Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1903
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1903, 433 aa
1>>>pF1KE1903 433 - 433 aa - 433 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8544+/-0.00041; mu= 14.9981+/- 0.025
mean_var=93.5953+/-19.640, 0's: 0 Z-trim(113.4): 151 B-trim: 1206 in 1/51
Lambda= 0.132571
statistics sampled from 22585 (22775) to 22585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 8.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_064582 (OMIM: 610663) N-lysine methyltransferas ( 433) 2954 575.6 8.7e-164
NP_001317293 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methy ( 477) 847 172.6 1.9e-42
NP_001161212 (OMIM: 608783) histone-lysine N-methy ( 428) 673 139.3 1.8e-32
XP_011542555 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 391) 537 113.3 1.2e-24
NP_073580 (OMIM: 608783) histone-lysine N-methyltr ( 369) 536 113.1 1.3e-24
NP_938015 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methyltr ( 490) 468 100.1 1.3e-20
XP_011542559 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 258) 316 70.9 4.5e-12
XP_011542556 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 286) 315 70.7 5.5e-12
XP_011542561 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09
XP_011542560 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09
XP_011542562 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09
XP_011542563 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09
XP_016857583 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 239) 270 62.0 1.9e-09
XP_016857584 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lys ( 236) 250 58.2 2.6e-08
NP_001019764 (OMIM: 614773) putative protein MSS51 ( 460) 168 42.7 0.0023
XP_005273224 (OMIM: 606425,609070,609820) PREDICTE ( 345) 159 40.9 0.0061
XP_005273223 (OMIM: 606425,609070,609820) PREDICTE ( 383) 159 41.0 0.0066
NP_071334 (OMIM: 606425,609070,609820) egl nine ho ( 426) 159 41.0 0.0072
>>NP_064582 (OMIM: 610663) N-lysine methyltransferase SM (433 aa)
initn: 2954 init1: 2954 opt: 2954 Z-score: 3061.5 bits: 575.6 E(85289): 8.7e-164
Smith-Waterman score: 2954; 99.8% identity (99.8% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE
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NP_064 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLEFPDNDSLVVLFAQVN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
NP_064 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLGFPDNDSLVVLFAQVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 CNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 IDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVRYARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 IDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVRYARN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 VIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 QYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDH
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NP_064 QYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDH
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE1 PYISEIKQEIESH
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NP_064 PYISEIKQEIESH
430
>>NP_001317293 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methyltra (477 aa)
initn: 701 init1: 272 opt: 847 Z-score: 883.0 bits: 172.6 E(85289): 1.9e-42
Smith-Waterman score: 847; 31.8% identity (66.0% similar) in 424 aa overlap (9-427:9-425)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE
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NP_001 MTIGRMENVEVFTAEGKGRGLKATKEFWAADIIFAERAYSAVVFDSLVNFVCHTCFKRQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP
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NP_001 KLHRCGQCKFAHYCDRTCQKDAWLNHKNECSAIKRYGKV--PNENIRLAARIMWRVEREG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLEFPDNDSLVVLFAQVN
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NP_001 TGLTEGCLVSVDDLQNHVEHFGEEEQKDLRVDVDTFLQYWPPQSQQFSMQYISHIFGVIN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE1 CNGFTIEDEE-LSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTS
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NP_001 CNGFTLSDQRGLQAVGVGIFPNLGLVNHDCWPNCTVIFNNGKIELRALGKISEGEELTVS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 YIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDP-PKAEAIRDMVRYA
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NP_001 YIDFLNVSEERKRQLKKQYYFDCTCEHCQKKLKDDLFLGVK--DNPKPSQEVVKEMIQFS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEG
....:.. .:. :....:. ::. :: :.:.:::.:. . : :.: .:
NP_001 KDTLEKIDKARSEGLYHEVVKLCRECLEKQEPVFADTNIYMLRMLSIVSEVLSYLQAFEE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKA---AGEKALKKAIAIMEVA
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NP_001 ASFYARRMVDGYMK---LYHPNNAQLGMAVMRAGLTNWHAGNIEVGHGMICKAYAILLVT
360 370 380 390 400 410
420 430
pF1KE1 HGKDHPYISEIKQEIESH
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NP_001 HGPSHPITKDLEAMRVQTEMELRMFRQNEFMYYKMREAALNNQPMQVMAEPSNEPSPALF
420 430 440 450 460 470
>>NP_001161212 (OMIM: 608783) histone-lysine N-methyltra (428 aa)
initn: 777 init1: 329 opt: 673 Z-score: 703.8 bits: 139.3 E(85289): 1.8e-32
Smith-Waterman score: 824; 32.5% identity (63.0% similar) in 422 aa overlap (9-426:6-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE
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NP_001 MEPLKVEKFATAKRGNGLRAVTPLRPGELLFRSDPLAYTVCKGSRGVVCDRCLLGKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP
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NP_001 KLMRCSQCRVAKYCSAKCQKKAWPDHKRECKCLKSCKPRY-PPDSVRLLGRVVFKL-MDG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLE----FPDNDSLVVLF
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NP_001 APSESEKLYSFYDLESNINKLTEDKKEGLRQLVMTFQHFMREEIQDASQLPPAFDLFEAF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 AQVNCNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEV
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NP_001 AKVICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSISLLNHSCDPNCSIVFNGPHLLLRAVRDIEVGEEL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 FTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVR
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NP_001 TICYLDMLMTSEERRKQLRDQYCFECDCFRCQTQDKDADMLT----GD----EQVWKEVQ
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDW
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NP_001 ESLKKIEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIISSNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 EGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAH
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NP_001 EEALFYGTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVMKVGKLQLHQGMFPQAMKNLRLAFDIMRVTH
350 360 370 380 390 400
420 430
pF1KE1 GKDHPYISEIKQEIESH
:..: : ..
NP_001 GREHSLIEDLILLLEECDANIRAS
410 420
>>XP_011542555 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lysine (391 aa)
initn: 675 init1: 269 opt: 537 Z-score: 563.7 bits: 113.3 E(85289): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 626; 29.4% identity (56.4% similar) in 422 aa overlap (9-426:6-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE
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XP_011 MEPLKVEKFATAKRGNGLRAVTPLRPGELLFRSDPLAYTVCKGSRGVVCDRCLLGKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP
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XP_011 KLMRCSQCRVAKYCSAKCQKKAWPDHKRECKCLKSCKPRY-PPDSVRLLGRVVFKL-MDG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLE----FPDNDSLVVLF
. :::: . ..::...:: ..::. ... . ...::. .... .: .: :
XP_011 APSESEKLYSFYDLESNINKLTEDKKEGLRQLVMTFQHFMREEIQDASQLPPAFDLFEAF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 AQVNCNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEV
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XP_011 AKVICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSISLLNHSCDPNCSIVFNGPHLLLRAVRDIEVGEE-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 FTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVR
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XP_011 ---DADMLTGDEQ----------VWKEVQESLKK--------------------------
240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDW
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XP_011 -----IEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIISSNSERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLL
260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 EGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAH
: :: :: . ..:: .: . . .:.:.: . . : :. :. ::.:.:
XP_011 EEALFYGTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVMKVGKLQLHQGMFPQAMKNLRLAFDIMRVTH
310 320 330 340 350 360
420 430
pF1KE1 GKDHPYISEIKQEIESH
:..: : ..
XP_011 GREHSLIEDLILLLEECDANIRAS
370 380 390
>>NP_073580 (OMIM: 608783) histone-lysine N-methyltransf (369 aa)
initn: 674 init1: 329 opt: 536 Z-score: 563.1 bits: 113.1 E(85289): 1.3e-24
Smith-Waterman score: 687; 31.6% identity (63.2% similar) in 367 aa overlap (64-426:2-355)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 FSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKEGLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPM
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NP_073 MRCSQCRVAKYCSAKCQKKAWPDHKRECKCL
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 VVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHPERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDI
. : ..::: .:.. : . . :::: . ..::...:: ..::. ... .
NP_073 KSCKPRY-PPDSVRLLGRVVFKL-MDGAPSESEKLYSFYDLESNINKLTEDKKEGLRQLV
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200
pF1KE1 AALHHFYSKHLE----FPDNDSLVVLFAQVNCNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSC
...::. .... .: .: ::.: ::.::: . :....: ...:...:.::::
NP_073 MTFQHFMREEIQDASQLPPAFDLFEAFAKVICNSFTICNAEMQEVGVGLYPSISLLNHSC
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 CPNVIVTYKGTLAEVRAVQEIKPGEEVFTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTT
:: ....: .:::..:. :::. :.:.:. .:.: .:::.: : :.: .: :
NP_073 DPNCSIVFNGPHLLLRAVRDIEVGEELTICYLDMLMTSEERRKQLRDQYCFECDCFRCQT
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 KDKDKAKVEIRKLSDPPKAEAIRDMVRYARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMS
.::: . .: : . :. . . :::.. :.: ..: .:. . :
NP_073 QDKDADMLT----GD----EQVWKEVQESLKKIEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIISSNS
210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SVFEDSNVYMLHMMYQAMGVCLYMQDWEGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLG
. : :.:.:... :: .:. . : :: :: . ..:: .: . . .:.:
NP_073 ERLPDINIYQLKVLDCAMDACINLGLLEEALFYGTRTMEPYRIFFPGSHPVRGVQVMKVG
260 270 280 290 300 310
390 400 410 420 430
pF1KE1 RLYMGLEHKAAGEKALKKAIAIMEVAHGKDHPYISEIKQEIESH
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NP_073 KLQLHQGMFPQAMKNLRLAFDIMRVTHGREHSLIEDLILLLEECDANIRAS
320 330 340 350 360
>>NP_938015 (OMIM: 606846) histone-lysine N-methyltransf (490 aa)
initn: 665 init1: 254 opt: 468 Z-score: 491.1 bits: 100.1 E(85289): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 812; 31.1% identity (64.3% similar) in 437 aa overlap (9-427:9-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRAEGLGGLERFCSPGKGRGLRALQPFQVGDLLFSCPAYAYVLTVNERGNHCEYCFTRKE
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NP_938 MTIGRMENVEVFTAEGKGRGLKATKEFWAADIIFAERAYSAVVFDSLVNFVCHTCFKRQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GLSKCGRCKQAFYCNVECQKEDWPMHKLECSPMVVFGENWNPSETVRLTARILAKQKIHP
: .::.:: : ::. :::. : :: ::: . .:. :.:..::.:::. . . .
NP_938 KLHRCGQCKFAHYCDRTCQKDAWLNHKNECSAIKRYGKV--PNENIRLAARIMWRVEREG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ERTPSEKLLAVKEFESHLDKLDNEKKDLIQSDIAALHHFYSKHLEFPDNDSLVVLFAQVN
:..: ....:.... .:.. .. :. .. ... . . . . . .:. .:
NP_938 TGLTEGCLVSVDDLQNHVEHFGEEEQKDLRVDVDTFLQYWPPQSQQFSMQYISHIFGVIN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220
pF1KE1 CNGFTIEDEE-LSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTY--------KGTL-----AEVRA
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NP_938 CNGFTLSDQRGLQAVGVGIFPNLGLVNHDCWPNCTVIFNNGNHEAVKSMFHTQMRIELRA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 VQEIKPGEEVFTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIRKLSDP-
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NP_938 LGKISEGEELTVSYIDFLNVSEERKRQLKKQYYFDCTCEHCQKKLKDDLFLGVK--DNPK
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NP_938 PSQEVVKEMIQFSKDTLEKIDKARSEGLYHEVVKLCRECLEKQEPVFADTNIYMLRMLSI
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NP_938 VSEVLSYLQAFEEASFYARRMVDGYMK---LYHPNNAQLGMAVMRAGLTNWHAGNIEVGH
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NP_938 GMICKAYAILLVTHGPSHPITKDLEAMRVQTEMELRMFRQNEFMYYKMREAALNNQPMQV
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>>XP_011542560 (OMIM: 608783) PREDICTED: histone-lysine (239 aa)
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Smith-Waterman score: 421; 30.9% identity (61.4% similar) in 236 aa overlap (191-426:1-225)
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pF1KE1 SKHLEFPDNDSLVVLFAQVNCNGFTIEDEELSHLGSAIFPDVALMNHSCCPNVIVTYKGT
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XP_011 MQEVGVGLYPSISLLNHSCDPNCSIVFNGP
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 LAEVRAVQEIKPGEEVFTSYIDLLYPTEDRNDRLRDSYFFTCECQECTTKDKDKAKVEIR
.:::..:. :::. :.:.:. .:.: .:::.: : :.: .: :.::: .
XP_011 HLLLRAVRDIEVGEELTICYLDMLMTSEERRKQLRDQYCFECDCFRCQTQDKDADMLT--
40 50 60 70 80
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pF1KE1 KLSDPPKAEAIRDMVRYARNVIEEFRRAKHYKSPSELLEICELSQEKMSSVFEDSNVYML
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XP_011 --GD----EQVWKEVQESLKKIEELK--AHWKWE-QVLAMCQAIISSNSERLPDINIYQL
90 100 110 120 130
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 HMMYQAMGVCLYMQDWEGALQYGQKIIKPYSKHYPLYSLNVASMWLKLGRLYMGLEHKAA
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pF1KE1 GEKALKKAIAIMEVAHGKDHPYISEIKQEIESH
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200 210 220 230
433 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:40:00 2016 done: Sun Nov 6 12:40:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]