Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1869
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1869, 390 aa
1>>>pF1KE1869 390 - 390 aa - 390 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7552+/-0.00063; mu= 15.4694+/- 0.038
mean_var=76.0850+/-15.128, 0's: 0 Z-trim(111.8): 39 B-trim: 9 in 1/53
Lambda= 0.147036
statistics sampled from 12628 (12667) to 12628 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.389), width: 16
Scan time: 3.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 ( 390) 2658 572.7 2e-163
CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 ( 412) 700 157.3 2.3e-38
CCDS1521.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 414) 699 157.1 2.6e-38
CCDS44318.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 ( 442) 699 157.1 2.8e-38
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 327 78.2 1.4e-14
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 317 76.1 6.6e-14
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 293 71.0 2.2e-12
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 290 70.3 3e-12
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 290 70.4 3.2e-12
>>CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 (390 aa)
initn: 2658 init1: 2658 opt: 2658 Z-score: 3047.5 bits: 572.7 E(32554): 2e-163
Smith-Waterman score: 2658; 99.7% identity (99.7% similar) in 390 aa overlap (1-390:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MPPSGLRLLPLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVTRVLMVETHNEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLKVEQHVELYQKYSNNSWR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 YLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQVDINGFT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TGRRGDLATIHGMNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 DFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE1 LEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS
370 380 390
>>CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 (412 aa)
initn: 1022 init1: 669 opt: 700 Z-score: 802.4 bits: 157.3 E(32554): 2.3e-38
Smith-Waterman score: 1093; 46.3% identity (67.6% similar) in 410 aa overlap (15-390:9-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA
:. : .:. . . .:::: :.:. .:.::.:::::::::::::.
CCDS98 MKMHLQRALVVLALLNFATVSLSLSTCTTLDFGHIKKKRVEAIRGQILSKLRLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRD---RVAGESAE--PEPEPEADYYAKEVTRVLMVE
::: . .: :::::::::. .. :: : . . :..:::::. . :..
CCDS98 SPPEPTVMTH--VPYQVLALYNSTRELLEEMHGEREEGCTQENTESEYYAKEIHKFDMIQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE1 ---THNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRL----KLKVEQHV
:::. : : ... : :.: ... . : :::.:.::. . . ::..
CCDS98 GLAEHNELAVCPKGITSKVFRF-NVSSVEKNRTN---LFRAEFRVLRVPNPSSKRNEQRI
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 ELYQKYSNN----SWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCS
::.: . . ::.... : . :::::::: .::.:: : :...: ::
CCDS98 ELFQILRPDEHIAKQRYIGGKNLPTRGTAEWLSFDVTDTVREWLLRRESNLGLEISIHCP
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260
pF1KE1 C-------DSRDN---TLQVDINGFTTGR---RGDLATIHGM---NRPFLLLMATPLERA
: : .: .... ..: . ::::. .. . . : :.:: : .:
CCDS98 CHTFQPNGDILENIHEVMEIKFKGVDNEDDHGRGDLGRLKKQKDHHNPHLILMMIPPHRL
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 QH--LQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPC
.. ..:..::::::::: . :.::::: ::::::.::::::.::::::.:::: :::
CCDS98 DNPGQGGQRKKRALDTNYCFRNLEENCCVRPLYIDFRQDLGWKWVHEPKGYYANFCSGPC
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 PYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRS
::. : :: .: ::.::: :: :::.:::::: :::: :.::::: :::::::::.:.:
CCDS98 PYLRSADTTHSTVLGLYNTLNPEASASPCCVPQDLEPLTILYYVGRTPKVEQLSNMVVKS
350 360 370 380 390 400
390
pF1KE1 CKCS
::::
CCDS98 CKCS
410
>>CCDS1521.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 (414 aa)
initn: 1019 init1: 653 opt: 699 Z-score: 801.2 bits: 157.1 E(32554): 2.6e-38
Smith-Waterman score: 1086; 45.1% identity (67.0% similar) in 412 aa overlap (18-390:9-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA
.:.: : .::::.:.::. :::::::::::::::.:.
CCDS15 MHYCVLSAFLILHLVTVALSLSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SPPSQGEVP-PGPLPEAVLALYNSTRD----RVAGESAEPEPE-PEADYYAKEVTRVLM-
::: . : : .: :...:::::: ... ..: : : . .:::::: .. :
CCDS15 SPPE--DYPEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMP
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE1 --VETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRL---KLKV-EQH
..: : : . : . :..: ... . . : .::.:..:: : .: ::.
CCDS15 PFFPSENAIPPTFYRPYFRI-VRFDVSAMEKNASN---LVKAEFRVFRLQNPKARVPEQR
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 VELYQ-----KYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAH
.:::: .. . ::...... :::::::: .:..:: . . ::..: :
CCDS15 IELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSFDVTDAVHEWLHHKDRNLGFKISLH
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260
pF1KE1 CSC-----------DSRDNTLQV---DINGFTTGRRGDLATIHGMNR------PFLLLMA
: : .... :.. :.: .: :: ::.. . : ::::
CCDS15 CPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTSGDQKTIKSTRKKNSGKTPHLLLML
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 TPLERAQHLQSSRHR-RALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANF
: : . :..:.. ::::. ::: ... :::.: :::::..:::::::::::::.:::
CCDS15 LPSYRLESQQTNRRKKRALDAAYCFRNVQDNCCLRPLYIDFKRDLGWKWIHEPKGYNANF
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 CLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSN
: : :::.:: :::.:.::.::: :: :::.:::: : :::: :.::.:. ::.:::::
CCDS15 CAGACPYLWSSDTQHSRVLSLYNTINPEASASPCCVSQDLEPLTILYYIGKTPKIEQLSN
350 360 370 380 390 400
390
pF1KE1 MIVRSCKCS
:::.:::::
CCDS15 MIVKSCKCS
410
>>CCDS44318.1 TGFB2 gene_id:7042|Hs108|chr1 (442 aa)
initn: 1040 init1: 653 opt: 699 Z-score: 800.8 bits: 157.1 E(32554): 2.8e-38
Smith-Waterman score: 1025; 43.4% identity (63.7% similar) in 424 aa overlap (30-390:21-442)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLA
::::.:.::. :::::::::::::::.:.
CCDS44 MHYCVLSAFLILHLVTVALSLSTCSTLDMDQFMRKRIEAIRGQILSKLKLT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SPPSQGEVP-PGPLPEAVLALYNSTRD----RVAGESAEPEPE-PEADYYAKEVTRVLM-
::: . : : .: :...:::::: ... ..: : : . .:::::: .. :
CCDS44 SPPE--DYPEPEEVPPEVISIYNSTRDLLQEKASRRAAACERERSDEEYYAKEVYKIDMP
60 70 80 90 100
120 130 140
pF1KE1 ----VETHNEIYDKFKQSTHSI----------YM----------FFNTSELREAVPEPVL
:: . . :. :. :. .: .. .. :
CCDS44 PFFPSETVCPVVTTPSGSVGSLCSRQSQVLCGYLDAIPPTFYRPYFRIVRFDVSAMEKNA
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190
pF1KE1 --LSRAELRLLRL---KLKV-EQHVELYQ-----KYSNNSWRYLSNRLLAPSDSPEWLSF
: .::.:..:: : .: ::..:::: .. . ::...... :::::
CCDS44 SNLVKAEFRVFRLQNPKARVPEQRIELYQILKSKDLTSPTQRYIDSKVVKTRAEGEWLSF
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240
pF1KE1 DVTGVVRQWLSRGGEIEGFRLSAHCSC-----------DSRDNTLQV---DINGFTTGRR
::: .:..:: . . ::..: :: : .... :.. :.: .:
CCDS44 DVTDAVHEWLHHKDRNLGFKISLHCPCCTFVPSNNYIIPNKSEELEARFAGIDGTSTYTS
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290
pF1KE1 GDLATIHGMNR------PFLLLMATPLERAQHLQSSRHR-RALDTNYCFSSTEKNCCVRQ
:: ::.. . : :::: : : . :..:.. ::::. ::: ... :::.:
CCDS44 GDQKTIKSTRKKNSGKTPHLLLMLLPSYRLESQQTNRRKKRALDAAYCFRNVQDNCCLRP
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 LYIDFRKDLGWKWIHEPKGYHANFCLGPCPYIWSLDTQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCV
:::::..:::::::::::::.:::: : :::.:: :::.:.::.::: :: :::.::::
CCDS44 LYIDFKRDLGWKWIHEPKGYNANFCAGACPYLWSSDTQHSRVLSLYNTINPEASASPCCV
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390
pF1KE1 PQALEPLPIVYYVGRKPKVEQLSNMIVRSCKCS
: :::: :.::.:. ::.::::::::.:::::
CCDS44 SQDLEPLTILYYIGKTPKIEQLSNMIVKSCKCS
410 420 430 440
>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa)
initn: 269 init1: 114 opt: 327 Z-score: 375.0 bits: 78.2 E(32554): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 339; 27.9% identity (53.4% similar) in 427 aa overlap (4-389:3-395)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MPPSGLRLLL-LLLPLLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRG--------
.: : :: :::: :: : :::: :: .:: : :
CCDS13 MVAGTRCLLALLLPQ----VLLGG--AAGLVP------ELGRRKFAAASSGRPSSQPSD
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE1 QILSK--LRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYN-STRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEV
..::. ::: : . . : : .::. : . : .:. . : :. . . :...
CCDS13 EVLSEFELRLLSMFGLKQRPT-PSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRA
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 TRVLMVETHNEIYDKFKQSTHSI--YMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLLRLKLK---
. : . :.: ... ... . .::: : ..: ... :::...: ...
CCDS13 NTVRSFH-HEESLEELPETSGKTTRRFFFNLS----SIPTEEFITSAELQVFREQMQDAL
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KE1 -----VEQHVELYQ---KYSNNSW----RYLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVRQWLSRG
......:. . :: : :..::. . : .: ::::: .: .: ..:
CCDS13 GNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNAS-RWESFDVTPAVMRWTAQG
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KE1 GEIEGFRLS-AHCSCDSRDNTLQVDINGFTTGRRGDLATIHGMNRPFLLLMAT-----PL
.:: . :: . . .: :. . . . : ::.:. .. ::
CCDS13 HANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQI----RPLLVTFGHDGKGHPL
230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 ERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQ-LYIDFRKDLGWK-WIHEPKGYHANFCL
.. .. :.....: . :. : :. ::.:: .:.::. :: : :::: .:
CCDS13 HKREKRQAKHKQR---------KRLKSSCKRHPLYVDF-SDVGWNDWIVAPPGYHAFYCH
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KE1 GPCPYIWS--LD-TQYSKVLALYNQHNPGASAAPCCVPQALEPLPIVYY-VGRKPKVEQL
: ::. . :. :... : .: :. : : :::: : . ..: ..: ...
CCDS13 GECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKA-CCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNY
330 340 350 360 370 380
380 390
pF1KE1 SNMIVRSCKCS
..:.:..: :
CCDS13 QDMVVEGCGCR
390
>>CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 (426 aa)
initn: 322 init1: 143 opt: 317 Z-score: 363.1 bits: 76.1 E(32554): 6.6e-14
Smith-Waterman score: 352; 26.6% identity (49.7% similar) in 447 aa overlap (1-390:1-426)
10 20 30 40
pF1KE1 MPPSGLRLLLLLLPLLWLLVL---TPGRP----AAGLSTCKTI----DMELVKRKRIEAI
:: :: .: : :..: ::: : .: :. . . .::.
CCDS54 MPLLWLRGFL--LASCWIIVRSSPTPGSEGHSAAPDCPSCALAALPKDVPNSQPEMVEAV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 RGQILSKLRLASPPSQGEVPPGPLPEAVLALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEADYYAKEVT
. .::. :.: . :. . :.:.: :: :. : .:. .: : ....
CCDS54 KKHILNMLHLKKRPDVTQ----PVPKA--ALLNAIRKLHVGKVGENGYVEIEDDIGRRAE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 RVLMVETHNEIYDKFKQSTHSIYMFFNTSELREAVPEPVLLSRAELRLL-------RLKL
..: .:: ...: . :. : .:. :. :::. :. : .
CCDS54 MNELMEQTSEIITFAESGTARKTLHFEIS--KEGSDLSVV-ERAEVWLFLKVPKANRTRT
120 130 140 150 160
170 180 190 200
pF1KE1 KVEQHVELYQKYSNNSWR-----------------YLSNRLLAPSDSPEWLSFDVTGVVR
:: .. ::. ..: ::.... : : : :.. ..
CCDS54 KVTIRLFQQQKHPQGSLDTGEEAEEVGLKGERSELLLSEKVVDARKST-WHVFPVSSSIQ
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250
pF1KE1 QWLSRGGEIEGFRLSAHCSCDSRDNTLQV-------------DINGFTTGRRGDLATIHG
. :..: :.. . .:. .: . .: : : .
CCDS54 RLLDQGKSSLDVRIACE-QCQESGASLVLLGKKKKKEEEGEGKKKGGGEGGAGADEEKEQ
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 MNRPFLLLMATPLERAQHLQSSRHRRALDTNYCFSSTEKNCCVRQLYIDFRKDLGWK-WI
.::::.:.: : : :.::.:. : .. . :: .:....: ::.::. ::
CCDS54 SHRPFLMLQARQSEDHPH---RRRRRGLE---C-DGKVNICCKKQFFVSF-KDIGWNDWI
290 300 310 320 330
320 330 340 350 360
pF1KE1 HEPKGYHANFCLGPCP-YIWSLDTQ----YSKVLALYNQ--HNPGASAAPCCVPQALEPL
:.:::::.: : :: .: . . . .: :. : . :.: :. :::: :.:.
CCDS54 IAPSGYHANYCEGECPSHIAGTSGSSLSFHSTVINHYRMRGHSPFANLKSCCVPTKLRPM
340 350 360 370 380 390
370 380 390
pF1KE1 PIVYYV-GRKPKVEQLSNMIVRSCKCS
..:: :.. ....::::. : ::
CCDS54 SMLYYDDGQNIIKKDIQNMIVEECGCS
400 410 420
>>CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 (407 aa)
initn: 292 init1: 114 opt: 293 Z-score: 335.9 bits: 71.0 E(32554): 2.2e-12
Smith-Waterman score: 383; 29.4% identity (51.8% similar) in 361 aa overlap (45-390:75-407)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 LLWLLVLTPGRPAAGLSTCKTIDMELVKRKRIEAIRGQILSKLRLASPPSQG-EVPPGPL
:.:.:..:::::::: :. . :: :
CCDS88 GERSSRPAPSVAPEPDGCPVCVWRQHSRELRLESIKSQILSKLRLKEAPNISREVVKQLL
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120
pF1KE1 PEAV-LALYNSTRDRVAGESAEPEPEPEAD-YYAKEVTRVLMV-ETHNEIY-DKFKQSTH
:.: : . .: :.. .:: : : :.: : . :. :: . : :
CCDS88 PKAPPLQQILDLHD-FQGDALQPEDFLEEDEYHATTETVISMAQETDPAVQTDGSPLCCH
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]