Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1901
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1901, 429 aa
1>>>pF1KE1901 429 - 429 aa - 429 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0924+/-0.00095; mu= 18.4087+/- 0.057
mean_var=64.2540+/-12.866, 0's: 0 Z-trim(104.2): 39 B-trim: 47 in 1/48
Lambda= 0.160002
statistics sampled from 7759 (7797) to 7759 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 2.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3231.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 429) 2901 678.7 3e-195
CCDS43174.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 387) 2612 611.9 3.4e-175
CCDS5702.1 ACTL6B gene_id:51412|Hs108|chr7 ( 426) 2505 587.2 9.9e-168
CCDS5934.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 418) 387 98.3 1.5e-20
CCDS33277.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 418) 379 96.5 5.3e-20
CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 ( 377) 366 93.5 3.9e-19
CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15 ( 377) 366 93.5 3.9e-19
CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 376) 363 92.8 6.2e-19
CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10 ( 377) 363 92.8 6.2e-19
CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17 ( 375) 361 92.3 8.6e-19
CCDS5341.1 ACTB gene_id:60|Hs108|chr7 ( 375) 361 92.3 8.6e-19
CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5 ( 376) 352 90.2 3.6e-18
CCDS63000.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 367) 348 89.3 6.7e-18
CCDS59432.1 POTEJ gene_id:653781|Hs108|chr2 (1038) 348 89.6 1.6e-17
CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2 (1075) 348 89.6 1.6e-17
CCDS2033.1 ACTR1B gene_id:10120|Hs108|chr2 ( 376) 342 87.9 1.8e-17
CCDS34782.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 348) 340 87.4 2.3e-17
CCDS7536.1 ACTR1A gene_id:10121|Hs108|chr10 ( 376) 337 86.8 4e-17
CCDS46409.1 POTEF gene_id:728378|Hs108|chr2 (1075) 331 85.7 2.5e-16
CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2 (1075) 331 85.7 2.5e-16
CCDS3206.1 ACTRT3 gene_id:84517|Hs108|chr3 ( 372) 319 82.6 7.1e-16
CCDS45.1 ACTRT2 gene_id:140625|Hs108|chr1 ( 377) 315 81.7 1.4e-15
CCDS46307.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 399) 312 81.0 2.3e-15
CCDS56124.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 333) 310 80.5 2.7e-15
CCDS14611.1 ACTRT1 gene_id:139741|Hs108|chrX ( 376) 310 80.5 3e-15
CCDS12207.1 ACTL9 gene_id:284382|Hs108|chr19 ( 416) 303 78.9 1e-14
CCDS1881.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 394) 300 78.2 1.5e-14
CCDS6771.1 ACTL7B gene_id:10880|Hs108|chr9 ( 415) 283 74.3 2.4e-13
CCDS6772.1 ACTL7A gene_id:10881|Hs108|chr9 ( 435) 273 72.0 1.3e-12
CCDS9074.1 ACTR6 gene_id:64431|Hs108|chr12 ( 396) 259 68.8 1.1e-11
>>CCDS3231.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 (429 aa)
initn: 2901 init1: 2901 opt: 2901 Z-score: 3618.7 bits: 678.7 E(32554): 3e-195
Smith-Waterman score: 2901; 100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 EKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGG
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KQCVERKCP
:::::::::
CCDS32 KQCVERKCP
>>CCDS43174.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 (387 aa)
initn: 2612 init1: 2612 opt: 2612 Z-score: 3258.9 bits: 611.9 E(32554): 3.4e-175
Smith-Waterman score: 2612; 100.0% identity (100.0% similar) in 387 aa overlap (43-429:1-387)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 ALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MVVERDDGSTLMEIDGDKGKQGGPTYYIDT
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 NALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPVLMSEAPWNTRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPVLMSEAPWNTRAK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 REKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 REKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGI
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 VKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHN
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 YMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPS
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 NVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKT
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420
pF1KE1 PPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP
340 350 360 370 380
>>CCDS5702.1 ACTL6B gene_id:51412|Hs108|chr7 (426 aa)
initn: 2209 init1: 2209 opt: 2505 Z-score: 3124.8 bits: 587.2 E(32554): 9.9e-168
Smith-Waterman score: 2505; 83.9% identity (95.6% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-426)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK
::::::::::::::::::::..::::::::::::.::::..:... .. :. .:..:::
CCDS57 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSFSVRAGYAGEDCPKADFPTTVGLLAAEEGGG--LELEGDK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV
:.: ..::::::.:::.. :..:::::::.:::. :.:::::::. ::::: .::::
CCDS57 EKKG-KIFHIDTNALHVPRDGAEVMSPLKNGMIEDWECFRAILDHTYSKHVKSEPNLHPV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI
::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS57 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEQYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLVLDSGATHTTAI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREGSPANWKRK
::::::::::::::::::::::.:::::::::: :...::::::.:: ::::.: :::.:
CCDS57 PVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFISMQCRELFQEMAIDIIPPYMIAAKEPVREGAPPNWKKK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 EKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNGYNCDFGAE
::::::..:::::::: ::::::::::::::: :::::::::::::::.::::: :.:::
CCDS57 EKLPQVSKSWHNYMCNEVIQDFQASVLQVSDSPYDEQVAAQMPTVHYEMPNGYNTDYGAE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAGGNTLIQSF
::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.:::::.:.:
CCDS57 RLRIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVGHVVTTSIGMCDIDIRPGLYGSVIVTGGNTLLQGF
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGG
::::::::::::::::::::::.:.:.::.:: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TDRLNRELSQKTPPSMRLKLIASNSTMERKFSPWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGG
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 KQCVERKCP
:::::::::
CCDS57 KQCVERKCP
420
>>CCDS5934.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 (418 aa)
initn: 527 init1: 197 opt: 387 Z-score: 482.6 bits: 98.3 E(32554): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 530; 27.9% identity (55.8% similar) in 441 aa overlap (15-429:9-412)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGM-----VVERDDGSTLME
: : :. .. ::::. :. .:. :.. ::.. . .:
CCDS59 MAGSLPPCVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIRESAKVVDQAQRRVLRG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IDGDKGKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEA
.: ..: .:. : . :...:..:::: .. ..... ....:
CCDS59 VDD-------LDFFIGDEAIDKPTYATKW--PIRHGIIEDWDLMERFMEQVVFKYLRAEP
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE1 SLHPVLMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRS--------TG
: ::.: : :: .:: :.:.::: .:.:.... :::. :. : ::
CCDS59 EDHYFLMTEPPLNTPENREYLAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 LILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKE
...::: : .::: .:::. . : . :.:: ::. ..:..: .. . : . . .
CCDS59 IVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLREREVGIPPEQSLETAK
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 AVREGSPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHY
:. ::: . :.: ....: .:. . .: .. .
CCDS59 AI----------KEK--------YCYICPDIVKEFAK--YDVDPRKWIKQYTGINAINQK
230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 EFPNGYNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGS
.: : : ::. :: .: : . . . : ..: :: . : ::.: :: .
CCDS59 KFV----IDVGYERFLGPEIFFHPEFA---NPDFMESISDVVDEVIQNCPIDVRRPLYKN
270 280 290 300 310
350 360 370 380 390
pF1KE1 VIVAGGNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRL-------KLIANNTTVE------RRFSSW
:...::.:....: ::.:.:.. . .:: .. . . :. .:.. :
CCDS59 VVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRVVDARLRLSEELSGGRIKPKPVEVQVVTHHMQRYAVW
320 330 340 350 360 370
400 410 420
pF1KE1 IGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP
.:::.::: : :. .:..::: : . . :. :
CCDS59 FGGSMLASTPEFFQVCHTKKDYEEYGPS-ICRHNPVFGVMS
380 390 400 410
>>CCDS33277.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 (418 aa)
initn: 499 init1: 188 opt: 379 Z-score: 472.6 bits: 96.5 E(32554): 5.3e-20
Smith-Waterman score: 514; 27.2% identity (55.7% similar) in 438 aa overlap (13-429:7-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK
: : : :. .. ::::. :. .:. :. . : . . :
CCDS33 MAGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIA-IKESAKVGDQAQRRVMK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV
: . ..: .:.. : . :...:.::::: .. ..... ....: :
CCDS33 GVDDLD-FFIGDEAIEKPTYATKW--PIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRS--------TGLILDS
:..: : :: .:: .:.::: .:.:.... :::. :. : :: ..::
CCDS33 LLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 GATHTTAIPVHDGYVLQQGIVKSPLAGDFITMQCRELFQEMNIELVPPYMIASKEAVREG
: : .::: .:::. . : . :.:: ::. ..:... .. . : . . .::.:
CCDS33 GDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKER
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 SPANWKRKEKLPQVTRSWHNYMCNCVIQDFQASVLQVSDSTYDEQVAAQMPTVHYEFPNG
..:.: ....:. ... : . .: .. . ::
CCDS33 ------------------YSYVCPDLVKEFNK--YDTDGSKWIKQYTGINAISKKEF---
240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YNCDFGAERLKIPEGLFDPSNVKGLSGNTMLGVSHVVTTSVGMCDIDIRPGLYGSVIVAG
. : : ::. :: .: : . . . .:.:: . : ::.: :: .....:
CCDS33 -SIDVGYERFLGPEIFFHPEFA---NPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSG
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390
pF1KE1 GNTLIQSFTDRLNRELSQKTPPSMRL-------KLIANNTTVE------RRFSSWIGGSI
:.:....: ::.:.:.. . ..: .: . :. .:.. :.:::.
CCDS33 GSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSGGRLKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSM
330 340 350 360 370 380
400 410 420
pF1KE1 LASLGTFQQMWISKQEYEEGGKQCVERKCP
::: : :. .:..::: : . . :. :
CCDS33 LASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPS-ICRHNPVFGVMS
390 400 410
>>CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 (377 aa)
initn: 887 init1: 358 opt: 366 Z-score: 457.1 bits: 93.5 E(32554): 3.9e-19
Smith-Waterman score: 856; 36.7% identity (63.6% similar) in 420 aa overlap (9-428:5-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGGVYGGDEVGALVFDIGSYTVRAGYAGEDCPKVDFPTAIGMVVERDDGSTLMEIDGDK
::. ::: : :: :.::.::.: :.. ::. .: : .: .: :.:
CCDS15 MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGR--PRHQG--VMVGMGQK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GKQGGPTYYIDTNALRVPRENMEAISPLKNGMVEDWDSFQAILDHTYKMHVKSEASLHPV
. :. .: . : . :...:.. .::... : ::. ... ::.
CCDS15 DS------YVGDEA-QSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPT
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LMSEAPWNTRAKREKLTELMFEHYNIPAFFLCKTAVLTAFANGRSTGLILDSGATHTTAI
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CCDS15 LLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNV
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370
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370
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CCDS19 PIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFV---TTAEREIVRDI-------K
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CCDS19 EKL-----------CY-VALDFENEMATAASSSSLEK--------SYELPDGQVITIGNE
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CCDS19 PSIVHRKCF
370
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CCDS73 ADRMQKEITALAPSTMKIKIIA---PPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAG
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CCDS73 PSIVHRKCF
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CCDS11 DS------YVGDEA-QSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPV
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CCDS11 LLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTV
110 120 130 140 150 160
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CCDS11 PIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFT---TTAEREIVRDI-------K
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CCDS11 EKL-----------CY-VALDFEQEMATAASSSSLEK--------SYELPDGQVITIGNE
220 230 240 250
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CCDS11 RFRCPEALFQPS----FLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGI
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pF1KE1 TDRLNRELSQKTPPSMRLKLIANNTTVERRFSSWIGGSILASLGTFQQMWISKQEYEEGG
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CCDS11 ADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPP---ERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESG
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 KQCVERKCP
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CCDS11 PSIVHRKCF
370
429 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]