Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1894
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1894, 423 aa
1>>>pF1KE1894 423 - 423 aa - 423 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6396+/-0.000516; mu= 15.0350+/- 0.032
mean_var=62.2352+/-12.605, 0's: 0 Z-trim(107.9): 142 B-trim: 205 in 1/52
Lambda= 0.162576
statistics sampled from 15873 (16020) to 15873 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.54), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 8.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin ( 423) 2706 643.9 2.3e-184
NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo ( 435) 1149 278.7 2e-74
XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1148 278.4 2.3e-74
XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1148 278.4 2.3e-74
NP_000615 (OMIM: 601841) plasma serine protease in ( 406) 1111 269.7 9.2e-72
NP_001747 (OMIM: 122500,611489) corticosteroid-bin ( 405) 1108 269.0 1.5e-71
NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 ( 427) 1107 268.8 1.8e-71
NP_006206 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 pre ( 427) 1107 268.8 1.8e-71
NP_001275961 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 1 ( 464) 1107 268.8 2e-71
NP_001121179 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001002236 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
XP_016876859 (OMIM: 107400,606963,613490) PREDICTE ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001121176 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001121177 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001002235 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001121173 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001121172 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001121178 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001121175 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_000286 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1-ant ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_001121174 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1106 268.6 2.1e-71
NP_000345 (OMIM: 300932,314200) thyroxine-binding ( 415) 1090 264.8 2.9e-70
NP_001271204 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform C [H ( 399) 1073 260.8 4.4e-69
XP_011535019 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 977 238.3 2.2e-62
XP_011535018 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 977 238.3 2.2e-62
XP_005262237 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 371) 944 230.6 5.2e-60
XP_006724746 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 425) 939 229.4 1.3e-59
NP_006211 (OMIM: 107410) putative alpha-1-antitryp ( 421) 909 222.4 1.7e-57
NP_001271205 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform D [H ( 286) 800 196.8 6.1e-50
NP_001094077 (OMIM: 605271) protein Z-dependent pr ( 444) 712 176.2 1.5e-43
NP_057270 (OMIM: 605271) protein Z-dependent prote ( 444) 712 176.2 1.5e-43
XP_005267790 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 444) 712 176.2 1.5e-43
XP_016876842 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 484) 712 176.2 1.6e-43
NP_006208 (OMIM: 605587) serpin I2 isoform 2 precu ( 405) 697 172.6 1.6e-42
NP_001012303 (OMIM: 605587) serpin I2 isoform 1 pr ( 415) 697 172.6 1.6e-42
NP_001035983 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform B [H ( 335) 692 171.4 3e-42
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 652 162.1 2.3e-39
XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 651 161.8 2.6e-39
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 651 161.8 2.6e-39
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 651 161.8 2.6e-39
XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 651 161.8 2.6e-39
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 651 161.8 2.6e-39
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 651 161.8 2.6e-39
NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 651 161.8 2.6e-39
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 651 161.8 2.6e-39
XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 651 161.8 2.6e-39
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 651 161.9 2.7e-39
XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454) 651 161.9 3.1e-39
XP_005245255 (OMIM: 107300,613118) PREDICTED: anti ( 416) 646 160.7 6.4e-39
NP_000479 (OMIM: 107300,613118) antithrombin-III p ( 464) 646 160.7 7.1e-39
>>NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin prec (423 aa)
initn: 2706 init1: 2706 opt: 2706 Z-score: 3430.9 bits: 643.9 E(85289): 2.3e-184
Smith-Waterman score: 2706; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRWR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNP
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 KQA
:::
NP_001 KQA
>>NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo sap (435 aa)
initn: 1078 init1: 788 opt: 1149 Z-score: 1457.0 bits: 278.7 E(85289): 2e-74
Smith-Waterman score: 1149; 45.3% identity (74.4% similar) in 422 aa overlap (3-423:18-435)
10 20 30 40
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHV
.: : :.:.:.: . : :: . . . .. .
NP_783 MQGQGRRRGTCKDIFCSKMASYLYGVLFAVGLCAPIYC--VSPANAPSAYPRPSSTKSTP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 DLGLASANVDFAFSLYKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKF
. : :.:::: ::..:::..:..:..:::.:.::.::.::::::..: :.::.:: :
NP_783 ASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGF
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 NLTETSEAEIHQSFQHLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEA
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NP_783 NLTHTPESAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FATDFQDSAAAKKLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQD
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NP_783 FSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 THQSR-FYLSKKKWVMVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKM
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NP_783 TRKNFPFLVGEQVTVHVPMMH-QKEQFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKM
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 EEVEAMLLPETLKRWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLS
...: : .::..: ::. : : :...:.:::: .:::. :: ..::...: ..::.:
NP_783 RQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWI-EVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 GITGARNLAVSQVVHKAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIV
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NP_783 GIAKRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMIT
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE1 PTDTQNIFFMSKVTNPKQA
:..:.:..:: :: ..
NP_783 NKATDGILFLGKVENPTKS
420 430
>>XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
initn: 1078 init1: 788 opt: 1148 Z-score: 1456.1 bits: 278.4 E(85289): 2.3e-74
Smith-Waterman score: 1148; 45.8% identity (75.3% similar) in 413 aa overlap (12-423:9-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSL
:.:.:.: . : :: . . . .. . . : :.:::: :
XP_011 MASYLYGVLFAVGLCAPIYC--VSPANAPSAYPRPSSTKSTPASQVYSLNTDFAFRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQ
:..:::..:..:..:::.:.::.::.::::::..: :.::.:: ::::.: :. :::.::
XP_011 YRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNLTHTPESAIHQGFQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLI
::...:. : .: :.::.:.:::..:.: : ..:::: .:.:.:::.. . :. :
XP_011 HLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQARI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE1 NDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSR-FYLSKKKWV
:..::. :.::..:.:. :: : :::::.:::::::: :: :. :... : .... :
XP_011 NSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 MVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRW
:::: .. . . : ::.: :... : :.: :.:.::.. ::...: : .::..:
XP_011 HVPMMHQKE-QFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQLEQALSARTLRKW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVH
::. : : :...:.:::: .:::. :: ..::...: ..::.:::. .: ::...:
XP_011 SHSLQKRWI-EVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAKRDSLQVSKATH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 KAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTN
:::::: ::::::.:::..:. . : . : ::: :::.:. :..:.:..:: :
XP_011 KAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVEN
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE1 PKQA
: ..
XP_011 PTKS
>>XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
initn: 1078 init1: 788 opt: 1148 Z-score: 1456.1 bits: 278.4 E(85289): 2.3e-74
Smith-Waterman score: 1148; 45.8% identity (75.3% similar) in 413 aa overlap (12-423:9-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MERMLPLLALGLLAAGFCPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSL
:.:.:.: . : :: . . . .. . . : :.:::: :
XP_011 MASYLYGVLFAVGLCAPIYC--VSPANAPSAYPRPSSTKSTPASQVYSLNTDFAFRL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YKQLVLKAPDKNVIFSPLSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQ
:..:::..:..:..:::.:.::.::.::::::..: :.::.:: ::::.: :. :::.::
XP_011 YRRLVLETPSQNIFFSPVSVSTSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGFNLTHTPESAIHQGFQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 HLLRTLNQSSDELQLSMGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLI
::...:. : .: :.::.:.:::..:.: : ..:::: .:.:.:::.. . :. :
XP_011 HLVHSLTVPSKDLTLKMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQARI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE1 NDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSR-FYLSKKKWV
:..::. :.::..:.:. :: : :::::.:::::::: :: :. :... : .... :
XP_011 NSHVKKKTQGKVVDIIQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 MVPMMSLHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRW
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XP_011 HVPMMHQKE-QFAFGVDTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSKGKMRQLEQALSARTLRKW
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 RDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVH
::. : : :...:.:::: .:::. :: ..::...: ..::.:::. .: ::...:
XP_011 SHSLQKRWI-EVFIPRFSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIAKRDSLQVSKATH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 KAVLDVFEEGTEASAATAVKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTN
:::::: ::::::.:::..:. . : . : ::: :::.:. :..:.:..:: :
XP_011 KAVLDVSEEGTEATAATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVEN
360 370 380 390 400 410
420
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: ..
XP_011 PTKS
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10 20 30 40 50
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420
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. :
NP_000 NRP
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NP_001 ISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGSTG
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NP_001 VTLNLTSKPI----ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
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>>NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 prec (427 aa)
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10 20 30 40 50
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420
>>NP_006206 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 precurs (427 aa)
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10 20 30 40 50
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: :: .:::: . . : . .. . : . .: .: ::.::::
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: :::: . :: :..:. : :.:... : :.:...::::.: ::.:.: .: ::
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:..::..: .
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10 20 30
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. ..::.:: ::::: ::...:..:::::.::: . :. .:.:.:....:..: .:
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.:. .: .. : :.: :.... .::::.::. :::::.::...: ....:::::::.::
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: :: :: . : . ::.... : :::: . :: :..:. : :.:... : :.
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.::. . :.. ::::::: ..: .:. :::.::: : ::::.:::. : ..:: ..
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: :.:::::::..: :.::...:..::..: .
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>>NP_001121179 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1-anti (418 aa)
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NP_001 IHEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTE
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pF1KE1 AAKKLINDYVKNGTRGKITDLIKDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLS
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NP_001 EAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVD
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pF1KE1 KKKWVMVPMMS-LHHLTIPYFRDEELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLP
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NP_001 QVTTVKVPMMKRLGMFNIQHCK--KLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTH
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 ETLKRWRDSLEFREIGELYLPKFSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLA
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NP_001 DIITKFLEN-EDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLK
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NP_001 LSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPE----VKFNKPFVFLMIEQNTKSPLF
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NP_001 MGKVVNPTQK
410
423 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 12:22:15 2016 done: Sun Nov 6 12:22:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]