Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1892
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1892, 421 aa
1>>>pF1KE1892 421 - 421 aa - 421 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3164+/-0.000992; mu= 17.0585+/- 0.059
mean_var=62.9643+/-12.537, 0's: 0 Z-trim(103.7): 28 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.161632
statistics sampled from 7507 (7530) to 7507 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 2.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 421) 2830 668.8 2.7e-192
CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 ( 388) 1989 472.7 2.7e-133
CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 ( 419) 1827 434.9 6.7e-122
CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 ( 419) 1632 389.5 3.3e-108
CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 436) 1502 359.2 4.5e-99
CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 ( 403) 1133 273.1 3.4e-73
CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 ( 417) 1111 268.0 1.2e-71
CCDS6200.1 CPA6 gene_id:57094|Hs108|chr8 ( 437) 1055 254.9 1.1e-67
CCDS3138.1 CPA3 gene_id:1359|Hs108|chr3 ( 417) 1022 247.2 2.2e-65
CCDS9401.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 423) 875 212.9 4.6e-55
CCDS2372.1 CPO gene_id:130749|Hs108|chr2 ( 374) 843 205.5 7.2e-53
CCDS73568.1 CPB2 gene_id:1361|Hs108|chr13 ( 386) 285 75.4 1.1e-13
>>CCDS5818.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (421 aa)
initn: 2830 init1: 2830 opt: 2830 Z-score: 3565.9 bits: 668.8 E(32554): 2.7e-192
Smith-Waterman score: 2830; 100.0% identity (100.0% similar) in 421 aa overlap (1-421:1-421)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
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CCDS58 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSNNFNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSNNFNY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 PASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNL
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 Y
:
CCDS58 Y
>>CCDS55163.1 CPA4 gene_id:51200|Hs108|chr7 (388 aa)
initn: 2594 init1: 1989 opt: 1989 Z-score: 2506.6 bits: 472.7 E(32554): 2.7e-133
Smith-Waterman score: 2532; 92.2% identity (92.2% similar) in 421 aa overlap (1-421:1-388)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSNNFNY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQ-------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 --------IYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGI
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVY
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 PASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNL
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 Y
:
CCDS55 Y
>>CCDS5817.2 CPA2 gene_id:1358|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 1594 init1: 1278 opt: 1827 Z-score: 2301.9 bits: 434.9 E(32554): 6.7e-122
Smith-Waterman score: 1827; 63.2% identity (84.8% similar) in 421 aa overlap (1-421:3-419)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPS
:: :::.:::.: : : : :::::.: : ..:..: :: ...:.:.:::::.
CCDS58 MAMRLILFFGALFGHIYC-LETFVGDQVLEIVPSNEEQIKNLLQLEAQEHLQLDFWKSPT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SFNRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSNNF
. .. . : :: :..:: : ::.:::. :.. :::.:.:::.:..:: :. .:::.: :
CCDS58 TPGETAHVRVPFVNVQAVKVFLESQGIAYSIMIEDVQVLLDKENEEMLFNRRRERSGN-F
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNA
:.::::.:: : .::::..:. : :. .:.:: ::::::: ::::::: .::.::.:
CCDS58 NFGAYHTLEEISQEMDNLVAEHPGLVSKVNIGSSFENRPMNVLKFSTGGD--KPAIWLDA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 GIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLW
:::.:::..::::.::: :::::: .::.:::::. .:::::::.::::::..::.::.:
CCDS58 GIHAREWVTQATALWTANKIVSDYGKDPSITSILDALDIFLLPVTNPDGYVFSQTKNRMW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKH
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CCDS58 RKTRSKVSGSLCVGVDPNRNWDAGFGGPGASSNPCSDSYHGPSANSEVEVKSIVDFIKSH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTT
:. :.:: :::::::::.::::. : : .::..::. ::..: :. ::.:.::: :..
CCDS58 GKVKAFITLHSYSQLLMFPYGYKCTKLDDFDELSEVAQKAAQSLRSLHGTKYKVGPICSV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 VYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRD
.: :::.::::.:: :::..:.::::::: ::::::: ::.:::::::::::.:::::::
CCDS58 IYQASGGSIDWSYDYGIKYSFAFELRDTGRYGFLLPARQILPTAEETWLGLKAIMEHVRD
360 370 380 390 400 410
420
pF1KE1 NLY
. :
CCDS58 HPY
>>CCDS5820.1 CPA1 gene_id:1357|Hs108|chr7 (419 aa)
initn: 1605 init1: 1141 opt: 1632 Z-score: 2056.2 bits: 389.5 E(32554): 3.3e-108
Smith-Waterman score: 1632; 54.4% identity (84.8% similar) in 421 aa overlap (1-421:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSSF
:: .: ...:.:. . :.: : : :::::.: . ...:...: . ..:.:.::..:.
CCDS58 MRGLLVLSVLLGA-VFGKEDFVGHQVLRISVADEAQVQKVKELEDLEHLQLDFWRGPAHP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERSSNNFNY
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CCDS58 GSPIDVRVPFPSIQAVKIFLESHGISYETMIEDVQSLLDEEQEQMFAFRSRARSTDTFNY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGKGVRRPAVWLNAGI
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CCDS58 ATYHTLEEIYDFLDLLVAENPHLVSKIQIGNTYEGRPIYVLKFSTG-GSKRPAIWIDTGI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVANPDGYVYTQTQNRLWRK
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CCDS58 HSREWVTQASGVWFAKKITQDYGQDAAFTAILDTLDIFLEIVTNPDGFAFTHSTNRMWRK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVDFIQKHGN
:::.. :: :::.::::::.:.:. .:::.:::::.::: :::::::::.:::.. :::
CCDS58 TRSHTAGSLCIGVDPNRNWDAGFGLSGASSNPCSETYHGKFANSEVEVKSIVDFVKDHGN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQVGPTCTTVY
.:.::..:::::::::::::... .:: .:::.... :. ::::. ::... : ..:
CCDS58 IKAFISIHSYSQLLMYPYGYKTEPVPDQDELDQLSKAAVTALASLYGTKFNYGSIIKAIY
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 PASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNL
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CCDS58 QASGSTIDWTYSQGIKYSFTFELRDTGRYGFLLPASQIIPTAKETWLALLTIMEHTLNHP
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 Y
:
CCDS58 Y
>>CCDS5819.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 (436 aa)
initn: 1501 init1: 1056 opt: 1502 Z-score: 1892.1 bits: 359.2 E(32554): 4.5e-99
Smith-Waterman score: 1502; 51.4% identity (81.0% similar) in 420 aa overlap (2-421:18-436)
10 20 30 40
pF1KE1 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLV
: :.. ..: .. :: .: ::::::. ... ..: :..:
CCDS58 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 NSNNLKLNFWKSPSSFNRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDE
. . :..::..:. . :::. :: :. .:..:.:.:: :.. :.:.:.:::.: .
CCDS58 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEERQA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 MQHNEGQERSSNNFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFS
: ... :::.:.:.:..::.:: :: .::.. . :.. ...::.::::. . :::::
CCDS58 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 TGKGVRRPAVWLNAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVAN
:: : :.::.:...::::::::..::.:::: :::::: .: ..:.::. ::::. :.:
CCDS58 TG-GSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTN
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 PDGYVYTQTQNRLWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANS
:::...:...::::::..: :: :::.: ::::...:.:.:...:::::.:::: .:
CCDS58 PDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 EVEVKSVVDFIQKHGNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALAS
: :: ..:.:: :::::..:..:::::.:::::: .. . . .:: .:. :..:: .
CCDS58 EPEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELYDLAKDAVEALYK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VSGTEYQVGPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEE
: : :: : ::.: ::: ..:::::.:::.::.::::::: :::::::.::::::.:
CCDS58 VHGIEYIFGSISTTLYVASGITVDWAYDSGIKYAFSFELRDTGQYGFLLPATQIIPTAQE
360 370 380 390 400 410
410 420
pF1KE1 TWLGLKTIMEHVRDNLY
::..:.:::::. .. :
CCDS58 TWMALRTIMEHTLNHPY
420 430
>>CCDS47713.1 CPA5 gene_id:93979|Hs108|chr7 (403 aa)
initn: 1120 init1: 700 opt: 1133 Z-score: 1427.6 bits: 273.1 E(32554): 3.4e-73
Smith-Waterman score: 1133; 48.8% identity (80.6% similar) in 330 aa overlap (2-331:18-346)
10 20 30 40
pF1KE1 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLV
: :.. ..: .. :: .: ::::::. ... ..: :..:
CCDS47 MQGTPGGGTRPGPSPVDRRTLLVFSFILAAALGQMNFTGDQVLRVLAKDEKQLSLLGDLE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 NSNNLKLNFWKSPSSFNRPVDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDE
. . :..::..:. . :::. :: :. .:..:.:.:: :.. :.:.:.:::.: .
CCDS47 GLKPQKVDFWRGPARPSLPVDMRVPFSELKDIKAYLESHGLAYSIMIKDIQVLLDEERQA
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 MQHNEGQERSSNNFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFS
: ... :::.:.:.:..::.:: :: .::.. . :.. ...::.::::. . :::::
CCDS47 MAKSRRLERSTNSFSYSSYHTLEEIYSWIDNFVMEHSDIVSKIQIGNSFENQSILVLKFS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 TGKGVRRPAVWLNAGIHSREWISQATAIWTARKIVSDYQRDPAITSILEKMDIFLLPVAN
:: : :.::.:...::::::::..::.:::: :::::: .: ..:.::. ::::. :.:
CCDS47 TG-GSRHPAIWIDTGIHSREWITHATGIWTANKIVSDYGKDRVLTDILNAMDIFIELVTN
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 PDGYVYTQTQNRLWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANS
:::...:...::::::..: :: :::.: ::::...:.:.:...:::::.:::: .:
CCDS47 PDGFAFTHSMNRLWRKNKSIRPGIFCIGVDLNRNWKSGFGGNGSNSNPCSETYHGPSPQS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 EVEVKSVVDFIQKHGNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALAS
: :: ..:.:: :::::..:..:::::.:::::: .. . . .::
CCDS47 EPEVAAIVNFITAHGNFKALISIHSYSQMLMYPYGRLLEPVSNQRELMWPVGSPSTGPMT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VSGTEYQVGPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEE
CCDS47 VASSTPSALSSGTLGSMASCCRPHRSSPRPRRRGWRFGPSWSTP
360 370 380 390 400
>>CCDS33874.1 CPB1 gene_id:1360|Hs108|chr3 (417 aa)
initn: 980 init1: 481 opt: 1111 Z-score: 1399.6 bits: 268.0 E(32554): 1.2e-71
Smith-Waterman score: 1111; 41.6% identity (72.7% similar) in 425 aa overlap (4-421:5-417)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MRWILFIGALIGSSICGQEKFFGDQVLRINVRNGDEISKLSQLVNSNNLKLNFWKSPSS
.... . ..:. : :.: :..:.:.::.. ..:. . .:.... ...::: :.:
CCDS33 MLALLVLVTVALASAHHGGEHFEGEKVFRVNVEDENHINIIRELASTT--QIDFWK-PDS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 FN--RP---VDVLVPSVSLQAFKSFLRSQGLEYAVTIEDLQALLDNEDDEMQHNEGQERS
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CCDS33 VTQIKPHSTVDFRVKAEDTVTVENVLKQNELQYKVLISNLRNVVEAQFDSRVRATGH---
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 SNNFNYGAYHSLEAIYHEMDNIAADFPDLARRVKIGHSFENRPMYVLKFSTGK-GVRRPA
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CCDS33 ----SYEKYNKWETIEAWTQQVATENPALISRSVIGTTFEGRAIYLLK--VGKAGQNKPA
120 130 140 150 160
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.... :.:.::::: : : .:. : : :. .: .:.:.:...::: : :::.:: :
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170 180 190 200 210 220
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pF1KE1 QNRLWRKTRSRNPGSSCIGADPNRNWNASFAGKGASDNPCSEVYHGPHANSEVEVKSVVD
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CCDS33 KSRFWRKTRSTHTGSSCIGTDPNRNFDAGWCEIGASRNPCDETYCGPAAESEKETKALAD
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 FIQ-KHGNFKGFIDLHSYSQLLMYPYGYSVKKAPDAEELDKVARLAAKALASVSGTEYQV
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CCDS33 FIRNKLSSIKAYLTIHSYSQMMIYPYSYAYKLGENNAELNALAKATVKELASLHGTKYTY
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360 370 380 390 400 410
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CCDS33 GPGATTIYPAAGGSDDWAYDQGIRYSFTFELRDTGRYGFLLPESQIRATCEETFLAIKYV
350 360 370 380 390 400
420
pF1KE1 MEHVRDNLY
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CCDS33 ASYVLEHLY
410
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10 20 30 40
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CCDS62 MKCLGKRRGQAAAFLPLCW-LFLKILQPGHSHLYNNRYAGDKVIRFIPKTEEEAYALKKI
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CCDS62 --SYQLKVDLWQ-PSSISYVSEGTVTDVHIPQNGSRALLAFLQEANIQYKVLIEDLQKTL
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: :.. ..:: ...:: .::::: : . : .. : . .::.:.:.: .
CCDS62 --EKGSSLHTQRNRRSLSGYNYEVYHSLEEIQNWMHHLNKTHSGLIHMFSIGRSYEGRSL
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..::.. . ..: :::.. :::.::::. : : ... . :. :::. ..:... ..
CCDS62 FILKLGRRSRLKR-AVWIDCGIHAREWIGPAFCQWFVKEALLTYKSDPAMRKMLNHLYFY
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CCDS62 IMPVFNVDGYHFSWTNDRFWRKTRSRNSRFRCRGVDANRNWKVKWCDEGASMHPCDDTYC
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280 290 300 310 320 330
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CCDS62 GPFPESEPEVKAVANFLRKHRKHIRAYLSFHAYAQMLLYPYSYKYATIPNFRCVESAAYK
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pF1KE1 AAKALASVSGTEYQVGPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQ
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CCDS62 AVNALQSVYGVRYRYGPASTTLYVSSGSSMDWAYKNGIPYAFAFELRDTGYFGFLLPEML
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400 410 420
pF1KE1 IIPTAEETWLGLKTIMEHVRDNLY
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CCDS62 IKPTCTETMLAVKNITMHLLKKCP
420 430
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CCDS31 HVAANMMVDFRVSEKESQAIQSALDQNKMHYEILIHDLQEEIEKQFDVKEDIPGRH----
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CCDS31 MWRKNRSKNQNSKCIGTDLNRNFNASWNSIPNTNDPCADNYRGSAPESEKETKAVTNFIR
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CCDS31 SHLNEIKVYITFHSYSQMLLFPYGYTSKLPPNHEDLAKVAKIGTDVLSTRYETRYIYGPI
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CCDS31 ESTIYPISGSSLDWAYDLGIKHTFAFELRDKGKFGFLLPESRIKPTCRETMLAVKFIAKY
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CCDS31 ILKHTS
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CCDS94 MKLCSLAVLVPIVLFCEQHVFAFQSGQVLAALPRTSRQVQVLQNLTTTYEIVL--WQ-PV
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CCDS94 TADLIVKKKQVHFFVNASDVDNVKAHLNVSGIPCSVLLADVEDLIQQ---QISNDTVSPR
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CCDS94 ASASY-YEQYHSLNEIYSWIEFITERHPDMLTKIHIGSSFEKYPLYVLKVSGKEQAAKNA
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CCDS94 IWIDCGIHAREWISPAFCLWFIGHITQFYGIIGQYTNLLRLVDFYVMPVVNVDGYDYSWK
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CCDS94 KNRMWRKNRSFYANNHCIGTDLNRNFASKHWCEEGASSSSCSETYCGLYPESEPEVKAVA
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pF1KE1 QVGPTCTTVYPASGSSIDWAYDNGIKFAFTFELRDTGTYGFLLPANQIIPTAEETWLGLK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]