Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1862
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1862, 381 aa
1>>>pF1KE1862 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0373+/-0.000863; mu= 13.9216+/- 0.052
mean_var=91.2376+/-18.137, 0's: 0 Z-trim(108.4): 17 B-trim: 16 in 1/49
Lambda= 0.134273
statistics sampled from 10162 (10173) to 10162 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 2.830
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3180.1 PTX3 gene_id:5806|Hs108|chr3 ( 381) 2572 508.2 4.8e-144
CCDS5657.1 NPTX2 gene_id:4885|Hs108|chr7 ( 431) 387 85.0 1.4e-16
CCDS32762.1 NPTX1 gene_id:4884|Hs108|chr17 ( 432) 361 80.0 4.5e-15
CCDS33647.1 NPTXR gene_id:23467|Hs108|chr22 ( 500) 347 77.3 3.3e-14
CCDS32362.1 PTX4 gene_id:390667|Hs108|chr16 ( 473) 304 69.0 1e-11
>>CCDS3180.1 PTX3 gene_id:5806|Hs108|chr3 (381 aa)
initn: 2572 init1: 2572 opt: 2572 Z-score: 2699.6 bits: 508.2 E(32554): 4.8e-144
Smith-Waterman score: 2572; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MHLLAILFCALWSAVLAENSDDYDLMYVNLDNEIDNGLHPTEDPTPCACGQEHSEWDKLF
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CCDS31 MHLLAILFCALWSAVLAENSDDYDLMYVNLDNEIDNGLHPTEDPTPCACGQEHSEWDKLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IMLENSQMRERMLLQATDDVLRGELQRLREELGRLAESLARPCAPGAPAEARLTSALDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IMLENSQMRERMLLQATDDVLRGELQRLREELGRLAESLARPCAPGAPAEARLTSALDEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAGRALAAVLEELRQTRADLHAVQGWAARSWLPAGCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAGRALAAVLEELRQTRADLHAVQGWAARSWLPAGCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCHIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCHIR
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE1 GNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS
:::::::::::::::::::::
CCDS31 GNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS
370 380
>>CCDS5657.1 NPTX2 gene_id:4885|Hs108|chr7 (431 aa)
initn: 326 init1: 151 opt: 387 Z-score: 411.3 bits: 85.0 E(32554): 1.4e-16
Smith-Waterman score: 387; 29.7% identity (60.7% similar) in 300 aa overlap (85-377:131-416)
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 EWDKLFIMLENSQMRERMLLQATDDVLRGELQRLREELGRLAESL-ARPCAPGAPAEAR-
:: :...: : ..: : : :.. :
CCDS56 KARGAGATGKDTMGDLPRDPGHVVEQLSRSLQTLKDRLESLEHQLRANVSNAGLPGDFRE
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160
pF1KE1 -LTSALDELLQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAG---RALAAVLEELRQTRADLHAVQG
: . : :: :. :..:..: .. .:.. . ..:. : : ..:. .:
CCDS56 VLQQRLGEL---ERQLLRKVAELEDEKSLLHNETSAHRQKTESTLNALLQRVTELE--RG
170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 WAARSWLPAGCETAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYG
.: . : . .... :.:.. ..:... . : .: .:. :.:.... . :::.
CCDS56 NSAFK-SPDAFKVSL--PLRTNYLYGKIKKTLP-ELYAFTICLWLRSSASPGIGTPFSYA
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 TKRNPYEIQLY-LSYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNG
. . :: : . . : .... . .: .:: :.: :.: ::....:. . .:
CCDS56 VPGQANEIVLIEWGNNPIELLINDKVAQL--PLFVSDGKWHHICVTWTTRDGMWEAFQDG
280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ELAATTVEMATGHIVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEE
: .: ..: : . ::.: .:::.. ::: :: : :: :.:. ::::: :: .:
CCDS56 EKLGTGENLAPWHPIKPGGVLILGQEQD--TVGGRFDATQAFVGELSQFNIWDRVLRAQE
330 340 350 360 370 380
350 360 370 380
pF1KE1 IRETGGAESCHIRGNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS
: . .. : .. :::. : .... :::
CCDS56 IVNIANC-STNMPGNIIPWVDNNVDVFGGASKWPVETCEERLLDL
390 400 410 420 430
>>CCDS32762.1 NPTX1 gene_id:4884|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 222 init1: 172 opt: 361 Z-score: 384.1 bits: 80.0 E(32554): 4.5e-15
Smith-Waterman score: 376; 27.6% identity (61.0% similar) in 272 aa overlap (114-377:159-420)
90 100 110 120 130
pF1KE1 ELQRLREELGRLAESLARPCAPGAPAEARLTSALDELLQATRDAGRR--LARM----EGA
:..: .:::. : .: :.:. ::
CCDS32 TLSQLGQTLQSLKTRLENLEQYSRLNSSSQTNSLKDLLQSKIDELERQVLSRVNTLEEGK
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 EAQRPEEAGRA-LAAVLEELRQTRADLHAVQGWAARSWLPAGCETAILFPMRSKKIFGSV
. : . :. . ..: :.: ..:. : .. : : . . ::.:.. ....:
CCDS32 GGPRNDTEERVKIETALTSLHQRISELEKGQ----KDNRP-GDKFQLTFPLRTNYMYAKV
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 HPVRPMRLESFSACIWVKATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLY-LSYQSIVFVVGGEENK
. : .. .:..:.:.:.. . . :::.. . :. : . . . .... . :
CCDS32 KKSLP-EMYAFTVCMWLKSSATPGVGTPFSYAVPGQANELVLIEWGNNPMEILINDKVAK
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 LVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGHIVPEGGILQIGQEKN
: ... :.: :.: ::....:. . .: ... ..: : . :.: .:::..
CCDS32 L--PFVINDGKWHHICVTWTTRDGVWEAYQDGTQGGSGENLAPYHPIKPQGVLVLGQEQD
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCHIRGNIVGWGVTEIQPHG
.::::: : :: :.:. ::::: :. :. . . . . ::...:. ..:. .:
CCDS32 --TLGGGFDATQAFVGELAHFNIWDRKLTPGEVYNLATCSTKALSGNVIAWAESHIEIYG
370 380 390 400 410
380
pF1KE1 GAQYVS
::
CCDS32 GATKWTFEACRQIN
420 430
>>CCDS33647.1 NPTXR gene_id:23467|Hs108|chr22 (500 aa)
initn: 198 init1: 97 opt: 347 Z-score: 368.5 bits: 77.3 E(32554): 3.3e-14
Smith-Waterman score: 356; 28.3% identity (58.3% similar) in 321 aa overlap (72-377:189-486)
50 60 70 80 90
pF1KE1 EDPTPCACGQEHSEWDKLFIMLENSQMRERMLLQATDDV--LRGELQRLREELGRLAESL
..:. : : :: ...::..:: ..
CCDS33 GRCESGLPRGLQGAGPRRDTMADGPWDSPALILELEDAVRALRDRIDRLEQELPARVNLS
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 ARPCAPGAPAEARLTSALDELLQATRDAGRRLARMEGAEAQRPEEAGRALAAVLEELRQ-
: : :: . . . : : .:.: :. ::.. . : .: ::. .. ::
CCDS33 AAP-APVSAVPTGLHSKMDQL------EGQLLAQVLALEKERV-----ALSHSSRRQRQE
220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 TRADLHAVQGWAAR------SWLPAGCETAILFPMRSKKIFGSVHPVRPMRLESFSACIW
.. .: ..:: .:. .. : : .:.:.. ... :. . : .: .:.::.:
CCDS33 VEKELDVLQGRVAELEHGSSAYSPPDA-FKISIPIRNNYMYARVRKALP-ELYAFTACMW
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260
pF1KE1 VKA-TDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLYLS-YQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSL--GRWT
... .. .. :::.. . :: : . .. . ... : ::. .:: . :
CCDS33 LRSRSSGTGQGTPFSYSVPGQANEIVLLEAGHEPMELLI----NDKVAQLPLSLKDNGWH
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 HLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATGHIVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLA
:.: .:....:: : . .::: .. ..:. : . ::: .:::.. .:: :: : :
CCDS33 HICIAWTTRDGLWSAYQDGELQGSGENLAAWHPIKPHGILILGQEQD--TLGGRFDATQA
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 FSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCH--IRGNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS
: : .. ::.:: .:. .. : .: . ::.. : .. :::
CCDS33 FVGDIAQFNLWDHALTPAQVL---GIANCTAPLLGNVLPWEDKLVEAFGGATKAAFDVCK
440 450 460 470 480 490
CCDS33 GRAKA
500
>>CCDS32362.1 PTX4 gene_id:390667|Hs108|chr16 (473 aa)
initn: 286 init1: 154 opt: 304 Z-score: 323.8 bits: 69.0 E(32554): 1e-11
Smith-Waterman score: 330; 31.3% identity (53.3% similar) in 319 aa overlap (64-348:126-434)
40 50 60 70 80
pF1KE1 IDNGLHPTEDPTPCACGQEHSEWDKLFIMLENSQMR--ERMLLQATDDVLRGELQRLR--
: ::.: :: .: :.:. : ::.
CCDS32 LAQLKAWVRKLQRRGRKVDTRLRALDLTLGERSQQRARERKAHKAQRDALQDSLARLEGL
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 --EELGRLAESLAR-PCA-PGA----PAEARLTSALDELLQATRDAGRRLARMEGAEAQR
. .::: .: : : ::. :: . . .:: .. : ....: .:
CCDS32 VHSQGARLAALEGRLPVAHPGTAALGPALVPTPTQPEELGPTSLKLQRDRQELRAASEHR
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180
pF1KE1 --PEEAGRALAAVLEELRQTRAD-LHAV-QGWAAR-----SWLPA------GCETAILFP
:... .: :. :. :. : : .: : . .: : : ...::
CCDS32 GPPQDS----SAPLQGRREPPASGSHRVLSGTAPKDPRQQAWSPQVPGEICGVGPTLVFP
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230
pF1KE1 MRSKK--IFGSVHPVRPMRLESFSACIWVK-ATDVLNKTILFSYGTKRNPYEIQLY----
: . .: : : .: :: : ::. :. :. :.::.:. : .. :.
CCDS32 NASTRNVVFLSPGFVTALRALSF--CSWVRTASGRLG--TLLSYATEDNDNKLVLHGRDS
280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LSYQSIVFVVGGEENKLVAEAMVSLGRWTHLCGTWNSEEGLTSLWVNGELAATTVEMATG
: :: ::.: . . .. :.: :.: :.: .: : :. .:.:: .. :
CCDS32 LLPGSIHFVIGDPAFRELPLQLLLDGQWHHICVIWTSTQGRYWLHVDRRLVATGSRFREG
330 340 350 360 370 380
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 HIVPEGGILQIGQEKNGCCVGGGFDETLAFSGRLTGFNIWDSVLSNEEIRETGGAESCHI
. .: :: : .:::... :::::: . :: : ..:. ::: .: :.
CCDS32 YEIPPGGSLVLGQEQDS--VGGGFDSSEAFVGSMSGLAIWDRALVPGEVANLAIGKEFPT
390 400 410 420 430 440
360 370 380
pF1KE1 RGNIVGWGVTEIQPHGGAQYVS
CCDS32 GAILTLANAALAGGFVQGANCTCLERCP
450 460 470
381 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 21:12:06 2016 done: Sun Nov 6 21:12:06 2016
Total Scan time: 2.830 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]