Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1909
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1909, 444 aa
1>>>pF1KE1909 444 - 444 aa - 444 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9156+/-0.000416; mu= 20.4202+/- 0.026
mean_var=75.5066+/-14.887, 0's: 0 Z-trim(111.3): 20 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.147598
statistics sampled from 19797 (19809) to 19797 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 8.060
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004170 (OMIM: 191060) tryptophan 5-hydroxylase ( 444) 2976 643.5 3.2e-184
NP_775489 (OMIM: 607478,608516,613003) tryptophan ( 490) 2243 487.5 3.4e-137
NP_000268 (OMIM: 261600,612349) phenylalanine-4-hy ( 452) 1626 356.0 1.1e-97
NP_000351 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxy ( 497) 1422 312.6 1.4e-84
XP_011518637 (OMIM: 191290,605407) PREDICTED: tyro ( 501) 1422 312.6 1.5e-84
NP_954987 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxy ( 524) 1422 312.7 1.5e-84
NP_954986 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxy ( 528) 1422 312.7 1.5e-84
XP_016874859 (OMIM: 261600,612349) PREDICTED: phen ( 240) 772 173.9 3.9e-43
>>NP_004170 (OMIM: 191060) tryptophan 5-hydroxylase 1 [H (444 aa)
initn: 2976 init1: 2976 opt: 2976 Z-score: 3428.2 bits: 643.5 E(85289): 3.2e-184
Smith-Waterman score: 2976; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (1-444:1-444)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRASLIFSLKNEVGGLIKALKIFQEKHVNLLHIESRKSKRRNSEF
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NP_004 MIEDNKENKDHSLERGRASLIFSLKNEVGGLIKALKIFQEKHVNLLHIESRKSKRRNSEF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTLKEDGMETVPWFPKKISDLDHCAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTLKEDGMETVPWFPKKISDLDHCAN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHVPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHVPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELKHALSGHAKVKPFDPKITC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELKHALSGHAKVKPFDPKITC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPFGVKYNPYTRSIQILKDTKSITSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPFGVKYNPYTRSIQILKDTKSITSA
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE1 MNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI
::::::::::::::::::::::::
NP_004 MNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI
430 440
>>NP_775489 (OMIM: 607478,608516,613003) tryptophan 5-hy (490 aa)
initn: 2213 init1: 2213 opt: 2243 Z-score: 2584.1 bits: 487.5 E(85289): 3.4e-137
Smith-Waterman score: 2243; 71.7% identity (92.5% similar) in 442 aa overlap (4-440:45-486)
10 20
pF1KE1 MIEDNKENKDHS-----LERGRASLIFSLKNEV
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NP_775 RRGFSLDSAVPEEHQLLGSSTLNKPNSGKNDDKGNKGSSKREAATESGKTAVVFSLKNEV
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 GGLIKALKIFQEKHVNLLHIESRKSKRRNSEFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLS
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NP_775 GGLVKALRLFQEKRVNMVHIESRKSRRRSSEVEIFVDCECGKTEFNELIQLLKFQTTIVT
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 VNLPDNFTLKEDGMETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYF
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NP_775 LNPPENIWTEEEELEDVPWFPRKISELDKCSHRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRQRRKYF
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 ADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYRE
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NP_775 VDVAMGYKYGQPIPRVEYTEEETKTWGVVFRELSKLYPTHACREYLKNFPLLTKYCGYRE
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 DNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEP
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NP_775 DNVPQLEDVSMFLKERSGFTVRPVAGYLSPRDFLAGLAYRVFHCTQYIRHGSDPLYTPEP
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 DTCHELLGHVPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLR
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NP_775 DTCHELLGHVPLLADPKFAQFSQEIGLASLGASDEDVQKLATCYFFTIEFGLCKQEGQLR
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 VFGAGLLSSISELKHALSGHAKVKPFDPKITCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMRE
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NP_775 AYGAGLLSSIGELKHALSDKACVKAFDPKTTCLQECLITTFQEAYFVSESFEEAKEKMRD
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 FTKTIKRPFGVKYNPYTRSIQILKDTKSITSAMNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI
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NP_775 FAKSITRPFSVYFNPYTQSIEILKDTRSIENVVQDLRSDLNTVCDALNKMNQYLGI
440 450 460 470 480 490
>>NP_000268 (OMIM: 261600,612349) phenylalanine-4-hydrox (452 aa)
initn: 1622 init1: 1458 opt: 1626 Z-score: 1874.5 bits: 356.0 E(85289): 1.1e-97
Smith-Waterman score: 1626; 55.9% identity (80.3% similar) in 431 aa overlap (9-438:26-451)
10 20 30 40
pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRASLIFSLKNEVGGLIKALKIFQEKHV
.:. . : :::::::.:::.: :.:..:.:. :
NP_000 MSTAVLENPGLGRKLSDFGQETSYIEDNCNQNGAISLIFSLKEEVGALAKVLRLFEENDV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 NLLHIESRKSKRRNSEFEIFVDCDINR-EQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTLKEDGM
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NP_000 NLTHIESRPSRLKKDEYEFFTHLDKRSLPALTNIIKILRHDIGATVHELS-----RDKKK
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 ETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIP
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NP_000 DTVPWFPRTIQELDRFANQILSYGAELDADHPGFKDPVYRARRKQFADIAYNYRHGQPIP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLK
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NP_000 RVEYMEEEKKTWGTVFKTLKSLYKTHACYEYNHIFPLLEKYCGFHEDNIPQLEDVSQFLQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 ERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHVPLLA
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NP_000 TCTGFRLRPVAGLLSSRDFLGGLAFRVFHCTQYIRHGSKPMYTPEPDICHELLGHVPLFS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 EPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELK
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NP_000 DRSFAQFSQEIGLASLGAPDEYIEKLATIYWFTVEFGLCKQGDSIKAYGAGLLSSFGELQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 HALSGHAKVKPFDPKITCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPFGVKYN
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NP_000 YCLSEKPKLLPLELEKTAIQNYTVTEFQPLYYVAESFNDAKEKVRNFAATIPRPFSVRYD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KE1 PYTRSIQILKDTKSITSAMNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI
:::. :..: .:... . .. .. .. .:: :.
NP_000 PYTQRIEVLDNTQQLKILADSINSEIGILCSALQKIK
420 430 440 450
>>NP_000351 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxygena (497 aa)
initn: 1426 init1: 1402 opt: 1422 Z-score: 1639.2 bits: 312.6 E(85289): 1.4e-84
Smith-Waterman score: 1449; 50.3% identity (78.7% similar) in 431 aa overlap (14-438:76-496)
10 20 30 40
pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRA--SLIFSLK-NEVGGLIKALKIFQE
..:.: .:.:: . .. ..: .:.:.:.
NP_000 RKEREAAVAAAAAAVPSEPGDPLEAVAFEEKEGKAVLNLLFSPRATKPSALSRAVKVFET
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90
pF1KE1 KHVNLLHIESRKSKRRNS---EFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTL
.... :.:.: ..: . ..: :: .. : .:. :: ..: .:. : .
NP_000 FEAKIHHLETRPAQRPRAGGPHLEYFVRLEVRR---GDLAALL---SGVRQVS-ED---V
110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 KEDGMETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKH
. . :::::.:.:.::.: . : . .:: :::::.:.:::.::: .:..:..:.:
NP_000 RSPAGPKVPWFPRKVSELDKCHHLVTKFDPDLDLDHPGFSDQVYRQRRKLIAEIAFQYRH
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 GDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDV
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NP_000 GDPIPRVEYTAEEIATWKEVYTTLKGLYATHACGEHLEAFALLERFSGYREDNIPQLEDV
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGH
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NP_000 SRFLKERTGFQLRPVAGLLSARDFLASLAFRVFQCTQYIRHASSPMHSPEPDCCHELLGH
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 VPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSS
::.::. .::::::.:::::::::.: ..::.: :.::::::::::.:.....:::::::
NP_000 VPMLADRTFAQFSQDIGLASLGASDEEIEKLSTLYWFTVEFGLCKQNGEVKAYGAGLLSS
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 ISELKHALSGHAKVKPFDPKITCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPF
.:: : :: . ... :::. . : :.:.:::::::: :::.:.: ... :.:::
NP_000 YGELLHCLSEEPEIRAFDPEAAAVQPYQDQTYQSVYFVSESFSDAKDKLRSYASRIQRPF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440
pF1KE1 GVKYNPYTRSIQILKDTKSITSAMNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI
.::..::: .:..: . ... ... .: .::... ::. .
NP_000 SVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRRSLEGVQDELDTLAHALSAIG
460 470 480 490
>>XP_011518637 (OMIM: 191290,605407) PREDICTED: tyrosine (501 aa)
initn: 1426 init1: 1402 opt: 1422 Z-score: 1639.2 bits: 312.6 E(85289): 1.5e-84
Smith-Waterman score: 1449; 50.3% identity (78.7% similar) in 431 aa overlap (14-438:80-500)
10 20 30 40
pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRA--SLIFSLK-NEVGGLIKALKIFQE
..:.: .:.:: . .. ..: .:.:.:.
XP_011 RKEREAAVAAAAAAVPSEPGDPLEAVAFEEKEGKAVLNLLFSPRATKPSALSRAVKVFET
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90
pF1KE1 KHVNLLHIESRKSKRRNS---EFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTL
.... :.:.: ..: . ..: :: .. : .:. :: ..: .:. : .
XP_011 FEAKIHHLETRPAQRPRAGGPHLEYFVRLEVRR---GDLAALL---SGVRQVS-ED---V
110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 KEDGMETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKH
. . :::::.:.:.::.: . : . .:: :::::.:.:::.::: .:..:..:.:
XP_011 RSPAGPKVPWFPRKVSELDKCHHLVTKFDPDLDLDHPGFSDQVYRQRRKLIAEIAFQYRH
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 GDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDV
:::::.::.: ::: :: :. :. :: :::: :.:. . :: .. :::::::::::::
XP_011 GDPIPRVEYTAEEIATWKEVYTTLKGLYATHACGEHLEAFALLERFSGYREDNIPQLEDV
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGH
: ::::::::..::::: :: ::::..::::::.::::.::.:.:...:::: :::::::
XP_011 SRFLKERTGFQLRPVAGLLSARDFLASLAFRVFQCTQYIRHASSPMHSPEPDCCHELLGH
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 VPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSS
::.::. .::::::.:::::::::.: ..::.: :.::::::::::.:.....:::::::
XP_011 VPMLADRTFAQFSQDIGLASLGASDEEIEKLSTLYWFTVEFGLCKQNGEVKAYGAGLLSS
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 ISELKHALSGHAKVKPFDPKITCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIKRPF
.:: : :: . ... :::. . : :.:.:::::::: :::.:.: ... :.:::
XP_011 YGELLHCLSEEPEIRAFDPEAAAVQPYQDQTYQSVYFVSESFSDAKDKLRSYASRIQRPF
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440
pF1KE1 GVKYNPYTRSIQILKDTKSITSAMNELQHDLDVVSDALAKVSRKPSI
.::..::: .:..: . ... ... .: .::... ::. .
XP_011 SVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRRSLEGVQDELDTLAHALSAIG
460 470 480 490 500
>>NP_954987 (OMIM: 191290,605407) tyrosine 3-monooxygena (524 aa)
initn: 1426 init1: 1402 opt: 1422 Z-score: 1638.9 bits: 312.7 E(85289): 1.5e-84
Smith-Waterman score: 1449; 50.3% identity (78.7% similar) in 431 aa overlap (14-438:103-523)
10 20 30 40
pF1KE1 MIEDNKENKDHSLERGRA--SLIFSLK-NEVGGLIKALKIFQE
..:.: .:.:: . .. ..: .:.:.:.
NP_954 RKEREAAVAAAAAAVPSEPGDPLEAVAFEEKEGKAVLNLLFSPRATKPSALSRAVKVFET
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90
pF1KE1 KHVNLLHIESRKSKRRNS---EFEIFVDCDINREQLNDIFHLLKSHTNVLSVNLPDNFTL
.... :.:.: ..: . ..: :: .. : .:. :: ..: .:. : .
NP_954 FEAKIHHLETRPAQRPRAGGPHLEYFVRLEVRR---GDLAALL---SGVRQVS-ED---V
140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 KEDGMETVPWFPKKISDLDHCANRVLMYGSELDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKH
. . :::::.:.:.::.: . : . .:: :::::.:.:::.::: .:..:..:.:
NP_954 RSPAGPKVPWFPRKVSELDKCHHLVTKFDPDLDLDHPGFSDQVYRQRRKLIAEIAFQYRH
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 GDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDV
:::::.::.: ::: :: :. :. :: :::: :.:. . :: .. :::::::::::::
NP_954 GDPIPRVEYTAEEIATWKEVYTTLKGLYATHACGEHLEAFALLERFSGYREDNIPQLEDV
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGH
: ::::::::..::::: :: ::::..::::::.::::.::.:.:...:::: :::::::
NP_954 SRFLKERTGFQLRPVAGLLSARDFLASLAFRVFQCTQYIRHASSPMHSPEPDCCHELLGH
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 VPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSS
::.::. .::::::.:::::::::.: ..::.: :.::::::::::.:.....:::::::
NP_954 VPMLADRTFAQFSQDIGLASLGASDEEIEKLSTLYWFTVEFGLCKQNGEVKAYGAGLLSS
370 380 390 400 410 420
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NP_954 SVKFDPYTLAIDVLDSPQAVRRSLEGVQDELDTLAHALSAIG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]