWNFEITNQSFNIVDIKPANMEELTEVITAA
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EFHPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVK
:::::.::.::::::::::::::::.:::::::.::::::::::.:::::::::::::::
CCDS43 EFHPHHCNTFVYSSSKGTIRLCDMRASALCDRHTKFFEEPEDPSNRSFFSEIISSISDVK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FSHSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNG
:::::::.::::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: :::
CCDS43 FSHSGRYIMTRDYLTVKVWDLNMENRPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECVWNG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 SDSAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDS
:::.:::::::::::::::.:.::::::::::.::::: :::::::.:::::::::::::
CCDS43 SDSVIMTGSYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRENSKPRAILKPRKVCVGGKRRKDEISVDS
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450
pF1KE1 LDFNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::.:::::::::: .:.:::::::::::::::.:
CCDS43 LDFSKKILHTAWHPSENIIAVAATNNLYIFQDKVN
400 410 420 430
>>CCDS3387.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 (447 aa)
initn: 2582 init1: 2510 opt: 2515 Z-score: 3068.5 bits: 577.0 E(32554): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 2515; 85.1% identity (97.4% similar) in 423 aa overlap (31-453:21-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAGAGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVI
:.:::::::::::..:.:::::::::::::
CCDS33 MGEDTDTRKINHSFLRDHSYVTEADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 FQREQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLST
:::: :.:. :::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::: ::::
CCDS33 FQREPESKNAPHSQGEYDVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIKWLPQQNAAHSLLST
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NDKTIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFAN
::::::::::.::::: ::::::::.:.:.: .:.:.::.:::::::::.::::::::
CCDS33 NDKTIKLWKITERDKRPEGYNLKDEEGKLKDLSTVTSLQVPVLKPMDLMVEVSPRRIFAN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AHTYHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEF
.::::::::::::: :::.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::.::
CCDS33 GHTYHINSISVNSDCETYMSADDLRINLWHLAITDRSFNIVDIKPANMEDLTEVITASEF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HPHQCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFS
:::.::.::::::::..::::::..::::.:::.::::::::.::::::::::.::::::
CCDS33 HPHHCNLFVYSSSKGSLRLCDMRAAALCDKHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSVSDVKFS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HSGRYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSD
::::::.:::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: :::::
CCDS33 HSGRYMLTRDYLTVKVWDLNMEARPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECAWNGSD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SAIMTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLD
:.::::.::::::::::.:.:::::::::::::::: ::::.::.:::::.:.:::::::
CCDS33 SVIMTGAYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRESSKPRAVLKPRRVCVGGKRRRDDISVDSLD
360 370 380 390 400 410
430 440 450
pF1KE1 FNKKILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:.::::::::::..:.::.::::::::::::.:
CCDS33 FTKKILHTAWHPAENIIAIAATNNLYIFQDKVNSDMH
420 430 440
>>CCDS56304.1 PPP2R2C gene_id:5522|Hs108|chr4 (430 aa)
initn: 2576 init1: 2504 opt: 2504 Z-score: 3055.3 bits: 574.5 E(32554): 7.3e-164
Smith-Waterman score: 2504; 85.2% identity (97.4% similar) in 420 aa overlap (34-453:7-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 AGGGGCPAGGNDFQWCFSQVKGAIDEDVAEADIISTVEFNYSGDLLATGDKGGRVVIFQR
::::::::::..:.::::::::::::::::
CCDS56 MGKRDTADIISTVEFNHTGELLATGDKGGRVVIFQR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQENKSRPHSRGEYNVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIRWLPQQNAAHFLLSTNDK
: :.:. :::.:::.:::::::::::::::::::::::::::.::::::::: :::::::
CCDS56 EPESKNAPHSQGEYDVYSTFQSHEPEFDYLKSLEIEEKINKIKWLPQQNAAHSLLSTNDK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TIKLWKISERDKRAEGYNLKDEDGRLRDPFRITALRVPILKPMDLMVEASPRRIFANAHT
:::::::.::::: ::::::::.:.:.: .:.:.::.:::::::::.::::::::.::
CCDS56 TIKLWKITERDKRPEGYNLKDEEGKLKDLSTVTSLQVPVLKPMDLMVEVSPRRIFANGHT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 YHINSISVNSDHETYLSADDLRINLWHLEITDRSFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPH
::::::::::: :::.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::.:::::
CCDS56 YHINSISVNSDCETYMSADDLRINLWHLAITDRSFNIVDIKPANMEDLTEVITASEFHPH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 QCNVFVYSSSKGTIRLCDMRSSALCDRHSKFFEEPEDPSSRSFFSEIISSISDVKFSHSG
.::.::::::::..::::::..::::.:::.::::::::.::::::::::.:::::::::
CCDS56 HCNLFVYSSSKGSLRLCDMRAAALCDKHSKLFEEPEDPSNRSFFSEIISSVSDVKFSHSG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RYMMTRDYLSVKVWDLNMESRPVETHQVHEYLRSKLCSLYENDCIFDKFECCWNGSDSAI
:::.:::::.:::::::::.::.::.:::.::::::::::::::::::::: ::::::.:
CCDS56 RYMLTRDYLTVKVWDLNMEARPIETYQVHDYLRSKLCSLYENDCIFDKFECAWNGSDSVI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 MTGSYNNFFRMFDRDTRRDVTLEASRESSKPRASLKPRKVCTGGKRRKDEISVDSLDFNK
:::.::::::::::.:.:::::::::::::::: ::::.::.:::::.:.::::::::.:
CCDS56 MTGAYNNFFRMFDRNTKRDVTLEASRESSKPRAVLKPRRVCVGGKRRRDDISVDSLDFTK
340 350 360 370 380 390
430 440 450
pF1KE1 KILHTAWHPVDNVIAVAATNNLYIFQDKIN
:::::::::..:.::.::::::::::::.:
CCDS56 KILHTAWHPAENIIAIAATNNLYIFQDKVNSDMH
400 410 420 430
453 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:18:51 2016 done: Sun Nov 6 21:18:51 2016
Total Scan time: 2.840 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]